Doublet Group distance statistics: 54512

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 6, 12, 16, 10, 7, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.005, 0.008, 0.011, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.003, 0.006, 0.010, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.004, 0.009, 0.013, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.009 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.004, 0.009, 0.013, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.009 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.008 std_dev=0.005
O2	A	0, 0.012, 0.026, 0.040, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.026 std_dev=0.014
O4	A	0, 0.021, 0.051, 0.081, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.051 std_dev=0.030
O3'	A	0, 0.088, 0.139, 0.189, 0.259 max_d=0.259 avg_d=0.139 std_dev=0.050
C3'	A	0, 0.045, 0.119, 0.192, 0.469 max_d=0.469 avg_d=0.119 std_dev=0.074
C2'	A	0, 0.028, 0.115, 0.201, 0.556 max_d=0.556 avg_d=0.115 std_dev=0.086
O4'	A	0, 0.006, 0.097, 0.189, 0.602 max_d=0.602 avg_d=0.097 std_dev=0.092
C4'	A	0, 0.054, 0.151, 0.248, 0.626 max_d=0.626 avg_d=0.151 std_dev=0.097
O2'	A	0, 0.051, 0.196, 0.341, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.196 std_dev=0.145
N1	B	0, 0.293, 0.462, 0.631, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.462 std_dev=0.169
C5'	A	0, 0.072, 0.242, 0.411, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.242 std_dev=0.170
C1'	B	0, 0.320, 0.495, 0.669, 1.024 max_d=1.024 avg_d=0.495 std_dev=0.174
C5	B	0, 0.282, 0.458, 0.633, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.458 std_dev=0.176
N3	B	0, 0.283, 0.462, 0.642, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.462 std_dev=0.179
C2	B	0, 0.316, 0.495, 0.675, 1.071 max_d=1.071 avg_d=0.495 std_dev=0.180
C6	B	0, 0.268, 0.448, 0.627, 1.035 max_d=1.035 avg_d=0.448 std_dev=0.180
C4	B	0, 0.255, 0.438, 0.622, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.438 std_dev=0.184
O4	B	0, 0.261, 0.468, 0.674, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.468 std_dev=0.206
O4'	B	0, 0.311, 0.524, 0.737, 1.405 max_d=1.405 avg_d=0.524 std_dev=0.213
OP1	A	0, 0.153, 0.381, 0.609, 1.370 max_d=1.370 avg_d=0.381 std_dev=0.228
O5'	A	0, 0.052, 0.285, 0.518, 1.742 max_d=1.742 avg_d=0.285 std_dev=0.233
O2	B	0, 0.342, 0.580, 0.817, 1.453 max_d=1.453 avg_d=0.580 std_dev=0.237
C4'	B	0, 0.192, 0.500, 0.808, 2.296 max_d=2.296 avg_d=0.500 std_dev=0.308
C2'	B	0, 0.185, 0.501, 0.818, 2.366 max_d=2.366 avg_d=0.501 std_dev=0.316
P	A	0, 0.056, 0.373, 0.689, 2.346 max_d=2.346 avg_d=0.373 std_dev=0.317
C3'	B	0, 0.155, 0.494, 0.833, 2.477 max_d=2.477 avg_d=0.494 std_dev=0.339
O3'	B	0, 0.182, 0.522, 0.861, 2.317 max_d=2.317 avg_d=0.522 std_dev=0.339
O2'	B	0, 0.202, 0.600, 0.998, 3.109 max_d=3.109 avg_d=0.600 std_dev=0.398
C5'	B	0, 0.090, 0.515, 0.940, 3.279 max_d=3.279 avg_d=0.515 std_dev=0.425
O5'	B	0, -0.062, 0.520, 1.102, 4.555 max_d=4.555 avg_d=0.520 std_dev=0.582
OP2	A	0, -0.212, 0.467, 1.147, 5.276 max_d=5.276 avg_d=0.467 std_dev=0.679
P	B	0, -0.169, 0.597, 1.363, 6.019 max_d=6.019 avg_d=0.597 std_dev=0.766
OP2	B	0, -0.159, 0.658, 1.475, 6.451 max_d=6.451 avg_d=0.658 std_dev=0.817
OP1	B	0, -0.267, 0.773, 1.813, 8.230 max_d=8.230 avg_d=0.773 std_dev=1.040

