Doublet Group distance statistics: 54537

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 7, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.006, 0.009, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.005, 0.008, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.008 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.004, 0.009, 0.013, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.005, 0.009, 0.014, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.005, 0.010, 0.015, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.006, 0.012, 0.019, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.007
O2	A	0, 0.009, 0.021, 0.034, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.021 std_dev=0.013
O4	A	0, 0.009, 0.035, 0.062, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.035 std_dev=0.026
C2'	A	0, 0.034, 0.097, 0.160, 0.232 max_d=0.232 avg_d=0.097 std_dev=0.063
O4'	A	0, 0.022, 0.109, 0.197, 0.364 max_d=0.364 avg_d=0.109 std_dev=0.087
O2'	A	0, 0.066, 0.161, 0.256, 0.346 max_d=0.346 avg_d=0.161 std_dev=0.095
C3'	A	0, 0.050, 0.166, 0.282, 0.435 max_d=0.435 avg_d=0.166 std_dev=0.116
O3'	A	0, 0.010, 0.199, 0.388, 0.633 max_d=0.633 avg_d=0.199 std_dev=0.189
C4'	A	0, 0.027, 0.219, 0.411, 0.676 max_d=0.676 avg_d=0.219 std_dev=0.192
C2'	B	0, 0.044, 0.287, 0.531, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.287 std_dev=0.243
C1'	B	0, 0.001, 0.254, 0.507, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.254 std_dev=0.253
O2'	B	0, 0.087, 0.346, 0.605, 0.965 max_d=0.965 avg_d=0.346 std_dev=0.259
P	A	0, 0.190, 0.454, 0.719, 1.089 max_d=1.089 avg_d=0.454 std_dev=0.265
O4'	B	0, -0.010, 0.268, 0.546, 1.040 max_d=1.040 avg_d=0.268 std_dev=0.278
N9	B	0, -0.048, 0.244, 0.536, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.244 std_dev=0.292
C4'	B	0, -0.008, 0.286, 0.580, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.286 std_dev=0.294
C3'	B	0, 0.025, 0.328, 0.631, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.328 std_dev=0.303
C5'	B	0, 0.001, 0.314, 0.627, 1.292 max_d=1.292 avg_d=0.314 std_dev=0.313
C4	B	0, -0.044, 0.277, 0.598, 1.177 max_d=1.177 avg_d=0.277 std_dev=0.321
N3	B	0, -0.002, 0.323, 0.647, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.323 std_dev=0.324
C8	B	0, -0.081, 0.255, 0.591, 1.412 max_d=1.412 avg_d=0.255 std_dev=0.336
O5'	A	0, 0.102, 0.458, 0.813, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.458 std_dev=0.355
C5	B	0, -0.061, 0.309, 0.680, 1.444 max_d=1.444 avg_d=0.309 std_dev=0.370
OP1	A	0, 0.145, 0.521, 0.898, 1.408 max_d=1.408 avg_d=0.521 std_dev=0.376
C2	B	0, 0.004, 0.382, 0.760, 1.210 max_d=1.210 avg_d=0.382 std_dev=0.378
N7	B	0, -0.082, 0.298, 0.678, 1.573 max_d=1.573 avg_d=0.298 std_dev=0.380
