Doublet Group distance statistics: 54508

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.007, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.007 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C6	A	0, 0.000, 0.017, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.000, 0.025, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.025 std_dev=0.025
O2	A	0, 0.000, 0.039, 0.078, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.039 std_dev=0.039
N4	A	0, 0.000, 0.059, 0.118, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.059 std_dev=0.059
N3	B	0, 0.000, 0.391, 0.782, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.391 std_dev=0.391
O4'	A	0, 0.000, 0.400, 0.801, 0.801 max_d=0.801 avg_d=0.400 std_dev=0.400
OP1	A	0, 0.000, 0.488, 0.976, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.488 std_dev=0.488
C2'	A	0, 0.000, 0.488, 0.976, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.488 std_dev=0.488
C4	B	0, 0.000, 0.489, 0.979, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.489 std_dev=0.489
N9	B	0, 0.000, 0.524, 1.048, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.524 std_dev=0.524
P	A	0, 0.000, 0.558, 1.115, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.558 std_dev=0.558
C2'	B	0, 0.000, 0.577, 1.154, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.577 std_dev=0.577
C1'	B	0, 0.000, 0.590, 1.180, 1.180 max_d=1.180 avg_d=0.590 std_dev=0.590
C2	B	0, 0.000, 0.591, 1.182, 1.182 max_d=1.182 avg_d=0.591 std_dev=0.591
C4'	A	0, 0.000, 0.646, 1.292, 1.292 max_d=1.292 avg_d=0.646 std_dev=0.646
N2	B	0, 0.000, 0.687, 1.374, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.687 std_dev=0.687
C3'	A	0, 0.000, 0.722, 1.443, 1.443 max_d=1.443 avg_d=0.722 std_dev=0.722
C5	B	0, 0.000, 0.741, 1.481, 1.481 max_d=1.481 avg_d=0.741 std_dev=0.741
C5'	A	0, 0.000, 0.759, 1.517, 1.517 max_d=1.517 avg_d=0.759 std_dev=0.759
C8	B	0, 0.000, 0.760, 1.520, 1.520 max_d=1.520 avg_d=0.760 std_dev=0.760
N1	B	0, 0.000, 0.826, 1.653, 1.653 max_d=1.653 avg_d=0.826 std_dev=0.826
O4'	B	0, 0.000, 0.865, 1.730, 1.730 max_d=1.730 avg_d=0.865 std_dev=0.865
N7	B	0, 0.000, 0.869, 1.738, 1.738 max_d=1.738 avg_d=0.869 std_dev=0.869
OP2	A	0, 0.000, 0.898, 1.797, 1.797 max_d=1.797 avg_d=0.898 std_dev=0.898
C6	B	0, 0.000, 0.907, 1.813, 1.813 max_d=1.813 avg_d=0.907 std_dev=0.907
O5'	A	0, 0.000, 0.915, 1.829, 1.829 max_d=1.829 avg_d=0.915 std_dev=0.915
O2'	A	0, 0.000, 0.971, 1.942, 1.942 max_d=1.942 avg_d=0.971 std_dev=0.971
C3'	B	0, 0.000, 1.059, 2.119, 2.119 max_d=2.119 avg_d=1.059 std_dev=1.059
O6	B	0, 0.000, 1.149, 2.298, 2.298 max_d=2.298 avg_d=1.149 std_dev=1.149
O3'	A	0, 0.000, 1.213, 2.425, 2.425 max_d=2.425 avg_d=1.213 std_dev=1.213
