Doublet Group distance statistics: 54488

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 10, 18, 15, 16, 21, 11, 3, 5, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.008, 0.018, 0.029, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.006, 0.018, 0.029, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.007, 0.018, 0.030, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.009, 0.022, 0.036, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.022 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.018, 0.046, 0.075, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.046 std_dev=0.028
N4	A	0, 0.019, 0.054, 0.089, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.054 std_dev=0.035
O4'	A	0, 0.228, 0.359, 0.490, 0.703 max_d=0.703 avg_d=0.359 std_dev=0.131
C2'	A	0, 0.233, 0.364, 0.495, 0.699 max_d=0.699 avg_d=0.364 std_dev=0.131
O2'	A	0, 0.227, 0.386, 0.545, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.386 std_dev=0.159
C5	B	0, 0.201, 0.373, 0.545, 0.934 max_d=0.934 avg_d=0.373 std_dev=0.172
C4	B	0, 0.255, 0.433, 0.611, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.433 std_dev=0.178
C4'	A	0, 0.351, 0.550, 0.749, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.550 std_dev=0.199
C3'	A	0, 0.383, 0.587, 0.790, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.587 std_dev=0.204
N9	B	0, 0.371, 0.577, 0.783, 1.082 max_d=1.082 avg_d=0.577 std_dev=0.206
OP2	A	0, 1.029, 1.237, 1.444, 1.776 max_d=1.776 avg_d=1.237 std_dev=0.207
C2'	B	0, 0.404, 0.626, 0.848, 1.282 max_d=1.282 avg_d=0.626 std_dev=0.222
C8	B	0, 0.389, 0.613, 0.837, 1.129 max_d=1.129 avg_d=0.613 std_dev=0.224
C6	B	0, 0.275, 0.509, 0.743, 1.330 max_d=1.330 avg_d=0.509 std_dev=0.234
N7	B	0, 0.269, 0.510, 0.750, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.510 std_dev=0.241
P	A	0, 0.472, 0.738, 1.004, 1.753 max_d=1.753 avg_d=0.738 std_dev=0.266
O5'	A	0, 0.961, 1.229, 1.497, 1.866 max_d=1.866 avg_d=1.229 std_dev=0.268
N3	B	0, 0.325, 0.596, 0.866, 1.203 max_d=1.203 avg_d=0.596 std_dev=0.271
C3'	B	0, 0.430, 0.712, 0.995, 1.600 max_d=1.600 avg_d=0.712 std_dev=0.283
N1	B	0, 0.343, 0.633, 0.922, 1.300 max_d=1.300 avg_d=0.633 std_dev=0.290
O3'	A	0, 0.481, 0.773, 1.066, 1.605 max_d=1.605 avg_d=0.773 std_dev=0.293
C2	B	0, 0.376, 0.674, 0.972, 1.265 max_d=1.265 avg_d=0.674 std_dev=0.298
OP1	A	0, 0.334, 0.638, 0.943, 1.885 max_d=1.885 avg_d=0.638 std_dev=0.304
O3'	B	0, 0.396, 0.701, 1.005, 1.759 max_d=1.759 avg_d=0.701 std_dev=0.305
C1'	B	0, 0.485, 0.804, 1.123, 1.685 max_d=1.685 avg_d=0.804 std_dev=0.319
C5'	A	0, 0.753, 1.079, 1.406, 1.853 max_d=1.853 avg_d=1.079 std_dev=0.327
O6	B	0, 0.344, 0.683, 1.022, 1.806 max_d=1.806 avg_d=0.683 std_dev=0.339
O2'	B	0, 0.467, 0.823, 1.179, 1.798 max_d=1.798 avg_d=0.823 std_dev=0.356
