Doublet Group distance statistics: 54487

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 4, 31, 33, 30, 23, 5, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.008, 0.016, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.008 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.006, 0.017, 0.028, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.017 std_dev=0.011
N3	A	0, -0.001, 0.010, 0.021, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.010 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.004, 0.015, 0.027, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.007, 0.020, 0.032, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.006, 0.019, 0.032, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.006, 0.020, 0.035, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.020 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.018, 0.052, 0.086, 0.203 max_d=0.203 avg_d=0.052 std_dev=0.034
N4	A	0, 0.017, 0.053, 0.090, 0.166 max_d=0.166 avg_d=0.053 std_dev=0.036
C2'	A	0, 0.069, 0.178, 0.286, 0.854 max_d=0.854 avg_d=0.178 std_dev=0.109
O4'	A	0, 0.049, 0.175, 0.301, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.175 std_dev=0.126
O2'	A	0, 0.080, 0.209, 0.339, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.209 std_dev=0.130
C4	B	0, 0.297, 0.441, 0.585, 0.840 max_d=0.840 avg_d=0.441 std_dev=0.144
N3	B	0, 0.239, 0.394, 0.548, 0.767 max_d=0.767 avg_d=0.394 std_dev=0.154
C2	B	0, 0.263, 0.423, 0.584, 0.880 max_d=0.880 avg_d=0.423 std_dev=0.161
N1	B	0, 0.255, 0.419, 0.583, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.419 std_dev=0.164
C6	B	0, 0.296, 0.465, 0.634, 0.859 max_d=0.859 avg_d=0.465 std_dev=0.169
C5	B	0, 0.330, 0.502, 0.673, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.502 std_dev=0.171
C4'	A	0, 0.093, 0.275, 0.457, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.275 std_dev=0.182
C3'	A	0, 0.108, 0.292, 0.476, 1.355 max_d=1.355 avg_d=0.292 std_dev=0.184
N9	B	0, 0.369, 0.562, 0.755, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.562 std_dev=0.193
O6	B	0, 0.351, 0.557, 0.764, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.557 std_dev=0.207
N2	B	0, 0.346, 0.572, 0.798, 1.224 max_d=1.224 avg_d=0.572 std_dev=0.226
C1'	B	0, 0.376, 0.605, 0.834, 1.336 max_d=1.336 avg_d=0.605 std_dev=0.229
C2'	B	0, 0.328, 0.557, 0.786, 1.282 max_d=1.282 avg_d=0.557 std_dev=0.229
N7	B	0, 0.418, 0.668, 0.918, 1.360 max_d=1.360 avg_d=0.668 std_dev=0.250
O3'	A	0, 0.188, 0.440, 0.691, 1.827 max_d=1.827 avg_d=0.440 std_dev=0.251
C8	B	0, 0.443, 0.697, 0.952, 1.320 max_d=1.320 avg_d=0.697 std_dev=0.254
O5'	A	0, 0.203, 0.479, 0.754, 2.149 max_d=2.149 avg_d=0.479 std_dev=0.276
O2'	B	0, 0.368, 0.646, 0.925, 1.437 max_d=1.437 avg_d=0.646 std_dev=0.278