C4'	B	0, 0.000, 1.227, 2.454, 2.454 max_d=2.454 avg_d=1.227 std_dev=1.227
O2'	B	0, 0.000, 1.343, 2.686, 2.686 max_d=2.686 avg_d=1.343 std_dev=1.343
O3'	B	0, 0.000, 1.453, 2.905, 2.905 max_d=2.905 avg_d=1.453 std_dev=1.453
C5'	B	0, 0.000, 1.716, 3.432, 3.432 max_d=3.432 avg_d=1.716 std_dev=1.716
O5'	B	0, 0.000, 1.757, 3.514, 3.514 max_d=3.514 avg_d=1.757 std_dev=1.757
P	B	0, 0.000, 2.314, 4.629, 4.629 max_d=4.629 avg_d=2.314 std_dev=2.314
OP2	B	0, 0.000, 2.394, 4.789, 4.789 max_d=4.789 avg_d=2.394 std_dev=2.394
OP1	B	0, 0.000, 2.612, 5.225, 5.225 max_d=5.225 avg_d=2.612 std_dev=2.612

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.26	0.00	0.03	0.23	0.59	0.23
C2	0.01	0.00	0.12	0.19	0.00	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.14	0.10	0.04	0.24	0.15	0.41	0.10
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.02	0.00	0.11	0.17	0.14	0.00	0.08	0.02	0.24	0.00	0.03	0.01	0.24	0.60	0.92	0.59
C3'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.25	0.00	0.23	0.00	0.18	0.16	0.24	0.26	0.15	0.00	0.00	0.01	0.03	0.16	0.40	0.20
C4	0.00	0.00	0.02	0.25	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.31	0.05	0.01	0.37	0.07	0.20	0.03
C4'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.00	0.08	0.05	0.07	0.09	0.02	0.24	0.00	0.00	0.01	0.05	0.34	0.07
C5	0.00	0.01	0.11	0.23	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.32	0.09	0.05	0.37	0.05	0.19	0.04
C5'	0.07	0.02	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.06	0.20	0.01	0.00	0.21	0.25	0.00
C6	0.00	0.01	0.14	0.18	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.27	0.04	0.06	0.30	0.10	0.36	0.05
N1	0.00	0.00	0.00	0.16	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.16	0.08	0.00	0.21	0.15	0.46	0.12
N3	0.01	0.00	0.08	0.24	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.23	0.03	0.03	0.32	0.11	0.30	0.03
N4	0.01	0.01	0.02	0.26	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.33	0.08	0.01	0.40	0.04	0.10	0.07
O2	0.01	0.00	0.24	0.15	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.20	0.08	0.18	0.18	0.46	0.14
O2'	0.02	0.14	0.00	0.00	0.31	0.24	0.32	0.06	0.27	0.16	0.23	0.33	0.00	0.00	0.03	0.16	0.19	0.65	1.00	0.59
O3'	0.26	0.10	0.03	0.00	0.05	0.00	0.09	0.20	0.04	0.08	0.03	0.08	0.20	0.03	0.00	0.17	0.17	0.21	0.19	0.07
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.06	0.00	0.03	0.01	0.08	0.16	0.17	0.00	0.14	0.05	0.35	0.01
O5'	0.03	0.24	0.24	0.03	0.37	0.01	0.37	0.00	0.30	0.21	0.32	0.40	0.18	0.19	0.17	0.14	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.23	0.15	0.60	0.16	0.07	0.05	0.05	0.21	0.10	0.15	0.11	0.04	0.18	0.65	0.21	0.05	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.59	0.41	0.92	0.40	0.20	0.34	0.19	0.25	0.36	0.46	0.30	0.10	0.46	1.00	0.19	0.35	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.23	0.10	0.59	0.20	0.03	0.07	0.04	0.00	0.05	0.12	0.03	0.07	0.14	0.59	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.04	0.00	0.07	0.25	0.14	0.16	0.32	0.36	0.38	0.28	0.22	0.18	0.02	0.39	0.14	0.62	0.11	0.06	0.58	0.49	0.80	0.84	0.70
