Doublet Group distance statistics: 54500

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.016 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.004, 0.013, 0.023, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.006, 0.017, 0.028, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.008, 0.021, 0.034, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.011, 0.024, 0.038, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.024 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.014, 0.030, 0.047, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.030 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.010, 0.030, 0.051, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.030 std_dev=0.020
O2	A	0, 0.005, 0.026, 0.048, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.026 std_dev=0.021
N4	A	0, 0.016, 0.041, 0.066, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.041 std_dev=0.025
C2'	A	0, 0.035, 0.309, 0.584, 0.731 max_d=0.731 avg_d=0.309 std_dev=0.275
O4'	A	0, 0.005, 0.302, 0.599, 0.717 max_d=0.717 avg_d=0.302 std_dev=0.297
C2'	B	0, 0.328, 0.673, 1.018, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.673 std_dev=0.345
C3'	B	0, 0.281, 0.637, 0.993, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.637 std_dev=0.356
C8	B	0, 0.330, 0.691, 1.053, 1.031 max_d=1.031 avg_d=0.691 std_dev=0.362
N9	B	0, 0.303, 0.672, 1.040, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.672 std_dev=0.368
O3'	B	0, 0.294, 0.680, 1.065, 1.096 max_d=1.096 avg_d=0.680 std_dev=0.386
C1'	B	0, 0.363, 0.749, 1.135, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.749 std_dev=0.386
N7	B	0, 0.335, 0.723, 1.111, 1.173 max_d=1.173 avg_d=0.723 std_dev=0.388
O4'	B	0, 0.407, 0.829, 1.250, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.829 std_dev=0.421
C4'	B	0, 0.342, 0.779, 1.217, 1.161 max_d=1.161 avg_d=0.779 std_dev=0.437
C5	B	0, 0.237, 0.677, 1.118, 1.212 max_d=1.212 avg_d=0.677 std_dev=0.441
O5'	A	0, 0.076, 0.533, 0.991, 1.312 max_d=1.312 avg_d=0.533 std_dev=0.457
C4	B	0, 0.194, 0.657, 1.120, 1.201 max_d=1.201 avg_d=0.657 std_dev=0.463
P	A	0, 0.196, 0.665, 1.134, 1.389 max_d=1.389 avg_d=0.665 std_dev=0.469
O2'	B	0, 0.398, 0.871, 1.345, 1.391 max_d=1.391 avg_d=0.871 std_dev=0.473
C3'	A	0, 0.063, 0.555, 1.047, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.555 std_dev=0.492
C5'	B	0, 0.311, 0.818, 1.325, 1.399 max_d=1.399 avg_d=0.818 std_dev=0.507
C6	B	0, 0.231, 0.753, 1.275, 1.372 max_d=1.372 avg_d=0.753 std_dev=0.522
O6	B	0, 0.329, 0.868, 1.406, 1.478 max_d=1.478 avg_d=0.868 std_dev=0.538
C4'	A	0, -0.021, 0.523, 1.067, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.523 std_dev=0.544
N3	B	0, 0.108, 0.706, 1.303, 1.428 max_d=1.428 avg_d=0.706 std_dev=0.597
N1	B	0, 0.198, 0.798, 1.397, 1.591 max_d=1.591 avg_d=0.798 std_dev=0.599
