Doublet Group distance statistics: 54498

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 2, 1, 2, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.005, 0.009, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.004, 0.009, 0.015, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.009 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.007, 0.014, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.014 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.009, 0.017, 0.025, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.017 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.009, 0.017, 0.025, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.017 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.008, 0.017, 0.026, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.017 std_dev=0.009
O2	A	0, 0.018, 0.038, 0.057, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.038 std_dev=0.019
N4	A	0, 0.023, 0.053, 0.084, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.053 std_dev=0.030
C2'	A	0, 0.090, 0.246, 0.403, 0.513 max_d=0.513 avg_d=0.246 std_dev=0.157
O4'	A	0, 0.089, 0.253, 0.417, 0.504 max_d=0.504 avg_d=0.253 std_dev=0.164
O2'	A	0, 0.110, 0.299, 0.488, 0.613 max_d=0.613 avg_d=0.299 std_dev=0.189
C4'	A	0, 0.152, 0.390, 0.627, 0.766 max_d=0.766 avg_d=0.390 std_dev=0.237
C3'	A	0, 0.169, 0.414, 0.658, 0.799 max_d=0.799 avg_d=0.414 std_dev=0.244
C4	B	0, 0.241, 0.488, 0.735, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.488 std_dev=0.247
C5	B	0, 0.269, 0.526, 0.783, 0.872 max_d=0.872 avg_d=0.526 std_dev=0.257
C6	B	0, 0.332, 0.595, 0.859, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.595 std_dev=0.263
N3	B	0, 0.327, 0.593, 0.858, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.593 std_dev=0.265
N1	B	0, 0.300, 0.602, 0.905, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.602 std_dev=0.302
C2	B	0, 0.294, 0.618, 0.941, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.618 std_dev=0.324
O6	B	0, 0.432, 0.760, 1.087, 1.283 max_d=1.283 avg_d=0.760 std_dev=0.327
N9	B	0, 0.220, 0.548, 0.875, 1.038 max_d=1.038 avg_d=0.548 std_dev=0.327
O3'	A	0, 0.272, 0.610, 0.948, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.610 std_dev=0.338
C8	B	0, 0.307, 0.655, 1.002, 1.267 max_d=1.267 avg_d=0.655 std_dev=0.348
N7	B	0, 0.315, 0.664, 1.013, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.664 std_dev=0.349
C1'	B	0, 0.342, 0.712, 1.083, 1.282 max_d=1.282 avg_d=0.712 std_dev=0.371
C2'	B	0, 0.395, 0.800, 1.205, 1.506 max_d=1.506 avg_d=0.800 std_dev=0.405
N2	B	0, 0.402, 0.819, 1.235, 1.634 max_d=1.634 avg_d=0.819 std_dev=0.416
C5'	A	0, 0.231, 0.658, 1.086, 1.437 max_d=1.437 avg_d=0.658 std_dev=0.427
C3'	B	0, 0.274, 0.777, 1.280, 1.672 max_d=1.672 avg_d=0.777 std_dev=0.503
O4'	B	0, 0.300, 0.815, 1.329, 1.736 max_d=1.736 avg_d=0.815 std_dev=0.515
O5'	B	0, 0.726, 1.265, 1.805, 1.911 max_d=1.911 avg_d=1.265 std_dev=0.539
C4'	B	0, 0.289, 0.831, 1.372, 1.857 max_d=1.857 avg_d=0.831 std_dev=0.542
O2'	B	0, 0.450, 1.000, 1.550, 1.907 max_d=1.907 avg_d=1.000 std_dev=0.550
O3'	B	0, 0.312, 0.883, 1.455, 1.857 max_d=1.857 avg_d=0.883 std_dev=0.571
O5'	A	0, 0.198, 0.806, 1.415, 1.833 max_d=1.833 avg_d=0.806 std_dev=0.609
C5'	B	0, 0.593, 1.215, 1.836, 2.143 max_d=2.143 avg_d=1.215 std_dev=0.621
P	A	0, 0.297, 0.943, 1.589, 2.105 max_d=2.105 avg_d=0.943 std_dev=0.646
OP2	A	0, 0.364, 1.022, 1.680, 2.110 max_d=2.110 avg_d=1.022 std_dev=0.658
P	B	0, 0.885, 1.612, 2.340, 2.756 max_d=2.756 avg_d=1.612 std_dev=0.727
OP1	A	0, 0.377, 1.164, 1.951, 2.550 max_d=2.550 avg_d=1.164 std_dev=0.787
OP1	B	0, 0.818, 1.611, 2.403, 2.690 max_d=2.690 avg_d=1.611 std_dev=0.792
OP2	B	0, 1.097, 2.016, 2.935, 3.558 max_d=3.558 avg_d=2.016 std_dev=0.919

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.16	0.19	0.20	0.12
