Doublet Group distance statistics: 54523

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.000, 0.006, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.000, 0.011, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.000, 0.013, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.013
O4	A	0, 0.000, 0.020, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.020
O2	A	0, 0.000, 0.034, 0.068, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.034 std_dev=0.034
C2	B	0, 0.000, 0.313, 0.626, 0.626 max_d=0.626 avg_d=0.313 std_dev=0.313
N1	B	0, 0.000, 0.358, 0.716, 0.716 max_d=0.716 avg_d=0.358 std_dev=0.358
N3	B	0, 0.000, 0.395, 0.790, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.395 std_dev=0.395
OP1	A	0, 0.000, 0.461, 0.922, 0.922 max_d=0.922 avg_d=0.461 std_dev=0.461
C2'	B	0, 0.000, 0.526, 1.052, 1.052 max_d=1.052 avg_d=0.526 std_dev=0.526
C6	B	0, 0.000, 0.545, 1.090, 1.090 max_d=1.090 avg_d=0.545 std_dev=0.545
O3'	A	0, 0.000, 0.545, 1.090, 1.090 max_d=1.090 avg_d=0.545 std_dev=0.545
C4	B	0, 0.000, 0.565, 1.130, 1.130 max_d=1.130 avg_d=0.565 std_dev=0.565
C5	B	0, 0.000, 0.638, 1.276, 1.276 max_d=1.276 avg_d=0.638 std_dev=0.638
O2	B	0, 0.000, 0.657, 1.315, 1.315 max_d=1.315 avg_d=0.657 std_dev=0.657
O4'	A	0, 0.000, 0.679, 1.357, 1.357 max_d=1.357 avg_d=0.679 std_dev=0.679
C3'	A	0, 0.000, 0.690, 1.381, 1.381 max_d=1.381 avg_d=0.690 std_dev=0.690
C2'	A	0, 0.000, 0.693, 1.386, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.693 std_dev=0.693
O2'	B	0, 0.000, 0.713, 1.426, 1.426 max_d=1.426 avg_d=0.713 std_dev=0.713
C1'	B	0, 0.000, 0.754, 1.508, 1.508 max_d=1.508 avg_d=0.754 std_dev=0.754
C4'	A	0, 0.000, 0.819, 1.639, 1.639 max_d=1.639 avg_d=0.819 std_dev=0.819
O4	B	0, 0.000, 0.868, 1.736, 1.736 max_d=1.736 avg_d=0.868 std_dev=0.868
C3'	B	0, 0.000, 0.921, 1.842, 1.842 max_d=1.842 avg_d=0.921 std_dev=0.921
O5'	A	0, 0.000, 0.942, 1.884, 1.884 max_d=1.884 avg_d=0.942 std_dev=0.942
O3'	B	0, 0.000, 1.065, 2.130, 2.130 max_d=2.130 avg_d=1.065 std_dev=1.065
P	A	0, 0.000, 1.077, 2.154, 2.154 max_d=2.154 avg_d=1.077 std_dev=1.077
O2'	A	0, 0.000, 1.147, 2.295, 2.295 max_d=2.295 avg_d=1.147 std_dev=1.147
O4'	B	0, 0.000, 1.218, 2.435, 2.435 max_d=2.435 avg_d=1.218 std_dev=1.218
C4'	B	0, 0.000, 1.342, 2.685, 2.685 max_d=2.685 avg_d=1.342 std_dev=1.342
C5'	A	0, 0.000, 1.592, 3.185, 3.185 max_d=3.185 avg_d=1.592 std_dev=1.592
C5'	B	0, 0.000, 1.754, 3.507, 3.507 max_d=3.507 avg_d=1.754 std_dev=1.754
O5'	B	0, 0.000, 2.242, 4.484, 4.484 max_d=4.484 avg_d=2.242 std_dev=2.242
OP2	A	0, 0.000, 2.365, 4.731, 4.731 max_d=4.731 avg_d=2.365 std_dev=2.365
P	B	0, 0.000, 2.752, 5.504, 5.504 max_d=5.504 avg_d=2.752 std_dev=2.752
OP1	B	0, 0.000, 3.151, 6.301, 6.301 max_d=6.301 avg_d=3.151 std_dev=3.151
OP2	B	0, 0.000, 3.349, 6.698, 6.698 max_d=6.698 avg_d=3.349 std_dev=3.349

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.22	0.21	0.36	0.10
C2	0.01	0.00	0.17	0.10	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.26	0.11	0.01	0.08	0.26	0.25	0.64	0.15
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.03	0.00	0.15	0.02	0.18	0.01	0.10	0.31	0.00	0.00	0.02	0.00	0.46	0.64	0.13	0.22