N2	B	0, 0.552, 0.956, 1.361, 1.786 max_d=1.786 avg_d=0.956 std_dev=0.405
O5'	B	0, 0.711, 1.171, 1.631, 2.187 max_d=2.187 avg_d=1.171 std_dev=0.460
O4'	B	0, 0.595, 1.063, 1.532, 2.311 max_d=2.311 avg_d=1.063 std_dev=0.469
C4'	B	0, 0.581, 1.068, 1.556, 2.434 max_d=2.434 avg_d=1.068 std_dev=0.488
P	B	0, 0.846, 1.424, 2.001, 3.003 max_d=3.003 avg_d=1.424 std_dev=0.578
C5'	B	0, 0.671, 1.337, 2.004, 3.065 max_d=3.065 avg_d=1.337 std_dev=0.666
OP2	B	0, 0.688, 1.396, 2.105, 3.845 max_d=3.845 avg_d=1.396 std_dev=0.709
OP1	B	0, 0.911, 1.764, 2.616, 4.905 max_d=4.905 avg_d=1.764 std_dev=0.852

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.07	0.07	0.18	0.08
C2	0.02	0.00	0.07	0.08	0.01	0.04	0.02	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.10	0.04	0.15	0.12	0.24	0.14
C2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.06	0.03	0.06	0.07	0.11	0.00	0.02	0.01	0.09	0.12	0.16	0.08
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.10	0.01	0.11	0.02	0.11	0.06	0.10	0.12	0.11	0.02	0.01	0.01	0.13	0.17	0.14	0.11
C4	0.03	0.01	0.06	0.10	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.06	0.13	0.04	0.22	0.21	0.29	0.22
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.07	0.00	0.08	0.01	0.08	0.04	0.05	0.08	0.05	0.06	0.02	0.01	0.02	0.09	0.13	0.04
C5	0.03	0.02	0.06	0.11	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.14	0.05	0.23	0.21	0.28	0.22
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.13	0.01	0.15	0.00	0.13	0.07	0.10	0.15	0.06	0.06	0.04	0.02	0.01	0.11	0.11	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.08	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.12	0.05	0.19	0.16	0.23	0.17
N1	0.01	0.01	0.03	0.06	0.02	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.07	0.02	0.14	0.11	0.21	0.12
N3	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.08	0.12	0.04	0.18	0.17	0.27	0.19
N4	0.03	0.02	0.07	0.12	0.01	0.08	0.01	0.15	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.07	0.16	0.05	0.24	0.25	0.32	0.25
O2	0.04	0.01	0.11	0.11	0.02	0.05	0.02	0.06	0.02	0.02	0.02	0.03	0.00	0.12	0.13	0.05	0.12	0.10	0.22	0.12
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.06	0.06	0.05	0.06	0.05	0.03	0.08	0.07	0.12	0.00	0.05	0.06	0.07	0.13	0.15	0.07
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.13	0.02	0.14	0.04	0.12	0.07	0.12	0.16	0.13	0.05	0.00	0.02	0.15	0.24	0.17	0.15
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.04	0.05	0.05	0.06	0.02	0.00	0.08	0.10	0.20	0.11
O5'	0.07	0.15	0.09	0.13	0.22	0.02	0.23	0.01	0.19	0.14	0.18	0.24	0.12	0.07	0.15	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.07	0.12	0.12	0.17	0.21	0.09	0.21	0.11	0.16	0.11	0.17	0.25	0.10	0.13	0.24	0.10	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.18	0.24	0.16	0.14	0.29	0.13	0.28	0.11	0.23	0.21	0.27	0.32	0.22	0.15	0.17	0.20	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.08	0.14	0.08	0.11	0.22	0.04	0.22	0.02	0.17	0.12	0.19	0.25	0.12	0.07	0.15	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.25	0.19	0.18	0.15	0.17	0.16	0.22	0.20	0.18	0.24	0.33	0.19	0.17	0.17	0.29	0.18	0.17	0.46	0.22	0.56	0.57	0.45