C2	0.01	0.00	0.10	0.14	0.01	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.15	0.02	0.39	0.36	0.33	0.33
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.08	0.02	0.09	0.06	0.18	0.00	0.02	0.01	0.29	0.39	0.14	0.25
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.09	0.01	0.12	0.02	0.15	0.05	0.13	0.10	0.21	0.02	0.01	0.01	0.40	0.50	0.18	0.36
C4	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.11	0.02	0.55	0.52	0.53	0.51
C4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.09	0.03	0.07	0.07	0.09	0.05	0.03	0.00	0.01	0.18	0.27	0.03
C5	0.01	0.00	0.06	0.12	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.14	0.02	0.58	0.53	0.52	0.52
C5'	0.02	0.13	0.02	0.02	0.15	0.00	0.13	0.00	0.12	0.08	0.16	0.16	0.15	0.05	0.03	0.01	0.01	0.15	0.41	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.15	0.01	0.09	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.16	0.02	0.51	0.43	0.36	0.41
N1	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.37	0.33	0.28	0.29
N3	0.01	0.00	0.09	0.13	0.00	0.07	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.15	0.02	0.48	0.45	0.44	0.43
N4	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.07	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.13	0.03	0.58	0.57	0.60	0.56
O2	0.01	0.00	0.18	0.21	0.01	0.09	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.25	0.02	0.30	0.30	0.28	0.26
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.05	0.02	0.08	0.06	0.15	0.00	0.03	0.05	0.13	0.32	0.13	0.14
O3'	0.02	0.15	0.02	0.01	0.11	0.03	0.14	0.03	0.16	0.05	0.15	0.13	0.25	0.03	0.00	0.03	0.35	0.60	0.29	0.41
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.05	0.03	0.00	0.09	0.06	0.37	0.15
O5'	0.16	0.39	0.29	0.40	0.55	0.01	0.58	0.01	0.51	0.37	0.48	0.58	0.30	0.13	0.35	0.09	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.19	0.36	0.39	0.50	0.52	0.18	0.53	0.15	0.43	0.33	0.45	0.57	0.30	0.32	0.60	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.20	0.33	0.14	0.18	0.53	0.27	0.52	0.41	0.36	0.28	0.44	0.60	0.28	0.13	0.29	0.37	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.33	0.25	0.36	0.51	0.03	0.52	0.01	0.41	0.29	0.43	0.56	0.26	0.14	0.41	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.35	0.12	0.37	0.18	0.16	0.18	0.22	0.24	0.31	0.22	0.20	0.25	0.24	0.28	0.22	0.66	0.22	0.25	0.60	0.44	0.63	0.62	0.59
C2	0.27	0.37	0.36	0.29	0.18	0.23	0.16	0.41	0.18	0.20	0.14	0.55	0.37	0.28	0.18	0.55	0.34	0.19	0.67	0.38	0.74	0.74	0.69
C2'	0.29	0.14	0.32	0.21	0.13	0.16	0.22	0.31	0.27	0.21	0.14	0.28	0.22	0.29	0.17	0.63	0.28	0.18	0.60	0.40	0.68	0.70	0.62
C3'	0.26	0.21	0.34	0.33	0.18	0.28	0.26	0.41	0.31	0.23	0.24	0.26	0.21	0.30	0.18	0.59	0.41	0.22	0.60	0.39	0.70	0.71	0.63
C4	0.25	0.43	0.37	0.42	0.22	0.40	0.14	0.60	0.15	0.26	0.35	0.54	0.37	0.29	0.21	0.44	0.47	0.29	0.75	0.21	0.83	0.83	0.78
C4'	0.27	0.39	0.32	0.17	0.26	0.16	0.32	0.21	0.41	0.23	0.42	0.44	0.31	0.31	0.20	0.62	0.21	0.19	0.50	0.46	0.55	0.56	0.51
C5	0.24	0.35	0.37	0.42	0.20	0.38	0.16	0.57	0.22	0.23	0.30	0.42	0.32	0.28	0.19	0.42	0.48	0.27	0.73	0.29	0.78	0.76	0.74
C5'	0.38	0.54	0.44	0.32	0.40	0.33	0.38	0.32	0.44	0.28	0.50	0.61	0.51	0.33	0.33	0.64	0.36	0.34	0.46	0.45	0.52	0.54	0.47
C6	0.26	0.27	0.37	0.32	0.18	0.26	0.21	0.42	0.24	0.23	0.19	0.35	0.30	0.30	0.19	0.49	0.39	0.19	0.67	0.33	0.70	0.68	0.67
N1	0.29	0.26	0.36	0.26	0.15	0.20	0.18	0.35	0.23	0.20	0.09	0.40	0.31	0.28	0.18	0.57	0.32	0.19	0.65	0.38	0.69	0.68	0.65
N3	0.25	0.44	0.36	0.36	0.22	0.32	0.16	0.52	0.13	0.25	0.29	0.60	0.39	0.31	0.20	0.49	0.41	0.24	0.72	0.28	0.80	0.81	0.75
N4	0.28	0.45	0.37	0.47	0.25	0.48	0.19	0.70	0.24	0.32	0.43	0.56	0.37	0.31	0.26	0.40	0.51	0.38	0.78	0.23	0.89	0.90	0.84
O2	0.29	0.35	0.36	0.26	0.18	0.20	0.18	0.35	0.23	0.19	0.13	0.57	0.37	0.29	0.18	0.59	0.29	0.19	0.65	0.44	0.72	0.73	0.67
