Doublet Group distance statistics: 54525

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.004, 0.007, 0.007 max_d=0.007 avg_d=0.004 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C6	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C2	A	0, 0.000, 0.021, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N1	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C1'	A	0, 0.000, 0.026, 0.053, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.026 std_dev=0.026
O4	A	0, 0.000, 0.034, 0.068, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.034 std_dev=0.034
O2	A	0, 0.000, 0.053, 0.105, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.053 std_dev=0.053
C2'	A	0, 0.000, 0.063, 0.125, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.063 std_dev=0.063
C6	B	0, 0.000, 0.069, 0.139, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.069 std_dev=0.069
O2'	A	0, 0.000, 0.085, 0.169, 0.169 max_d=0.169 avg_d=0.085 std_dev=0.085
O4'	A	0, 0.000, 0.143, 0.286, 0.286 max_d=0.286 avg_d=0.143 std_dev=0.143
C5	B	0, 0.000, 0.191, 0.382, 0.382 max_d=0.382 avg_d=0.191 std_dev=0.191
C3'	A	0, 0.000, 0.233, 0.467, 0.467 max_d=0.467 avg_d=0.233 std_dev=0.233
O3'	A	0, 0.000, 0.260, 0.520, 0.520 max_d=0.520 avg_d=0.260 std_dev=0.260
N1	B	0, 0.000, 0.267, 0.534, 0.534 max_d=0.534 avg_d=0.267 std_dev=0.267
C4'	B	0, 0.000, 0.312, 0.624, 0.624 max_d=0.624 avg_d=0.312 std_dev=0.312
P	B	0, 0.000, 0.315, 0.629, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.315 std_dev=0.315
C4	B	0, 0.000, 0.345, 0.691, 0.691 max_d=0.691 avg_d=0.345 std_dev=0.345
C4'	A	0, 0.000, 0.370, 0.740, 0.740 max_d=0.740 avg_d=0.370 std_dev=0.370
C3'	B	0, 0.000, 0.392, 0.784, 0.784 max_d=0.784 avg_d=0.392 std_dev=0.392
C1'	B	0, 0.000, 0.411, 0.822, 0.822 max_d=0.822 avg_d=0.411 std_dev=0.411
O4'	B	0, 0.000, 0.429, 0.858, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.429 std_dev=0.429
C2	B	0, 0.000, 0.431, 0.861, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.431 std_dev=0.431
N3	B	0, 0.000, 0.431, 0.863, 0.863 max_d=0.863 avg_d=0.431 std_dev=0.431
C5'	B	0, 0.000, 0.438, 0.875, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.438 std_dev=0.438
OP1	B	0, 0.000, 0.475, 0.950, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.475 std_dev=0.475
C2'	B	0, 0.000, 0.484, 0.968, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.484 std_dev=0.484
O3'	B	0, 0.000, 0.508, 1.017, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.508 std_dev=0.508
O4	B	0, 0.000, 0.509, 1.018, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.509 std_dev=0.509
OP2	B	0, 0.000, 0.518, 1.036, 1.036 max_d=1.036 avg_d=0.518 std_dev=0.518
O2	B	0, 0.000, 0.603, 1.206, 1.206 max_d=1.206 avg_d=0.603 std_dev=0.603
C5'	A	0, 0.000, 0.671, 1.341, 1.341 max_d=1.341 avg_d=0.671 std_dev=0.671
O2'	B	0, 0.000, 0.706, 1.413, 1.413 max_d=1.413 avg_d=0.706 std_dev=0.706
O5'	B	0, 0.000, 0.833, 1.667, 1.667 max_d=1.667 avg_d=0.833 std_dev=0.833
O5'	A	0, 0.000, 1.993, 3.985, 3.985 max_d=3.985 avg_d=1.993 std_dev=1.993
P	A	0, 0.000, 3.011, 6.022, 6.022 max_d=6.022 avg_d=3.011 std_dev=3.011
OP1	A	0, 0.000, 3.522, 7.044, 7.044 max_d=7.044 avg_d=3.522 std_dev=3.522
OP2	A	0, 0.000, 4.040, 8.081, 8.081 max_d=8.081 avg_d=4.040 std_dev=4.040

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.07	0.09	0.23	0.00
