Doublet Group distance statistics: 54494

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 1, 1, 0, 2, 2, 1, 4, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.005, 0.010, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.005 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.005, 0.012, 0.020, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.006, 0.013, 0.021, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.005, 0.014, 0.024, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.005, 0.016, 0.026, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.011, 0.024, 0.036, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.024 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.005, 0.029, 0.054, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.029 std_dev=0.025
N4	A	0, 0.005, 0.037, 0.069, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.037 std_dev=0.032
C2'	A	0, 0.056, 0.282, 0.509, 0.710 max_d=0.710 avg_d=0.282 std_dev=0.227
O4'	A	0, 0.058, 0.301, 0.545, 0.741 max_d=0.741 avg_d=0.301 std_dev=0.244
C4	B	0, 0.196, 0.449, 0.701, 0.784 max_d=0.784 avg_d=0.449 std_dev=0.253
C5	B	0, 0.286, 0.554, 0.822, 0.894 max_d=0.894 avg_d=0.554 std_dev=0.268
O2'	A	0, 0.077, 0.348, 0.618, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.348 std_dev=0.270
N9	B	0, 0.195, 0.502, 0.810, 1.258 max_d=1.258 avg_d=0.502 std_dev=0.307
N7	B	0, 0.331, 0.640, 0.948, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.640 std_dev=0.309
C8	B	0, 0.262, 0.603, 0.944, 1.416 max_d=1.416 avg_d=0.603 std_dev=0.341
N3	B	0, 0.218, 0.569, 0.920, 1.157 max_d=1.157 avg_d=0.569 std_dev=0.351
C4'	A	0, 0.143, 0.513, 0.883, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.513 std_dev=0.370
C6	B	0, 0.364, 0.762, 1.159, 1.306 max_d=1.306 avg_d=0.762 std_dev=0.398
C3'	A	0, 0.135, 0.549, 0.963, 1.294 max_d=1.294 avg_d=0.549 std_dev=0.414
C1'	B	0, 0.274, 0.695, 1.116, 1.663 max_d=1.663 avg_d=0.695 std_dev=0.421
C2	B	0, 0.278, 0.722, 1.166, 1.384 max_d=1.384 avg_d=0.722 std_dev=0.444
N1	B	0, 0.369, 0.824, 1.278, 1.395 max_d=1.395 avg_d=0.824 std_dev=0.455
C2'	B	0, 0.229, 0.702, 1.175, 1.661 max_d=1.661 avg_d=0.702 std_dev=0.473
O6	B	0, 0.502, 0.999, 1.495, 1.665 max_d=1.665 avg_d=0.999 std_dev=0.496
N2	B	0, 0.448, 0.993, 1.537, 1.783 max_d=1.783 avg_d=0.993 std_dev=0.544
O4'	B	0, 0.476, 1.036, 1.597, 2.154 max_d=2.154 avg_d=1.036 std_dev=0.561
C3'	B	0, 0.483, 1.056, 1.628, 2.136 max_d=2.136 avg_d=1.056 std_dev=0.573
C5'	A	0, 0.205, 0.794, 1.383, 2.043 max_d=2.043 avg_d=0.794 std_dev=0.589
O2'	B	0, 0.356, 0.960, 1.565, 2.187 max_d=2.187 avg_d=0.960 std_dev=0.604
O3'	A	0, 0.196, 0.855, 1.514, 2.417 max_d=2.417 avg_d=0.855 std_dev=0.659
O3'	B	0, 0.427, 1.118, 1.809, 2.303 max_d=2.303 avg_d=1.118 std_dev=0.691
