Doublet Group distance statistics: 54529

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 13, 25, 27, 13, 7, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.006, 0.012, 0.019, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.002, 0.012, 0.022, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.012 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.008, 0.018, 0.028, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.018 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.013, 0.024, 0.035, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.024 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.014, 0.025, 0.036, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.025 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.014, 0.026, 0.038, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.026 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.014, 0.026, 0.038, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.026 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.027, 0.051, 0.075, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.051 std_dev=0.024
O4	A	0, 0.039, 0.086, 0.134, 0.183 max_d=0.183 avg_d=0.086 std_dev=0.047
C2'	A	0, 0.033, 0.106, 0.179, 0.434 max_d=0.434 avg_d=0.106 std_dev=0.073
O2'	A	0, 0.067, 0.157, 0.248, 0.485 max_d=0.485 avg_d=0.157 std_dev=0.090
O4'	A	0, 0.009, 0.108, 0.207, 0.541 max_d=0.541 avg_d=0.108 std_dev=0.099
C3'	A	0, 0.067, 0.198, 0.328, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.198 std_dev=0.131
C4	B	0, 0.139, 0.274, 0.409, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.274 std_dev=0.135
N9	B	0, 0.142, 0.278, 0.414, 0.632 max_d=0.632 avg_d=0.278 std_dev=0.136
C4'	A	0, 0.048, 0.188, 0.329, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.188 std_dev=0.141
C1'	B	0, 0.139, 0.281, 0.422, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.281 std_dev=0.142
C5	B	0, 0.157, 0.307, 0.457, 0.744 max_d=0.744 avg_d=0.307 std_dev=0.150
N3	B	0, 0.153, 0.305, 0.456, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.305 std_dev=0.151
O4'	B	0, 0.116, 0.268, 0.419, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.268 std_dev=0.152
C8	B	0, 0.162, 0.323, 0.484, 0.710 max_d=0.710 avg_d=0.323 std_dev=0.161
C6	B	0, 0.202, 0.372, 0.541, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.372 std_dev=0.170
N7	B	0, 0.163, 0.335, 0.507, 0.826 max_d=0.826 avg_d=0.335 std_dev=0.172
C2	B	0, 0.185, 0.358, 0.531, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.358 std_dev=0.173
N1	B	0, 0.223, 0.396, 0.569, 0.860 max_d=0.860 avg_d=0.396 std_dev=0.173
C4'	B	0, 0.133, 0.308, 0.483, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.308 std_dev=0.175
O5'	A	0, 0.150, 0.328, 0.505, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.328 std_dev=0.177
O3'	A	0, 0.103, 0.289, 0.474, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.289 std_dev=0.185
C3'	B	0, 0.153, 0.360, 0.566, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.360 std_dev=0.207
C5'	A	0, 0.087, 0.298, 0.510, 1.292 max_d=1.292 avg_d=0.298 std_dev=0.211
P	A	0, 0.157, 0.386, 0.615, 1.224 max_d=1.224 avg_d=0.386 std_dev=0.229
N6	B	0, 0.218, 0.450, 0.682, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.450 std_dev=0.232
O5'	B	0, 0.145, 0.380, 0.614, 1.268 max_d=1.268 avg_d=0.380 std_dev=0.234
O3'	B	0, 0.175, 0.412, 0.650, 1.045 max_d=1.045 avg_d=0.412 std_dev=0.237
C2'	B	0, 0.132, 0.373, 0.615, 1.487 max_d=1.487 avg_d=0.373 std_dev=0.242
OP2	A	0, 0.210, 0.488, 0.765, 1.461 max_d=1.461 avg_d=0.488 std_dev=0.278
C5'	B	0, 0.084, 0.372, 0.661, 2.224 max_d=2.224 avg_d=0.372 std_dev=0.289