C2	0.03	0.00	0.04	0.09	0.01	0.14	0.01	0.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.09	0.01	0.07	0.62	0.62	0.96	0.84
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.03	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.18	0.02	0.38	0.04
C3'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.12	0.00	0.09	0.00	0.06	0.05	0.11	0.10	0.01	0.01	0.13	0.00	0.32	0.25	0.25	0.09
C4	0.02	0.01	0.04	0.12	0.00	0.13	0.00	0.27	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.00	0.06	0.69	0.72	1.20	0.96
C4'	0.02	0.14	0.03	0.00	0.13	0.00	0.07	0.00	0.03	0.05	0.16	0.21	0.06	0.02	0.14	0.00	0.03	0.05	0.53	0.17
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.07	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.01	0.03	0.51	0.42	0.72	0.64
C5'	0.02	0.26	0.01	0.00	0.27	0.00	0.19	0.00	0.12	0.13	0.31	0.34	0.07	0.02	0.31	0.01	0.00	0.19	0.22	0.03
C6	0.00	0.00	0.03	0.06	0.00	0.03	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.01	0.35	0.20	0.35	0.39
N1	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.05	0.01	0.13	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.01	0.02	0.36	0.25	0.38	0.42
N3	0.02	0.00	0.04	0.11	0.00	0.16	0.00	0.31	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.12	0.01	0.07	0.75	0.83	1.34	1.07
O2	0.05	0.00	0.05	0.10	0.01	0.21	0.01	0.34	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.11	0.00	0.12	0.72	0.78	1.12	1.00
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.31	0.92	0.40
O3'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.12	0.02	0.09	0.02	0.06	0.05	0.12	0.11	0.00	0.00	0.13	0.02	0.28	0.25	0.55	0.07
O4	0.02	0.01	0.05	0.13	0.00	0.14	0.01	0.31	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.00	0.06	0.78	0.87	1.45	1.12
O4'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.06	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.07	0.12	0.01	0.02	0.06	0.00	0.08	0.13	0.27	0.05
O5'	0.07	0.62	0.18	0.32	0.69	0.03	0.51	0.00	0.35	0.36	0.75	0.72	0.06	0.28	0.78	0.08	0.00	0.04	0.01	0.00
OP1	0.09	0.62	0.02	0.25	0.72	0.05	0.42	0.19	0.20	0.25	0.83	0.78	0.31	0.25	0.87	0.13	0.04	0.00	0.02	0.00
OP2	0.23	0.96	0.38	0.25	1.20	0.53	0.72	0.22	0.35	0.38	1.34	1.12	0.92	0.55	1.45	0.27	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.00	0.84	0.04	0.09	0.96	0.17	0.64	0.03	0.39	0.42	1.07	1.00	0.40	0.07	1.12	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.14	0.15	0.02	0.02	0.01	0.09	0.27	0.02	0.11	0.09	0.21	0.26	0.04	0.07	0.09	0.01	0.10	0.24	0.04
C2	0.06	0.07	0.03	0.11	0.01	0.11	0.06	0.29	0.03	0.04	0.06	0.10	0.11	0.13	0.03	0.02	0.27	0.12	0.21	0.06
C2'	0.19	0.12	0.13	0.03	0.05	0.00	0.10	0.27	0.03	0.10	0.06	0.17	0.23	0.07	0.09	0.14	0.05	0.12	0.27	0.07
C3'	0.07	0.06	0.03	0.17	0.22	0.07	0.26	0.27	0.16	0.05	0.13	0.01	0.07	0.21	0.28	0.10	0.10	0.05	0.11	0.01
C4	0.04	0.11	0.01	0.10	0.10	0.16	0.00	0.30	0.04	0.00	0.15	0.14	0.07	0.10	0.12	0.16	0.32	0.19	0.25	0.08
C4'	0.08	0.09	0.01	0.16	0.31	0.04	0.34	0.26	0.20	0.07	0.19	0.02	0.13	0.18	0.40	0.10	0.06	0.02	0.06	0.04
C5	0.02	0.20	0.09	0.05	0.12	0.14	0.01	0.31	0.02	0.07	0.21	0.26	0.16	0.04	0.13	0.17	0.22	0.21	0.30	0.04
C5'	0.07	0.30	0.16	0.29	0.55	0.12	0.53	0.27	0.35	0.25	0.43	0.24	0.02	0.31	0.67	0.02	0.17	0.08	0.22	0.08
C6	0.12	0.21	0.14	0.02	0.09	0.10	0.01	0.31	0.00	0.11	0.19	0.28	0.23	0.02	0.08	0.08	0.13	0.18	0.31	0.00
N1	0.13	0.15	0.10	0.05	0.03	0.08	0.05	0.30	0.01	0.09	0.12	0.20	0.20	0.07	0.00	0.00	0.15	0.13	0.27	0.00