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.08	0.10	0.12	0.08
C2	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.04	0.01	0.03	0.10	0.13	0.18	0.11
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.04	0.04	0.01	0.04	0.07	0.00	0.02	0.03	0.01	0.09	0.15	0.21	0.11
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.07	0.15	0.07
C4	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.04	0.00	0.02	0.13	0.15	0.17	0.12
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.04	0.04
C5	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.03	0.01	0.04	0.14	0.16	0.14	0.12
C5'	0.02	0.04	0.04	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.06	0.04	0.05	0.03	0.04	0.02	0.06	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.03	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.03	0.01	0.04	0.14	0.15	0.12	0.10
N1	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.11	0.13	0.14	0.10
N3	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.04	0.01	0.02	0.11	0.14	0.19	0.12
O2	0.01	0.00	0.07	0.04	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.05	0.01	0.05	0.08	0.11	0.20	0.11
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.01	0.06	0.04	0.07	0.02	0.05	0.12	0.00	0.04	0.05	0.01	0.09	0.20	0.25	0.13
O3'	0.03	0.04	0.02	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.04	0.05	0.04	0.00	0.04	0.03	0.05	0.06	0.14	0.07
O4	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.02	0.13	0.16	0.18	0.13
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.02	0.00	0.06	0.05	0.06	0.06
O5'	0.08	0.10	0.09	0.04	0.13	0.01	0.14	0.01	0.14	0.11	0.11	0.08	0.09	0.05	0.13	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.10	0.13	0.15	0.07	0.15	0.03	0.16	0.06	0.15	0.13	0.14	0.11	0.20	0.06	0.16	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.18	0.21	0.15	0.17	0.04	0.14	0.11	0.12	0.14	0.19	0.20	0.25	0.14	0.18	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.11	0.11	0.07	0.12	0.04	0.12	0.01	0.10	0.10	0.12	0.11	0.13	0.07	0.13	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.12	0.14	0.11	0.10	0.11	0.12	0.13	0.08	0.08	0.10	0.18	0.14	0.11	0.13	0.13	0.20	0.36	0.26	0.29
C2	0.13	0.14	0.11	0.13	0.10	0.13	0.11	0.11	0.10	0.11	0.12	0.18	0.17	0.10	0.13	0.15	0.09	0.20	0.30	0.16
C2'	0.11	0.11	0.15	0.12	0.10	0.13	0.12	0.19	0.09	0.07	0.09	0.19	0.13	0.13	0.13	0.12	0.31	0.56	0.42	0.46
C3'	0.11	0.11	0.14	0.14	0.11	0.15	0.13	0.24	0.10	0.07	0.10	0.18	0.12	0.14	0.13	0.12	0.40	0.69	0.51	0.58
C4	0.15	0.17	0.12	0.15	0.09	0.12	0.10	0.10	0.10	0.13	0.15	0.21	0.15	0.10	0.10	0.14	0.09	0.24	0.29	0.17
C4'	0.13	0.11	0.11	0.12	0.12	0.15	0.14	0.23	0.13	0.08	0.11	0.17	0.15	0.13	0.14	0.13	0.37	0.59	0.38	0.48
C5	0.16	0.18	0.14	0.15	0.10	0.13	0.11	0.12	0.10	0.14	0.14	0.23	0.16	0.13	0.14	0.14	0.14	0.34	0.24	0.23
C5'	0.17	0.11	0.13	0.11	0.14	0.15	0.16	0.25	0.16	0.12	0.12	0.17	0.26	0.11	0.15	0.12	0.40	0.70	0.42	0.52
C6	0.16	0.17	0.14	0.14	0.11	0.14	0.12	0.14	0.10	0.13	0.13	0.23	0.16	0.13	0.16	0.15	0.18	0.38	0.24	0.27
N1	0.13	0.14	0.12	0.12	0.08	0.12	0.11	0.11	0.08	0.10	0.10	0.19	0.14	0.10	0.13	0.14	0.13	0.30	0.24	0.22
N3	0.14	0.16	0.11	0.15	0.11	0.14	0.11	0.11	0.11	0.13	0.15	0.19	0.16	0.10	0.13	0.15	0.10	0.20	0.33	0.16
O2	0.13	0.14	0.14	0.14	0.13	0.16	0.14	0.15	0.12	0.12	0.13	0.16	0.21	0.12	0.15	0.18	0.14	0.17	0.35	0.18