C5'	A	0, -0.006, 0.384, 0.774, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.384 std_dev=0.390
C6	B	0, -0.034, 0.385, 0.803, 1.578 max_d=1.578 avg_d=0.385 std_dev=0.418
N1	B	0, -0.006, 0.413, 0.831, 1.463 max_d=1.463 avg_d=0.413 std_dev=0.419
N6	B	0, -0.031, 0.452, 0.935, 1.850 max_d=1.850 avg_d=0.452 std_dev=0.483
O3'	B	0, -0.045, 0.447, 0.940, 1.574 max_d=1.574 avg_d=0.447 std_dev=0.492
O5'	B	0, -0.133, 0.467, 1.067, 2.558 max_d=2.558 avg_d=0.467 std_dev=0.600
OP1	B	0, -0.144, 0.681, 1.506, 2.735 max_d=2.735 avg_d=0.681 std_dev=0.825
OP2	A	0, -0.131, 0.712, 1.554, 3.433 max_d=3.433 avg_d=0.712 std_dev=0.842
P	B	0, -0.401, 0.506, 1.414, 3.760 max_d=3.760 avg_d=0.506 std_dev=0.908
OP2	B	0, -0.600, 0.771, 2.142, 5.220 max_d=5.220 avg_d=0.771 std_dev=1.371

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.11	0.01	0.00	0.30	0.33	0.31	0.13
C2	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00	0.03	0.00	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.13	0.01	0.04	0.37	0.34	0.49	0.16
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.02	0.02	0.10	0.02	0.02	0.04	0.06	0.00	0.03	0.04	0.01	0.20	0.30	0.38	0.10
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.02	0.05	0.02	0.03	0.04	0.01	0.00	0.05	0.01	0.07	0.28	0.26	0.09
C4	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.09	0.00	0.30	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.10	0.00	0.02	0.41	0.36	0.68	0.20
C4'	0.00	0.03	0.02	0.00	0.09	0.00	0.12	0.00	0.12	0.05	0.06	0.04	0.02	0.02	0.10	0.00	0.01	0.21	0.24	0.03
C5	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.12	0.00	0.33	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.09	0.00	0.04	0.42	0.37	0.68	0.21
C5'	0.09	0.19	0.10	0.02	0.30	0.00	0.33	0.00	0.30	0.20	0.24	0.13	0.09	0.05	0.31	0.02	0.00	0.25	0.26	0.01
C6	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.12	0.00	0.30	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.05	0.42	0.37	0.58	0.19
N1	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.01	0.20	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.01	0.38	0.35	0.47	0.16
N3	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.06	0.00	0.24	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.12	0.00	0.03	0.40	0.35	0.60	0.18
O2	0.02	0.00	0.06	0.04	0.01	0.04	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.15	0.01	0.07	0.34	0.33	0.42	0.14
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.07	0.02	0.05	0.09	0.04	0.04	0.09	0.10	0.00	0.03	0.08	0.02	0.16	0.28	0.42	0.09
O3'	0.11	0.13	0.03	0.00	0.10	0.02	0.09	0.05	0.08	0.10	0.12	0.15	0.03	0.00	0.10	0.13	0.09	0.36	0.24	0.12
O4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.10	0.00	0.31	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.10	0.00	0.02	0.41	0.36	0.73	0.21
