Doublet Group distance statistics: 54492

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 3, 7, 3, 5, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.006, 0.011, 0.016, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.011 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.024, 0.035, 0.047, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.035 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.027, 0.039, 0.051, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.039 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.022, 0.035, 0.047, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.035 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.018, 0.031, 0.044, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.031 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.029, 0.042, 0.056, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.042 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.040, 0.058, 0.076, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.058 std_dev=0.018
O2	A	0, 0.077, 0.115, 0.154, 0.169 max_d=0.169 avg_d=0.115 std_dev=0.039
N4	A	0, 0.043, 0.089, 0.134, 0.228 max_d=0.228 avg_d=0.089 std_dev=0.045
O4'	A	0, 0.062, 0.164, 0.265, 0.370 max_d=0.370 avg_d=0.164 std_dev=0.101
C2'	A	0, 0.119, 0.228, 0.337, 0.414 max_d=0.414 avg_d=0.228 std_dev=0.109
O2'	A	0, 0.148, 0.287, 0.427, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.287 std_dev=0.140
C4'	A	0, 0.147, 0.298, 0.449, 0.616 max_d=0.616 avg_d=0.298 std_dev=0.151
C3'	A	0, 0.124, 0.303, 0.483, 0.650 max_d=0.650 avg_d=0.303 std_dev=0.179
C4	B	0, 0.233, 0.421, 0.609, 0.717 max_d=0.717 avg_d=0.421 std_dev=0.188
N3	B	0, 0.292, 0.493, 0.693, 0.835 max_d=0.835 avg_d=0.493 std_dev=0.200
C2	B	0, 0.403, 0.617, 0.830, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.617 std_dev=0.214
C5	B	0, 0.300, 0.528, 0.756, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.528 std_dev=0.228
C5'	A	0, 0.279, 0.509, 0.738, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.509 std_dev=0.229
N9	B	0, 0.259, 0.498, 0.737, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.498 std_dev=0.239
O5'	A	0, 0.285, 0.529, 0.773, 1.080 max_d=1.080 avg_d=0.529 std_dev=0.244
N1	B	0, 0.406, 0.653, 0.900, 1.053 max_d=1.053 avg_d=0.653 std_dev=0.247
C6	B	0, 0.385, 0.634, 0.883, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.634 std_dev=0.249
O3'	A	0, 0.203, 0.478, 0.753, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.478 std_dev=0.275
N2	B	0, 0.545, 0.825, 1.106, 1.370 max_d=1.370 avg_d=0.825 std_dev=0.281
N7	B	0, 0.392, 0.683, 0.974, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.683 std_dev=0.291
C2'	B	0, 0.249, 0.553, 0.858, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.553 std_dev=0.304
C8	B	0, 0.338, 0.646, 0.953, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.646 std_dev=0.307
O6	B	0, 0.504, 0.819, 1.134, 1.338 max_d=1.338 avg_d=0.819 std_dev=0.315