O2'	0.11	0.12	0.22	0.15	0.10	0.13	0.12	0.19	0.09	0.09	0.10	0.19	0.21	0.15	0.13	0.12	0.30	0.52	0.47	0.46
O3'	0.11	0.12	0.21	0.18	0.10	0.15	0.12	0.25	0.10	0.09	0.10	0.18	0.15	0.16	0.12	0.11	0.40	0.62	0.57	0.59
O4	0.15	0.17	0.13	0.17	0.11	0.13	0.10	0.10	0.11	0.14	0.16	0.21	0.15	0.11	0.10	0.14	0.10	0.23	0.32	0.17
O4'	0.15	0.11	0.11	0.13	0.11	0.14	0.15	0.16	0.13	0.09	0.10	0.18	0.13	0.12	0.14	0.15	0.22	0.39	0.21	0.30
O5'	0.19	0.16	0.14	0.11	0.15	0.16	0.18	0.28	0.17	0.15	0.14	0.22	0.27	0.11	0.15	0.13	0.44	0.85	0.51	0.62
OP1	0.14	0.11	0.12	0.11	0.13	0.19	0.16	0.33	0.14	0.11	0.11	0.19	0.27	0.15	0.15	0.14	0.47	0.89	0.51	0.63
OP2	0.38	0.29	0.35	0.27	0.18	0.21	0.18	0.19	0.22	0.28	0.22	0.38	0.55	0.26	0.17	0.23	0.34	0.78	0.49	0.57
P	0.19	0.12	0.16	0.11	0.13	0.14	0.14	0.26	0.13	0.12	0.10	0.19	0.33	0.10	0.16	0.12	0.43	0.83	0.51	0.61

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.12	0.01	0.00	0.06	0.06	0.08	0.07
C2	0.01	0.00	0.08	0.07	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.09	0.01	0.08	0.11	0.16	0.12	0.13
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.01	0.07	0.07	0.08	0.01	0.06	0.14	0.00	0.02	0.04	0.01	0.07	0.08	0.16	0.10
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.11	0.00	0.13	0.01	0.11	0.07	0.09	0.07	0.01	0.01	0.12	0.01	0.09	0.19	0.14	0.11
C4	0.01	0.01	0.03	0.11	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.05	0.00	0.02	0.10	0.13	0.27	0.13
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.11	0.03	0.02	0.10	0.10	0.02	0.06	0.00	0.01	0.08	0.07	0.02
C5	0.01	0.01	0.07	0.13	0.00	0.11	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.22	0.08	0.01	0.08	0.17	0.17	0.32	0.18
C5'	0.03	0.06	0.07	0.01	0.08	0.00	0.14	0.00	0.13	0.03	0.05	0.13	0.04	0.07	0.09	0.01	0.01	0.07	0.10	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.11	0.01	0.11	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.22	0.07	0.01	0.10	0.16	0.15	0.24	0.15
N1	0.00	0.01	0.01	0.07	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.06	0.01	0.01	0.06	0.07	0.11	0.08
N3	0.01	0.00	0.06	0.09	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.06	0.01	0.05	0.09	0.16	0.17	0.12
O2	0.02	0.01	0.14	0.07	0.01	0.10	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.14	0.02	0.15	0.18	0.24	0.12	0.20
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.14	0.10	0.22	0.04	0.22	0.08	0.06	0.15	0.00	0.04	0.15	0.07	0.03	0.13	0.16	0.06
O3'	0.12	0.09	0.02	0.01	0.05	0.02	0.08	0.07	0.07	0.06	0.06	0.14	0.04	0.00	0.06	0.07	0.16	0.34	0.27	0.23
O4	0.01	0.01	0.04	0.12	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.15	0.06	0.00	0.02	0.11	0.15	0.31	0.15
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.02	0.00	0.08	0.01	0.10	0.01	0.05	0.15	0.07	0.07	0.02	0.00	0.08	0.07	0.09	0.08
O5'	0.06	0.11	0.07	0.09	0.10	0.01	0.17	0.01	0.16	0.06	0.09	0.18	0.03	0.16	0.11	0.08	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.06	0.16	0.08	0.19	0.13	0.08	0.17	0.07	0.15	0.07	0.16	0.24	0.13	0.34	0.15	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.12	0.16	0.14	0.27	0.07	0.32	0.10	0.24	0.11	0.17	0.12	0.16	0.27	0.31	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.13	0.10	0.11	0.13	0.02	0.18	0.01	0.15	0.08	0.12	0.20	0.06	0.23	0.15	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00