C3'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.03	0.01	0.12	0.01	0.14	0.01	0.06	0.19	0.02	0.01	0.03	0.01	0.35	0.51	0.11	0.24
C4	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.00	0.32	0.27	0.74	0.14
C4'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.07	0.09
C5	0.00	0.01	0.15	0.12	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.12	0.03	0.00	0.07	0.34	0.28	0.64	0.10
C5'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.03	0.08	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01
C6	0.01	0.01	0.18	0.14	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.04	0.01	0.09	0.35	0.28	0.53	0.08
N1	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.04	0.01	0.00	0.29	0.25	0.54	0.12
N3	0.01	0.00	0.10	0.06	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.08	0.01	0.05	0.28	0.26	0.74	0.16
O2	0.03	0.00	0.31	0.19	0.01	0.00	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.49	0.16	0.01	0.14	0.23	0.25	0.62	0.15
O2'	0.01	0.26	0.00	0.02	0.03	0.02	0.12	0.01	0.14	0.03	0.19	0.49	0.00	0.03	0.04	0.01	0.49	0.78	0.08	0.28
O3'	0.04	0.11	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.04	0.08	0.16	0.03	0.00	0.02	0.01	0.24	0.42	0.19	0.18
O4	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.00	0.31	0.26	0.78	0.14
O4'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.01	0.09	0.00	0.05	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.15	0.39	0.31
O5'	0.22	0.26	0.46	0.35	0.32	0.01	0.34	0.01	0.35	0.29	0.28	0.23	0.49	0.24	0.31	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.21	0.25	0.64	0.51	0.27	0.01	0.28	0.01	0.28	0.25	0.26	0.25	0.78	0.42	0.26	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.36	0.64	0.13	0.11	0.74	0.07	0.64	0.00	0.53	0.54	0.74	0.62	0.08	0.19	0.78	0.39	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.15	0.22	0.24	0.14	0.09	0.10	0.01	0.08	0.12	0.16	0.15	0.28	0.18	0.14	0.31	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.27	0.21	0.17	0.01	0.14	0.06	0.26	0.29	0.16	0.10	0.07	0.38	0.41	0.05	0.20	0.11	0.03	0.08	0.08	0.30
C2	0.40	0.17	0.26	0.22	0.19	0.38	0.17	0.23	0.06	0.22	0.02	0.25	0.38	0.24	0.33	0.46	0.60	0.65	0.81	0.44
C2'	0.26	0.31	0.12	0.15	0.13	0.06	0.35	0.53	0.25	0.10	0.16	0.56	0.44	0.09	0.19	0.04	0.18	0.29	0.57	0.64
C3'	0.33	0.44	0.24	0.10	0.00	0.11	0.24	0.71	0.17	0.19	0.30	0.73	0.62	0.04	0.04	0.02	0.55	0.96	1.17	1.20
C4	0.25	0.10	0.19	0.16	0.01	0.22	0.12	0.12	0.22	0.20	0.00	0.08	0.26	0.17	0.15	0.26	0.40	0.41	0.78	0.28
C4'	0.56	0.65	0.58	0.23	0.23	0.08	0.05	0.51	0.12	0.44	0.50	0.92	0.94	0.30	0.18	0.12	0.54	1.20	0.95	1.14
C5	0.15	0.13	0.13	0.04	0.07	0.03	0.09	0.12	0.13	0.14	0.10	0.12	0.24	0.05	0.02	0.06	0.11	0.02	0.39	0.07
C5'	0.77	1.00	0.86	0.43	0.54	0.18	0.31	0.45	0.36	0.70	0.85	1.33	1.28	0.49	0.48	0.22	0.58	1.48	1.07	1.26
C6	0.16	0.18	0.12	0.01	0.01	0.03	0.04	0.25	0.02	0.12	0.12	0.25	0.29	0.01	0.04	0.00	0.01	0.13	0.15	0.24
N1	0.29	0.20	0.19	0.07	0.11	0.14	0.17	0.10	0.03	0.16	0.06	0.31	0.36	0.10	0.19	0.20	0.22	0.16	0.31	0.03
N3	0.35	0.12	0.24	0.24	0.15	0.37	0.02	0.28	0.18	0.23	0.05	0.14	0.32	0.25	0.32	0.43	0.61	0.68	0.98	0.51
