Doublet Group distance statistics: 54530

back

Distances from reference structure (by RMSD)

4, 10, 19, 17, 5, 4, 8, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.011, 0.017, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.011 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.008, 0.017, 0.027, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.017 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.015, 0.042, 0.068, 0.142 max_d=0.142 avg_d=0.042 std_dev=0.027
O4	A	0, 0.025, 0.066, 0.107, 0.214 max_d=0.214 avg_d=0.066 std_dev=0.041
O4'	A	0, 0.047, 0.121, 0.196, 0.357 max_d=0.357 avg_d=0.121 std_dev=0.074
C2'	A	0, 0.049, 0.127, 0.206, 0.347 max_d=0.347 avg_d=0.127 std_dev=0.079
O2'	A	0, 0.076, 0.176, 0.275, 0.406 max_d=0.406 avg_d=0.176 std_dev=0.100
C4'	A	0, 0.090, 0.195, 0.301, 0.537 max_d=0.537 avg_d=0.195 std_dev=0.106
C3'	A	0, 0.094, 0.207, 0.320, 0.568 max_d=0.568 avg_d=0.207 std_dev=0.113
O4'	B	0, 0.158, 0.306, 0.453, 0.701 max_d=0.701 avg_d=0.306 std_dev=0.147
C1'	B	0, 0.160, 0.315, 0.471, 0.825 max_d=0.825 avg_d=0.315 std_dev=0.156
N9	B	0, 0.134, 0.302, 0.470, 0.799 max_d=0.799 avg_d=0.302 std_dev=0.168
O3'	A	0, 0.136, 0.311, 0.487, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.311 std_dev=0.175
C4	B	0, 0.121, 0.296, 0.472, 0.723 max_d=0.723 avg_d=0.296 std_dev=0.176
C5'	A	0, 0.145, 0.333, 0.521, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.333 std_dev=0.188
N3	B	0, 0.136, 0.330, 0.523, 0.753 max_d=0.753 avg_d=0.330 std_dev=0.194
C5	B	0, 0.114, 0.326, 0.538, 0.847 max_d=0.847 avg_d=0.326 std_dev=0.212
C4'	B	0, 0.172, 0.386, 0.599, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.386 std_dev=0.214
C8	B	0, 0.147, 0.361, 0.574, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.361 std_dev=0.214
C2'	B	0, 0.191, 0.407, 0.622, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.407 std_dev=0.215
N7	B	0, 0.136, 0.371, 0.607, 0.927 max_d=0.927 avg_d=0.371 std_dev=0.235
C3'	B	0, 0.160, 0.412, 0.663, 1.824 max_d=1.824 avg_d=0.412 std_dev=0.252
C2	B	0, 0.129, 0.381, 0.633, 0.987 max_d=0.987 avg_d=0.381 std_dev=0.252
C6	B	0, 0.102, 0.362, 0.621, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.362 std_dev=0.260
N1	B	0, 0.120, 0.396, 0.672, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.396 std_dev=0.276
O5'	A	0, 0.140, 0.419, 0.697, 2.126 max_d=2.126 avg_d=0.419 std_dev=0.279
O5'	B	0, 0.149, 0.446, 0.743, 1.881 max_d=1.881 avg_d=0.446 std_dev=0.297
P	A	0, 0.206, 0.504, 0.803, 2.268 max_d=2.268 avg_d=0.504 std_dev=0.299
N6	B	0, 0.109, 0.418, 0.727, 1.280 max_d=1.280 avg_d=0.418 std_dev=0.309
O2'	B	0, 0.217, 0.557, 0.898, 1.952 max_d=1.952 avg_d=0.557 std_dev=0.340