C2	0.04	0.20	0.06	0.45	0.05	0.40	0.21	0.64	0.14	0.31	0.10	0.35	0.13	0.38	0.14	0.64	0.19	0.23	0.84	0.24	1.10	1.13	1.01
C2'	0.08	0.10	0.23	0.42	0.21	0.32	0.32	0.51	0.33	0.32	0.22	0.03	0.10	0.38	0.22	0.46	0.13	0.19	0.70	0.38	0.98	0.96	0.84
C3'	0.14	0.30	0.07	0.01	0.17	0.05	0.31	0.09	0.45	0.13	0.46	0.29	0.15	0.26	0.06	0.74	0.33	0.08	0.29	0.54	0.51	0.57	0.42
C4	0.00	0.32	0.01	0.55	0.14	0.50	0.11	0.74	0.23	0.13	0.33	0.37	0.24	0.08	0.00	0.67	0.42	0.26	0.89	0.21	1.16	1.11	1.05
C4'	0.01	0.50	0.08	0.04	0.35	0.00	0.50	0.13	0.64	0.31	0.66	0.47	0.32	0.45	0.23	0.54	0.38	0.01	0.34	0.71	0.51	0.59	0.44
C5	0.08	0.24	0.03	0.44	0.13	0.35	0.07	0.54	0.13	0.06	0.21	0.28	0.21	0.05	0.04	0.74	0.30	0.13	0.66	0.10	0.91	0.81	0.78
C5'	0.04	0.61	0.15	0.01	0.42	0.01	0.53	0.08	0.65	0.33	0.70	0.65	0.44	0.45	0.28	0.41	0.40	0.03	0.27	0.69	0.42	0.49	0.36
C6	0.09	0.14	0.01	0.32	0.01	0.23	0.11	0.41	0.08	0.15	0.04	0.22	0.13	0.20	0.03	0.72	0.08	0.07	0.57	0.13	0.80	0.75	0.68
N1	0.02	0.11	0.06	0.35	0.08	0.27	0.24	0.48	0.23	0.27	0.04	0.26	0.08	0.35	0.12	0.66	0.06	0.13	0.67	0.31	0.91	0.92	0.81
N3	0.05	0.30	0.03	0.54	0.04	0.50	0.04	0.76	0.10	0.26	0.28	0.40	0.19	0.26	0.09	0.64	0.35	0.29	0.94	0.06	1.23	1.24	1.13
N4	0.01	0.38	0.05	0.64	0.23	0.61	0.29	0.88	0.41	0.00	0.44	0.40	0.28	0.14	0.07	0.61	0.60	0.31	1.01	0.44	1.33	1.23	1.20
O2	0.07	0.15	0.09	0.45	0.11	0.41	0.29	0.67	0.26	0.37	0.02	0.34	0.08	0.46	0.19	0.61	0.16	0.26	0.88	0.41	1.15	1.21	1.06
O2'	0.06	0.13	0.25	0.48	0.14	0.36	0.31	0.61	0.28	0.39	0.05	0.38	0.07	0.46	0.21	0.47	0.16	0.19	0.87	0.40	1.23	1.23	1.06
O3'	0.02	0.58	0.02	0.00	0.41	0.01	0.62	0.17	0.83	0.37	0.83	0.55	0.36	0.56	0.26	0.73	0.39	0.04	0.41	0.99	0.62	0.78	0.58
O4'	0.03	0.34	0.07	0.10	0.30	0.04	0.50	0.20	0.62	0.34	0.57	0.18	0.19	0.48	0.21	0.58	0.33	0.02	0.42	0.70	0.59	0.67	0.52
O5'	0.38	0.27	0.29	0.37	0.00	0.40	0.08	0.33	0.24	0.16	0.34	0.38	0.07	0.02	0.17	0.86	0.65	0.38	0.17	0.29	0.02	0.06	0.06
OP1	0.40	0.23	0.29	0.41	0.03	0.44	0.15	0.36	0.31	0.08	0.34	0.28	0.05	0.08	0.13	0.79	0.61	0.40	0.16	0.39	0.10	0.17	0.00
OP2	0.34	0.40	0.34	0.36	0.15	0.35	0.27	0.29	0.44	0.02	0.50	0.46	0.21	0.16	0.06	0.98	0.51	0.32	0.11	0.50	0.11	0.19	0.04
P	0.40	0.25	0.30	0.41	0.02	0.43	0.13	0.36	0.29	0.11	0.35	0.33	0.07	0.04	0.15	0.85	0.64	0.40	0.18	0.35	0.04	0.10	0.05

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.05	0.05	0.05	0.00	0.01	0.00	0.27	0.00	0.05	0.05	0.04	0.17	0.12
C2	0.05	0.00	0.13	0.08	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.17	0.32	0.13	0.10	0.01	0.09	0.04	0.01
