Doublet Group distance statistics: 54490

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 10, 8, 5, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.018, 0.029, 0.040, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.029 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.010, 0.021, 0.032, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.021 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.019, 0.031, 0.043, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.031 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.020, 0.033, 0.046, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.033 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.039, 0.053, 0.067, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.053 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.033, 0.049, 0.064, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.049 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.036, 0.053, 0.071, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.053 std_dev=0.017
N4	A	0, 0.062, 0.094, 0.126, 0.160 max_d=0.160 avg_d=0.094 std_dev=0.032
O2	A	0, 0.064, 0.097, 0.129, 0.184 max_d=0.184 avg_d=0.097 std_dev=0.033
O4'	A	0, 0.107, 0.227, 0.347, 0.486 max_d=0.486 avg_d=0.227 std_dev=0.120
C2'	A	0, 0.142, 0.283, 0.424, 0.579 max_d=0.579 avg_d=0.283 std_dev=0.141
O2'	A	0, 0.198, 0.344, 0.491, 0.666 max_d=0.666 avg_d=0.344 std_dev=0.146
N1	B	0, 0.209, 0.407, 0.604, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.407 std_dev=0.197
N3	B	0, 0.217, 0.426, 0.634, 0.877 max_d=0.877 avg_d=0.426 std_dev=0.209
C2	B	0, 0.150, 0.361, 0.573, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.361 std_dev=0.211
C4'	A	0, 0.177, 0.394, 0.612, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.394 std_dev=0.217
C4	B	0, 0.418, 0.643, 0.868, 1.053 max_d=1.053 avg_d=0.643 std_dev=0.225
C3'	A	0, 0.194, 0.424, 0.653, 0.887 max_d=0.887 avg_d=0.424 std_dev=0.230
C6	B	0, 0.325, 0.558, 0.791, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.558 std_dev=0.233
C5	B	0, 0.500, 0.740, 0.981, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.740 std_dev=0.240
N9	B	0, 0.737, 1.022, 1.306, 1.493 max_d=1.493 avg_d=1.022 std_dev=0.284
O6	B	0, 0.422, 0.722, 1.022, 1.282 max_d=1.282 avg_d=0.722 std_dev=0.300
N2	B	0, 0.341, 0.643, 0.946, 1.377 max_d=1.377 avg_d=0.643 std_dev=0.302
N7	B	0, 0.853, 1.161, 1.469, 1.612 max_d=1.612 avg_d=1.161 std_dev=0.308
C1'	B	0, 0.920, 1.251, 1.581, 1.834 max_d=1.834 avg_d=1.251 std_dev=0.331
C8	B	0, 0.965, 1.303, 1.640, 1.785 max_d=1.785 avg_d=1.303 std_dev=0.337
O3'	A	0, 0.282, 0.621, 0.961, 1.325 max_d=1.325 avg_d=0.621 std_dev=0.339
C5'	A	0, 0.244, 0.618, 0.992, 1.375 max_d=1.375 avg_d=0.618 std_dev=0.374
OP1	A	0, 1.404, 1.829, 2.254, 2.556 max_d=2.556 avg_d=1.829 std_dev=0.425
O5'	A	0, 1.274, 1.759, 2.245, 2.539 max_d=2.539 avg_d=1.759 std_dev=0.486