OP1	A	0, 0.218, 0.594, 0.971, 2.998 max_d=2.998 avg_d=0.594 std_dev=0.376
C5'	B	0, 0.096, 0.485, 0.874, 1.867 max_d=1.867 avg_d=0.485 std_dev=0.389
OP2	A	0, 0.191, 0.595, 0.998, 3.331 max_d=3.331 avg_d=0.595 std_dev=0.404
O3'	B	0, 0.075, 0.507, 0.939, 3.544 max_d=3.544 avg_d=0.507 std_dev=0.432
P	B	0, 0.154, 0.839, 1.524, 2.057 max_d=2.057 avg_d=0.839 std_dev=0.685
OP2	B	0, 0.152, 1.301, 2.449, 3.226 max_d=3.226 avg_d=1.301 std_dev=1.148
OP1	B	0, -0.078, 1.792, 3.663, 4.820 max_d=4.820 avg_d=1.792 std_dev=1.870

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.09	0.14	0.09
C2	0.02	0.00	0.06	0.07	0.02	0.04	0.02	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.08	0.02	0.02	0.16	0.13	0.24	0.16
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.06	0.10	0.01	0.01	0.05	0.01	0.10	0.11	0.12	0.10
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.07	0.01	0.09	0.02	0.09	0.04	0.07	0.11	0.02	0.01	0.08	0.01	0.12	0.14	0.08	0.10
C4	0.02	0.02	0.04	0.07	0.00	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.09	0.01	0.03	0.21	0.18	0.33	0.22
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.07	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.05	0.06	0.04	0.02	0.07	0.00	0.02	0.08	0.07	0.03
C5	0.02	0.02	0.04	0.09	0.01	0.09	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.10	0.01	0.04	0.23	0.19	0.33	0.23
C5'	0.03	0.08	0.02	0.02	0.14	0.01	0.16	0.00	0.14	0.08	0.10	0.07	0.04	0.04	0.15	0.02	0.01	0.11	0.11	0.02
C6	0.02	0.01	0.04	0.09	0.01	0.08	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.09	0.01	0.03	0.21	0.15	0.26	0.18
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.15	0.12	0.21	0.14
N3	0.02	0.01	0.06	0.07	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.09	0.02	0.02	0.19	0.16	0.29	0.19
O2	0.03	0.01	0.10	0.11	0.02	0.06	0.02	0.07	0.02	0.02	0.02	0.00	0.10	0.13	0.03	0.03	0.15	0.13	0.23	0.15
O2'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.05	0.04	0.03	0.04	0.02	0.02	0.06	0.10	0.00	0.04	0.05	0.04	0.05	0.08	0.08	0.06
O3'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.09	0.02	0.10	0.04	0.09	0.04	0.09	0.13	0.04	0.00	0.10	0.02	0.12	0.16	0.09	0.09
O4	0.02	0.02	0.05	0.08	0.01	0.07	0.01	0.15	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.10	0.00	0.04	0.22	0.20	0.36	0.24
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.04	0.00	0.07	0.09	0.12	0.09
