Doublet Group distance statistics: 54533

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 7, 9, 10, 3, 4, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.008 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.004, 0.011, 0.019, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.002, 0.014, 0.025, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.014 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.020 std_dev=0.014
O4	A	0, 0.029, 0.098, 0.168, 0.362 max_d=0.362 avg_d=0.098 std_dev=0.069
C2'	A	0, 0.014, 0.112, 0.210, 0.394 max_d=0.394 avg_d=0.112 std_dev=0.098
O2'	A	0, 0.029, 0.133, 0.237, 0.417 max_d=0.417 avg_d=0.133 std_dev=0.104
O4'	A	0, 0.003, 0.108, 0.213, 0.402 max_d=0.402 avg_d=0.108 std_dev=0.105
N1	B	0, 0.191, 0.338, 0.486, 0.811 max_d=0.811 avg_d=0.338 std_dev=0.148
C4	B	0, 0.131, 0.279, 0.427, 0.686 max_d=0.686 avg_d=0.279 std_dev=0.148
C2	B	0, 0.201, 0.353, 0.505, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.353 std_dev=0.152
C5	B	0, 0.112, 0.266, 0.419, 0.679 max_d=0.679 avg_d=0.266 std_dev=0.154
C4'	A	0, 0.009, 0.162, 0.316, 0.597 max_d=0.597 avg_d=0.162 std_dev=0.154
C3'	A	0, 0.020, 0.177, 0.334, 0.636 max_d=0.636 avg_d=0.177 std_dev=0.157
C6	B	0, 0.132, 0.290, 0.448, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.290 std_dev=0.158
N3	B	0, 0.169, 0.328, 0.487, 0.744 max_d=0.744 avg_d=0.328 std_dev=0.159
N9	B	0, 0.128, 0.315, 0.502, 0.667 max_d=0.667 avg_d=0.315 std_dev=0.187
N7	B	0, 0.093, 0.304, 0.516, 0.881 max_d=0.881 avg_d=0.304 std_dev=0.211
O3'	A	0, 0.038, 0.251, 0.465, 0.874 max_d=0.874 avg_d=0.251 std_dev=0.214
C8	B	0, 0.111, 0.327, 0.543, 0.891 max_d=0.891 avg_d=0.327 std_dev=0.216
N6	B	0, 0.104, 0.325, 0.545, 0.969 max_d=0.969 avg_d=0.325 std_dev=0.221
C1'	B	0, 0.148, 0.389, 0.630, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.389 std_dev=0.241
C2'	B	0, 0.187, 0.442, 0.697, 1.058 max_d=1.058 avg_d=0.442 std_dev=0.255
C5'	A	0, -0.010, 0.279, 0.568, 1.174 max_d=1.174 avg_d=0.279 std_dev=0.289
O5'	A	0, -0.037, 0.307, 0.651, 1.489 max_d=1.489 avg_d=0.307 std_dev=0.344
O4'	B	0, 0.053, 0.429, 0.805, 1.831 max_d=1.831 avg_d=0.429 std_dev=0.376
OP1	A	0, 0.032, 0.409, 0.787, 1.939 max_d=1.939 avg_d=0.409 std_dev=0.377
O2'	B	0, 0.174, 0.568, 0.963, 2.189 max_d=2.189 avg_d=0.568 std_dev=0.394
P	A	0, -0.033, 0.376, 0.784, 2.043 max_d=2.043 avg_d=0.376 std_dev=0.408
OP2	A	0, 0.008, 0.462, 0.917, 2.246 max_d=2.246 avg_d=0.462 std_dev=0.455
C4'	B	0, -0.017, 0.547, 1.110, 2.523 max_d=2.523 avg_d=0.547 std_dev=0.564
P	B	0, -0.061, 0.531, 1.124, 2.737 max_d=2.737 avg_d=0.531 std_dev=0.593
O5'	B	0, -0.066, 0.541, 1.147, 2.709 max_d=2.709 avg_d=0.541 std_dev=0.606
C5'	B	0, -0.064, 0.554, 1.172, 3.037 max_d=3.037 avg_d=0.554 std_dev=0.618
OP1	B	0, -0.039, 0.587, 1.213, 2.777 max_d=2.777 avg_d=0.587 std_dev=0.626
C3'	B	0, -0.026, 0.617, 1.260, 2.649 max_d=2.649 avg_d=0.617 std_dev=0.643
OP2	B	0, -0.086, 0.618, 1.323, 2.916 max_d=2.916 avg_d=0.618 std_dev=0.704
O3'	B	0, -0.196, 0.787, 1.770, 4.072 max_d=4.072 avg_d=0.787 std_dev=0.983

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.06	0.15	0.07	0.13
C2	0.01	0.00	0.07	0.08	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.09	0.01	0.01	0.14	0.23	0.17	0.24
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.06	0.11	0.00	0.02	0.04	0.01	0.04	0.06	0.06	0.07
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.05	0.03	0.08	0.12	0.01	0.01	0.06	0.01	0.03	0.10	0.05	0.04
