Doublet Group distance statistics: 54496

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 3, 2, 4, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.004, 0.006, 0.007 max_d=0.007 avg_d=0.004 std_dev=0.002
N3	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.008 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.010, 0.018, 0.025, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.018 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.009, 0.017, 0.024, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.017 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.010, 0.019, 0.027, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.019 std_dev=0.009
O2	A	0, 0.024, 0.042, 0.059, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.042 std_dev=0.017
N4	A	0, 0.029, 0.053, 0.077, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.053 std_dev=0.024
O4'	A	0, 0.039, 0.166, 0.293, 0.440 max_d=0.440 avg_d=0.166 std_dev=0.127
O2'	A	0, 0.084, 0.216, 0.348, 0.524 max_d=0.524 avg_d=0.216 std_dev=0.132
C2'	A	0, 0.023, 0.155, 0.287, 0.449 max_d=0.449 avg_d=0.155 std_dev=0.132
C4'	A	0, 0.106, 0.280, 0.454, 0.661 max_d=0.661 avg_d=0.280 std_dev=0.174
N3	B	0, 0.232, 0.418, 0.605, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.418 std_dev=0.186
C2	B	0, 0.299, 0.495, 0.691, 0.860 max_d=0.860 avg_d=0.495 std_dev=0.196
C3'	A	0, 0.077, 0.278, 0.479, 0.718 max_d=0.718 avg_d=0.278 std_dev=0.201
C4	B	0, 0.189, 0.422, 0.655, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.422 std_dev=0.233
N2	B	0, 0.372, 0.609, 0.846, 0.934 max_d=0.934 avg_d=0.609 std_dev=0.237
N1	B	0, 0.280, 0.540, 0.800, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.540 std_dev=0.260
C5'	A	0, 0.182, 0.463, 0.743, 1.057 max_d=1.057 avg_d=0.463 std_dev=0.280
C2'	B	0, 0.256, 0.537, 0.818, 1.053 max_d=1.053 avg_d=0.537 std_dev=0.281
O5'	A	0, 0.219, 0.500, 0.781, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.500 std_dev=0.281
C5	B	0, 0.187, 0.468, 0.749, 1.119 max_d=1.119 avg_d=0.468 std_dev=0.281
N9	B	0, 0.223, 0.508, 0.793, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.508 std_dev=0.285
C3'	B	0, 0.339, 0.629, 0.920, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.629 std_dev=0.291
OP2	A	0, 0.366, 0.661, 0.955, 1.187 max_d=1.187 avg_d=0.661 std_dev=0.295
O3'	A	0, 0.123, 0.418, 0.712, 1.082 max_d=1.082 avg_d=0.418 std_dev=0.295
P	A	0, 0.325, 0.633, 0.940, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.633 std_dev=0.307
C1'	B	0, 0.285, 0.593, 0.901, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.593 std_dev=0.308
C6	B	0, 0.199, 0.511, 0.824, 1.130 max_d=1.130 avg_d=0.511 std_dev=0.313
O3'	B	0, 0.368, 0.687, 1.006, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.687 std_dev=0.319
N7	B	0, 0.238, 0.571, 0.904, 1.348 max_d=1.348 avg_d=0.571 std_dev=0.333
O2'	B	0, 0.323, 0.657, 0.991, 1.297 max_d=1.297 avg_d=0.657 std_dev=0.334
C8	B	0, 0.266, 0.602, 0.938, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.602 std_dev=0.336
C4'	B	0, 0.431, 0.797, 1.163, 1.356 max_d=1.356 avg_d=0.797 std_dev=0.366
OP1	A	0, 0.349, 0.719, 1.089, 1.344 max_d=1.344 avg_d=0.719 std_dev=0.370
O4'	B	0, 0.365, 0.746, 1.128, 1.313 max_d=1.313 avg_d=0.746 std_dev=0.381
O6	B	0, 0.208, 0.602, 0.996, 1.349 max_d=1.349 avg_d=0.602 std_dev=0.394
C5'	B	0, 0.546, 0.982, 1.418, 1.678 max_d=1.678 avg_d=0.982 std_dev=0.436
O5'	B	0, 0.573, 1.009, 1.446, 1.721 max_d=1.721 avg_d=1.009 std_dev=0.437
P	B	0, 0.595, 1.179, 1.763, 2.365 max_d=2.365 avg_d=1.179 std_dev=0.584
OP1	B	0, 0.740, 1.466, 2.191, 3.335 max_d=3.335 avg_d=1.466 std_dev=0.726
OP2	B	0, 0.359, 1.431, 2.504, 4.639 max_d=4.639 avg_d=1.431 std_dev=1.073