P	A	0, 1.200, 1.803, 2.407, 2.710 max_d=2.710 avg_d=1.803 std_dev=0.604
C2'	B	0, 2.564, 3.200, 3.836, 3.870 max_d=3.870 avg_d=3.200 std_dev=0.636
O4'	B	0, 1.888, 2.624, 3.360, 3.532 max_d=3.532 avg_d=2.624 std_dev=0.736
O2'	B	0, 2.863, 3.663, 4.463, 4.668 max_d=4.668 avg_d=3.663 std_dev=0.800
C3'	B	0, 3.141, 3.960, 4.780, 4.833 max_d=4.833 avg_d=3.960 std_dev=0.819
OP2	A	0, 2.819, 3.641, 4.462, 4.570 max_d=4.570 avg_d=3.641 std_dev=0.822
O3'	B	0, 3.322, 4.232, 5.142, 5.259 max_d=5.259 avg_d=4.232 std_dev=0.910
C4'	B	0, 3.046, 3.975, 4.904, 5.029 max_d=5.029 avg_d=3.975 std_dev=0.929
O5'	B	0, 3.869, 4.982, 6.095, 6.299 max_d=6.299 avg_d=4.982 std_dev=1.113
C5'	B	0, 4.354, 5.598, 6.843, 6.818 max_d=6.818 avg_d=5.598 std_dev=1.245
P	B	0, 4.941, 6.256, 7.572, 7.944 max_d=7.944 avg_d=6.256 std_dev=1.315
OP1	B	0, 5.513, 6.883, 8.252, 7.839 max_d=7.839 avg_d=6.883 std_dev=1.369
OP2	B	0, 5.647, 7.192, 8.737, 8.814 max_d=8.814 avg_d=7.192 std_dev=1.545

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.12	0.13	0.16	0.08
C2	0.02	0.00	0.08	0.11	0.01	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.08	0.13	0.03	0.21	0.21	0.27	0.19
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.06	0.03	0.07	0.06	0.13	0.01	0.02	0.01	0.14	0.23	0.13	0.12
C3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.11	0.00	0.11	0.03	0.10	0.07	0.13	0.12	0.14	0.02	0.01	0.02	0.16	0.27	0.11	0.16
C4	0.02	0.01	0.05	0.11	0.00	0.09	0.00	0.21	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.14	0.04	0.28	0.30	0.37	0.29
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.09	0.00	0.10	0.01	0.09	0.05	0.07	0.10	0.05	0.07	0.02	0.00	0.02	0.12	0.14	0.03
C5	0.02	0.01	0.06	0.11	0.00	0.10	0.00	0.22	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.14	0.05	0.29	0.29	0.35	0.28
C5'	0.04	0.13	0.02	0.03	0.21	0.01	0.22	0.00	0.18	0.12	0.17	0.23	0.09	0.06	0.05	0.02	0.01	0.13	0.19	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.09	0.00	0.18	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.12	0.05	0.25	0.23	0.26	0.21
N1	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.05	0.02	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.02	0.20	0.18	0.22	0.16
N3	0.02	0.00	0.07	0.13	0.00	0.07	0.01	0.17	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.15	0.03	0.25	0.26	0.33	0.24
N4	0.02	0.02	0.06	0.12	0.00	0.10	0.01	0.23	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.16	0.04	0.30	0.34	0.41	0.32
O2	0.04	0.00	0.13	0.14	0.02	0.05	0.02	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.12	0.17	0.05	0.18	0.18	0.25	0.16
O2'	0.01	0.08	0.01	0.02	0.07	0.07	0.05	0.06	0.04	0.03	0.09	0.08	0.12	0.00	0.04	0.06	0.09	0.21	0.10	0.08
O3'	0.01	0.13	0.02	0.01	0.14	0.02	0.14	0.05	0.12	0.07	0.15	0.16	0.17	0.04	0.00	0.02	0.15	0.35	0.17	0.21
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.05	0.02	0.05	0.02	0.03	0.04	0.05	0.06	0.02	0.00	0.09	0.10	0.19	0.10