OP2	A	0, 0.330, 0.948, 1.567, 1.658 max_d=1.658 avg_d=0.948 std_dev=0.619
C2	B	0, 0.146, 0.781, 1.417, 1.611 max_d=1.611 avg_d=0.781 std_dev=0.635
O2'	A	0, -0.134, 0.528, 1.189, 1.832 max_d=1.832 avg_d=0.528 std_dev=0.661
N2	B	0, 0.290, 0.966, 1.642, 1.860 max_d=1.860 avg_d=0.966 std_dev=0.676
O3'	A	0, 0.171, 0.868, 1.564, 1.897 max_d=1.897 avg_d=0.868 std_dev=0.697
C5'	A	0, -0.042, 0.750, 1.543, 1.942 max_d=1.942 avg_d=0.750 std_dev=0.793
OP1	A	0, 0.403, 1.208, 2.012, 2.411 max_d=2.411 avg_d=1.208 std_dev=0.804
O5'	B	0, 0.843, 1.926, 3.009, 2.928 max_d=2.928 avg_d=1.926 std_dev=1.083
P	B	0, 1.194, 2.699, 4.204, 4.029 max_d=4.029 avg_d=2.699 std_dev=1.505
OP1	B	0, 1.166, 2.730, 4.293, 4.072 max_d=4.072 avg_d=2.730 std_dev=1.563
OP2	B	0, 1.334, 2.997, 4.661, 4.515 max_d=4.515 avg_d=2.997 std_dev=1.664

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.24	0.01	0.16	0.14	0.30	0.15
C2	0.01	0.00	0.13	0.20	0.01	0.05	0.02	0.14	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.20	0.10	0.15	0.05	0.29	0.07
C2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.16	0.14	0.01	0.09	0.01	0.22	0.00	0.04	0.02	0.48	0.47	0.52	0.47
C3'	0.02	0.20	0.01	0.00	0.33	0.01	0.35	0.04	0.31	0.20	0.27	0.35	0.15	0.01	0.01	0.03	0.29	0.29	0.18	0.18
C4	0.01	0.01	0.01	0.33	0.00	0.19	0.01	0.32	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.35	0.16	0.03	0.22	0.21	0.35	0.17
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.19	0.00	0.27	0.01	0.26	0.11	0.09	0.20	0.12	0.23	0.04	0.00	0.03	0.12	0.29	0.05
C5	0.01	0.02	0.10	0.35	0.01	0.27	0.00	0.40	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.42	0.22	0.12	0.25	0.25	0.38	0.22
C5'	0.07	0.14	0.16	0.04	0.32	0.01	0.40	0.00	0.35	0.17	0.21	0.35	0.14	0.07	0.18	0.02	0.01	0.16	0.37	0.03
C6	0.01	0.02	0.14	0.31	0.01	0.26	0.00	0.35	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.36	0.17	0.15	0.19	0.14	0.33	0.14
N1	0.01	0.01	0.01	0.20	0.01	0.11	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.19	0.08	0.01	0.13	0.04	0.30	0.08
N3	0.01	0.01	0.09	0.27	0.01	0.09	0.01	0.21	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.22	0.16	0.06	0.17	0.10	0.31	0.09
N4	0.01	0.01	0.01	0.35	0.00	0.20	0.01	0.35	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.38	0.20	0.03	0.25	0.27	0.38	0.22
O2	0.02	0.01	0.22	0.15	0.02	0.12	0.03	0.14	0.03	0.02	0.02	0.02	0.00	0.06	0.37	0.19	0.18	0.12	0.28	0.12
O2'	0.02	0.12	0.00	0.01	0.35	0.23	0.42	0.07	0.36	0.19	0.22	0.38	0.06	0.00	0.06	0.16	0.31	0.33	0.56	0.37
O3'	0.24	0.20	0.04	0.01	0.16	0.04	0.22	0.18	0.17	0.08	0.16	0.20	0.37	0.06	0.00	0.15	0.15	0.28	0.27	0.12
O4'	0.01	0.10	0.02	0.03	0.03	0.00	0.12	0.02	0.15	0.01	0.06	0.03	0.19	0.16	0.15	0.00	0.05	0.07	0.27	0.07
O5'	0.16	0.15	0.48	0.29	0.22	0.03	0.25	0.01	0.19	0.13	0.17	0.25	0.18	0.31	0.15	0.05	0.00	0.02	0.01	0.02
