Doublet Group distance statistics: 54491

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 5, 4, 6, 2, 3, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.005, 0.015, 0.024, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C5	A	0, -0.002, 0.010, 0.022, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.010 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.015, 0.028, 0.040, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.028 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.013, 0.026, 0.038, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.026 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.015, 0.029, 0.043, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.029 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.005, 0.021, 0.036, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.021 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.012, 0.029, 0.046, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.029 std_dev=0.017
O2	A	0, 0.037, 0.069, 0.101, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.069 std_dev=0.032
N4	A	0, 0.043, 0.083, 0.123, 0.184 max_d=0.184 avg_d=0.083 std_dev=0.040
C2'	A	0, 0.052, 0.148, 0.244, 0.441 max_d=0.441 avg_d=0.148 std_dev=0.096
O4'	A	0, 0.048, 0.167, 0.287, 0.449 max_d=0.449 avg_d=0.167 std_dev=0.120
O2'	A	0, 0.071, 0.203, 0.335, 0.465 max_d=0.465 avg_d=0.203 std_dev=0.132
C3'	A	0, 0.108, 0.288, 0.469, 0.726 max_d=0.726 avg_d=0.288 std_dev=0.181
C4'	A	0, 0.115, 0.296, 0.478, 0.699 max_d=0.699 avg_d=0.296 std_dev=0.182
N1	B	0, 0.367, 0.592, 0.816, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.592 std_dev=0.224
C4	B	0, 0.427, 0.664, 0.901, 1.254 max_d=1.254 avg_d=0.664 std_dev=0.237
O3'	A	0, 0.168, 0.407, 0.646, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.407 std_dev=0.239
C6	B	0, 0.427, 0.671, 0.915, 1.210 max_d=1.210 avg_d=0.671 std_dev=0.244
C5	B	0, 0.468, 0.720, 0.972, 1.335 max_d=1.335 avg_d=0.720 std_dev=0.252
N3	B	0, 0.285, 0.541, 0.798, 1.113 max_d=1.113 avg_d=0.541 std_dev=0.256
C5'	A	0, 0.235, 0.497, 0.759, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.497 std_dev=0.262
C2	B	0, 0.247, 0.511, 0.774, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.511 std_dev=0.263
N9	B	0, 0.570, 0.842, 1.114, 1.450 max_d=1.450 avg_d=0.842 std_dev=0.272
C2'	B	0, 0.597, 0.880, 1.163, 1.398 max_d=1.398 avg_d=0.880 std_dev=0.283
O6	B	0, 0.465, 0.760, 1.055, 1.274 max_d=1.274 avg_d=0.760 std_dev=0.295
N7	B	0, 0.582, 0.890, 1.198, 1.576 max_d=1.576 avg_d=0.890 std_dev=0.308
C1'	B	0, 0.644, 0.953, 1.261, 1.534 max_d=1.534 avg_d=0.953 std_dev=0.309
C8	B	0, 0.647, 0.957, 1.266, 1.628 max_d=1.628 avg_d=0.957 std_dev=0.309
N2	B	0, 0.214, 0.535, 0.857, 1.300 max_d=1.300 avg_d=0.535 std_dev=0.322
O2'	B	0, 0.713, 1.065, 1.417, 1.674 max_d=1.674 avg_d=1.065 std_dev=0.352