O5'	0.12	0.21	0.14	0.16	0.28	0.02	0.29	0.01	0.25	0.20	0.25	0.30	0.18	0.09	0.15	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.13	0.21	0.23	0.27	0.30	0.12	0.29	0.13	0.23	0.18	0.26	0.34	0.18	0.21	0.35	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.27	0.13	0.11	0.37	0.14	0.35	0.19	0.26	0.22	0.33	0.41	0.25	0.10	0.17	0.19	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.19	0.12	0.16	0.29	0.03	0.28	0.02	0.21	0.16	0.24	0.32	0.16	0.08	0.21	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.21	0.23	0.16	0.15	0.17	0.16	0.15	0.21	0.15	0.22	0.26	0.19	0.16	0.16	0.40	0.15	0.19	0.57	0.24	0.67	0.59	0.55
C2	0.20	0.16	0.21	0.17	0.14	0.15	0.15	0.20	0.18	0.17	0.14	0.27	0.18	0.19	0.15	0.35	0.17	0.16	0.71	0.24	0.86	0.80	0.72
C2'	0.18	0.20	0.19	0.14	0.13	0.12	0.16	0.15	0.19	0.14	0.20	0.27	0.17	0.17	0.13	0.36	0.13	0.14	0.56	0.23	0.66	0.62	0.55
C3'	0.15	0.20	0.18	0.17	0.15	0.15	0.18	0.19	0.20	0.17	0.21	0.25	0.16	0.19	0.14	0.30	0.17	0.13	0.53	0.23	0.63	0.57	0.52
C4	0.19	0.21	0.22	0.25	0.16	0.25	0.17	0.35	0.13	0.23	0.14	0.30	0.19	0.24	0.19	0.29	0.25	0.22	0.86	0.20	1.04	0.98	0.89
C4'	0.16	0.24	0.18	0.14	0.17	0.14	0.18	0.13	0.22	0.14	0.24	0.29	0.20	0.16	0.14	0.32	0.13	0.14	0.43	0.23	0.52	0.43	0.41
C5	0.20	0.18	0.24	0.27	0.15	0.27	0.15	0.35	0.15	0.22	0.16	0.24	0.18	0.21	0.19	0.29	0.27	0.23	0.84	0.19	0.99	0.92	0.85
C5'	0.21	0.28	0.23	0.19	0.22	0.18	0.21	0.17	0.24	0.18	0.26	0.31	0.26	0.19	0.20	0.31	0.17	0.18	0.38	0.23	0.48	0.36	0.36
C6	0.19	0.19	0.23	0.22	0.14	0.20	0.16	0.25	0.18	0.17	0.18	0.23	0.18	0.18	0.16	0.32	0.22	0.18	0.73	0.21	0.84	0.76	0.71
N1	0.19	0.18	0.22	0.17	0.14	0.15	0.15	0.18	0.19	0.16	0.18	0.24	0.17	0.17	0.15	0.36	0.16	0.16	0.67	0.23	0.79	0.71	0.65
N3	0.19	0.20	0.21	0.20	0.15	0.19	0.17	0.27	0.16	0.20	0.11	0.33	0.20	0.22	0.17	0.32	0.20	0.17	0.80	0.23	0.98	0.92	0.82
N4	0.22	0.24	0.23	0.29	0.19	0.30	0.21	0.42	0.15	0.29	0.20	0.33	0.21	0.30	0.23	0.27	0.29	0.27	0.93	0.18	1.15	1.11	0.99
O2	0.22	0.16	0.21	0.15	0.15	0.15	0.16	0.16	0.19	0.16	0.15	0.27	0.19	0.19	0.16	0.38	0.14	0.18	0.67	0.26	0.83	0.76	0.68
O2'	0.23	0.23	0.22	0.15	0.17	0.17	0.17	0.13	0.21	0.15	0.23	0.30	0.21	0.16	0.16	0.40	0.13	0.20	0.51	0.24	0.61	0.54	0.49
O3'	0.15	0.20	0.18	0.20	0.15	0.18	0.18	0.23	0.20	0.19	0.21	0.26	0.17	0.21	0.15	0.28	0.21	0.15	0.49	0.23	0.60	0.55	0.50
O4'	0.20	0.24	0.22	0.17	0.16	0.19	0.18	0.16	0.22	0.15	0.25	0.29	0.18	0.16	0.15	0.38	0.17	0.19	0.50	0.24	0.58	0.49	0.47
O5'	0.16	0.27	0.19	0.13	0.23	0.10	0.26	0.14	0.29	0.23	0.29	0.28	0.23	0.26	0.20	0.23	0.10	0.11	0.54	0.30	0.62	0.50	0.51
OP1	0.04	0.19	0.07	0.08	0.11	0.11	0.15	0.20	0.18	0.12	0.20	0.22	0.14	0.15	0.07	0.12	0.09	0.06	0.45	0.20	0.61	0.39	0.46
OP2	0.12	0.24	0.14	0.07	0.19	0.12	0.21	0.25	0.25	0.17	0.26	0.26	0.21	0.21	0.14	0.16	0.03	0.10	0.76	0.26	0.87	0.66	0.74
P	0.05	0.18	0.10	0.09	0.12	0.09	0.16	0.17	0.19	0.14	0.19	0.20	0.14	0.16	0.09	0.12	0.09	0.04	0.54	0.20	0.64	0.44	0.51