O5'	0.09	0.16	0.10	0.12	0.21	0.02	0.23	0.01	0.21	0.15	0.19	0.15	0.05	0.12	0.22	0.07	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.09	0.13	0.11	0.14	0.18	0.08	0.19	0.11	0.15	0.12	0.16	0.13	0.08	0.16	0.20	0.09	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.14	0.24	0.12	0.08	0.33	0.07	0.33	0.11	0.26	0.21	0.29	0.23	0.08	0.09	0.36	0.12	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.16	0.10	0.10	0.22	0.03	0.23	0.02	0.18	0.14	0.19	0.15	0.06	0.09	0.24	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.20	0.12	0.12	0.14	0.14	0.14	0.31	0.17	0.17	0.20	0.17	0.18	0.16	0.12	0.13	0.20	0.12	0.23	1.34	0.82	0.62
C2	0.13	0.24	0.12	0.13	0.13	0.13	0.13	0.21	0.18	0.23	0.23	0.19	0.17	0.19	0.13	0.14	0.17	0.11	0.22	1.71	0.58	0.70
C2'	0.13	0.22	0.12	0.13	0.15	0.14	0.17	0.32	0.20	0.20	0.22	0.18	0.22	0.19	0.14	0.13	0.20	0.12	0.25	1.43	1.03	0.69
C3'	0.11	0.19	0.11	0.12	0.12	0.18	0.13	0.39	0.15	0.18	0.19	0.16	0.17	0.17	0.11	0.14	0.21	0.11	0.22	1.10	1.05	0.56
C4	0.18	0.21	0.19	0.15	0.13	0.15	0.15	0.19	0.11	0.29	0.17	0.17	0.12	0.26	0.20	0.26	0.24	0.15	0.19	1.44	0.39	0.59
C4'	0.11	0.18	0.13	0.15	0.12	0.21	0.12	0.44	0.13	0.16	0.17	0.16	0.14	0.14	0.11	0.15	0.23	0.13	0.21	0.74	0.99	0.42
C5	0.19	0.19	0.21	0.17	0.12	0.16	0.12	0.21	0.11	0.25	0.16	0.16	0.11	0.21	0.18	0.29	0.28	0.17	0.19	1.18	0.40	0.51
C5'	0.15	0.22	0.17	0.21	0.16	0.29	0.14	0.48	0.14	0.18	0.19	0.21	0.13	0.16	0.15	0.20	0.29	0.20	0.22	0.49	0.89	0.32
C6	0.16	0.19	0.16	0.14	0.10	0.15	0.09	0.25	0.11	0.21	0.17	0.16	0.10	0.16	0.14	0.23	0.26	0.14	0.19	1.15	0.52	0.51
N1	0.13	0.21	0.11	0.11	0.12	0.13	0.11	0.25	0.15	0.20	0.20	0.18	0.14	0.16	0.12	0.15	0.20	0.10	0.20	1.43	0.62	0.62
N3	0.15	0.24	0.15	0.13	0.12	0.13	0.12	0.19	0.13	0.28	0.22	0.19	0.12	0.24	0.17	0.19	0.18	0.12	0.20	1.66	0.46	0.67
O2	0.13	0.26	0.13	0.15	0.16	0.14	0.17	0.23	0.23	0.20	0.27	0.21	0.24	0.18	0.13	0.13	0.17	0.13	0.26	1.89	0.66	0.77
O2'	0.16	0.24	0.16	0.16	0.18	0.17	0.22	0.32	0.25	0.20	0.26	0.20	0.29	0.23	0.16	0.15	0.21	0.15	0.29	1.44	1.19	0.73
O3'	0.11	0.20	0.11	0.13	0.12	0.17	0.14	0.39	0.17	0.18	0.20	0.16	0.20	0.18	0.12	0.13	0.21	0.11	0.24	1.05	1.20	0.57
O4	0.21	0.21	0.24	0.19	0.20	0.17	0.24	0.19	0.18	0.33	0.17	0.18	0.20	0.33	0.25	0.32	0.27	0.17	0.20	1.44	0.35	0.59
O4'	0.10	0.18	0.12	0.13	0.12	0.19	0.12	0.41	0.14	0.16	0.17	0.16	0.14	0.14	0.11	0.13	0.21	0.13	0.21	0.84	0.80	0.44
O5'	0.19	0.27	0.19	0.19	0.21	0.29	0.20	0.46	0.20	0.24	0.24	0.25	0.19	0.22	0.20	0.29	0.24	0.23	0.23	0.64	0.80	0.36
OP1	0.18	0.29	0.20	0.18	0.21	0.29	0.19	0.45	0.21	0.21	0.26	0.27	0.19	0.20	0.19	0.37	0.24	0.23	0.22	0.32	0.72	0.26
OP2	0.22	0.42	0.20	0.23	0.33	0.29	0.33	0.41	0.36	0.30	0.41	0.38	0.36	0.32	0.27	0.29	0.35	0.26	0.20	0.67	0.65	0.35
P	0.16	0.31	0.16	0.19	0.23	0.28	0.22	0.42	0.24	0.22	0.29	0.28	0.23	0.22	0.20	0.28	0.30	0.22	0.19	0.48	0.68	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.04	0.04	0.03	0.02	0.00	0.02	0.12	0.00	0.20	0.55	0.24	0.18
