Doublet Group distance statistics: 54524

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.004, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.000, 0.006, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.012
O4	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
O2	A	0, 0.000, 0.020, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.020
O4'	A	0, 0.000, 0.223, 0.446, 0.446 max_d=0.446 avg_d=0.223 std_dev=0.223
C2'	A	0, 0.000, 0.313, 0.627, 0.627 max_d=0.627 avg_d=0.313 std_dev=0.313
O4'	B	0, 0.000, 0.328, 0.656, 0.656 max_d=0.656 avg_d=0.328 std_dev=0.328
C1'	B	0, 0.000, 0.357, 0.715, 0.715 max_d=0.715 avg_d=0.357 std_dev=0.357
N1	B	0, 0.000, 0.450, 0.899, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.450 std_dev=0.450
C4'	B	0, 0.000, 0.456, 0.911, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.456 std_dev=0.456
O5'	A	0, 0.000, 0.491, 0.983, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.491 std_dev=0.491
C4'	A	0, 0.000, 0.566, 1.133, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.566 std_dev=0.566
C2	B	0, 0.000, 0.578, 1.155, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.578 std_dev=0.578
C6	B	0, 0.000, 0.587, 1.174, 1.174 max_d=1.174 avg_d=0.587 std_dev=0.587
C3'	A	0, 0.000, 0.627, 1.253, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.627 std_dev=0.627
P	B	0, 0.000, 0.647, 1.295, 1.295 max_d=1.295 avg_d=0.647 std_dev=0.647
O2	B	0, 0.000, 0.658, 1.316, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.658 std_dev=0.658
O5'	B	0, 0.000, 0.701, 1.402, 1.402 max_d=1.402 avg_d=0.701 std_dev=0.701
N3	B	0, 0.000, 0.716, 1.432, 1.432 max_d=1.432 avg_d=0.716 std_dev=0.716
C5'	A	0, 0.000, 0.728, 1.455, 1.455 max_d=1.455 avg_d=0.728 std_dev=0.728
O2'	A	0, 0.000, 0.741, 1.482, 1.482 max_d=1.482 avg_d=0.741 std_dev=0.741
C5	B	0, 0.000, 0.801, 1.603, 1.603 max_d=1.603 avg_d=0.801 std_dev=0.801
C4	B	0, 0.000, 0.833, 1.666, 1.666 max_d=1.666 avg_d=0.833 std_dev=0.833
C5'	B	0, 0.000, 0.907, 1.815, 1.815 max_d=1.815 avg_d=0.907 std_dev=0.907
OP1	B	0, 0.000, 0.912, 1.823, 1.823 max_d=1.823 avg_d=0.912 std_dev=0.912
C3'	B	0, 0.000, 0.937, 1.874, 1.874 max_d=1.874 avg_d=0.937 std_dev=0.937
O4	B	0, 0.000, 1.009, 2.018, 2.018 max_d=2.018 avg_d=1.009 std_dev=1.009
O3'	A	0, 0.000, 1.059, 2.118, 2.118 max_d=2.118 avg_d=1.059 std_dev=1.059
OP2	B	0, 0.000, 1.065, 2.130, 2.130 max_d=2.130 avg_d=1.065 std_dev=1.065
C2'	B	0, 0.000, 1.086, 2.172, 2.172 max_d=2.172 avg_d=1.086 std_dev=1.086
P	A	0, 0.000, 1.093, 2.186, 2.186 max_d=2.186 avg_d=1.093 std_dev=1.093
O3'	B	0, 0.000, 1.136, 2.273, 2.273 max_d=2.273 avg_d=1.136 std_dev=1.136
O2'	B	0, 0.000, 1.585, 3.171, 3.171 max_d=3.171 avg_d=1.585 std_dev=1.585
OP2	A	0, 0.000, 1.618, 3.236, 3.236 max_d=3.236 avg_d=1.618 std_dev=1.618
OP1	A	0, 0.000, 1.932, 3.864, 3.864 max_d=3.864 avg_d=1.932 std_dev=1.932

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.16	0.00	0.00	0.15	0.40	0.06	0.16
C2	0.01	0.00	0.07	0.17	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.05	0.00	0.01	0.16	0.50	0.09	0.24
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.02	0.02	0.08	0.07	0.09	0.01	0.04	0.15	0.00	0.01	0.02	0.02	0.41	0.83	0.17	0.48
