Doublet Group distance statistics: 54505

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.008
N3	A	0, -0.002, 0.006, 0.015, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.006 std_dev=0.008
C5	A	0, -0.001, 0.008, 0.017, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.008 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.001, 0.014, 0.027, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.014 std_dev=0.013
N4	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.021 std_dev=0.015
C6	A	0, 0.000, 0.017, 0.033, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N1	A	0, -0.002, 0.020, 0.041, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.020 std_dev=0.021
O2	A	0, 0.002, 0.029, 0.056, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.029 std_dev=0.027
O4'	A	0, -0.002, 0.027, 0.056, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.027 std_dev=0.029
C2'	A	0, 0.012, 0.042, 0.072, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.042 std_dev=0.030
O2'	A	0, 0.034, 0.125, 0.216, 0.214 max_d=0.214 avg_d=0.125 std_dev=0.091
C3'	A	0, -0.026, 0.093, 0.211, 0.260 max_d=0.260 avg_d=0.093 std_dev=0.119
O3'	A	0, -0.023, 0.105, 0.233, 0.285 max_d=0.285 avg_d=0.105 std_dev=0.128
C4'	A	0, -0.028, 0.101, 0.229, 0.282 max_d=0.282 avg_d=0.101 std_dev=0.129
C4	B	0, 0.079, 0.272, 0.465, 0.427 max_d=0.427 avg_d=0.272 std_dev=0.193
C5	B	0, 0.018, 0.255, 0.493, 0.571 max_d=0.571 avg_d=0.255 std_dev=0.237
C5'	A	0, -0.054, 0.196, 0.445, 0.548 max_d=0.548 avg_d=0.196 std_dev=0.250
N9	B	0, 0.101, 0.360, 0.619, 0.598 max_d=0.598 avg_d=0.360 std_dev=0.259
N7	B	0, 0.008, 0.304, 0.600, 0.706 max_d=0.706 avg_d=0.304 std_dev=0.296
N3	B	0, 0.032, 0.349, 0.666, 0.767 max_d=0.767 avg_d=0.349 std_dev=0.317
C8	B	0, 0.041, 0.358, 0.675, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.358 std_dev=0.317
C6	B	0, 0.105, 0.427, 0.749, 0.778 max_d=0.778 avg_d=0.427 std_dev=0.322
C2	B	0, 0.127, 0.478, 0.829, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.478 std_dev=0.351
N1	B	0, 0.148, 0.515, 0.882, 0.826 max_d=0.826 avg_d=0.515 std_dev=0.367
C1'	B	0, 0.164, 0.566, 0.968, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.566 std_dev=0.402
O6	B	0, 0.154, 0.585, 1.017, 1.027 max_d=1.027 avg_d=0.585 std_dev=0.432
C2'	B	0, 0.128, 0.586, 1.044, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.586 std_dev=0.458
N2	B	0, 0.168, 0.652, 1.136, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.652 std_dev=0.484
O4'	B	0, 0.217, 0.766, 1.316, 1.259 max_d=1.259 avg_d=0.766 std_dev=0.549
O2'	B	0, 0.248, 0.849, 1.449, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.849 std_dev=0.601
C3'	B	0, 0.013, 0.642, 1.271, 1.496 max_d=1.496 avg_d=0.642 std_dev=0.629
C4'	B	0, 0.249, 0.899, 1.549, 1.514 max_d=1.514 avg_d=0.899 std_dev=0.650
O3'	B	0, -0.076, 0.712, 1.500, 1.810 max_d=1.810 avg_d=0.712 std_dev=0.788
OP2	A	0, -0.022, 0.784, 1.590, 1.893 max_d=1.893 avg_d=0.784 std_dev=0.806
C5'	B	0, 0.340, 1.160, 1.980, 1.759 max_d=1.759 avg_d=1.160 std_dev=0.820
O5'	B	0, 0.326, 1.190, 2.053, 2.023 max_d=2.023 avg_d=1.190 std_dev=0.864
O5'	A	0, -0.113, 0.755, 1.623, 1.971 max_d=1.971 avg_d=0.755 std_dev=0.868
P	A	0, -0.200, 0.706, 1.612, 1.985 max_d=1.985 avg_d=0.706 std_dev=0.906
OP1	A	0, -0.109, 0.953, 2.014, 2.433 max_d=2.433 avg_d=0.953 std_dev=1.061
P	B	0, 0.311, 1.856, 3.402, 3.784 max_d=3.784 avg_d=1.856 std_dev=1.546
OP2	B	0, 0.290, 2.418, 4.545, 5.178 max_d=5.178 avg_d=2.418 std_dev=2.128
OP1	B	0, -0.047, 2.610, 5.266, 6.255 max_d=6.255 avg_d=2.610 std_dev=2.656

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.16	0.15	0.10	0.13