C4'	B	0, 0.714, 1.409, 2.105, 2.624 max_d=2.624 avg_d=1.409 std_dev=0.696
O5'	A	0, 0.230, 0.970, 1.710, 2.702 max_d=2.702 avg_d=0.970 std_dev=0.740
OP2	A	0, 0.425, 1.178, 1.931, 2.679 max_d=2.679 avg_d=1.178 std_dev=0.753
P	A	0, 0.322, 1.106, 1.890, 2.595 max_d=2.595 avg_d=1.106 std_dev=0.784
C5'	B	0, 1.031, 1.908, 2.784, 3.189 max_d=3.189 avg_d=1.908 std_dev=0.876
OP1	A	0, 0.196, 1.176, 2.156, 3.203 max_d=3.203 avg_d=1.176 std_dev=0.980
O5'	B	0, 0.949, 2.060, 3.172, 4.786 max_d=4.786 avg_d=2.060 std_dev=1.112
P	B	0, 1.327, 2.681, 4.034, 5.861 max_d=5.861 avg_d=2.681 std_dev=1.353
OP2	B	0, 1.405, 2.770, 4.134, 5.901 max_d=5.901 avg_d=2.770 std_dev=1.364
OP1	B	0, 1.704, 3.300, 4.896, 6.763 max_d=6.763 avg_d=3.300 std_dev=1.596

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.07	0.00	0.08	0.09	0.14	0.09
C2	0.02	0.00	0.09	0.16	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.15	0.05	0.17	0.17	0.27	0.19
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.03	0.03	0.07	0.08	0.09	0.02	0.06	0.04	0.16	0.00	0.02	0.01	0.13	0.16	0.16	0.09
C3'	0.02	0.16	0.00	0.00	0.19	0.01	0.19	0.02	0.17	0.13	0.18	0.21	0.16	0.01	0.01	0.02	0.24	0.27	0.14	0.21
C4	0.02	0.01	0.03	0.19	0.00	0.07	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.20	0.04	0.27	0.31	0.41	0.32
C4'	0.01	0.03	0.03	0.01	0.07	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.05	0.08	0.03	0.17	0.02	0.00	0.01	0.10	0.14	0.02
C5	0.02	0.01	0.07	0.19	0.00	0.09	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.22	0.08	0.31	0.34	0.41	0.35
C5'	0.06	0.08	0.08	0.02	0.15	0.01	0.17	0.00	0.16	0.10	0.11	0.16	0.06	0.11	0.12	0.01	0.01	0.15	0.24	0.02
C6	0.01	0.01	0.09	0.17	0.00	0.08	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.18	0.09	0.27	0.26	0.29	0.27
N1	0.01	0.01	0.02	0.13	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.09	0.03	0.17	0.17	0.22	0.18
N3	0.02	0.01	0.06	0.18	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.18	0.04	0.22	0.24	0.35	0.25
N4	0.02	0.01	0.04	0.21	0.00	0.08	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.23	0.05	0.29	0.36	0.47	0.36
O2	0.02	0.00	0.16	0.16	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.16	0.20	0.08	0.12	0.11	0.23	0.14
O2'	0.02	0.13	0.00	0.01	0.14	0.17	0.12	0.11	0.10	0.09	0.15	0.15	0.16	0.00	0.07	0.11	0.18	0.25	0.10	0.14
O3'	0.07	0.15	0.02	0.01	0.20	0.02	0.22	0.12	0.18	0.09	0.18	0.23	0.20	0.07	0.00	0.06	0.30	0.42	0.27	0.32
O4'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.04	0.00	0.08	0.01	0.09	0.03	0.04	0.05	0.08	0.11	0.06	0.00	0.10	0.13	0.16	0.12