C4	0.02	0.00	0.03	0.05	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.00	0.04	0.16	0.32	0.22	0.31
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.04	0.03	0.05	0.05	0.03	0.02	0.06	0.00	0.01	0.05	0.02	0.03
C5	0.02	0.01	0.03	0.04	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.14	0.32	0.18	0.29
C5'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.10	0.01	0.09	0.00	0.08	0.06	0.09	0.07	0.03	0.03	0.11	0.01	0.00	0.05	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.04	0.11	0.27	0.13	0.24
N1	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.11	0.22	0.12	0.21
N3	0.02	0.00	0.06	0.08	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.09	0.01	0.02	0.16	0.28	0.21	0.29
O2	0.01	0.00	0.11	0.12	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.15	0.01	0.02	0.14	0.20	0.17	0.22
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.03	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.05	0.09	0.00	0.03	0.04	0.03	0.02	0.07	0.05	0.03
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.05	0.02	0.05	0.03	0.06	0.03	0.09	0.15	0.03	0.00	0.06	0.02	0.04	0.23	0.08	0.09
O4	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.17	0.34	0.24	0.33
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.00	0.05	0.19	0.06	0.12
O5'	0.06	0.14	0.04	0.03	0.16	0.01	0.14	0.00	0.11	0.11	0.16	0.14	0.02	0.04	0.17	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.15	0.23	0.06	0.10	0.32	0.05	0.32	0.05	0.27	0.22	0.28	0.20	0.07	0.23	0.34	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.17	0.06	0.05	0.22	0.02	0.18	0.03	0.13	0.12	0.21	0.17	0.05	0.08	0.24	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.24	0.07	0.04	0.31	0.03	0.29	0.01	0.24	0.21	0.29	0.22	0.03	0.09	0.33	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.09	0.12	0.07	0.08	0.16	0.12	0.15	0.12	0.13	0.08	0.09	0.17	0.15	0.09	0.10	0.43	0.17	0.10	0.15	0.09	0.11
C2	0.08	0.12	0.12	0.08	0.08	0.15	0.12	0.15	0.10	0.15	0.08	0.09	0.12	0.16	0.10	0.11	0.40	0.16	0.09	0.16	0.09	0.11
C2'	0.14	0.10	0.10	0.19	0.10	0.29	0.11	0.26	0.11	0.14	0.08	0.13	0.16	0.15	0.12	0.13	0.61	0.27	0.14	0.23	0.10	0.17
C3'	0.10	0.09	0.09	0.11	0.07	0.23	0.12	0.21	0.14	0.13	0.10	0.09	0.21	0.16	0.09	0.11	0.51	0.23	0.10	0.18	0.10	0.11
C4	0.13	0.19	0.15	0.19	0.09	0.09	0.07	0.09	0.09	0.16	0.18	0.14	0.11	0.14	0.12	0.10	0.14	0.08	0.22	0.08	0.22	0.11
C4'	0.08	0.11	0.16	0.08	0.10	0.12	0.15	0.11	0.18	0.15	0.15	0.09	0.25	0.18	0.10	0.09	0.36	0.15	0.11	0.11	0.14	0.07
C5	0.13	0.20	0.16	0.22	0.11	0.10	0.11	0.11	0.11	0.17	0.20	0.15	0.10	0.17	0.13	0.09	0.11	0.08	0.25	0.09	0.26	0.14
C5'	0.10	0.15	0.19	0.14	0.13	0.08	0.19	0.08	0.22	0.18	0.19	0.12	0.29	0.22	0.13	0.10	0.24	0.12	0.16	0.09	0.22	0.09
C6	0.09	0.18	0.15	0.16	0.10	0.07	0.12	0.08	0.10	0.15	0.15	0.13	0.13	0.17	0.11	0.09	0.20	0.07	0.18	0.08	0.20	0.09
N1	0.07	0.13	0.12	0.07	0.07	0.11	0.11	0.10	0.09	0.13	0.08	0.10	0.13	0.15	0.09	0.08	0.34	0.12	0.11	0.12	0.11	0.08
N3	0.10	0.15	0.13	0.10	0.07	0.09	0.10	0.10	0.09	0.15	0.12	0.12	0.11	0.16	0.10	0.12	0.29	0.10	0.12	0.12	0.11	0.08
O2	0.13	0.11	0.13	0.18	0.13	0.25	0.15	0.24	0.13	0.18	0.10	0.11	0.14	0.18	0.15	0.15	0.56	0.24	0.14	0.23	0.13	0.19
O2'	0.18	0.11	0.12	0.27	0.13	0.34	0.12	0.31	0.12	0.15	0.10	0.15	0.17	0.15	0.15	0.15	0.71	0.32	0.19	0.28	0.15	0.23
O3'	0.14	0.10	0.10	0.19	0.08	0.30	0.11	0.27	0.13	0.14	0.10	0.11	0.21	0.16	0.11	0.13	0.61	0.28	0.12	0.23	0.09	0.14
O4	0.17	0.18	0.15	0.25	0.11	0.14	0.08	0.13	0.13	0.17	0.19	0.15	0.15	0.14	0.14	0.12	0.10	0.13	0.30	0.10	0.28	0.16