C2	0.02	0.00	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.09	0.02	0.03	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.32	0.27	0.14	0.27
C2'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.26	0.24	0.06	0.20
C3'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.06	0.06	0.05	0.09	0.01	0.00	0.00	0.03	0.37	0.33	0.03	0.28
C4	0.01	0.00	0.04	0.07	0.00	0.07	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.07	0.02	0.47	0.41	0.29	0.41
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.08	0.06	0.04	0.08	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.27	0.02
C5	0.02	0.01	0.03	0.07	0.01	0.08	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.02	0.49	0.42	0.29	0.44
C5'	0.04	0.09	0.02	0.01	0.17	0.00	0.19	0.00	0.17	0.13	0.13	0.19	0.04	0.02	0.03	0.01	0.01	0.14	0.41	0.02
C6	0.03	0.02	0.02	0.06	0.01	0.08	0.00	0.17	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02	0.06	0.02	0.43	0.34	0.17	0.36
N1	0.00	0.03	0.03	0.06	0.01	0.06	0.00	0.13	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.06	0.01	0.29	0.24	0.10	0.24
N3	0.02	0.00	0.03	0.05	0.00	0.04	0.01	0.13	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01	0.40	0.34	0.22	0.34
N4	0.01	0.00	0.04	0.09	0.00	0.08	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.09	0.02	0.49	0.45	0.35	0.45
O2	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.03	0.03	0.01	0.00	0.00	0.05	0.00	0.01	0.25	0.21	0.10	0.21
O2'	0.04	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.05	0.00	0.04	0.06	0.05	0.11	0.14	0.04
O3'	0.03	0.04	0.02	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.06	0.06	0.06	0.09	0.00	0.04	0.00	0.00	0.31	0.34	0.00	0.26
O4'	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.08	0.19	0.05
O5'	0.16	0.32	0.26	0.37	0.47	0.01	0.49	0.01	0.43	0.29	0.40	0.49	0.25	0.05	0.31	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.15	0.27	0.24	0.33	0.41	0.08	0.42	0.14	0.34	0.24	0.34	0.45	0.21	0.11	0.34	0.08	0.02	0.00	0.06	0.00
OP2	0.10	0.14	0.06	0.03	0.29	0.27	0.29	0.41	0.17	0.10	0.22	0.35	0.10	0.14	0.00	0.19	0.01	0.06	0.00	0.01
P	0.13	0.27	0.20	0.28	0.41	0.02	0.44	0.02	0.36	0.24	0.34	0.45	0.21	0.04	0.26	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.12	0.22	0.28	0.04	0.21	0.06	0.23	0.11	0.12	0.12	0.21	0.11	0.11	0.11	0.30	0.29	0.22	0.33	0.16	0.35	0.66	0.27
C2	0.21	0.29	0.23	0.34	0.09	0.23	0.11	0.29	0.12	0.21	0.14	0.48	0.26	0.23	0.14	0.25	0.35	0.21	0.44	0.21	0.46	0.83	0.37
C2'	0.21	0.16	0.22	0.31	0.05	0.23	0.03	0.26	0.10	0.11	0.14	0.25	0.14	0.08	0.11	0.31	0.35	0.21	0.37	0.14	0.19	0.81	0.35
C3'	0.19	0.18	0.25	0.38	0.06	0.30	0.07	0.36	0.15	0.07	0.19	0.24	0.13	0.03	0.09	0.34	0.45	0.22	0.45	0.18	0.11	0.97	0.49
C4	0.18	0.46	0.26	0.45	0.11	0.36	0.08	0.51	0.10	0.30	0.37	0.62	0.32	0.30	0.16	0.23	0.46	0.20	0.68	0.15	0.22	1.26	0.68
C4'	0.17	0.12	0.20	0.26	0.06	0.24	0.09	0.24	0.15	0.05	0.16	0.15	0.07	0.06	0.07	0.34	0.30	0.20	0.29	0.17	0.08	0.69	0.31
C5	0.19	0.40	0.28	0.50	0.11	0.43	0.02	0.59	0.20	0.28	0.37	0.50	0.29	0.22	0.15	0.25	0.51	0.25	0.75	0.20	0.20	1.37	0.78
C5'	0.13	0.20	0.17	0.28	0.15	0.32	0.23	0.34	0.29	0.13	0.27	0.20	0.13	0.21	0.09	0.36	0.40	0.22	0.33	0.33	0.32	0.79	0.42
C6	0.20	0.30	0.28	0.46	0.09	0.37	0.03	0.48	0.15	0.20	0.27	0.39	0.24	0.14	0.14	0.28	0.47	0.23	0.62	0.16	0.11	1.15	0.61
N1	0.21	0.24	0.24	0.34	0.07	0.24	0.06	0.31	0.10	0.17	0.16	0.35	0.22	0.16	0.13	0.28	0.35	0.20	0.45	0.15	0.29	0.87	0.39
N3	0.19	0.40	0.24	0.38	0.10	0.26	0.13	0.37	0.09	0.26	0.23	0.62	0.31	0.29	0.15	0.23	0.40	0.18	0.54	0.22	0.39	1.01	0.49
N4	0.17	0.48	0.25	0.46	0.10	0.39	0.10	0.58	0.10	0.34	0.43	0.65	0.31	0.35	0.17	0.21	0.48	0.22	0.76	0.14	0.24	1.40	0.78