C3'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.24	0.00	0.23	0.00	0.20	0.16	0.21	0.12	0.01	0.00	0.25	0.01	0.27	0.54	0.10	0.32
C4	0.01	0.00	0.02	0.24	0.00	0.12	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.26	0.11	0.00	0.01	0.18	0.52	0.36	0.32
C4'	0.00	0.06	0.02	0.00	0.12	0.00	0.14	0.01	0.13	0.08	0.09	0.02	0.19	0.01	0.13	0.00	0.01	0.07	0.18	0.05
C5	0.00	0.00	0.08	0.23	0.00	0.14	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.24	0.15	0.00	0.02	0.18	0.48	0.42	0.33
C5'	0.00	0.11	0.07	0.00	0.21	0.01	0.23	0.00	0.20	0.12	0.16	0.06	0.10	0.12	0.22	0.01	0.00	0.08	0.10	0.00
C6	0.00	0.00	0.09	0.20	0.00	0.13	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.11	0.00	0.03	0.18	0.46	0.30	0.29
N1	0.01	0.00	0.01	0.16	0.00	0.08	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.16	0.46	0.11	0.23
N3	0.01	0.00	0.04	0.21	0.00	0.09	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.24	0.03	0.00	0.01	0.17	0.53	0.22	0.29
O2	0.02	0.00	0.15	0.12	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.14	0.00	0.02	0.15	0.49	0.03	0.20
O2'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.26	0.19	0.24	0.10	0.19	0.15	0.24	0.12	0.00	0.05	0.29	0.15	0.15	0.66	0.24	0.19
O3'	0.16	0.05	0.01	0.00	0.11	0.01	0.15	0.12	0.11	0.01	0.03	0.14	0.05	0.00	0.13	0.07	0.05	0.26	0.24	0.01
O4	0.00	0.00	0.02	0.25	0.00	0.13	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.13	0.00	0.00	0.18	0.54	0.43	0.35
O4'	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.15	0.07	0.00	0.00	0.02	0.07	0.18	0.04
O5'	0.15	0.16	0.41	0.27	0.18	0.01	0.18	0.00	0.18	0.16	0.17	0.15	0.15	0.05	0.18	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.40	0.50	0.83	0.54	0.52	0.07	0.48	0.08	0.46	0.46	0.53	0.49	0.66	0.26	0.54	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.06	0.09	0.17	0.10	0.36	0.18	0.42	0.10	0.30	0.11	0.22	0.03	0.24	0.24	0.43	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.16	0.24	0.48	0.32	0.32	0.05	0.33	0.00	0.29	0.23	0.29	0.20	0.19	0.01	0.35	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.04	0.25	0.05	0.12	0.11	0.17	0.32	0.12	0.00	0.03	0.13	0.65	0.19	0.14	0.21	0.30	0.51	0.59	0.42
C2	0.03	0.10	0.03	0.13	0.27	0.20	0.31	0.48	0.24	0.11	0.19	0.02	0.37	0.01	0.30	0.22	0.08	0.49	0.68	0.42
C2'	0.09	0.01	0.25	0.06	0.16	0.09	0.19	0.29	0.14	0.03	0.08	0.07	0.66	0.22	0.19	0.21	0.40	0.57	0.67	0.51
C3'	0.13	0.20	0.30	0.01	0.07	0.21	0.04	0.43	0.04	0.09	0.17	0.31	0.75	0.13	0.07	0.26	0.20	0.35	0.44	0.26
C4	0.06	0.09	0.09	0.04	0.20	0.11	0.17	0.33	0.10	0.05	0.16	0.05	0.35	0.06	0.22	0.15	0.03	0.57	0.75	0.44
C4'	0.04	0.13	0.27	0.00	0.00	0.25	0.10	0.41	0.11	0.02	0.10	0.25	0.71	0.13	0.01	0.34	0.13	0.26	0.34	0.15
C5	0.14	0.05	0.27	0.10	0.03	0.04	0.03	0.24	0.01	0.06	0.01	0.09	0.55	0.20	0.05	0.16	0.05	0.60	0.75	0.46
C5'	0.11	0.27	0.40	0.11	0.17	0.17	0.05	0.30	0.02	0.13	0.27	0.38	0.84	0.23	0.19	0.28	0.14	0.33	0.41	0.19
C6	0.16	0.08	0.33	0.13	0.04	0.05	0.07	0.25	0.03	0.06	0.02	0.15	0.68	0.25	0.06	0.19	0.14	0.58	0.72	0.45
N1	0.10	0.00	0.20	0.01	0.15	0.13	0.19	0.36	0.14	0.02	0.07	0.08	0.57	0.14	0.17	0.23	0.17	0.53	0.68	0.44
N3	0.02	0.15	0.01	0.14	0.31	0.18	0.32	0.44	0.23	0.13	0.23	0.08	0.29	0.03	0.34	0.18	0.03	0.52	0.72	0.43
O2	0.01	0.14	0.06	0.23	0.34	0.25	0.39	0.57	0.30	0.16	0.23	0.05	0.29	0.10	0.38	0.22	0.08	0.41	0.59	0.38