O2	0.48	0.17	0.31	0.32	0.26	0.56	0.26	0.46	0.03	0.24	0.05	0.28	0.43	0.34	0.41	0.64	0.91	1.03	1.10	0.77
O2'	0.04	0.03	0.17	0.39	0.44	0.15	0.67	0.54	0.55	0.17	0.13	0.30	0.15	0.32	0.50	0.05	0.00	0.26	0.40	0.32
O3'	0.05	0.14	0.07	0.39	0.26	0.33	0.50	0.93	0.45	0.10	0.02	0.43	0.31	0.31	0.29	0.22	0.70	0.81	1.43	1.32
O4	0.24	0.07	0.19	0.20	0.05	0.25	0.24	0.19	0.29	0.20	0.02	0.00	0.23	0.20	0.10	0.28	0.46	0.49	0.93	0.38
O4'	0.58	0.55	0.56	0.31	0.18	0.20	0.08	0.25	0.18	0.44	0.39	0.72	0.81	0.34	0.11	0.22	0.18	0.61	0.33	0.61
O5'	0.48	0.82	0.52	0.15	0.60	0.09	0.39	0.57	0.35	0.55	0.81	1.03	0.82	0.15	0.61	0.00	0.68	1.42	0.95	1.20
OP1	0.14	0.48	0.21	0.08	0.47	0.30	0.29	0.64	0.20	0.27	0.57	0.57	0.43	0.10	0.53	0.25	0.70	1.27	0.83	1.10
OP2	0.34	0.52	0.55	0.19	0.06	0.09	0.15	0.61	0.07	0.24	0.39	0.88	1.02	0.33	0.00	0.17	0.66	1.42	1.05	1.24
P	0.23	0.55	0.36	0.01	0.34	0.25	0.12	0.69	0.09	0.28	0.55	0.78	0.69	0.06	0.35	0.24	0.76	1.42	0.97	1.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.06	0.01	0.30	0.02
C2	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.00	0.03	0.06	0.02	0.04	0.33	0.05
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.10	0.02	0.01	0.11	0.00	0.02	0.04	0.00	0.01	0.03	0.17	0.02
C3'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.10	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.07	0.01	0.04	0.05	0.09	0.04
C4	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.07	0.01	0.02	0.06	0.06	0.48	0.00
C4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.04	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.12	0.03
C5	0.00	0.01	0.09	0.10	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.00	0.03	0.10	0.13	0.54	0.05
C5'	0.02	0.09	0.01	0.00	0.12	0.01	0.10	0.00	0.08	0.07	0.11	0.08	0.01	0.03	0.13	0.01	0.01	0.04	0.11	0.02
C6	0.00	0.00	0.10	0.10	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.12	0.01	0.05	0.10	0.13	0.50	0.06
N1	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.02	0.01	0.06	0.03	0.38	0.01
N3	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.02	0.02	0.05	0.03	0.01	0.39	0.05
O2	0.01	0.00	0.11	0.06	0.02	0.02	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00	0.19	0.07	0.04	0.09	0.01	0.11	0.25	0.09
O2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.07	0.19	0.00	0.06	0.00	0.02	0.04	0.07	0.07	0.05
O3'	0.02	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.11	0.03	0.12	0.04	0.02	0.07	0.06	0.00	0.07	0.01	0.10	0.09	0.07	0.05
O4	0.02	0.03	0.04	0.07	0.01	0.06	0.00	0.13	0.01	0.02	0.02	0.04	0.00	0.07	0.00	0.03	0.06	0.05	0.50	0.01
O4'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.05	0.09	0.02	0.01	0.03	0.00	0.08	0.01	0.33	0.02
O5'	0.06	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.10	0.01	0.10	0.06	0.03	0.01	0.04	0.10	0.06	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01
OP1	0.01	0.04	0.03	0.05	0.06	0.04	0.13	0.04	0.13	0.03	0.01	0.11	0.07	0.09	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.30	0.33	0.17	0.09	0.48	0.12	0.54	0.11	0.50	0.38	0.39	0.25	0.07	0.07	0.50	0.33	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.02	0.05	0.02	0.04	0.00	0.03	0.05	0.02	0.06	0.01	0.05	0.09	0.05	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00