C3'	B	0, 0.569, 0.947, 1.326, 1.675 max_d=1.675 avg_d=0.947 std_dev=0.379
O4'	B	0, 0.750, 1.150, 1.551, 1.944 max_d=1.944 avg_d=1.150 std_dev=0.401
C4'	B	0, 0.711, 1.168, 1.625, 2.092 max_d=2.092 avg_d=1.168 std_dev=0.457
O3'	B	0, 0.583, 1.069, 1.555, 1.937 max_d=1.937 avg_d=1.069 std_dev=0.486
C5'	B	0, 0.703, 1.250, 1.797, 2.438 max_d=2.438 avg_d=1.250 std_dev=0.547
OP2	A	0, 0.224, 0.795, 1.366, 1.665 max_d=1.665 avg_d=0.795 std_dev=0.571
P	A	0, 0.412, 0.990, 1.567, 1.944 max_d=1.944 avg_d=0.990 std_dev=0.578
O5'	B	0, 0.871, 1.449, 2.028, 2.615 max_d=2.615 avg_d=1.449 std_dev=0.579
O5'	A	0, 0.392, 1.010, 1.629, 2.069 max_d=2.069 avg_d=1.010 std_dev=0.619
P	B	0, 0.629, 1.263, 1.897, 2.543 max_d=2.543 avg_d=1.263 std_dev=0.634
OP1	B	0, 0.655, 1.313, 1.971, 2.764 max_d=2.764 avg_d=1.313 std_dev=0.658
OP2	B	0, 0.607, 1.306, 2.005, 2.829 max_d=2.829 avg_d=1.306 std_dev=0.699
OP1	A	0, 0.605, 1.322, 2.040, 2.742 max_d=2.742 avg_d=1.322 std_dev=0.718

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.15	0.17	0.33	0.14
C2	0.02	0.00	0.05	0.09	0.02	0.05	0.02	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.09	0.03	0.35	0.29	0.34	0.26
C2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.05	0.02	0.07	0.03	0.06	0.03	0.05	0.06	0.08	0.00	0.02	0.01	0.25	0.30	0.24	0.19
C3'	0.02	0.09	0.01	0.00	0.11	0.01	0.12	0.03	0.11	0.07	0.10	0.12	0.10	0.03	0.01	0.02	0.35	0.40	0.20	0.27
C4	0.03	0.02	0.05	0.11	0.00	0.10	0.00	0.22	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.14	0.05	0.48	0.39	0.41	0.38
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.10	0.00	0.11	0.01	0.10	0.05	0.07	0.11	0.04	0.07	0.03	0.01	0.02	0.13	0.32	0.05
C5	0.03	0.02	0.07	0.12	0.00	0.11	0.00	0.23	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.14	0.06	0.49	0.38	0.39	0.38
C5'	0.03	0.12	0.03	0.03	0.22	0.01	0.23	0.00	0.20	0.12	0.17	0.24	0.08	0.07	0.05	0.01	0.01	0.17	0.38	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.10	0.00	0.20	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.12	0.06	0.42	0.31	0.34	0.30
N1	0.01	0.01	0.03	0.07	0.02	0.05	0.02	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.07	0.03	0.33	0.26	0.33	0.23
N3	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.07	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.12	0.03	0.42	0.34	0.38	0.32
N4	0.03	0.02	0.06	0.12	0.00	0.11	0.01	0.24	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.08	0.15	0.06	0.51	0.43	0.45	0.42
O2	0.04	0.01	0.08	0.10	0.02	0.04	0.02	0.08	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.11	0.11	0.05	0.29	0.26	0.33	0.22
O2'	0.02	0.07	0.00	0.03	0.07	0.07	0.05	0.07	0.04	0.03	0.08	0.08	0.11	0.00	0.05	0.06	0.09	0.20	0.27	0.11
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.14	0.03	0.14	0.05	0.12	0.07	0.12	0.15	0.11	0.05	0.00	0.02	0.29	0.46	0.22	0.29
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.05	0.01	0.06	0.01	0.06	0.03	0.03	0.06	0.05	0.06	0.02	0.00	0.08	0.11	0.41	0.16