C2	0.04	0.00	0.14	0.09	0.01	0.06	0.02	0.09	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.23	0.21	0.09	0.24	0.95	0.36	0.34
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.08	0.01	0.05	0.09	0.08	0.06	0.12	0.14	0.07	0.04	0.02	0.00	0.03	0.01	0.39	0.29	0.63	0.31
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.07	0.01	0.10	0.02	0.10	0.13	0.09	0.08	0.12	0.13	0.07	0.01	0.01	0.01	0.25	0.61	0.43	0.34
C4	0.02	0.01	0.08	0.07	0.00	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.13	0.13	0.05	0.24	1.06	0.30	0.38
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.05	0.10	0.04	0.06	0.08	0.10	0.04	0.09	0.02	0.00	0.01	0.21	0.18	0.06
C5	0.02	0.02	0.05	0.10	0.01	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.13	0.10	0.04	0.27	1.36	0.33	0.51
C5'	0.04	0.09	0.09	0.02	0.10	0.01	0.15	0.00	0.15	0.17	0.12	0.08	0.19	0.19	0.10	0.07	0.06	0.01	0.01	0.17	0.40	0.02
C6	0.02	0.02	0.08	0.10	0.01	0.05	0.01	0.15	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.16	0.13	0.05	0.27	1.37	0.37	0.52
C8	0.02	0.02	0.06	0.13	0.01	0.10	0.01	0.17	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.11	0.07	0.06	0.28	1.43	0.25	0.54
N1	0.04	0.01	0.12	0.09	0.02	0.04	0.01	0.12	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.20	0.18	0.07	0.25	1.18	0.38	0.43
N3	0.04	0.01	0.14	0.08	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.22	0.21	0.09	0.23	0.83	0.33	0.29
N6	0.03	0.02	0.07	0.12	0.02	0.08	0.02	0.19	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.03	0.16	0.12	0.05	0.29	1.54	0.41	0.60
N7	0.02	0.02	0.04	0.13	0.01	0.10	0.01	0.19	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.12	0.08	0.05	0.29	1.59	0.32	0.61
N9	0.00	0.02	0.02	0.07	0.01	0.04	0.01	0.10	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.08	0.01	0.24	1.01	0.25	0.36
O2'	0.02	0.23	0.00	0.01	0.13	0.09	0.13	0.07	0.16	0.11	0.20	0.22	0.16	0.12	0.06	0.00	0.05	0.06	0.41	0.40	0.83	0.39
O3'	0.12	0.21	0.03	0.01	0.13	0.02	0.10	0.06	0.13	0.07	0.18	0.21	0.12	0.08	0.08	0.05	0.00	0.08	0.15	0.66	0.37	0.32
O4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.01	0.05	0.06	0.07	0.09	0.05	0.05	0.01	0.06	0.08	0.00	0.06	0.68	0.17	0.30
O5'	0.20	0.24	0.39	0.25	0.24	0.01	0.27	0.01	0.27	0.28	0.25	0.23	0.29	0.29	0.24	0.41	0.15	0.06	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.55	0.95	0.29	0.61	1.06	0.21	1.36	0.17	1.37	1.43	1.18	0.83	1.54	1.59	1.01	0.40	0.66	0.68	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.36	0.63	0.43	0.30	0.18	0.33	0.40	0.37	0.25	0.38	0.33	0.41	0.32	0.25	0.83	0.37	0.17	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.34	0.31	0.34	0.38	0.06	0.51	0.02	0.52	0.54	0.43	0.29	0.60	0.61	0.36	0.39	0.32	0.30	0.01	0.01	0.01	0.00