C1'	B	0, 0.287, 0.617, 0.947, 1.425 max_d=1.425 avg_d=0.617 std_dev=0.330
P	A	0, 0.371, 0.709, 1.047, 1.406 max_d=1.406 avg_d=0.709 std_dev=0.338
C3'	B	0, 0.386, 0.760, 1.135, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.760 std_dev=0.374
OP1	A	0, 0.438, 0.812, 1.187, 1.574 max_d=1.574 avg_d=0.812 std_dev=0.374
O3'	B	0, 0.453, 0.842, 1.231, 1.445 max_d=1.445 avg_d=0.842 std_dev=0.389
OP2	A	0, 0.416, 0.824, 1.232, 1.617 max_d=1.617 avg_d=0.824 std_dev=0.408
O4'	B	0, 0.367, 0.841, 1.315, 2.044 max_d=2.044 avg_d=0.841 std_dev=0.474
O2'	B	0, 0.224, 0.764, 1.304, 1.865 max_d=1.865 avg_d=0.764 std_dev=0.540
C4'	B	0, 0.417, 0.995, 1.573, 2.292 max_d=2.292 avg_d=0.995 std_dev=0.578
C5'	B	0, 0.622, 1.345, 2.069, 2.956 max_d=2.956 avg_d=1.345 std_dev=0.724
O5'	B	0, 1.114, 2.344, 3.574, 4.836 max_d=4.836 avg_d=2.344 std_dev=1.230
OP2	B	0, 1.868, 3.270, 4.673, 5.424 max_d=5.424 avg_d=3.270 std_dev=1.403
P	B	0, 1.535, 3.211, 4.887, 6.757 max_d=6.757 avg_d=3.211 std_dev=1.676
OP1	B	0, 1.853, 4.115, 6.378, 9.009 max_d=9.009 avg_d=4.115 std_dev=2.262

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.10	0.11	0.14	0.08
C2	0.02	0.00	0.06	0.09	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.10	0.02	0.18	0.17	0.19	0.14
C2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.06	0.02	0.06	0.06	0.12	0.00	0.02	0.02	0.06	0.17	0.16	0.08
C3'	0.02	0.09	0.01	0.00	0.10	0.01	0.11	0.02	0.10	0.05	0.10	0.11	0.13	0.02	0.01	0.01	0.05	0.20	0.15	0.09
C4	0.02	0.01	0.05	0.10	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.05	0.12	0.03	0.25	0.20	0.22	0.19
C4'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.04	0.07	0.05	0.06	0.02	0.00	0.02	0.13	0.09	0.03
C5	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.07	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.14	0.04	0.25	0.19	0.20	0.18
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.12	0.01	0.13	0.00	0.11	0.06	0.10	0.14	0.06	0.06	0.04	0.02	0.01	0.12	0.04	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.12	0.04	0.22	0.15	0.17	0.13
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.01	0.17	0.14	0.16	0.11
N3	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.06	0.11	0.02	0.22	0.20	0.22	0.18
N4	0.03	0.02	0.06	0.11	0.01	0.07	0.02	0.14	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.06	0.15	0.04	0.26	0.23	0.25	0.22
O2	0.03	0.01	0.12	0.13	0.02	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.12	0.15	0.04	0.16	0.17	0.19	0.14
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.05	0.06	0.04	0.06	0.03	0.02	0.06	0.06	0.12	0.00	0.04	0.04	0.04	0.17	0.14	0.07
O3'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.12	0.02	0.14	0.04	0.12	0.05	0.11	0.15	0.15	0.04	0.00	0.02	0.11	0.24	0.18	0.12
O4'	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.01	0.02	0.04	0.04	0.04	0.02	0.00	0.08	0.08	0.15	0.09
