Doublet Group distance statistics: 54499

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 1, 2, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.006, 0.009, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.006 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.016 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.007, 0.022, 0.037, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.022 std_dev=0.015
C6	A	0, 0.011, 0.030, 0.049, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.030 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.013, 0.033, 0.054, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.033 std_dev=0.020
C2	A	0, 0.015, 0.036, 0.057, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.036 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.013, 0.035, 0.058, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.035 std_dev=0.023
O2	A	0, 0.036, 0.085, 0.134, 0.155 max_d=0.155 avg_d=0.085 std_dev=0.049
N4	A	0, 0.040, 0.103, 0.165, 0.169 max_d=0.169 avg_d=0.103 std_dev=0.062
O4'	A	0, 0.068, 0.226, 0.384, 0.479 max_d=0.479 avg_d=0.226 std_dev=0.158
C6	B	0, 0.241, 0.416, 0.591, 0.586 max_d=0.586 avg_d=0.416 std_dev=0.175
C2'	A	0, 0.097, 0.287, 0.477, 0.623 max_d=0.623 avg_d=0.287 std_dev=0.190
C5	B	0, 0.250, 0.446, 0.642, 0.753 max_d=0.753 avg_d=0.446 std_dev=0.196
O6	B	0, 0.257, 0.463, 0.668, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.463 std_dev=0.205
O5'	A	0, 0.148, 0.356, 0.563, 0.754 max_d=0.754 avg_d=0.356 std_dev=0.208
C4	B	0, 0.251, 0.481, 0.712, 0.873 max_d=0.873 avg_d=0.481 std_dev=0.230
O2'	A	0, 0.150, 0.396, 0.642, 0.845 max_d=0.845 avg_d=0.396 std_dev=0.246
N9	B	0, 0.261, 0.524, 0.786, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.524 std_dev=0.262
N1	B	0, 0.303, 0.574, 0.846, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.574 std_dev=0.272
C3'	A	0, 0.132, 0.429, 0.725, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.429 std_dev=0.296
N7	B	0, 0.341, 0.658, 0.974, 1.120 max_d=1.120 avg_d=0.658 std_dev=0.317
C8	B	0, 0.356, 0.679, 1.001, 1.160 max_d=1.160 avg_d=0.679 std_dev=0.322
C1'	B	0, 0.289, 0.613, 0.936, 1.227 max_d=1.227 avg_d=0.613 std_dev=0.323
O3'	A	0, 0.159, 0.496, 0.832, 0.988 max_d=0.988 avg_d=0.496 std_dev=0.337
O4'	B	0, 0.333, 0.681, 1.029, 1.271 max_d=1.271 avg_d=0.681 std_dev=0.348
N3	B	0, 0.327, 0.689, 1.052, 1.209 max_d=1.209 avg_d=0.689 std_dev=0.363
C4'	A	0, 0.090, 0.461, 0.832, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.461 std_dev=0.371
C2	B	0, 0.357, 0.762, 1.166, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.762 std_dev=0.404
C2'	B	0, 0.297, 0.709, 1.121, 1.555 max_d=1.555 avg_d=0.709 std_dev=0.412
C4'	B	0, 0.404, 0.826, 1.247, 1.567 max_d=1.567 avg_d=0.826 std_dev=0.421