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.04	0.06	0.05	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.20	0.02	0.24	0.36	0.18
C2	0.05	0.00	0.09	0.12	0.02	0.05	0.02	0.11	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.13	0.05	0.50	0.02	0.63	0.64	0.51
C2'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.05	0.02	0.05	0.03	0.06	0.05	0.08	0.11	0.09	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.29	0.06	0.32	0.30	0.23
C3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.08	0.01	0.08	0.02	0.10	0.09	0.11	0.14	0.11	0.09	0.05	0.02	0.01	0.01	0.40	0.10	0.42	0.28	0.32
C4	0.02	0.02	0.05	0.08	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.02	0.51	0.01	0.59	0.61	0.49
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.06	0.06	0.05	0.07	0.05	0.07	0.03	0.07	0.02	0.00	0.02	0.07	0.17	0.33	0.04
C5	0.02	0.02	0.05	0.08	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.09	0.03	0.64	0.01	0.77	0.76	0.65
C5'	0.03	0.11	0.03	0.02	0.10	0.01	0.13	0.00	0.15	0.12	0.13	0.11	0.09	0.14	0.08	0.07	0.04	0.01	0.01	0.17	0.24	0.43	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.11	0.03	0.68	0.01	0.86	0.85	0.71
C8	0.02	0.02	0.05	0.09	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.10	0.05	0.59	0.03	0.64	0.65	0.57
N1	0.04	0.01	0.08	0.11	0.01	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.13	0.03	0.61	0.01	0.77	0.77	0.63
N2	0.06	0.01	0.11	0.14	0.02	0.07	0.02	0.11	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.16	0.16	0.06	0.46	0.02	0.59	0.61	0.46
N3	0.05	0.01	0.09	0.11	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.11	0.05	0.43	0.01	0.53	0.55	0.42
N7	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.05	0.69	0.03	0.82	0.81	0.70
N9	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.45	0.02	0.48	0.52	0.41
O2'	0.02	0.14	0.00	0.02	0.07	0.07	0.07	0.07	0.09	0.05	0.12	0.16	0.12	0.06	0.03	0.00	0.04	0.07	0.09	0.09	0.22	0.26	0.08
O3'	0.03	0.13	0.02	0.01	0.08	0.02	0.09	0.04	0.11	0.10	0.13	0.16	0.11	0.11	0.05	0.04	0.00	0.02	0.33	0.12	0.44	0.26	0.30
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	0.06	0.05	0.05	0.01	0.07	0.02	0.00	0.12	0.05	0.14	0.40	0.15
O5'	0.20	0.50	0.29	0.40	0.51	0.02	0.64	0.01	0.68	0.59	0.61	0.46	0.43	0.69	0.45	0.09	0.33	0.12	0.00	0.75	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.06	0.10	0.01	0.07	0.01	0.17	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.09	0.12	0.05	0.75	0.00	0.97	0.96	0.81
OP1	0.24	0.63	0.32	0.42	0.59	0.17	0.77	0.24	0.86	0.64	0.77	0.59	0.53	0.82	0.48	0.22	0.44	0.14	0.02	0.97	0.00	0.01	0.00
OP2	0.36	0.64	0.30	0.28	0.61	0.33	0.76	0.43	0.85	0.65	0.77	0.61	0.55	0.81	0.52	0.26	0.26	0.40	0.02	0.96	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.51	0.23	0.32	0.49	0.04	0.65	0.01	0.71	0.57	0.63	0.46	0.42	0.70	0.41	0.08	0.30	0.15	0.01	0.81	0.00	0.01	0.00