OP1	A	0, 0.145, 0.478, 0.812, 1.662 max_d=1.662 avg_d=0.478 std_dev=0.334
O2'	B	0, 0.083, 0.490, 0.897, 2.871 max_d=2.871 avg_d=0.490 std_dev=0.407
P	B	0, 0.096, 0.503, 0.910, 2.212 max_d=2.212 avg_d=0.503 std_dev=0.407
OP2	B	0, 0.022, 0.639, 1.255, 3.767 max_d=3.767 avg_d=0.639 std_dev=0.616
OP1	B	0, -0.164, 0.659, 1.482, 4.916 max_d=4.916 avg_d=0.659 std_dev=0.823

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.06	0.08	0.12	0.07
C2	0.02	0.00	0.05	0.09	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.10	0.02	0.02	0.14	0.13	0.21	0.14
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.05	0.07	0.00	0.01	0.06	0.01	0.05	0.06	0.12	0.06
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.10	0.00	0.10	0.02	0.08	0.06	0.10	0.11	0.02	0.01	0.11	0.01	0.07	0.07	0.11	0.07
C4	0.02	0.01	0.05	0.10	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.12	0.01	0.02	0.19	0.18	0.27	0.19
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.07	0.04	0.06	0.05	0.05	0.01	0.08	0.00	0.02	0.06	0.05	0.03
C5	0.02	0.01	0.05	0.10	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.11	0.01	0.03	0.18	0.17	0.25	0.18
C5'	0.02	0.08	0.02	0.02	0.13	0.01	0.13	0.00	0.11	0.07	0.11	0.07	0.05	0.03	0.14	0.02	0.01	0.06	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.09	0.01	0.03	0.16	0.13	0.19	0.14
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.06	0.02	0.01	0.12	0.10	0.17	0.11
N3	0.01	0.00	0.05	0.10	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.11	0.02	0.02	0.17	0.16	0.25	0.17
O2	0.03	0.01	0.07	0.11	0.02	0.05	0.02	0.07	0.02	0.02	0.01	0.00	0.08	0.12	0.02	0.03	0.13	0.12	0.20	0.13
O2'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.04	0.05	0.03	0.05	0.03	0.02	0.05	0.08	0.00	0.04	0.05	0.05	0.06	0.08	0.11	0.06
O3'	0.02	0.10	0.01	0.01	0.12	0.01	0.11	0.03	0.09	0.06	0.11	0.12	0.04	0.00	0.14	0.01	0.10	0.11	0.14	0.10
O4	0.02	0.02	0.06	0.11	0.01	0.08	0.01	0.14	0.01	0.02	0.02	0.02	0.05	0.14	0.00	0.03	0.20	0.20	0.30	0.21
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.05	0.01	0.03	0.00	0.06	0.11	0.11	0.09
O5'	0.06	0.14	0.05	0.07	0.19	0.02	0.18	0.01	0.16	0.12	0.17	0.13	0.06	0.10	0.20	0.06	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.08	0.13	0.06	0.07	0.18	0.06	0.17	0.06	0.13	0.10	0.16	0.12	0.08	0.11	0.20	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.21	0.12	0.11	0.27	0.05	0.25	0.02	0.19	0.17	0.25	0.20	0.11	0.14	0.30	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.14	0.06	0.07	0.19	0.03	0.18	0.02	0.14	0.11	0.17	0.13	0.06	0.10	0.21	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.16	0.10	0.12	0.13	0.16	0.14	0.29	0.15	0.14	0.16	0.16	0.16	0.15	0.12	0.19	0.17	0.12	0.20	0.56	0.45	0.33
C2	0.11	0.17	0.11	0.12	0.10	0.17	0.10	0.25	0.12	0.13	0.15	0.15	0.14	0.13	0.09	0.18	0.15	0.15	0.23	0.74	0.40	0.38
C2'	0.14	0.18	0.11	0.13	0.15	0.17	0.15	0.30	0.17	0.16	0.18	0.17	0.18	0.17	0.13	0.19	0.17	0.13	0.22	0.60	0.55	0.38
C3'	0.12	0.17	0.10	0.13	0.12	0.17	0.13	0.31	0.15	0.15	0.16	0.15	0.17	0.16	0.11	0.22	0.20	0.12	0.20	0.48	0.52	0.32
C4	0.11	0.17	0.17	0.11	0.09	0.15	0.11	0.20	0.13	0.15	0.14	0.15	0.15	0.16	0.11	0.29	0.15	0.16	0.20	0.66	0.28	0.32
C4'	0.15	0.15	0.13	0.17	0.12	0.20	0.13	0.33	0.13	0.17	0.14	0.14	0.15	0.17	0.13	0.24	0.23	0.15	0.21	0.38	0.48	0.29
C5	0.11	0.17	0.18	0.10	0.10	0.14	0.11	0.20	0.13	0.13	0.15	0.16	0.14	0.13	0.09	0.35	0.16	0.16	0.18	0.56	0.25	0.27
C5'	0.17	0.15	0.18	0.21	0.13	0.23	0.14	0.34	0.13	0.18	0.14	0.14	0.15	0.17	0.15	0.30	0.29	0.17	0.23	0.31	0.44	0.26
C6	0.11	0.18	0.15	0.09	0.11	0.14	0.11	0.22	0.13	0.12	0.15	0.17	0.14	0.13	0.09	0.31	0.16	0.14	0.17	0.53	0.29	0.27
N1	0.11	0.17	0.10	0.10	0.11	0.16	0.11	0.25	0.13	0.12	0.15	0.16	0.14	0.13	0.08	0.22	0.15	0.12	0.20	0.62	0.37	0.33