C2	0.20	0.20	0.19	0.20	0.17	0.21	0.18	0.32	0.18	0.22	0.18	0.27	0.18	0.23	0.19	0.25	0.19	0.19	0.55	0.22	0.69	0.76	0.59
C2'	0.18	0.25	0.16	0.13	0.15	0.13	0.16	0.21	0.19	0.17	0.24	0.34	0.20	0.17	0.15	0.29	0.14	0.14	0.46	0.22	0.59	0.58	0.47
C3'	0.15	0.24	0.15	0.12	0.13	0.11	0.14	0.20	0.17	0.17	0.22	0.33	0.19	0.17	0.13	0.28	0.14	0.11	0.45	0.19	0.59	0.53	0.45
C4	0.20	0.19	0.19	0.26	0.14	0.30	0.14	0.45	0.13	0.26	0.19	0.24	0.15	0.24	0.20	0.20	0.24	0.26	0.61	0.16	0.82	0.90	0.71
C4'	0.18	0.28	0.16	0.11	0.16	0.11	0.15	0.14	0.19	0.17	0.25	0.36	0.23	0.16	0.15	0.30	0.13	0.14	0.39	0.20	0.52	0.41	0.37
C5	0.20	0.20	0.19	0.27	0.14	0.31	0.14	0.44	0.17	0.23	0.20	0.23	0.16	0.20	0.19	0.20	0.24	0.27	0.58	0.19	0.75	0.82	0.66
C5'	0.22	0.29	0.23	0.13	0.21	0.14	0.19	0.14	0.21	0.21	0.26	0.36	0.27	0.19	0.20	0.33	0.14	0.18	0.37	0.20	0.52	0.34	0.34
C6	0.17	0.22	0.18	0.22	0.13	0.24	0.14	0.34	0.17	0.19	0.21	0.26	0.17	0.18	0.16	0.21	0.21	0.20	0.52	0.18	0.65	0.68	0.55
N1	0.17	0.21	0.18	0.19	0.13	0.19	0.14	0.29	0.17	0.19	0.20	0.27	0.16	0.18	0.16	0.25	0.18	0.17	0.51	0.19	0.63	0.67	0.53
N3	0.20	0.20	0.19	0.23	0.17	0.26	0.18	0.39	0.14	0.25	0.17	0.27	0.18	0.26	0.21	0.22	0.21	0.23	0.59	0.18	0.78	0.86	0.67
N4	0.23	0.20	0.21	0.29	0.17	0.36	0.17	0.51	0.17	0.30	0.22	0.25	0.16	0.28	0.23	0.20	0.27	0.32	0.64	0.20	0.92	1.00	0.79
O2	0.23	0.24	0.20	0.19	0.21	0.20	0.22	0.29	0.24	0.23	0.23	0.32	0.23	0.24	0.22	0.29	0.18	0.21	0.54	0.28	0.67	0.74	0.57
O2'	0.22	0.29	0.18	0.15	0.19	0.15	0.19	0.19	0.23	0.18	0.28	0.38	0.24	0.18	0.18	0.32	0.16	0.19	0.43	0.26	0.55	0.53	0.43
O3'	0.16	0.25	0.16	0.12	0.13	0.12	0.14	0.20	0.18	0.17	0.23	0.35	0.20	0.17	0.14	0.30	0.15	0.12	0.44	0.20	0.60	0.51	0.44
O4'	0.18	0.28	0.17	0.17	0.16	0.15	0.16	0.19	0.21	0.17	0.26	0.36	0.22	0.16	0.15	0.29	0.19	0.16	0.42	0.21	0.51	0.46	0.39
O5'	0.18	0.27	0.21	0.08	0.19	0.06	0.20	0.13	0.22	0.22	0.25	0.32	0.24	0.22	0.19	0.28	0.02	0.11	0.42	0.23	0.59	0.41	0.41
OP1	0.05	0.21	0.10	0.03	0.10	0.09	0.12	0.20	0.14	0.18	0.18	0.29	0.18	0.18	0.08	0.15	0.02	0.06	0.34	0.16	0.63	0.38	0.37
OP2	0.10	0.22	0.12	0.07	0.18	0.17	0.22	0.31	0.23	0.24	0.23	0.25	0.19	0.26	0.16	0.11	0.02	0.14	0.48	0.26	0.73	0.47	0.51
P	0.06	0.19	0.10	0.02	0.11	0.08	0.13	0.18	0.15	0.18	0.17	0.25	0.16	0.18	0.09	0.14	0.01	0.04	0.37	0.17	0.60	0.34	0.37

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.04	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.20	0.03	0.25	0.28	0.16
C2	0.04	0.00	0.13	0.15	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.19	0.04	0.38	0.02	0.49	0.55	0.37