C3'	B	0, 0.314, 0.594, 0.873, 1.546 max_d=1.546 avg_d=0.594 std_dev=0.280
P	A	0, 0.298, 0.582, 0.866, 1.494 max_d=1.494 avg_d=0.582 std_dev=0.284
O4'	B	0, 0.408, 0.708, 1.008, 1.634 max_d=1.634 avg_d=0.708 std_dev=0.300
O3'	B	0, 0.326, 0.634, 0.941, 1.838 max_d=1.838 avg_d=0.634 std_dev=0.308
OP2	A	0, 0.300, 0.617, 0.934, 1.772 max_d=1.772 avg_d=0.617 std_dev=0.317
OP1	A	0, 0.338, 0.656, 0.973, 1.384 max_d=1.384 avg_d=0.656 std_dev=0.318
C5'	A	0, 0.140, 0.460, 0.779, 2.295 max_d=2.295 avg_d=0.460 std_dev=0.319
C4'	B	0, 0.375, 0.713, 1.051, 1.928 max_d=1.928 avg_d=0.713 std_dev=0.338
C5'	B	0, 0.419, 0.847, 1.274, 2.243 max_d=2.243 avg_d=0.847 std_dev=0.428
O5'	B	0, 0.492, 1.078, 1.663, 2.953 max_d=2.953 avg_d=1.078 std_dev=0.586
P	B	0, 0.436, 1.339, 2.242, 5.097 max_d=5.097 avg_d=1.339 std_dev=0.903
OP1	B	0, 0.719, 1.768, 2.816, 5.622 max_d=5.622 avg_d=1.768 std_dev=1.049
OP2	B	0, 0.383, 1.704, 3.025, 7.549 max_d=7.549 avg_d=1.704 std_dev=1.321

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.09	0.09	0.14	0.08
C2	0.02	0.00	0.07	0.08	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.03	0.16	0.15	0.19	0.14
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.06	0.03	0.06	0.07	0.12	0.00	0.02	0.01	0.09	0.15	0.12	0.08
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.09	0.01	0.10	0.02	0.10	0.05	0.09	0.10	0.12	0.02	0.01	0.01	0.12	0.19	0.12	0.11
C4	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.12	0.03	0.21	0.21	0.25	0.20
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.05	0.07	0.06	0.06	0.02	0.00	0.02	0.08	0.11	0.04
C5	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.13	0.04	0.22	0.21	0.24	0.20
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.12	0.01	0.13	0.00	0.11	0.07	0.10	0.13	0.07	0.06	0.03	0.02	0.01	0.10	0.12	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.11	0.04	0.20	0.16	0.18	0.15
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.02	0.15	0.13	0.17	0.12
N3	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.11	0.03	0.19	0.18	0.23	0.18
N4	0.02	0.01	0.07	0.10	0.00	0.07	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.14	0.04	0.23	0.24	0.28	0.23
O2	0.04	0.01	0.12	0.12	0.01	0.06	0.02	0.07	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.12	0.14	0.05	0.13	0.13	0.19	0.13
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.06	0.06	0.05	0.06	0.04	0.03	0.07	0.07	0.12	0.00	0.05	0.05	0.05	0.13	0.11	0.05
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.12	0.02	0.13	0.03	0.11	0.05	0.11	0.14	0.14	0.05	0.00	0.02	0.14	0.26	0.18	0.16
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.04	0.05	0.05	0.02	0.00	0.08	0.09	0.18	0.11