N3	0.01	0.05	0.00	0.13	0.03	0.14	0.04	0.29	0.04	0.00	0.07	0.07	0.06	0.13	0.03	0.09	0.34	0.15	0.21	0.09
O2	0.06	0.03	0.01	0.14	0.06	0.10	0.09	0.28	0.03	0.02	0.00	0.06	0.09	0.16	0.10	0.02	0.30	0.08	0.13	0.08
O2'	0.28	0.18	0.23	0.07	0.02	0.09	0.09	0.22	0.01	0.15	0.11	0.26	0.36	0.03	0.08	0.21	0.27	0.16	0.22	0.09
O3'	0.09	0.07	0.03	0.16	0.25	0.02	0.27	0.19	0.16	0.05	0.15	0.02	0.08	0.21	0.31	0.16	0.02	0.01	0.01	0.00
O4	0.11	0.05	0.03	0.12	0.11	0.18	0.01	0.29	0.04	0.04	0.14	0.06	0.00	0.11	0.17	0.20	0.37	0.20	0.24	0.10
O4'	0.13	0.04	0.07	0.09	0.15	0.04	0.19	0.28	0.09	0.02	0.04	0.10	0.19	0.12	0.21	0.09	0.06	0.05	0.09	0.01
O5'	0.67	1.04	0.80	0.92	1.41	0.64	1.38	0.74	1.11	0.95	1.23	0.93	0.59	0.91	1.55	0.51	0.69	0.30	0.89	0.58
OP1	0.68	1.24	0.85	0.98	1.81	0.58	1.66	0.67	1.26	1.07	1.56	1.10	0.56	0.96	2.12	0.45	0.64	0.31	1.23	0.65
OP2	0.63	1.50	0.70	0.63	2.21	0.16	1.87	0.07	1.31	1.17	1.95	1.38	0.40	0.50	2.63	0.22	0.02	0.60	0.48	0.13
P	0.65	1.26	0.75	0.78	1.80	0.41	1.61	0.43	1.20	1.05	1.58	1.15	0.50	0.72	2.09	0.37	0.38	0.13	0.77	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.11	0.09	0.48	0.11
C2	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.04	0.00	0.00	0.36	0.17	0.27	0.07
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.02	0.01	0.04	0.00	0.02	0.04	0.01	0.19	0.23	0.31	0.02
C3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.13	0.00	0.17	0.02	0.16	0.08	0.08	0.00	0.03	0.02	0.14	0.00	0.27	0.33	0.19	0.13
C4	0.00	0.01	0.04	0.13	0.00	0.09	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.15	0.00	0.01	0.56	0.23	0.05	0.24
C4'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.09	0.00	0.12	0.00	0.11	0.05	0.05	0.00	0.02	0.03	0.10	0.00	0.00	0.18	0.38	0.07
C5	0.01	0.02	0.07	0.17	0.00	0.12	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.02	0.05	0.20	0.01	0.01	0.59	0.22	0.09	0.25
C5'	0.01	0.07	0.01	0.02	0.16	0.00	0.19	0.00	0.17	0.08	0.11	0.04	0.03	0.01	0.18	0.00	0.00	0.20	0.30	0.00
C6	0.01	0.01	0.07	0.16	0.00	0.11	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.18	0.00	0.01	0.50	0.18	0.28	0.13
N1	0.00	0.00	0.02	0.08	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.00	0.01	0.34	0.15	0.35	0.03
N3	0.00	0.00	0.01	0.08	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.09	0.00	0.01	0.46	0.20	0.16	0.16
O2	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.01	0.00	0.02	0.28	0.16	0.30	0.03
O2'	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.02	0.05	0.03	0.05	0.01	0.02	0.06	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.20	0.36	0.06
O3'	0.02	0.04	0.02	0.02	0.15	0.03	0.20	0.01	0.18	0.09	0.09	0.01	0.02	0.00	0.17	0.04	0.24	0.44	0.07	0.20
O4	0.00	0.00	0.04	0.14	0.00	0.10	0.01	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.17	0.00	0.00	0.61	0.26	0.07	0.31
O4'	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.00	0.00	0.07	0.01	0.61	0.24
O5'	0.11	0.36	0.19	0.27	0.56	0.00	0.59	0.00	0.50	0.34	0.46	0.28	0.03	0.24	0.61	0.07	0.00	0.03	0.02	0.00
OP1	0.09	0.17	0.23	0.33	0.23	0.18	0.22	0.20	0.18	0.15	0.20	0.16	0.20	0.44	0.26	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.48	0.27	0.31	0.19	0.05	0.38	0.09	0.30	0.28	0.35	0.16	0.30	0.36	0.07	0.07	0.61	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.07	0.02	0.13	0.24	0.07	0.25	0.00	0.13	0.03	0.16	0.03	0.06	0.20	0.31	0.24	0.00	0.00	0.01	0.00