O5'	0.08	0.17	0.13	0.24	0.27	0.01	0.31	0.01	0.27	0.17	0.22	0.29	0.12	0.18	0.30	0.10	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.09	0.17	0.16	0.27	0.31	0.10	0.34	0.15	0.26	0.17	0.24	0.36	0.11	0.25	0.42	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.27	0.16	0.14	0.41	0.14	0.41	0.24	0.29	0.22	0.35	0.47	0.23	0.10	0.27	0.16	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.19	0.09	0.21	0.32	0.02	0.35	0.02	0.27	0.18	0.25	0.36	0.14	0.14	0.32	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.29	0.27	0.29	0.21	0.24	0.20	0.26	0.23	0.20	0.28	0.35	0.25	0.19	0.20	0.41	0.21	0.20	0.53	0.24	0.67	0.59	0.56
C2	0.18	0.21	0.19	0.27	0.13	0.21	0.15	0.28	0.19	0.17	0.22	0.27	0.17	0.18	0.16	0.51	0.22	0.17	0.63	0.23	0.75	0.74	0.68
C2'	0.18	0.29	0.21	0.22	0.19	0.18	0.17	0.22	0.21	0.15	0.27	0.35	0.25	0.15	0.16	0.45	0.16	0.15	0.54	0.22	0.74	0.63	0.60
C3'	0.20	0.27	0.30	0.32	0.20	0.28	0.22	0.36	0.22	0.27	0.25	0.35	0.24	0.27	0.21	0.43	0.26	0.21	0.65	0.23	0.89	0.75	0.73
C4	0.28	0.21	0.30	0.33	0.19	0.33	0.13	0.41	0.11	0.25	0.20	0.25	0.21	0.19	0.24	0.66	0.30	0.28	0.76	0.14	0.89	0.89	0.84
C4'	0.18	0.33	0.26	0.22	0.21	0.19	0.19	0.24	0.23	0.18	0.29	0.41	0.28	0.19	0.17	0.36	0.15	0.15	0.44	0.23	0.64	0.49	0.48
C5	0.31	0.19	0.34	0.37	0.18	0.37	0.12	0.44	0.13	0.24	0.17	0.22	0.20	0.17	0.25	0.72	0.34	0.32	0.78	0.16	0.89	0.84	0.83
C5'	0.23	0.35	0.26	0.22	0.25	0.24	0.23	0.27	0.26	0.21	0.31	0.41	0.32	0.21	0.21	0.40	0.20	0.20	0.44	0.25	0.62	0.45	0.48
C6	0.28	0.21	0.29	0.35	0.18	0.32	0.14	0.36	0.15	0.22	0.19	0.24	0.21	0.17	0.22	0.66	0.32	0.28	0.69	0.17	0.80	0.72	0.72
N1	0.21	0.23	0.23	0.30	0.17	0.24	0.16	0.29	0.19	0.18	0.23	0.28	0.21	0.17	0.18	0.53	0.24	0.20	0.62	0.20	0.74	0.68	0.65
N3	0.22	0.22	0.22	0.29	0.16	0.25	0.14	0.34	0.14	0.21	0.19	0.27	0.19	0.19	0.19	0.58	0.25	0.21	0.69	0.18	0.82	0.83	0.77
N4	0.31	0.26	0.35	0.34	0.24	0.37	0.20	0.48	0.20	0.30	0.26	0.28	0.24	0.25	0.28	0.68	0.32	0.32	0.80	0.21	0.97	1.00	0.93
O2	0.14	0.22	0.17	0.25	0.13	0.17	0.18	0.23	0.25	0.16	0.27	0.30	0.15	0.19	0.13	0.42	0.19	0.14	0.58	0.30	0.71	0.71	0.63
O2'	0.24	0.35	0.31	0.31	0.23	0.28	0.21	0.28	0.28	0.18	0.34	0.42	0.30	0.17	0.21	0.36	0.25	0.23	0.56	0.30	0.75	0.60	0.59
O3'	0.20	0.33	0.32	0.35	0.18	0.31	0.18	0.41	0.20	0.25	0.28	0.47	0.27	0.24	0.18	0.42	0.31	0.20	0.67	0.21	0.98	0.80	0.78
O4'	0.19	0.33	0.30	0.28	0.21	0.23	0.20	0.25	0.24	0.19	0.30	0.40	0.28	0.19	0.18	0.36	0.22	0.18	0.46	0.24	0.60	0.47	0.47
O5'	0.22	0.26	0.22	0.11	0.18	0.07	0.22	0.18	0.22	0.24	0.22	0.33	0.25	0.28	0.17	0.49	0.01	0.13	0.38	0.25	0.64	0.48	0.46
OP1	0.14	0.20	0.09	0.04	0.12	0.08	0.20	0.26	0.21	0.24	0.18	0.28	0.19	0.29	0.09	0.25	0.02	0.08	0.36	0.26	0.58	0.49	0.44
OP2	0.15	0.25	0.24	0.07	0.25	0.14	0.36	0.31	0.37	0.39	0.30	0.27	0.22	0.45	0.23	0.56	0.02	0.12	0.62	0.43	0.85	0.75	0.72
P	0.14	0.19	0.12	0.01	0.14	0.06	0.22	0.22	0.23	0.26	0.19	0.25	0.17	0.30	0.12	0.36	0.01	0.05	0.40	0.27	0.62	0.49	0.47

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.14	0.00	0.23	0.01	0.25	0.18	0.19