O5'	0.09	0.16	0.09	0.12	0.21	0.02	0.22	0.01	0.20	0.15	0.19	0.23	0.13	0.05	0.14	0.08	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.09	0.15	0.15	0.19	0.21	0.08	0.21	0.10	0.16	0.13	0.18	0.24	0.13	0.13	0.26	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.19	0.12	0.12	0.25	0.11	0.24	0.12	0.18	0.17	0.23	0.28	0.19	0.11	0.18	0.18	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.14	0.08	0.11	0.20	0.04	0.20	0.02	0.15	0.12	0.18	0.23	0.13	0.05	0.16	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.22	0.18	0.19	0.19	0.18	0.23	0.22	0.23	0.25	0.22	0.31	0.19	0.26	0.21	0.26	0.17	0.19	0.42	0.25	0.59	0.59	0.48
C2	0.19	0.17	0.17	0.18	0.18	0.18	0.23	0.27	0.22	0.27	0.16	0.30	0.15	0.29	0.21	0.23	0.16	0.19	0.55	0.27	0.79	0.78	0.66
C2'	0.17	0.23	0.15	0.13	0.17	0.13	0.21	0.18	0.22	0.24	0.22	0.34	0.19	0.26	0.18	0.25	0.12	0.15	0.42	0.26	0.63	0.64	0.51
C3'	0.15	0.21	0.14	0.11	0.13	0.10	0.18	0.16	0.18	0.23	0.19	0.31	0.16	0.24	0.16	0.25	0.11	0.12	0.40	0.22	0.63	0.64	0.50
C4	0.22	0.24	0.21	0.22	0.17	0.25	0.19	0.36	0.14	0.30	0.19	0.33	0.20	0.30	0.22	0.23	0.21	0.24	0.66	0.19	0.96	0.98	0.83
C4'	0.17	0.23	0.15	0.12	0.15	0.12	0.18	0.14	0.19	0.21	0.21	0.31	0.19	0.21	0.16	0.26	0.13	0.14	0.31	0.21	0.49	0.55	0.39
C5	0.22	0.25	0.22	0.23	0.16	0.26	0.17	0.36	0.15	0.29	0.21	0.32	0.21	0.28	0.22	0.25	0.22	0.24	0.64	0.19	0.88	0.90	0.77
C5'	0.21	0.25	0.21	0.13	0.18	0.14	0.18	0.13	0.19	0.22	0.22	0.32	0.23	0.21	0.19	0.32	0.13	0.17	0.28	0.20	0.48	0.56	0.37
C6	0.20	0.22	0.20	0.20	0.15	0.21	0.18	0.29	0.17	0.27	0.19	0.31	0.19	0.26	0.20	0.24	0.18	0.20	0.54	0.20	0.74	0.74	0.64
N1	0.19	0.19	0.17	0.18	0.16	0.18	0.21	0.25	0.20	0.26	0.18	0.31	0.16	0.27	0.20	0.24	0.16	0.18	0.50	0.24	0.70	0.70	0.59
N3	0.20	0.20	0.18	0.19	0.18	0.21	0.23	0.32	0.19	0.29	0.14	0.32	0.17	0.31	0.22	0.23	0.18	0.21	0.62	0.25	0.90	0.91	0.77
N4	0.24	0.27	0.23	0.25	0.20	0.29	0.21	0.41	0.17	0.32	0.25	0.34	0.22	0.32	0.25	0.24	0.24	0.28	0.72	0.19	1.08	1.12	0.93
O2	0.20	0.18	0.17	0.17	0.20	0.17	0.26	0.25	0.27	0.27	0.21	0.28	0.17	0.30	0.22	0.24	0.16	0.19	0.52	0.32	0.76	0.74	0.62
O2'	0.22	0.28	0.18	0.16	0.22	0.17	0.24	0.19	0.26	0.25	0.27	0.37	0.24	0.26	0.22	0.27	0.15	0.19	0.37	0.29	0.57	0.60	0.45
O3'	0.15	0.22	0.14	0.12	0.13	0.12	0.18	0.16	0.19	0.23	0.20	0.33	0.17	0.24	0.15	0.26	0.14	0.12	0.39	0.22	0.65	0.67	0.50
O4'	0.19	0.23	0.17	0.19	0.17	0.18	0.20	0.21	0.21	0.23	0.22	0.31	0.18	0.23	0.19	0.25	0.19	0.18	0.36	0.22	0.50	0.52	0.40
O5'	0.18	0.26	0.20	0.07	0.19	0.06	0.20	0.11	0.21	0.24	0.23	0.32	0.24	0.24	0.19	0.27	0.03	0.11	0.36	0.22	0.58	0.56	0.44
OP1	0.07	0.21	0.10	0.06	0.11	0.11	0.13	0.20	0.16	0.16	0.19	0.28	0.17	0.18	0.08	0.15	0.02	0.08	0.32	0.19	0.66	0.65	0.44
OP2	0.10	0.28	0.12	0.09	0.19	0.15	0.22	0.27	0.26	0.24	0.27	0.32	0.23	0.26	0.16	0.13	0.03	0.13	0.46	0.28	0.82	0.66	0.59
P	0.06	0.21	0.10	0.02	0.12	0.07	0.14	0.16	0.17	0.18	0.20	0.27	0.18	0.18	0.09	0.14	0.01	0.03	0.33	0.19	0.62	0.55	0.43

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.21	0.02	0.27	0.30	0.17