OP1	0.14	0.05	0.47	0.29	0.21	0.12	0.25	0.16	0.14	0.04	0.10	0.27	0.12	0.33	0.28	0.07	0.02	0.00	0.03	0.00
OP2	0.30	0.29	0.52	0.18	0.35	0.29	0.38	0.37	0.33	0.30	0.31	0.38	0.28	0.56	0.27	0.27	0.01	0.03	0.00	0.00
P	0.15	0.07	0.47	0.18	0.17	0.05	0.22	0.03	0.14	0.08	0.09	0.22	0.12	0.37	0.12	0.07	0.02	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.27	0.21	0.24	0.10	0.22	0.12	0.22	0.08	0.24	0.19	0.20	0.21	0.25	0.22	0.21	0.39	0.17	0.19	0.20	0.28	0.32	0.39	0.28
C2	0.23	0.28	0.24	0.11	0.17	0.11	0.14	0.10	0.13	0.19	0.10	0.40	0.31	0.24	0.17	0.35	0.13	0.15	0.24	0.25	0.28	0.44	0.32
C2'	0.23	0.28	0.26	0.32	0.18	0.28	0.17	0.36	0.22	0.14	0.25	0.34	0.26	0.17	0.16	0.36	0.43	0.21	0.43	0.26	0.67	0.64	0.57
C3'	0.15	0.18	0.15	0.13	0.18	0.11	0.23	0.17	0.25	0.20	0.20	0.18	0.17	0.25	0.15	0.28	0.27	0.07	0.25	0.29	0.36	0.44	0.33
C4	0.21	0.46	0.23	0.15	0.26	0.17	0.17	0.22	0.28	0.19	0.43	0.52	0.39	0.14	0.19	0.28	0.13	0.16	0.37	0.24	0.42	0.58	0.47
C4'	0.14	0.19	0.15	0.11	0.12	0.13	0.16	0.10	0.20	0.12	0.20	0.23	0.15	0.16	0.09	0.29	0.20	0.13	0.13	0.23	0.22	0.29	0.18
C5	0.25	0.32	0.28	0.21	0.22	0.21	0.15	0.24	0.22	0.20	0.30	0.36	0.29	0.11	0.22	0.31	0.18	0.21	0.40	0.22	0.43	0.59	0.49
C5'	0.19	0.25	0.20	0.21	0.15	0.24	0.14	0.20	0.17	0.09	0.21	0.31	0.23	0.12	0.12	0.30	0.31	0.22	0.12	0.18	0.24	0.23	0.17
C6	0.28	0.20	0.31	0.17	0.17	0.18	0.07	0.17	0.08	0.19	0.14	0.24	0.23	0.12	0.22	0.36	0.12	0.21	0.33	0.12	0.38	0.51	0.41
N1	0.26	0.17	0.26	0.11	0.17	0.13	0.13	0.11	0.12	0.19	0.08	0.24	0.23	0.19	0.20	0.36	0.12	0.18	0.26	0.19	0.32	0.44	0.33
N3	0.22	0.47	0.23	0.11	0.22	0.12	0.07	0.15	0.10	0.19	0.35	0.57	0.41	0.21	0.17	0.31	0.09	0.14	0.30	0.14	0.33	0.51	0.39
N4	0.19	0.56	0.21	0.18	0.33	0.20	0.31	0.28	0.49	0.18	0.60	0.62	0.45	0.13	0.20	0.24	0.17	0.16	0.42	0.48	0.51	0.66	0.56
O2	0.23	0.24	0.24	0.14	0.16	0.13	0.22	0.08	0.27	0.20	0.13	0.40	0.29	0.28	0.16	0.38	0.20	0.17	0.20	0.39	0.24	0.39	0.27
O2'	0.27	0.36	0.23	0.20	0.21	0.18	0.19	0.27	0.24	0.18	0.27	0.49	0.35	0.22	0.18	0.45	0.27	0.20	0.41	0.30	0.71	0.73	0.60
O3'	0.17	0.29	0.17	0.09	0.16	0.09	0.14	0.13	0.18	0.11	0.24	0.40	0.26	0.14	0.12	0.29	0.19	0.11	0.24	0.19	0.28	0.44	0.30
O4'	0.17	0.17	0.17	0.06	0.12	0.09	0.18	0.02	0.23	0.13	0.22	0.20	0.13	0.17	0.10	0.34	0.12	0.12	0.14	0.27	0.19	0.28	0.18
O5'	0.13	0.14	0.15	0.05	0.15	0.05	0.22	0.09	0.24	0.20	0.20	0.14	0.11	0.25	0.13	0.30	0.02	0.08	0.22	0.29	0.27	0.34	0.26
OP1	0.05	0.14	0.07	0.05	0.11	0.05	0.15	0.10	0.17	0.16	0.16	0.18	0.12	0.19	0.10	0.11	0.01	0.05	0.17	0.20	0.33	0.17	0.22
OP2	0.20	0.24	0.23	0.10	0.24	0.13	0.26	0.25	0.26	0.27	0.25	0.24	0.24	0.29	0.24	0.20	0.01	0.13	0.22	0.27	0.39	0.27	0.31
P	0.10	0.12	0.13	0.06	0.11	0.05	0.15	0.09	0.15	0.17	0.13	0.14	0.11	0.18	0.12	0.14	0.00	0.07	0.15	0.18	0.25	0.17	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.05	0.08	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.08	0.02	0.12	0.09	0.08