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.07	0.06	0.12	0.08
C2	0.02	0.00	0.08	0.08	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.10	0.04	0.13	0.14	0.23	0.17
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.06	0.02	0.07	0.04	0.13	0.00	0.02	0.01	0.06	0.10	0.10	0.06
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.07	0.00	0.08	0.02	0.08	0.04	0.08	0.08	0.11	0.01	0.00	0.01	0.05	0.12	0.08	0.07
C4	0.02	0.01	0.03	0.07	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.09	0.02	0.18	0.24	0.32	0.25
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.03	0.05	0.03	0.05	0.02	0.00	0.02	0.06	0.03	0.03
C5	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.10	0.04	0.19	0.25	0.31	0.26
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.11	0.01	0.13	0.00	0.11	0.06	0.08	0.13	0.04	0.06	0.05	0.01	0.01	0.06	0.01	0.02
C6	0.01	0.00	0.06	0.08	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.10	0.05	0.16	0.18	0.23	0.20
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.12	0.13	0.19	0.15
N3	0.02	0.00	0.07	0.08	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.10	0.04	0.16	0.19	0.29	0.21
N4	0.02	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.10	0.03	0.20	0.28	0.36	0.28
O2	0.03	0.00	0.13	0.11	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.14	0.06	0.10	0.11	0.20	0.14
O2'	0.02	0.08	0.00	0.01	0.04	0.05	0.03	0.06	0.04	0.02	0.07	0.05	0.13	0.00	0.04	0.04	0.05	0.11	0.07	0.05
O3'	0.01	0.10	0.02	0.00	0.09	0.02	0.10	0.05	0.10	0.04	0.10	0.10	0.14	0.04	0.00	0.02	0.07	0.18	0.11	0.10
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.04	0.03	0.06	0.04	0.02	0.00	0.05	0.08	0.08	0.09
O5'	0.07	0.13	0.06	0.05	0.18	0.02	0.19	0.01	0.16	0.12	0.16	0.20	0.10	0.05	0.07	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.06	0.14	0.10	0.12	0.24	0.06	0.25	0.06	0.18	0.13	0.19	0.28	0.11	0.11	0.18	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.23	0.10	0.08	0.32	0.03	0.31	0.01	0.23	0.19	0.29	0.36	0.20	0.07	0.11	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.17	0.06	0.07	0.25	0.03	0.26	0.02	0.20	0.15	0.21	0.28	0.14	0.05	0.10	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.17	0.21	0.18	0.10	0.17	0.15	0.21	0.19	0.18	0.17	0.25	0.15	0.19	0.15	0.27	0.17	0.17	0.38	0.24	0.47	0.48	0.32
C2	0.19	0.25	0.21	0.22	0.13	0.23	0.08	0.30	0.18	0.18	0.23	0.32	0.22	0.16	0.16	0.22	0.20	0.20	0.48	0.26	0.63	0.73	0.43
C2'	0.16	0.17	0.16	0.12	0.10	0.13	0.14	0.20	0.16	0.18	0.15	0.27	0.15	0.19	0.14	0.24	0.11	0.13	0.42	0.21	0.48	0.51	0.38
C3'	0.13	0.17	0.13	0.08	0.11	0.07	0.16	0.16	0.19	0.19	0.18	0.24	0.13	0.21	0.13	0.21	0.07	0.09	0.43	0.23	0.45	0.51	0.40
C4	0.21	0.25	0.23	0.28	0.15	0.30	0.15	0.40	0.27	0.18	0.28	0.29	0.21	0.17	0.16	0.23	0.26	0.25	0.55	0.35	0.71	0.89	0.54
C4'	0.14	0.22	0.13	0.07	0.16	0.07	0.22	0.13	0.25	0.21	0.25	0.26	0.16	0.24	0.16	0.23	0.10	0.09	0.37	0.28	0.38	0.44	0.34
C5	0.25	0.24	0.27	0.29	0.20	0.31	0.25	0.40	0.30	0.26	0.28	0.26	0.21	0.29	0.22	0.27	0.27	0.28	0.52	0.36	0.62	0.70	0.48
C5'	0.19	0.26	0.19	0.08	0.23	0.07	0.26	0.09	0.28	0.26	0.28	0.28	0.22	0.28	0.22	0.25	0.06	0.13	0.37	0.30	0.37	0.47	0.35
C6	0.25	0.21	0.28	0.27	0.18	0.28	0.23	0.33	0.26	0.26	0.24	0.24	0.20	0.28	0.22	0.29	0.24	0.26	0.46	0.31	0.53	0.55	0.40
N1	0.20	0.20	0.23	0.22	0.10	0.21	0.14	0.27	0.20	0.18	0.21	0.27	0.18	0.19	0.15	0.26	0.20	0.19	0.43	0.26	0.54	0.58	0.37
N3	0.20	0.26	0.22	0.25	0.14	0.27	0.06	0.36	0.20	0.18	0.27	0.31	0.22	0.14	0.17	0.22	0.23	0.23	0.53	0.29	0.70	0.88	0.51
N4	0.22	0.26	0.23	0.29	0.17	0.33	0.18	0.45	0.29	0.18	0.30	0.29	0.21	0.16	0.18	0.23	0.28	0.28	0.58	0.38	0.78	1.05	0.62