C2	0.02	0.00	0.10	0.15	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.23	0.16	0.04	0.39	0.01	0.44	0.47	0.42
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.04	0.03	0.04	0.09	0.04	0.09	0.06	0.14	0.11	0.09	0.03	0.00	0.02	0.01	0.21	0.06	0.35	0.20	0.20
C3'	0.02	0.15	0.01	0.00	0.16	0.01	0.19	0.02	0.19	0.19	0.17	0.15	0.14	0.21	0.14	0.02	0.01	0.03	0.19	0.20	0.34	0.11	0.20
C4	0.01	0.01	0.04	0.16	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.21	0.10	0.02	0.43	0.01	0.44	0.44	0.43
C4'	0.01	0.04	0.03	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.09	0.12	0.06	0.05	0.04	0.12	0.06	0.19	0.02	0.00	0.04	0.10	0.14	0.16	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.19	0.00	0.09	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.27	0.12	0.02	0.55	0.01	0.57	0.59	0.57
C5'	0.04	0.09	0.09	0.02	0.11	0.01	0.16	0.00	0.16	0.17	0.13	0.08	0.08	0.19	0.10	0.12	0.13	0.03	0.01	0.19	0.14	0.22	0.02
C6	0.01	0.00	0.04	0.19	0.00	0.09	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.31	0.13	0.02	0.56	0.00	0.61	0.66	0.61
C8	0.01	0.01	0.09	0.19	0.00	0.12	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.19	0.15	0.04	0.56	0.01	0.52	0.47	0.54
N1	0.02	0.00	0.06	0.17	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.29	0.13	0.03	0.48	0.01	0.54	0.59	0.53
N2	0.03	0.00	0.14	0.15	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.21	0.21	0.06	0.34	0.01	0.40	0.45	0.37
N3	0.02	0.00	0.11	0.14	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.16	0.05	0.34	0.01	0.37	0.39	0.35
N7	0.01	0.01	0.09	0.21	0.00	0.12	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.26	0.17	0.04	0.62	0.01	0.63	0.64	0.65
N9	0.01	0.01	0.03	0.14	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.15	0.07	0.01	0.41	0.01	0.39	0.34	0.38
O2'	0.02	0.23	0.00	0.02	0.21	0.19	0.27	0.12	0.31	0.19	0.29	0.21	0.18	0.26	0.15	0.00	0.07	0.14	0.22	0.34	0.35	0.15	0.19
O3'	0.14	0.16	0.02	0.01	0.10	0.02	0.12	0.13	0.13	0.15	0.13	0.21	0.16	0.17	0.07	0.07	0.00	0.08	0.20	0.15	0.42	0.21	0.25
O4'	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.06	0.05	0.04	0.01	0.14	0.08	0.00	0.16	0.03	0.15	0.17	0.09
O5'	0.23	0.39	0.21	0.19	0.43	0.04	0.55	0.01	0.56	0.56	0.48	0.34	0.34	0.62	0.41	0.22	0.20	0.16	0.00	0.62	0.02	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.06	0.20	0.01	0.10	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.34	0.15	0.03	0.62	0.00	0.70	0.75	0.70
OP1	0.25	0.44	0.35	0.34	0.44	0.14	0.57	0.14	0.61	0.52	0.54	0.40	0.37	0.63	0.39	0.35	0.42	0.15	0.02	0.70	0.00	0.02	0.00
OP2	0.18	0.47	0.20	0.11	0.44	0.16	0.59	0.22	0.66	0.47	0.59	0.45	0.39	0.64	0.34	0.15	0.21	0.17	0.02	0.75	0.02	0.00	0.00
P	0.19	0.42	0.20	0.20	0.43	0.02	0.57	0.02	0.61	0.54	0.53	0.37	0.35	0.65	0.38	0.19	0.25	0.09	0.01	0.70	0.00	0.00	0.00