O5'	0.10	0.18	0.06	0.05	0.25	0.02	0.25	0.01	0.22	0.17	0.22	0.26	0.16	0.04	0.11	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.11	0.17	0.17	0.20	0.20	0.13	0.19	0.12	0.15	0.14	0.20	0.23	0.17	0.17	0.24	0.08	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.19	0.16	0.15	0.22	0.09	0.20	0.04	0.17	0.16	0.22	0.25	0.19	0.14	0.18	0.15	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.14	0.08	0.09	0.19	0.03	0.18	0.02	0.13	0.11	0.18	0.22	0.14	0.07	0.12	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.30	0.20	0.26	0.23	0.19	0.22	0.20	0.29	0.19	0.27	0.21	0.29	0.16	0.24	0.25	0.42	0.23	0.25	0.53	0.21	0.80	0.73	0.62
C2	0.25	0.14	0.21	0.22	0.19	0.20	0.22	0.36	0.21	0.27	0.18	0.22	0.13	0.26	0.23	0.33	0.21	0.20	0.70	0.24	1.19	0.93	0.87
C2'	0.27	0.19	0.24	0.17	0.17	0.17	0.20	0.27	0.20	0.26	0.21	0.27	0.15	0.24	0.23	0.42	0.18	0.21	0.53	0.22	0.82	0.75	0.64
C3'	0.24	0.20	0.24	0.12	0.15	0.13	0.17	0.25	0.17	0.25	0.20	0.30	0.16	0.23	0.20	0.41	0.15	0.16	0.48	0.19	0.74	0.71	0.59
C4	0.18	0.15	0.14	0.24	0.16	0.28	0.22	0.48	0.18	0.28	0.15	0.24	0.10	0.29	0.21	0.20	0.21	0.21	0.84	0.21	1.45	1.06	1.05
C4'	0.27	0.24	0.24	0.15	0.15	0.17	0.15	0.22	0.15	0.24	0.21	0.34	0.19	0.20	0.21	0.42	0.19	0.21	0.40	0.16	0.58	0.60	0.45
C5	0.21	0.20	0.16	0.26	0.20	0.30	0.22	0.48	0.18	0.30	0.19	0.27	0.17	0.29	0.25	0.18	0.21	0.25	0.81	0.18	1.28	0.98	0.96
C5'	0.24	0.29	0.24	0.09	0.18	0.13	0.16	0.17	0.18	0.23	0.24	0.38	0.25	0.19	0.20	0.39	0.14	0.17	0.34	0.17	0.55	0.51	0.38
C6	0.24	0.22	0.20	0.23	0.20	0.24	0.21	0.38	0.18	0.29	0.20	0.30	0.18	0.27	0.25	0.25	0.20	0.22	0.68	0.19	1.03	0.84	0.79
N1	0.26	0.17	0.22	0.22	0.18	0.21	0.21	0.34	0.19	0.28	0.19	0.27	0.13	0.26	0.24	0.34	0.21	0.21	0.64	0.21	1.00	0.83	0.76
N3	0.20	0.13	0.17	0.22	0.17	0.23	0.22	0.42	0.20	0.26	0.15	0.23	0.12	0.28	0.21	0.27	0.20	0.18	0.79	0.24	1.39	1.03	0.99
N4	0.17	0.17	0.13	0.26	0.15	0.33	0.20	0.55	0.16	0.28	0.17	0.25	0.12	0.30	0.20	0.16	0.23	0.25	0.91	0.21	1.65	1.15	1.16
O2	0.28	0.17	0.24	0.22	0.21	0.20	0.23	0.33	0.23	0.26	0.21	0.23	0.18	0.26	0.24	0.39	0.22	0.22	0.67	0.27	1.15	0.91	0.84
O2'	0.33	0.21	0.28	0.20	0.20	0.22	0.21	0.26	0.21	0.27	0.23	0.28	0.18	0.24	0.26	0.47	0.21	0.27	0.48	0.24	0.74	0.71	0.58
O3'	0.25	0.21	0.24	0.12	0.15	0.14	0.17	0.24	0.18	0.25	0.20	0.30	0.17	0.23	0.20	0.42	0.13	0.17	0.44	0.21	0.71	0.71	0.56
O4'	0.31	0.23	0.28	0.24	0.17	0.25	0.17	0.28	0.16	0.27	0.21	0.34	0.17	0.22	0.24	0.43	0.27	0.27	0.47	0.17	0.61	0.64	0.50
O5'	0.28	0.34	0.32	0.09	0.27	0.06	0.26	0.17	0.26	0.30	0.30	0.40	0.32	0.28	0.27	0.40	0.02	0.15	0.46	0.25	0.67	0.59	0.51
OP1	0.05	0.25	0.12	0.05	0.11	0.19	0.10	0.35	0.14	0.17	0.21	0.34	0.21	0.16	0.07	0.20	0.02	0.13	0.34	0.14	0.81	0.66	0.47
OP2	0.12	0.23	0.15	0.08	0.14	0.22	0.18	0.42	0.18	0.27	0.21	0.29	0.19	0.25	0.16	0.15	0.02	0.17	0.56	0.19	0.85	0.78	0.68
P	0.08	0.23	0.15	0.02	0.11	0.12	0.11	0.27	0.14	0.19	0.19	0.31	0.19	0.18	0.10	0.20	0.01	0.06	0.40	0.14	0.69	0.59	0.47

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.03	0.06	0.10	0.07	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.19	0.04	0.45	0.29	0.20