O2	0.23	0.20	0.20	0.27	0.08	0.20	0.13	0.21	0.16	0.17	0.09	0.40	0.22	0.21	0.14	0.25	0.29	0.26	0.33	0.27	0.65	0.63	0.25
O2'	0.21	0.08	0.14	0.18	0.03	0.17	0.06	0.14	0.12	0.07	0.11	0.14	0.09	0.08	0.09	0.27	0.19	0.23	0.21	0.17	0.39	0.56	0.17
O3'	0.18	0.18	0.22	0.34	0.07	0.29	0.07	0.34	0.15	0.06	0.19	0.24	0.13	0.02	0.08	0.33	0.42	0.21	0.43	0.18	0.20	0.99	0.51
O4'	0.19	0.12	0.22	0.28	0.02	0.22	0.04	0.23	0.11	0.08	0.13	0.17	0.07	0.04	0.09	0.32	0.28	0.21	0.30	0.13	0.22	0.62	0.26
O5'	0.20	0.19	0.20	0.03	0.14	0.08	0.11	0.05	0.14	0.04	0.17	0.22	0.19	0.08	0.11	0.41	0.01	0.14	0.24	0.15	0.30	0.78	0.39
OP1	0.11	0.14	0.16	0.03	0.10	0.03	0.08	0.13	0.08	0.10	0.11	0.18	0.14	0.09	0.10	0.19	0.03	0.02	0.20	0.08	0.69	0.83	0.49
OP2	0.27	0.31	0.37	0.08	0.28	0.07	0.25	0.31	0.26	0.21	0.29	0.34	0.31	0.21	0.26	0.40	0.01	0.08	0.42	0.24	0.77	1.29	0.75
P	0.14	0.13	0.20	0.02	0.11	0.03	0.08	0.16	0.07	0.09	0.10	0.16	0.14	0.06	0.11	0.27	0.00	0.04	0.26	0.06	0.56	0.87	0.50

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.04	0.02	0.01	0.06	0.01	0.62	0.09	0.15
C2	0.02	0.00	0.07	0.06	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.07	0.06	0.10	0.00	1.00	0.25	0.24
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.04	0.09	0.07	0.05	0.02	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.32	0.22	0.01
C3'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.04	0.05	0.07	0.06	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.03	0.12	0.28	0.09
C4	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.03	0.03	0.12	0.00	0.81	0.29	0.16
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.03	0.04	0.02	0.00	0.02	0.04	0.18	0.09	0.06
C5	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01	0.18	0.01	0.70	0.46	0.10
C5'	0.02	0.03	0.01	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.10	0.15	0.06	0.02	0.02	0.16	0.07	0.04	0.03	0.00	0.00	0.12	0.14	0.21	0.02
C6	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.03	0.02	0.17	0.00	0.77	0.48	0.12
C8	0.00	0.00	0.07	0.04	0.00	0.07	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.05	0.05	0.22	0.01	0.41	0.50	0.12
N1	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.05	0.05	0.13	0.01	0.92	0.36	0.18
N2	0.03	0.00	0.09	0.07	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.09	0.09	0.07	0.02	1.09	0.20	0.30
N3	0.01	0.00	0.07	0.06	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.06	0.06	0.08	0.00	0.95	0.20	0.24
N7	0.00	0.00	0.05	0.03	0.00	0.07	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.03	0.03	0.23	0.01	0.45	0.61	0.16
N9	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.01	0.00	0.13	0.01	0.65	0.27	0.11
O2'	0.04	0.06	0.01	0.01	0.03	0.04	0.04	0.04	0.03	0.07	0.04	0.08	0.06	0.07	0.05	0.00	0.03	0.02	0.03	0.04	0.35	0.11	0.06
O3'	0.02	0.07	0.03	0.00	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.05	0.05	0.09	0.06	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.09	0.01	0.31	0.41	0.21
O4'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.05	0.05	0.09	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.65	0.19	0.25
O5'	0.06	0.10	0.07	0.07	0.12	0.02	0.18	0.00	0.17	0.22	0.13	0.07	0.08	0.23	0.13	0.03	0.09	0.03	0.00	0.18	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.18	0.00	0.69	0.57	0.12
OP1	0.62	1.00	0.32	0.12	0.81	0.18	0.70	0.14	0.77	0.41	0.92	1.09	0.95	0.45	0.65	0.35	0.31	0.65	0.01	0.69	0.00	0.07	0.01
OP2	0.09	0.25	0.22	0.28	0.29	0.09	0.46	0.21	0.48	0.50	0.36	0.20	0.20	0.61	0.27	0.11	0.41	0.19	0.01	0.57	0.07	0.00	0.01
P	0.15	0.24	0.01	0.09	0.16	0.06	0.10	0.02	0.12	0.12	0.18	0.30	0.24	0.16	0.11	0.06	0.21	0.25	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00