C2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.06	0.02	0.05	0.02	0.07	0.07	0.10	0.16	0.13	0.06	0.03	0.01	0.02	0.01	0.24	0.07	0.30	0.22	0.19
C3'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.08	0.01	0.08	0.02	0.10	0.12	0.13	0.19	0.14	0.10	0.05	0.02	0.01	0.01	0.32	0.10	0.39	0.20	0.25
C4	0.02	0.01	0.06	0.08	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.09	0.02	0.40	0.02	0.49	0.53	0.38
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.09	0.07	0.09	0.07	0.09	0.04	0.06	0.02	0.00	0.02	0.08	0.18	0.27	0.07
C5	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.07	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.09	0.03	0.49	0.02	0.63	0.69	0.51
C5'	0.04	0.13	0.02	0.02	0.13	0.01	0.17	0.00	0.18	0.18	0.16	0.13	0.11	0.20	0.12	0.06	0.04	0.02	0.01	0.20	0.24	0.35	0.02
C6	0.03	0.01	0.07	0.10	0.01	0.07	0.01	0.18	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.08	0.11	0.03	0.51	0.01	0.67	0.75	0.54
C8	0.01	0.02	0.07	0.12	0.01	0.09	0.01	0.18	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.14	0.04	0.50	0.03	0.57	0.59	0.47
N1	0.04	0.01	0.10	0.13	0.02	0.07	0.01	0.16	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.10	0.15	0.04	0.45	0.01	0.59	0.67	0.47
N2	0.05	0.01	0.16	0.19	0.02	0.09	0.01	0.13	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.15	0.24	0.06	0.34	0.02	0.46	0.52	0.34
N3	0.04	0.01	0.13	0.14	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.11	0.17	0.04	0.34	0.02	0.42	0.47	0.32
N7	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.09	0.01	0.20	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.12	0.04	0.55	0.03	0.69	0.74	0.57
N9	0.01	0.02	0.03	0.05	0.01	0.04	0.01	0.12	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.37	0.03	0.42	0.45	0.33
O2'	0.02	0.12	0.01	0.02	0.06	0.06	0.06	0.06	0.08	0.05	0.10	0.15	0.11	0.05	0.03	0.00	0.05	0.05	0.08	0.08	0.24	0.21	0.11
O3'	0.02	0.19	0.02	0.01	0.09	0.02	0.09	0.04	0.11	0.14	0.15	0.24	0.17	0.12	0.05	0.05	0.00	0.02	0.29	0.12	0.47	0.23	0.26
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.04	0.04	0.06	0.04	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.16	0.04	0.19	0.31	0.17
O5'	0.20	0.38	0.24	0.32	0.40	0.02	0.49	0.01	0.51	0.50	0.45	0.34	0.34	0.55	0.37	0.08	0.29	0.16	0.00	0.55	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.07	0.10	0.02	0.08	0.02	0.20	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.08	0.12	0.04	0.55	0.00	0.75	0.84	0.61
OP1	0.25	0.49	0.30	0.39	0.49	0.18	0.63	0.24	0.67	0.57	0.59	0.46	0.42	0.69	0.42	0.24	0.47	0.19	0.02	0.75	0.00	0.02	0.01
OP2	0.28	0.55	0.22	0.20	0.53	0.27	0.69	0.35	0.75	0.59	0.67	0.52	0.47	0.74	0.45	0.21	0.23	0.31	0.02	0.84	0.02	0.00	0.01
P	0.16	0.37	0.19	0.25	0.38	0.07	0.51	0.02	0.54	0.47	0.47	0.34	0.32	0.57	0.33	0.11	0.26	0.17	0.01	0.61	0.01	0.01	0.00