O2'	B	0, 0.355, 0.810, 1.266, 1.683 max_d=1.683 avg_d=0.810 std_dev=0.455
C3'	B	0, 0.356, 0.824, 1.292, 1.678 max_d=1.678 avg_d=0.824 std_dev=0.468
C5'	B	0, 0.435, 0.904, 1.374, 1.621 max_d=1.621 avg_d=0.904 std_dev=0.469
P	A	0, 0.326, 0.843, 1.361, 1.499 max_d=1.499 avg_d=0.843 std_dev=0.517
O3'	B	0, 0.353, 0.950, 1.547, 1.931 max_d=1.931 avg_d=0.950 std_dev=0.597
O5'	B	0, 0.478, 1.090, 1.701, 1.882 max_d=1.882 avg_d=1.090 std_dev=0.611
N2	B	0, 0.449, 1.082, 1.714, 1.786 max_d=1.786 avg_d=1.082 std_dev=0.633
OP2	A	0, 0.404, 1.196, 1.989, 2.177 max_d=2.177 avg_d=1.196 std_dev=0.792
OP1	A	0, 0.328, 1.139, 1.950, 2.287 max_d=2.287 avg_d=1.139 std_dev=0.811
C5'	A	0, 0.240, 1.138, 2.036, 2.103 max_d=2.103 avg_d=1.138 std_dev=0.898
P	B	0, 0.462, 1.717, 2.972, 3.711 max_d=3.711 avg_d=1.717 std_dev=1.255
OP1	B	0, 0.570, 2.075, 3.581, 4.300 max_d=4.300 avg_d=2.075 std_dev=1.505
OP2	B	0, 0.383, 2.101, 3.819, 4.970 max_d=4.970 avg_d=2.101 std_dev=1.718

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.08	0.13	0.40	0.08
C2	0.03	0.00	0.06	0.13	0.01	0.04	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.11	0.03	0.15	0.13	0.53	0.16
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.03	0.09	0.02	0.08	0.02	0.04	0.06	0.14	0.00	0.02	0.01	0.11	0.25	0.28	0.05
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.15	0.00	0.14	0.05	0.12	0.09	0.15	0.16	0.15	0.02	0.00	0.04	0.22	0.33	0.19	0.16
C4	0.02	0.01	0.05	0.15	0.00	0.13	0.00	0.40	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.15	0.03	0.21	0.26	0.67	0.30
C4'	0.03	0.04	0.03	0.00	0.13	0.00	0.17	0.01	0.15	0.07	0.08	0.15	0.05	0.08	0.01	0.01	0.04	0.16	0.35	0.04
C5	0.01	0.00	0.09	0.14	0.00	0.17	0.00	0.46	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.16	0.05	0.23	0.30	0.68	0.33
C5'	0.04	0.19	0.02	0.05	0.40	0.01	0.46	0.00	0.40	0.23	0.29	0.45	0.07	0.11	0.03	0.04	0.00	0.24	0.41	0.02
C6	0.00	0.00	0.08	0.12	0.00	0.15	0.00	0.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.13	0.05	0.21	0.22	0.61	0.27
N1	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01	0.07	0.01	0.23	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.02	0.16	0.13	0.52	0.17
N3	0.03	0.00	0.04	0.15	0.00	0.08	0.00	0.29	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.13	0.02	0.18	0.17	0.60	0.23
N4	0.02	0.01	0.06	0.16	0.00	0.15	0.00	0.45	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.17	0.03	0.22	0.32	0.71	0.34
O2	0.04	0.00	0.14	0.15	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.14	0.06	0.13	0.16	0.45	0.10
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.10	0.08	0.09	0.11	0.07	0.05	0.10	0.11	0.13	0.00	0.06	0.06	0.07	0.24	0.31	0.07
O3'	0.01	0.11	0.02	0.00	0.15	0.01	0.16	0.03	0.13	0.07	0.13	0.17	0.14	0.06	0.00	0.02	0.18	0.39	0.15	0.19
O4'	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.01	0.05	0.04	0.05	0.02	0.02	0.03	0.06	0.06	0.02	0.00	0.08	0.11	0.38	0.09