C2	0.06	0.00	0.12	0.11	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.15	0.14	0.05	0.13	0.02	0.15	0.19	0.15
C2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.05	0.01	0.03	0.02	0.06	0.05	0.10	0.15	0.11	0.03	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.10	0.09	0.05
C3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.06	0.01	0.08	0.02	0.09	0.09	0.10	0.14	0.10	0.09	0.04	0.01	0.01	0.02	0.11	0.10	0.11	0.10	0.08
C4	0.02	0.01	0.05	0.06	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.07	0.02	0.12	0.02	0.13	0.17	0.14
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.04	0.08	0.04	0.09	0.06	0.08	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.07	0.13	0.06	0.05
C5	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.09	0.02	0.16	0.01	0.19	0.25	0.21
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.04	0.01	0.08	0.00	0.08	0.10	0.05	0.07	0.06	0.12	0.04	0.02	0.04	0.02	0.00	0.12	0.13	0.07	0.03
C6	0.03	0.01	0.06	0.09	0.02	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.08	0.10	0.02	0.18	0.00	0.22	0.29	0.24
C8	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.08	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.09	0.05	0.15	0.02	0.16	0.20	0.18
N1	0.05	0.01	0.10	0.10	0.02	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.13	0.13	0.03	0.16	0.02	0.18	0.25	0.20
N2	0.08	0.01	0.15	0.14	0.01	0.09	0.02	0.07	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.21	0.18	0.07	0.13	0.02	0.15	0.18	0.14
N3	0.06	0.01	0.11	0.10	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.13	0.12	0.06	0.12	0.02	0.14	0.14	0.12
N7	0.01	0.01	0.03	0.09	0.02	0.08	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.10	0.04	0.18	0.02	0.23	0.28	0.25
N9	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.11	0.01	0.12	0.13	0.11
O2'	0.02	0.15	0.00	0.01	0.06	0.02	0.04	0.02	0.08	0.04	0.13	0.21	0.13	0.03	0.02	0.00	0.03	0.03	0.04	0.07	0.11	0.07	0.05
O3'	0.02	0.14	0.03	0.01	0.07	0.02	0.09	0.04	0.10	0.09	0.13	0.18	0.12	0.10	0.04	0.03	0.00	0.02	0.17	0.12	0.17	0.14	0.15
O4'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.05	0.03	0.07	0.06	0.04	0.02	0.03	0.02	0.00	0.14	0.03	0.16	0.12	0.12
O5'	0.08	0.13	0.04	0.11	0.12	0.03	0.16	0.00	0.18	0.15	0.16	0.13	0.12	0.18	0.11	0.04	0.17	0.14	0.00	0.21	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.05	0.10	0.02	0.07	0.01	0.12	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.07	0.12	0.03	0.21	0.00	0.28	0.36	0.30
OP1	0.12	0.15	0.10	0.11	0.13	0.13	0.19	0.13	0.22	0.16	0.18	0.15	0.14	0.23	0.12	0.11	0.17	0.16	0.01	0.28	0.00	0.03	0.01
OP2	0.09	0.19	0.09	0.10	0.17	0.06	0.25	0.07	0.29	0.20	0.25	0.18	0.14	0.28	0.13	0.07	0.14	0.12	0.02	0.36	0.03	0.00	0.01
P	0.08	0.15	0.05	0.08	0.14	0.05	0.21	0.03	0.24	0.18	0.20	0.14	0.12	0.25	0.11	0.05	0.15	0.12	0.01	0.30	0.01	0.01	0.00