O2	0.20	0.29	0.20	0.21	0.19	0.21	0.16	0.28	0.20	0.20	0.25	0.37	0.26	0.20	0.19	0.22	0.19	0.20	0.47	0.27	0.63	0.74	0.42
O2'	0.19	0.18	0.19	0.14	0.13	0.15	0.15	0.18	0.18	0.18	0.16	0.27	0.17	0.19	0.16	0.28	0.14	0.17	0.37	0.23	0.44	0.48	0.32
O3'	0.13	0.17	0.13	0.08	0.11	0.07	0.16	0.15	0.19	0.19	0.18	0.25	0.13	0.21	0.13	0.21	0.08	0.09	0.42	0.22	0.44	0.55	0.41
O4'	0.15	0.21	0.17	0.15	0.14	0.14	0.22	0.17	0.26	0.19	0.25	0.24	0.13	0.23	0.14	0.25	0.18	0.13	0.34	0.29	0.38	0.40	0.28
O5'	0.15	0.20	0.17	0.05	0.18	0.03	0.22	0.11	0.24	0.24	0.22	0.23	0.17	0.26	0.18	0.21	0.01	0.08	0.41	0.27	0.43	0.52	0.40
OP1	0.05	0.17	0.09	0.02	0.11	0.07	0.14	0.16	0.17	0.15	0.18	0.22	0.14	0.17	0.08	0.14	0.02	0.04	0.20	0.20	0.42	0.70	0.32
OP2	0.03	0.19	0.05	0.03	0.12	0.14	0.16	0.25	0.20	0.14	0.20	0.23	0.16	0.19	0.07	0.06	0.02	0.11	0.36	0.24	0.51	0.69	0.43
P	0.04	0.17	0.08	0.01	0.10	0.07	0.14	0.16	0.17	0.15	0.17	0.21	0.14	0.18	0.08	0.11	0.01	0.03	0.29	0.20	0.41	0.60	0.34

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.16	0.01	0.38	0.34	0.13
C2	0.01	0.00	0.11	0.14	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.16	0.02	0.37	0.01	0.58	0.65	0.32
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.05	0.07	0.08	0.13	0.11	0.06	0.02	0.00	0.03	0.01	0.21	0.06	0.31	0.23	0.14
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.02	0.11	0.11	0.13	0.17	0.13	0.11	0.05	0.02	0.01	0.01	0.29	0.11	0.30	0.25	0.22
C4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.08	0.01	0.39	0.01	0.59	0.64	0.33
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.08	0.08	0.07	0.07	0.05	0.09	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.09	0.12	0.30	0.05
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.07	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.09	0.01	0.49	0.01	0.68	0.83	0.44
C5'	0.03	0.13	0.02	0.02	0.12	0.00	0.16	0.00	0.18	0.16	0.16	0.13	0.11	0.18	0.10	0.05	0.03	0.01	0.01	0.20	0.12	0.36	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.11	0.01	0.08	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.11	0.02	0.50	0.00	0.71	0.90	0.47
C8	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.11	0.03	0.49	0.01	0.65	0.75	0.41
N1	0.01	0.00	0.08	0.13	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.14	0.02	0.44	0.01	0.66	0.79	0.40
N2	0.02	0.00	0.13	0.17	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.21	0.03	0.33	0.01	0.55	0.60	0.28
N3	0.01	0.01	0.11	0.13	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.15	0.02	0.32	0.01	0.53	0.55	0.27
N7	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.09	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.12	0.02	0.55	0.01	0.73	0.93	0.50
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.35	0.01	0.54	0.55	0.28
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.04	0.05	0.03	0.05	0.05	0.04	0.06	0.10	0.08	0.04	0.02	0.00	0.06	0.04	0.07	0.05	0.20	0.26	0.05
O3'	0.02	0.16	0.03	0.01	0.08	0.02	0.09	0.03	0.11	0.11	0.14	0.21	0.15	0.12	0.04	0.06	0.00	0.02	0.22	0.12	0.34	0.44	0.24
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.07	0.02	0.35	0.38	0.15
O5'	0.16	0.37	0.21	0.29	0.39	0.01	0.49	0.01	0.50	0.49	0.44	0.33	0.32	0.55	0.35	0.07	0.22	0.07	0.00	0.55	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.09	0.01	0.20	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.12	0.02	0.55	0.00	0.76	1.02	0.53
OP1	0.38	0.58	0.31	0.30	0.59	0.12	0.68	0.12	0.71	0.65	0.66	0.55	0.53	0.73	0.54	0.20	0.34	0.35	0.02	0.76	0.00	0.01	0.00
OP2	0.34	0.65	0.23	0.25	0.64	0.30	0.83	0.36	0.90	0.75	0.79	0.60	0.55	0.93	0.55	0.26	0.44	0.38	0.02	1.02	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.32	0.14	0.22	0.33	0.05	0.44	0.01	0.47	0.41	0.40	0.28	0.27	0.50	0.28	0.05	0.24	0.15	0.00	0.53	0.00	0.00	0.00