O4'	0.10	0.12	0.19	0.12	0.12	0.08	0.16	0.08	0.18	0.16	0.15	0.10	0.23	0.19	0.12	0.09	0.28	0.11	0.13	0.10	0.14	0.07
O5'	0.10	0.17	0.16	0.13	0.12	0.12	0.17	0.11	0.20	0.16	0.19	0.14	0.28	0.20	0.12	0.11	0.24	0.16	0.17	0.12	0.24	0.11
OP1	0.20	0.27	0.11	0.07	0.20	0.23	0.16	0.21	0.17	0.16	0.22	0.25	0.14	0.15	0.18	0.31	0.37	0.28	0.11	0.23	0.14	0.17
OP2	0.14	0.18	0.18	0.22	0.16	0.15	0.20	0.15	0.21	0.22	0.19	0.15	0.28	0.25	0.17	0.15	0.18	0.17	0.26	0.16	0.35	0.19
P	0.14	0.19	0.07	0.06	0.12	0.18	0.10	0.17	0.09	0.12	0.14	0.18	0.12	0.12	0.12	0.23	0.29	0.24	0.10	0.18	0.16	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.21	0.00	0.11	0.11	0.19	0.17
C2	0.02	0.00	0.15	0.15	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.15	0.19	0.07	0.06	0.10	0.14	0.14
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.09	0.01	0.05	0.14	0.08	0.06	0.13	0.15	0.06	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.35	0.27	0.43	0.38
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.17	0.00	0.23	0.01	0.23	0.24	0.20	0.12	0.27	0.27	0.16	0.01	0.00	0.02	0.12	0.09	0.05	0.09
C4	0.01	0.01	0.09	0.17	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.15	0.10	0.04	0.06	0.11	0.14	0.14
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.08	0.11	0.05	0.02	0.10	0.11	0.06	0.20	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06	0.01
C5	0.01	0.00	0.05	0.23	0.00	0.08	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.20	0.07	0.02	0.09	0.11	0.14	0.13
C5'	0.05	0.05	0.14	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.08	0.08	0.06	0.04	0.10	0.09	0.04	0.06	0.15	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01
C6	0.01	0.00	0.08	0.23	0.00	0.08	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.21	0.07	0.04	0.09	0.11	0.13	0.12
C8	0.01	0.01	0.06	0.24	0.00	0.11	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.19	0.13	0.05	0.11	0.11	0.16	0.13
N1	0.02	0.00	0.13	0.20	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.19	0.11	0.06	0.07	0.11	0.13	0.13
N3	0.02	0.00	0.15	0.12	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.13	0.22	0.07	0.07	0.10	0.15	0.15
N6	0.01	0.01	0.06	0.27	0.01	0.10	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.24	0.11	0.03	0.13	0.11	0.15	0.12
N7	0.01	0.00	0.04	0.27	0.00	0.11	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.22	0.15	0.03	0.13	0.11	0.16	0.12
N9	0.00	0.01	0.02	0.16	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.05	0.01	0.07	0.11	0.16	0.15
O2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.15	0.20	0.20	0.06	0.21	0.19	0.19	0.13	0.24	0.22	0.13	0.00	0.03	0.14	0.25	0.13	0.48	0.30
O3'	0.21	0.19	0.02	0.00	0.10	0.01	0.07	0.15	0.07	0.13	0.11	0.22	0.11	0.15	0.05	0.03	0.00	0.14	0.11	0.32	0.22	0.20
O4'	0.00	0.07	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.05	0.06	0.07	0.03	0.03	0.01	0.14	0.14	0.00	0.07	0.05	0.08	0.05
O5'	0.11	0.06	0.35	0.12	0.06	0.01	0.09	0.01	0.09	0.11	0.07	0.07	0.13	0.13	0.07	0.25	0.11	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.11	0.10	0.27	0.09	0.11	0.05	0.11	0.04	0.11	0.11	0.11	0.10	0.11	0.11	0.11	0.13	0.32	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.14	0.43	0.05	0.14	0.06	0.14	0.10	0.13	0.16	0.13	0.15	0.15	0.16	0.16	0.48	0.22	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.14	0.38	0.09	0.14	0.01	0.13	0.01	0.12	0.13	0.13	0.15	0.12	0.12	0.15	0.30	0.20	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00