C2	0.04	0.00	0.12	0.16	0.01	0.08	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.18	0.04	0.39	0.01	0.57	0.58	0.43
C2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.06	0.02	0.05	0.03	0.07	0.06	0.10	0.14	0.12	0.06	0.03	0.01	0.03	0.01	0.19	0.07	0.25	0.30	0.17
C3'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.09	0.01	0.09	0.03	0.11	0.11	0.14	0.18	0.14	0.10	0.06	0.02	0.01	0.02	0.24	0.12	0.31	0.30	0.22
C4	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.02	0.41	0.01	0.54	0.58	0.43
C4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.08	0.09	0.08	0.09	0.07	0.09	0.05	0.06	0.02	0.00	0.02	0.09	0.17	0.29	0.09
C5	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.07	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.10	0.02	0.50	0.01	0.69	0.79	0.57
C5'	0.04	0.14	0.03	0.03	0.13	0.01	0.18	0.00	0.19	0.18	0.17	0.14	0.12	0.20	0.11	0.06	0.06	0.02	0.01	0.22	0.19	0.28	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.11	0.01	0.08	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.12	0.03	0.51	0.01	0.75	0.85	0.62
C8	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.09	0.01	0.18	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.14	0.04	0.50	0.02	0.61	0.72	0.53
N1	0.03	0.01	0.10	0.14	0.01	0.08	0.01	0.17	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.15	0.03	0.46	0.01	0.68	0.73	0.54
N2	0.05	0.01	0.14	0.18	0.01	0.09	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.23	0.05	0.35	0.02	0.54	0.54	0.39
N3	0.04	0.01	0.12	0.14	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.15	0.04	0.34	0.02	0.48	0.49	0.35
N7	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.09	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.13	0.04	0.55	0.02	0.75	0.90	0.65
N9	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.02	0.38	0.02	0.45	0.50	0.37
O2'	0.02	0.13	0.01	0.02	0.07	0.06	0.06	0.06	0.08	0.04	0.12	0.16	0.12	0.04	0.03	0.00	0.08	0.04	0.08	0.08	0.24	0.42	0.18
O3'	0.02	0.18	0.03	0.01	0.09	0.02	0.10	0.06	0.12	0.14	0.15	0.23	0.15	0.13	0.06	0.08	0.00	0.02	0.26	0.13	0.43	0.51	0.33
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.05	0.04	0.04	0.02	0.04	0.02	0.00	0.18	0.03	0.24	0.31	0.18
O5'	0.21	0.39	0.19	0.24	0.41	0.02	0.50	0.01	0.51	0.50	0.46	0.35	0.34	0.55	0.38	0.08	0.26	0.18	0.00	0.56	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.09	0.01	0.22	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.08	0.13	0.03	0.56	0.00	0.84	0.97	0.70
OP1	0.27	0.57	0.25	0.31	0.54	0.17	0.69	0.19	0.75	0.61	0.68	0.54	0.48	0.75	0.45	0.24	0.43	0.24	0.02	0.84	0.00	0.02	0.01
OP2	0.30	0.58	0.30	0.30	0.58	0.29	0.79	0.28	0.85	0.72	0.73	0.54	0.49	0.90	0.50	0.42	0.51	0.31	0.02	0.97	0.02	0.00	0.01
P	0.17	0.43	0.17	0.22	0.43	0.09	0.57	0.02	0.62	0.53	0.54	0.39	0.35	0.65	0.37	0.18	0.33	0.18	0.01	0.70	0.01	0.01	0.00