O2'	0.14	0.07	0.33	0.20	0.33	0.06	0.35	0.17	0.23	0.07	0.20	0.06	0.77	0.43	0.41	0.12	0.55	0.57	0.57	0.55
O3'	0.06	0.07	0.10	0.24	0.12	0.47	0.27	0.75	0.27	0.09	0.03	0.23	0.60	0.10	0.11	0.48	0.10	0.05	0.01	0.14
O4	0.03	0.14	0.03	0.06	0.23	0.10	0.14	0.31	0.07	0.06	0.22	0.13	0.24	0.02	0.26	0.11	0.10	0.55	0.73	0.42
O4'	0.06	0.06	0.28	0.07	0.08	0.16	0.15	0.31	0.13	0.02	0.01	0.16	0.70	0.22	0.08	0.30	0.20	0.39	0.46	0.27
O5'	0.28	0.25	0.77	0.60	0.08	0.21	0.02	0.08	0.06	0.19	0.18	0.38	1.24	0.85	0.06	0.08	0.40	0.61	0.56	0.44
OP1	0.45	0.40	1.15	0.99	0.11	0.43	0.05	0.26	0.13	0.31	0.27	0.60	1.66	1.36	0.05	0.03	0.47	0.74	0.52	0.49
OP2	0.26	0.03	0.86	0.91	0.09	0.54	0.03	0.56	0.06	0.11	0.06	0.07	1.17	1.27	0.15	0.08	0.79	0.92	0.85	0.78
P	0.33	0.24	0.92	0.81	0.05	0.36	0.02	0.26	0.08	0.20	0.15	0.37	1.36	1.13	0.01	0.01	0.53	0.73	0.62	0.54

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.14	0.41	0.46	0.21
C2	0.01	0.00	0.11	0.09	0.00	0.01	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.12	0.00	0.04	0.29	0.33	0.41	0.13
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.15	0.06	0.17	0.03	0.05	0.25	0.00	0.04	0.06	0.00	0.43	0.09	0.03	0.24
C3'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.00	0.15	0.02	0.16	0.01	0.04	0.20	0.00	0.00	0.06	0.01	0.43	0.11	0.17	0.34
C4	0.00	0.00	0.06	0.05	0.00	0.08	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.03	0.00	0.03	0.48	0.24	0.24	0.02
C4'	0.02	0.01	0.01	0.00	0.08	0.00	0.12	0.00	0.12	0.03	0.03	0.07	0.10	0.01	0.09	0.00	0.01	0.36	0.16	0.10
C5	0.00	0.00	0.15	0.15	0.00	0.12	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.13	0.00	0.00	0.52	0.26	0.19	0.01
C5'	0.03	0.09	0.06	0.02	0.24	0.00	0.29	0.00	0.25	0.12	0.16	0.01	0.04	0.02	0.27	0.01	0.00	0.36	0.20	0.00
C6	0.00	0.00	0.17	0.16	0.00	0.12	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.14	0.00	0.01	0.45	0.35	0.28	0.08
N1	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.30	0.38	0.40	0.15
N3	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.03	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.07	0.00	0.04	0.38	0.28	0.34	0.08
O2	0.01	0.00	0.25	0.20	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.24	0.24	0.00	0.05	0.20	0.34	0.46	0.17
O2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.04	0.10	0.11	0.04	0.12	0.02	0.05	0.24	0.00	0.05	0.04	0.04	0.26	0.09	0.21	0.14
O3'	0.01	0.12	0.04	0.00	0.03	0.01	0.13	0.02	0.14	0.01	0.07	0.24	0.05	0.00	0.03	0.02	0.31	0.24	0.21	0.40
O4	0.00	0.00	0.06	0.06	0.00	0.09	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.03	0.00	0.03	0.51	0.19	0.19	0.02
O4'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.05	0.04	0.02	0.03	0.00	0.10	0.71	0.56	0.44
O5'	0.14	0.29	0.43	0.43	0.48	0.01	0.52	0.00	0.45	0.30	0.38	0.20	0.26	0.31	0.51	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.41	0.33	0.09	0.11	0.24	0.36	0.26	0.36	0.35	0.38	0.28	0.34	0.09	0.24	0.19	0.71	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.46	0.41	0.03	0.17	0.24	0.16	0.19	0.20	0.28	0.40	0.34	0.46	0.21	0.21	0.19	0.56	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.21	0.13	0.24	0.34	0.02	0.10	0.01	0.00	0.08	0.15	0.08	0.17	0.14	0.40	0.02	0.44	0.00	0.00	0.00	0.00