O5'	0.15	0.35	0.25	0.35	0.48	0.02	0.49	0.01	0.42	0.33	0.42	0.51	0.29	0.09	0.29	0.08	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.17	0.29	0.30	0.40	0.39	0.13	0.38	0.17	0.31	0.26	0.34	0.43	0.26	0.20	0.46	0.11	0.02	0.00	0.03	0.01
OP2	0.33	0.34	0.24	0.20	0.41	0.32	0.39	0.38	0.34	0.33	0.38	0.45	0.33	0.27	0.22	0.41	0.03	0.03	0.00	0.01
P	0.14	0.26	0.19	0.27	0.38	0.05	0.38	0.02	0.30	0.23	0.32	0.42	0.22	0.11	0.29	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.23	0.19	0.18	0.18	0.18	0.18	0.19	0.21	0.20	0.24	0.28	0.20	0.19	0.19	0.25	0.19	0.19	0.24	0.22	0.36	0.40	0.31
C2	0.21	0.22	0.21	0.24	0.19	0.22	0.21	0.25	0.22	0.23	0.23	0.27	0.20	0.24	0.21	0.24	0.26	0.21	0.29	0.25	0.39	0.44	0.36
C2'	0.18	0.24	0.16	0.18	0.16	0.16	0.17	0.18	0.21	0.17	0.24	0.32	0.20	0.19	0.16	0.24	0.24	0.15	0.23	0.23	0.36	0.42	0.31
C3'	0.17	0.22	0.21	0.26	0.14	0.25	0.18	0.28	0.21	0.18	0.23	0.28	0.17	0.20	0.14	0.28	0.34	0.19	0.29	0.25	0.38	0.45	0.34
C4	0.28	0.19	0.28	0.35	0.22	0.34	0.25	0.38	0.24	0.32	0.22	0.22	0.19	0.32	0.28	0.28	0.37	0.31	0.41	0.29	0.48	0.54	0.47
C4'	0.15	0.25	0.15	0.15	0.14	0.15	0.17	0.15	0.21	0.15	0.24	0.31	0.20	0.18	0.12	0.26	0.20	0.14	0.18	0.23	0.30	0.38	0.25
C5	0.30	0.18	0.31	0.38	0.23	0.37	0.25	0.39	0.24	0.33	0.22	0.20	0.19	0.31	0.29	0.30	0.39	0.34	0.42	0.29	0.47	0.53	0.46
C5'	0.28	0.29	0.31	0.27	0.22	0.31	0.22	0.27	0.25	0.20	0.27	0.35	0.29	0.22	0.20	0.48	0.34	0.29	0.22	0.26	0.26	0.38	0.24
C6	0.25	0.20	0.27	0.31	0.20	0.29	0.22	0.31	0.24	0.26	0.24	0.22	0.18	0.25	0.24	0.28	0.33	0.26	0.33	0.27	0.40	0.46	0.38
N1	0.20	0.21	0.21	0.23	0.18	0.22	0.20	0.23	0.22	0.22	0.24	0.25	0.18	0.22	0.20	0.25	0.26	0.20	0.28	0.25	0.37	0.43	0.34
N3	0.23	0.21	0.24	0.29	0.21	0.27	0.24	0.31	0.23	0.27	0.22	0.26	0.20	0.28	0.24	0.25	0.31	0.25	0.35	0.27	0.44	0.49	0.42
N4	0.31	0.20	0.31	0.38	0.24	0.39	0.27	0.44	0.24	0.37	0.22	0.23	0.20	0.37	0.31	0.29	0.41	0.36	0.48	0.29	0.55	0.61	0.54
O2	0.21	0.24	0.18	0.20	0.19	0.19	0.20	0.21	0.22	0.21	0.23	0.32	0.22	0.22	0.20	0.24	0.23	0.19	0.26	0.25	0.37	0.42	0.33
O2'	0.26	0.28	0.20	0.15	0.23	0.17	0.20	0.17	0.22	0.21	0.26	0.36	0.28	0.20	0.23	0.28	0.17	0.23	0.22	0.23	0.35	0.40	0.29
O3'	0.15	0.21	0.18	0.25	0.13	0.25	0.17	0.29	0.21	0.18	0.22	0.29	0.16	0.20	0.13	0.26	0.34	0.18	0.30	0.24	0.40	0.48	0.36
O4'	0.16	0.25	0.16	0.17	0.14	0.16	0.17	0.17	0.21	0.17	0.25	0.32	0.19	0.17	0.14	0.23	0.19	0.15	0.23	0.22	0.36	0.40	0.30
O5'	0.17	0.31	0.21	0.07	0.23	0.08	0.27	0.09	0.33	0.19	0.34	0.34	0.27	0.25	0.17	0.37	0.02	0.12	0.20	0.36	0.33	0.40	0.28
OP1	0.07	0.23	0.10	0.03	0.13	0.06	0.15	0.15	0.20	0.13	0.23	0.28	0.19	0.16	0.07	0.22	0.03	0.04	0.21	0.22	0.39	0.39	0.30
OP2	0.16	0.29	0.20	0.11	0.24	0.17	0.26	0.32	0.28	0.25	0.29	0.31	0.26	0.28	0.21	0.22	0.03	0.16	0.37	0.30	0.45	0.49	0.41