O5'	0.08	0.15	0.11	0.22	0.21	0.04	0.23	0.00	0.21	0.16	0.18	0.22	0.13	0.07	0.18	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.13	0.13	0.25	0.33	0.26	0.16	0.30	0.24	0.22	0.13	0.17	0.32	0.16	0.24	0.39	0.11	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.40	0.53	0.28	0.19	0.67	0.35	0.68	0.41	0.61	0.52	0.60	0.71	0.45	0.31	0.15	0.38	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.16	0.05	0.16	0.30	0.04	0.33	0.02	0.27	0.17	0.23	0.34	0.10	0.07	0.19	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.44	0.11	0.14	0.20	0.11	0.13	0.17	0.13	0.16	0.27	0.60	0.40	0.20	0.13	0.22	0.14	0.11	0.43	0.15	0.51	0.78	0.45
C2	0.09	0.32	0.08	0.09	0.13	0.07	0.10	0.14	0.12	0.11	0.24	0.44	0.25	0.15	0.08	0.17	0.10	0.06	0.39	0.16	0.50	0.79	0.46
C2'	0.14	0.51	0.09	0.15	0.20	0.09	0.12	0.20	0.15	0.20	0.34	0.73	0.43	0.23	0.12	0.22	0.18	0.08	0.52	0.15	0.68	0.94	0.58
C3'	0.09	0.38	0.09	0.23	0.08	0.18	0.13	0.31	0.12	0.30	0.25	0.59	0.30	0.31	0.12	0.19	0.26	0.12	0.67	0.17	0.93	1.13	0.79
C4	0.18	0.29	0.22	0.19	0.19	0.17	0.11	0.21	0.11	0.07	0.22	0.34	0.27	0.06	0.15	0.26	0.20	0.16	0.44	0.08	0.69	0.97	0.63
C4'	0.10	0.24	0.09	0.17	0.05	0.12	0.14	0.21	0.10	0.27	0.13	0.40	0.20	0.28	0.13	0.19	0.18	0.10	0.53	0.16	0.70	0.89	0.58
C5	0.23	0.34	0.28	0.23	0.24	0.21	0.12	0.24	0.11	0.09	0.24	0.39	0.33	0.09	0.19	0.33	0.25	0.20	0.50	0.11	0.78	1.08	0.71
C5'	0.24	0.15	0.27	0.27	0.09	0.27	0.15	0.29	0.13	0.29	0.11	0.26	0.11	0.26	0.20	0.36	0.32	0.24	0.58	0.17	0.84	0.91	0.67
C6	0.21	0.38	0.25	0.18	0.23	0.17	0.09	0.21	0.09	0.09	0.24	0.46	0.37	0.15	0.16	0.32	0.19	0.16	0.49	0.12	0.71	1.01	0.65
N1	0.14	0.39	0.14	0.11	0.18	0.10	0.10	0.16	0.11	0.12	0.26	0.51	0.35	0.17	0.11	0.23	0.11	0.09	0.44	0.14	0.57	0.86	0.51
N3	0.11	0.27	0.13	0.12	0.13	0.10	0.08	0.16	0.09	0.06	0.20	0.34	0.23	0.09	0.09	0.19	0.12	0.09	0.39	0.12	0.56	0.85	0.51
N4	0.20	0.26	0.25	0.23	0.21	0.21	0.15	0.25	0.14	0.12	0.21	0.30	0.26	0.09	0.18	0.27	0.25	0.19	0.44	0.08	0.75	1.01	0.67
O2	0.08	0.28	0.04	0.11	0.12	0.07	0.14	0.14	0.17	0.15	0.23	0.43	0.20	0.18	0.10	0.12	0.14	0.06	0.37	0.20	0.42	0.69	0.38
O2'	0.23	0.52	0.17	0.15	0.25	0.14	0.15	0.14	0.16	0.20	0.34	0.77	0.47	0.21	0.19	0.27	0.17	0.18	0.39	0.15	0.48	0.73	0.39
O3'	0.12	0.40	0.12	0.23	0.10	0.18	0.13	0.30	0.11	0.29	0.26	0.62	0.32	0.30	0.12	0.20	0.28	0.13	0.67	0.16	0.98	1.16	0.81
O4'	0.09	0.29	0.08	0.14	0.09	0.08	0.13	0.18	0.10	0.23	0.14	0.43	0.28	0.27	0.09	0.24	0.14	0.04	0.48	0.17	0.56	0.81	0.50
O5'	0.18	0.28	0.26	0.06	0.15	0.06	0.20	0.17	0.19	0.31	0.19	0.40	0.28	0.34	0.15	0.47	0.02	0.10	0.60	0.25	0.83	1.03	0.72
OP1	0.06	0.19	0.09	0.02	0.08	0.03	0.13	0.10	0.13	0.21	0.15	0.28	0.17	0.22	0.08	0.15	0.01	0.01	0.34	0.17	0.78	0.73	0.55
OP2	0.17	0.48	0.26	0.05	0.36	0.17	0.38	0.41	0.44	0.29	0.48	0.53	0.42	0.35	0.26	0.24	0.02	0.07	0.73	0.45	1.35	1.21	1.07