N3	0.12	0.17	0.14	0.12	0.09	0.16	0.10	0.23	0.12	0.17	0.14	0.15	0.14	0.17	0.11	0.22	0.14	0.16	0.23	0.74	0.34	0.37
O2	0.13	0.17	0.14	0.16	0.12	0.19	0.11	0.28	0.14	0.15	0.17	0.16	0.16	0.15	0.12	0.16	0.16	0.16	0.27	0.81	0.47	0.44
O2'	0.17	0.20	0.16	0.17	0.18	0.18	0.20	0.32	0.21	0.20	0.20	0.19	0.23	0.22	0.17	0.18	0.17	0.16	0.24	0.61	0.64	0.41
O3'	0.13	0.17	0.11	0.14	0.13	0.18	0.15	0.32	0.16	0.16	0.17	0.15	0.19	0.17	0.12	0.22	0.21	0.12	0.21	0.48	0.58	0.34
O4	0.14	0.17	0.20	0.14	0.14	0.16	0.16	0.19	0.16	0.18	0.15	0.16	0.19	0.19	0.15	0.31	0.16	0.18	0.21	0.68	0.26	0.32
O4'	0.14	0.15	0.11	0.14	0.13	0.18	0.14	0.31	0.14	0.17	0.14	0.15	0.15	0.17	0.13	0.22	0.20	0.14	0.20	0.39	0.40	0.27
O5'	0.14	0.16	0.15	0.15	0.13	0.21	0.15	0.32	0.16	0.19	0.16	0.15	0.17	0.18	0.14	0.32	0.22	0.17	0.22	0.35	0.41	0.25
OP1	0.12	0.14	0.16	0.21	0.10	0.27	0.12	0.38	0.13	0.17	0.14	0.11	0.14	0.16	0.12	0.33	0.23	0.21	0.29	0.28	0.44	0.29
OP2	0.19	0.27	0.24	0.14	0.22	0.18	0.22	0.27	0.24	0.22	0.27	0.25	0.25	0.23	0.20	0.46	0.19	0.17	0.18	0.37	0.33	0.23
P	0.12	0.17	0.16	0.14	0.12	0.21	0.14	0.31	0.15	0.16	0.16	0.14	0.16	0.16	0.12	0.36	0.19	0.18	0.21	0.31	0.36	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.00	0.12	0.39	0.13	0.12
C2	0.04	0.00	0.13	0.09	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.14	0.07	0.16	0.57	0.18	0.19
C2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.06	0.01	0.04	0.08	0.06	0.08	0.10	0.13	0.05	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.20	0.25	0.30	0.16
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.06	0.05	0.08	0.09	0.06	0.05	0.02	0.02	0.01	0.01	0.12	0.16	0.27	0.12
C4	0.02	0.01	0.06	0.05	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.10	0.04	0.18	0.59	0.16	0.22
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.06	0.03	0.05	0.04	0.06	0.02	0.05	0.03	0.00	0.01	0.16	0.11	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.09	0.02	0.22	0.70	0.19	0.30
C5'	0.04	0.05	0.08	0.02	0.06	0.01	0.09	0.00	0.09	0.12	0.07	0.05	0.12	0.12	0.07	0.05	0.05	0.01	0.01	0.10	0.14	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.10	0.03	0.22	0.71	0.21	0.30
C8	0.02	0.01	0.08	0.05	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.12	0.08	0.06	0.24	0.69	0.20	0.31
N1	0.03	0.00	0.10	0.08	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.12	0.05	0.19	0.65	0.18	0.25
N3	0.04	0.00	0.13	0.09	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.16	0.13	0.07	0.15	0.52	0.17	0.17
N6	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.11	0.09	0.04	0.25	0.77	0.25	0.35
N7	0.01	0.01	0.06	0.05	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.12	0.08	0.04	0.25	0.76	0.24	0.35
N9	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.09	0.01	0.18	0.56	0.14	0.21
O2'	0.01	0.16	0.00	0.02	0.08	0.05	0.09	0.05	0.10	0.12	0.13	0.16	0.11	0.12	0.06	0.00	0.05	0.03	0.21	0.26	0.38	0.19
O3'	0.11	0.14	0.02	0.01	0.10	0.03	0.09	0.05	0.10	0.08	0.12	0.13	0.09	0.08	0.09	0.05	0.00	0.09	0.10	0.16	0.26	0.12
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.06	0.05	0.07	0.04	0.04	0.01	0.03	0.09	0.00	0.10	0.39	0.13	0.16
O5'	0.12	0.16	0.20	0.12	0.18	0.01	0.22	0.01	0.22	0.24	0.19	0.15	0.25	0.25	0.18	0.21	0.10	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.39	0.57	0.25	0.16	0.59	0.16	0.70	0.10	0.71	0.69	0.65	0.52	0.77	0.76	0.56	0.26	0.16	0.39	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.18	0.30	0.27	0.16	0.11	0.19	0.14	0.21	0.20	0.18	0.17	0.25	0.24	0.14	0.38	0.26	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.19	0.16	0.12	0.22	0.04	0.30	0.01	0.30	0.31	0.25	0.17	0.35	0.35	0.21	0.19	0.12	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00