P	0.07	0.20	0.12	0.03	0.13	0.05	0.16	0.15	0.19	0.13	0.21	0.24	0.17	0.16	0.09	0.21	0.01	0.03	0.20	0.22	0.33	0.37	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.03	0.11	0.11	0.07
C2	0.04	0.00	0.11	0.12	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.16	0.04	0.15	0.02	0.22	0.26	0.18
C2'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.07	0.01	0.06	0.02	0.08	0.05	0.10	0.13	0.11	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.08	0.07	0.18	0.15	0.11
C3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.08	0.01	0.09	0.02	0.11	0.09	0.12	0.14	0.11	0.09	0.05	0.03	0.01	0.01	0.08	0.11	0.21	0.19	0.15
C4	0.02	0.01	0.07	0.08	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.10	0.02	0.15	0.01	0.19	0.22	0.17
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.08	0.04	0.06	0.05	0.08	0.03	0.06	0.01	0.01	0.02	0.06	0.11	0.05	0.04
C5	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.03	0.19	0.01	0.24	0.28	0.22
C5'	0.03	0.07	0.02	0.02	0.08	0.01	0.12	0.00	0.12	0.14	0.09	0.06	0.05	0.16	0.08	0.06	0.03	0.02	0.01	0.14	0.09	0.03	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.11	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.14	0.03	0.20	0.01	0.27	0.31	0.24
C8	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.08	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.10	0.04	0.18	0.02	0.20	0.21	0.18
N1	0.03	0.00	0.10	0.12	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.16	0.03	0.18	0.02	0.25	0.30	0.22
N2	0.04	0.00	0.13	0.14	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.19	0.05	0.14	0.03	0.22	0.26	0.17
N3	0.04	0.00	0.11	0.11	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.13	0.14	0.04	0.13	0.02	0.18	0.22	0.15
N7	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.08	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.05	0.11	0.04	0.21	0.02	0.26	0.28	0.23
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.05	0.01	0.13	0.02	0.16	0.17	0.13
O2'	0.02	0.14	0.00	0.03	0.08	0.06	0.06	0.06	0.09	0.05	0.12	0.17	0.13	0.05	0.03	0.00	0.04	0.05	0.08	0.08	0.20	0.14	0.12
O3'	0.01	0.16	0.01	0.01	0.10	0.01	0.11	0.03	0.14	0.10	0.16	0.19	0.14	0.11	0.05	0.04	0.00	0.01	0.11	0.15	0.30	0.28	0.21
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.05	0.04	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.08	0.04	0.09	0.14	0.10
O5'	0.08	0.15	0.08	0.08	0.15	0.02	0.19	0.01	0.20	0.18	0.18	0.14	0.13	0.21	0.13	0.08	0.11	0.08	0.00	0.21	0.02	0.03	0.01
O6	0.03	0.02	0.07	0.11	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.08	0.15	0.04	0.21	0.00	0.30	0.34	0.27
OP1	0.11	0.22	0.18	0.21	0.19	0.11	0.24	0.09	0.27	0.20	0.25	0.22	0.18	0.26	0.16	0.20	0.30	0.09	0.02	0.30	0.00	0.03	0.01
OP2	0.11	0.26	0.15	0.19	0.22	0.05	0.28	0.03	0.31	0.21	0.30	0.26	0.22	0.28	0.17	0.14	0.28	0.14	0.03	0.34	0.03	0.00	0.01
P	0.07	0.18	0.11	0.15	0.17	0.04	0.22	0.02	0.24	0.18	0.22	0.17	0.15	0.23	0.13	0.12	0.21	0.10	0.01	0.27	0.01	0.01	0.00