O2'	0.39	0.16	0.37	0.14	0.19	0.18	0.22	0.18	0.30	0.21	0.18	0.26	0.27	0.27	0.24	0.73	0.20	0.29	0.57	0.44	0.61	0.62	0.56
O3'	0.29	0.23	0.36	0.35	0.20	0.30	0.26	0.42	0.31	0.23	0.25	0.28	0.24	0.30	0.20	0.63	0.44	0.25	0.58	0.39	0.70	0.73	0.63
O4'	0.32	0.33	0.37	0.19	0.19	0.21	0.30	0.22	0.42	0.24	0.42	0.39	0.21	0.30	0.19	0.66	0.23	0.25	0.58	0.49	0.60	0.58	0.56
O5'	0.20	0.39	0.23	0.12	0.30	0.11	0.35	0.20	0.42	0.24	0.43	0.39	0.31	0.31	0.22	0.48	0.01	0.15	0.46	0.46	0.58	0.55	0.50
OP1	0.10	0.40	0.14	0.03	0.22	0.06	0.20	0.17	0.29	0.09	0.37	0.49	0.34	0.13	0.10	0.23	0.02	0.03	0.45	0.29	0.63	0.52	0.53
OP2	0.19	0.24	0.27	0.10	0.22	0.18	0.27	0.40	0.29	0.29	0.27	0.24	0.21	0.31	0.22	0.30	0.02	0.13	0.68	0.32	0.84	0.72	0.76
P	0.09	0.25	0.15	0.01	0.13	0.06	0.16	0.19	0.22	0.12	0.26	0.30	0.20	0.14	0.06	0.25	0.01	0.02	0.48	0.24	0.61	0.50	0.52

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.21	0.02	0.22	0.15	0.19
C2	0.03	0.00	0.14	0.21	0.01	0.09	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.25	0.03	0.44	0.01	0.44	0.50	0.45
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.08	0.07	0.12	0.17	0.14	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01	0.28	0.08	0.29	0.19	0.25
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.14	0.00	0.13	0.03	0.17	0.07	0.20	0.24	0.19	0.09	0.06	0.02	0.01	0.01	0.37	0.16	0.39	0.17	0.32
C4	0.02	0.01	0.07	0.14	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.14	0.01	0.45	0.01	0.44	0.46	0.45
C4'	0.00	0.09	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.10	0.07	0.10	0.10	0.08	0.08	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.11	0.12	0.22	0.02
C5	0.01	0.00	0.06	0.13	0.00	0.08	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.14	0.01	0.56	0.01	0.57	0.63	0.58
C5'	0.03	0.16	0.03	0.03	0.14	0.00	0.18	0.00	0.20	0.16	0.19	0.15	0.13	0.19	0.11	0.04	0.02	0.01	0.01	0.22	0.21	0.40	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.17	0.01	0.10	0.01	0.20	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.19	0.02	0.58	0.00	0.62	0.69	0.62
C8	0.01	0.01	0.07	0.07	0.00	0.07	0.01	0.16	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.08	0.04	0.54	0.02	0.53	0.52	0.54
N1	0.03	0.00	0.12	0.20	0.01	0.10	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.23	0.01	0.52	0.01	0.54	0.62	0.55
N2	0.04	0.01	0.17	0.24	0.01	0.10	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.11	0.29	0.04	0.40	0.02	0.40	0.46	0.41
N3	0.03	0.00	0.14	0.19	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.21	0.03	0.38	0.01	0.38	0.40	0.38
N7	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.08	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.10	0.03	0.60	0.02	0.63	0.69	0.64
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.41	0.02	0.39	0.37	0.39
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.05	0.05	0.06	0.04	0.07	0.04	0.09	0.11	0.08	0.05	0.02	0.00	0.03	0.06	0.05	0.08	0.13	0.09	0.05
O3'	0.01	0.25	0.01	0.01	0.14	0.02	0.14	0.02	0.19	0.08	0.23	0.29	0.21	0.10	0.06	0.03	0.00	0.02	0.28	0.19	0.36	0.22	0.27
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.03	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.12	0.03	0.15	0.18	0.12
O5'	0.21	0.44	0.28	0.37	0.45	0.02	0.56	0.01	0.58	0.54	0.52	0.40	0.38	0.60	0.41	0.05	0.28	0.12	0.00	0.63	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.08	0.16	0.01	0.11	0.01	0.22	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.08	0.19	0.03	0.63	0.00	0.70	0.79	0.70
OP1	0.22	0.44	0.29	0.39	0.44	0.12	0.57	0.21	0.62	0.53	0.54	0.40	0.38	0.63	0.39	0.13	0.36	0.15	0.01	0.70	0.00	0.01	0.00
OP2	0.15	0.50	0.19	0.17	0.46	0.22	0.63	0.40	0.69	0.52	0.62	0.46	0.40	0.69	0.37	0.09	0.22	0.18	0.02	0.79	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.45	0.25	0.32	0.45	0.02	0.58	0.01	0.62	0.54	0.55	0.41	0.38	0.64	0.39	0.05	0.27	0.12	0.00	0.70	0.00	0.01	0.00