C2	0.07	0.00	0.15	0.21	0.02	0.12	0.01	0.22	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.18	0.24	0.06	0.48	0.02	1.02	0.66	0.58
C2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.07	0.02	0.05	0.03	0.08	0.07	0.12	0.18	0.15	0.06	0.02	0.01	0.02	0.02	0.27	0.08	0.40	0.29	0.24
C3'	0.01	0.21	0.01	0.00	0.11	0.01	0.09	0.03	0.12	0.13	0.18	0.26	0.20	0.10	0.05	0.03	0.01	0.02	0.35	0.12	0.45	0.31	0.29
C4	0.03	0.02	0.07	0.11	0.00	0.08	0.00	0.18	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.11	0.03	0.49	0.02	0.94	0.62	0.53
C4'	0.01	0.12	0.02	0.01	0.08	0.00	0.10	0.01	0.12	0.10	0.12	0.13	0.10	0.11	0.06	0.06	0.03	0.00	0.03	0.14	0.26	0.27	0.06
C5	0.03	0.01	0.05	0.09	0.00	0.10	0.00	0.23	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.09	0.09	0.05	0.60	0.02	1.18	0.80	0.69
C5'	0.03	0.22	0.03	0.03	0.18	0.01	0.23	0.00	0.26	0.19	0.25	0.22	0.18	0.23	0.13	0.06	0.06	0.02	0.01	0.29	0.37	0.40	0.06
C6	0.04	0.01	0.08	0.12	0.01	0.12	0.01	0.26	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.12	0.13	0.05	0.64	0.01	1.30	0.88	0.76
C8	0.03	0.02	0.07	0.13	0.01	0.10	0.01	0.19	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.04	0.14	0.07	0.56	0.04	0.96	0.66	0.55
N1	0.06	0.00	0.12	0.18	0.02	0.12	0.01	0.25	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.16	0.20	0.05	0.58	0.02	1.21	0.80	0.70
N2	0.10	0.01	0.18	0.26	0.02	0.13	0.02	0.22	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.02	0.04	0.22	0.31	0.08	0.45	0.03	0.98	0.62	0.56
N3	0.07	0.01	0.15	0.20	0.01	0.10	0.01	0.18	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.16	0.22	0.06	0.41	0.01	0.86	0.55	0.48
N7	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.11	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.07	0.65	0.03	1.21	0.86	0.71
N9	0.01	0.03	0.02	0.05	0.01	0.06	0.02	0.13	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.04	0.04	0.03	0.42	0.03	0.77	0.50	0.42
O2'	0.02	0.18	0.01	0.03	0.10	0.06	0.09	0.06	0.12	0.04	0.16	0.22	0.16	0.06	0.04	0.00	0.06	0.06	0.11	0.12	0.28	0.20	0.11
O3'	0.02	0.24	0.02	0.01	0.11	0.03	0.09	0.06	0.13	0.14	0.20	0.31	0.22	0.11	0.04	0.06	0.00	0.02	0.30	0.12	0.56	0.36	0.30
O4'	0.01	0.06	0.02	0.02	0.03	0.00	0.05	0.02	0.05	0.07	0.05	0.08	0.06	0.07	0.03	0.06	0.02	0.00	0.13	0.07	0.38	0.29	0.19
O5'	0.19	0.48	0.27	0.35	0.49	0.03	0.60	0.01	0.64	0.56	0.58	0.45	0.41	0.65	0.42	0.11	0.30	0.13	0.00	0.69	0.03	0.02	0.01
O6	0.04	0.02	0.08	0.12	0.02	0.14	0.02	0.29	0.01	0.04	0.02	0.03	0.01	0.03	0.03	0.12	0.12	0.07	0.69	0.00	1.43	0.99	0.84
OP1	0.45	1.02	0.40	0.45	0.94	0.26	1.18	0.37	1.30	0.96	1.21	0.98	0.86	1.21	0.77	0.28	0.56	0.38	0.03	1.43	0.00	0.01	0.01
OP2	0.29	0.66	0.29	0.31	0.62	0.27	0.80	0.40	0.88	0.66	0.80	0.62	0.55	0.86	0.50	0.20	0.36	0.29	0.02	0.99	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.58	0.24	0.29	0.53	0.06	0.69	0.06	0.76	0.55	0.70	0.56	0.48	0.71	0.42	0.11	0.30	0.19	0.01	0.84	0.01	0.01	0.00