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.06	0.00	0.01	0.11	0.01	0.11	0.07	0.18	0.14	0.09	0.01	0.00	0.03	0.03	0.21	0.02	0.13	0.28	0.22
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.13	0.00	0.20	0.01	0.19	0.22	0.14	0.05	0.06	0.24	0.14	0.01	0.00	0.01	0.07	0.21	0.18	0.11	0.10
C4	0.03	0.00	0.06	0.13	0.00	0.01	0.00	0.07	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.19	0.06	0.12	0.03	0.09	0.00	0.03
C4'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.00	0.05	0.18	0.01	0.11	0.08	0.17	0.06	0.20	0.03	0.00	0.00	0.08	0.04	0.05	0.04
C5	0.02	0.01	0.01	0.20	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.32	0.08	0.01	0.22	0.02	0.19	0.11	0.14
C5'	0.01	0.00	0.11	0.01	0.07	0.00	0.16	0.00	0.15	0.23	0.07	0.05	0.03	0.26	0.09	0.08	0.13	0.00	0.00	0.20	0.02	0.01	0.01
C6	0.04	0.00	0.01	0.19	0.02	0.05	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.34	0.12	0.05	0.23	0.01	0.22	0.17	0.17
C8	0.01	0.00	0.11	0.22	0.01	0.18	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.29	0.04	0.10	0.23	0.01	0.15	0.01	0.12
N1	0.05	0.00	0.07	0.14	0.02	0.01	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.27	0.23	0.10	0.17	0.01	0.16	0.12	0.10
N2	0.05	0.00	0.18	0.05	0.00	0.11	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.40	0.15	0.06	0.02	0.06	0.02	0.02
N3	0.05	0.00	0.14	0.06	0.00	0.08	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.11	0.34	0.13	0.05	0.02	0.04	0.03	0.04
N7	0.00	0.01	0.09	0.24	0.00	0.17	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.35	0.05	0.07	0.29	0.01	0.24	0.15	0.21
N9	0.01	0.01	0.01	0.14	0.00	0.06	0.01	0.09	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.13	0.00	0.09	0.03	0.05	0.07	0.01
O2'	0.00	0.17	0.00	0.01	0.21	0.20	0.32	0.08	0.34	0.29	0.27	0.08	0.11	0.35	0.19	0.00	0.02	0.14	0.11	0.39	0.00	0.28	0.13
O3'	0.27	0.32	0.03	0.00	0.19	0.03	0.08	0.13	0.12	0.04	0.23	0.40	0.34	0.05	0.13	0.02	0.00	0.17	0.20	0.06	0.48	0.27	0.28
O4'	0.00	0.13	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.05	0.10	0.10	0.15	0.13	0.07	0.00	0.14	0.17	0.00	0.05	0.03	0.07	0.20	0.15
O5'	0.05	0.10	0.21	0.07	0.12	0.00	0.22	0.00	0.23	0.23	0.17	0.06	0.05	0.29	0.09	0.11	0.20	0.05	0.00	0.29	0.01	0.00	0.00
O6	0.05	0.01	0.02	0.21	0.03	0.08	0.02	0.20	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.39	0.06	0.03	0.29	0.00	0.28	0.25	0.24
OP1	0.04	0.09	0.13	0.18	0.09	0.04	0.19	0.02	0.22	0.15	0.16	0.06	0.04	0.24	0.05	0.00	0.48	0.07	0.01	0.28	0.00	0.01	0.00
OP2	0.17	0.04	0.28	0.11	0.00	0.05	0.11	0.01	0.17	0.01	0.12	0.02	0.03	0.15	0.07	0.28	0.27	0.20	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.01	0.22	0.10	0.03	0.04	0.14	0.01	0.17	0.12	0.10	0.02	0.04	0.21	0.01	0.13	0.28	0.15	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00