P	0.09	0.24	0.16	0.01	0.13	0.06	0.15	0.17	0.16	0.21	0.19	0.32	0.22	0.22	0.11	0.22	0.00	0.02	0.50	0.17	0.88	0.87	0.68

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.20	0.23	0.26
C2	0.03	0.00	0.12	0.14	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.17	0.04	0.20	0.01	0.16	0.38	0.24
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.04	0.09	0.08	0.16	0.13	0.08	0.03	0.00	0.01	0.01	0.15	0.05	0.11	0.20	0.06
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.07	0.00	0.05	0.01	0.06	0.10	0.10	0.18	0.13	0.09	0.03	0.01	0.01	0.01	0.22	0.05	0.27	0.31	0.17
C4	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.07	0.03	0.19	0.01	0.14	0.37	0.22
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.05	0.08	0.06	0.03	0.02	0.05	0.02	0.01	0.02	0.03	0.15	0.08	0.14
C5	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.07	0.02	0.23	0.01	0.24	0.48	0.27
C5'	0.04	0.11	0.01	0.01	0.10	0.01	0.11	0.00	0.11	0.10	0.11	0.11	0.09	0.11	0.08	0.05	0.03	0.03	0.01	0.12	0.06	0.02	0.00
C6	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.02	0.24	0.00	0.26	0.52	0.29
C8	0.00	0.01	0.09	0.10	0.01	0.03	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.13	0.02	0.21	0.01	0.24	0.45	0.27
N1	0.02	0.00	0.08	0.10	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.12	0.03	0.23	0.01	0.19	0.45	0.24
N2	0.03	0.00	0.16	0.18	0.01	0.08	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.23	0.05	0.20	0.02	0.18	0.36	0.26
N3	0.02	0.00	0.13	0.13	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.16	0.04	0.17	0.01	0.16	0.33	0.24
N7	0.01	0.01	0.08	0.09	0.00	0.03	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.13	0.02	0.24	0.01	0.33	0.56	0.34
N9	0.00	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.16	0.01	0.12	0.32	0.20
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.04	0.05	0.05	0.05	0.05	0.06	0.07	0.14	0.10	0.07	0.02	0.00	0.02	0.04	0.07	0.06	0.21	0.10	0.17
O3'	0.01	0.17	0.01	0.01	0.07	0.02	0.07	0.03	0.08	0.13	0.12	0.23	0.16	0.13	0.04	0.02	0.00	0.01	0.25	0.08	0.46	0.43	0.30
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.10	0.02	0.34	0.33	0.38
O5'	0.07	0.20	0.15	0.22	0.19	0.02	0.23	0.01	0.24	0.21	0.23	0.20	0.17	0.24	0.16	0.07	0.25	0.10	0.00	0.26	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.05	0.05	0.01	0.03	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.08	0.02	0.26	0.00	0.35	0.59	0.34
OP1	0.20	0.16	0.11	0.27	0.14	0.15	0.24	0.06	0.26	0.24	0.19	0.18	0.16	0.33	0.12	0.21	0.46	0.34	0.01	0.35	0.00	0.01	0.00
OP2	0.23	0.38	0.20	0.31	0.37	0.08	0.48	0.02	0.52	0.45	0.45	0.36	0.33	0.56	0.32	0.10	0.43	0.33	0.02	0.59	0.01	0.00	0.00
P	0.26	0.24	0.06	0.17	0.22	0.14	0.27	0.00	0.29	0.27	0.24	0.26	0.24	0.34	0.20	0.17	0.30	0.38	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00