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.02	0.05	0.01	0.03	0.07	0.02	0.13	0.02	0.00	0.27	0.32	0.17	0.14
O5'	0.30	0.37	0.20	0.07	0.41	0.01	0.42	0.00	0.42	0.38	0.40	0.34	0.16	0.09	0.41	0.27	0.00	0.03	0.01	0.00
OP1	0.33	0.34	0.30	0.28	0.36	0.21	0.37	0.25	0.37	0.35	0.35	0.33	0.28	0.36	0.36	0.32	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.31	0.49	0.38	0.26	0.68	0.24	0.68	0.26	0.58	0.47	0.60	0.42	0.42	0.24	0.73	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.16	0.10	0.09	0.20	0.03	0.21	0.01	0.19	0.16	0.18	0.14	0.09	0.12	0.21	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.15	0.24	0.27	0.06	0.30	0.11	0.33	0.15	0.20	0.16	0.10	0.19	0.18	0.15	0.17	0.40	0.28	0.24	0.33	0.31	0.29
C2	0.23	0.25	0.26	0.27	0.14	0.29	0.09	0.33	0.16	0.25	0.25	0.20	0.17	0.18	0.19	0.21	0.37	0.28	0.42	0.61	0.69	0.58
C2'	0.16	0.14	0.19	0.23	0.06	0.26	0.11	0.31	0.14	0.18	0.14	0.11	0.19	0.18	0.11	0.13	0.35	0.21	0.15	0.21	0.18	0.13
C3'	0.10	0.15	0.13	0.20	0.08	0.21	0.13	0.26	0.16	0.12	0.16	0.12	0.20	0.15	0.06	0.12	0.33	0.13	0.16	0.08	0.24	0.07
C4	0.27	0.32	0.27	0.28	0.24	0.30	0.23	0.33	0.19	0.32	0.29	0.28	0.15	0.32	0.27	0.24	0.42	0.31	0.44	0.68	0.79	0.61
C4'	0.07	0.15	0.07	0.13	0.10	0.11	0.14	0.15	0.17	0.11	0.16	0.13	0.20	0.15	0.06	0.15	0.29	0.07	0.16	0.13	0.16	0.09
C5	0.29	0.29	0.28	0.30	0.26	0.31	0.26	0.33	0.19	0.34	0.21	0.28	0.24	0.35	0.29	0.24	0.46	0.32	0.38	0.57	0.66	0.51
C5'	0.08	0.14	0.10	0.09	0.07	0.06	0.09	0.13	0.13	0.07	0.13	0.14	0.16	0.10	0.05	0.23	0.19	0.06	0.15	0.13	0.12	0.06
C6	0.28	0.21	0.28	0.30	0.22	0.32	0.22	0.33	0.16	0.32	0.13	0.23	0.24	0.32	0.27	0.23	0.46	0.32	0.33	0.48	0.53	0.42
N1	0.25	0.19	0.26	0.28	0.13	0.31	0.11	0.33	0.09	0.27	0.16	0.17	0.16	0.24	0.22	0.21	0.41	0.30	0.34	0.48	0.52	0.44
N3	0.24	0.30	0.27	0.26	0.19	0.29	0.16	0.33	0.20	0.28	0.30	0.24	0.17	0.25	0.22	0.23	0.38	0.29	0.46	0.70	0.81	0.65
O2	0.18	0.26	0.25	0.25	0.14	0.27	0.13	0.33	0.23	0.16	0.28	0.20	0.25	0.06	0.13	0.21	0.32	0.25	0.44	0.64	0.71	0.63
O2'	0.13	0.15	0.17	0.21	0.06	0.23	0.10	0.30	0.13	0.15	0.15	0.12	0.18	0.16	0.08	0.11	0.30	0.18	0.15	0.18	0.26	0.09
O3'	0.20	0.10	0.25	0.31	0.10	0.32	0.13	0.37	0.13	0.19	0.11	0.09	0.16	0.18	0.15	0.19	0.39	0.23	0.15	0.11	0.32	0.10
O4	0.26	0.34	0.26	0.27	0.24	0.29	0.24	0.32	0.23	0.32	0.32	0.28	0.20	0.32	0.26	0.23	0.41	0.30	0.47	0.74	0.87	0.66
O4'	0.21	0.15	0.21	0.27	0.07	0.28	0.14	0.24	0.20	0.10	0.19	0.11	0.24	0.14	0.10	0.19	0.43	0.26	0.19	0.21	0.27	0.19
O5'	0.09	0.40	0.09	0.18	0.31	0.16	0.44	0.16	0.54	0.29	0.51	0.29	0.61	0.42	0.21	0.21	0.42	0.06	0.16	0.15	0.28	0.14
OP1	0.23	0.39	0.23	0.24	0.33	0.18	0.43	0.10	0.51	0.32	0.48	0.32	0.59	0.42	0.27	0.36	0.37	0.19	0.37	0.28	0.53	0.37
OP2	0.19	0.27	0.19	0.29	0.18	0.35	0.28	0.42	0.36	0.26	0.35	0.18	0.46	0.31	0.19	0.19	0.40	0.29	0.26	0.30	0.23	0.27
P	0.08	0.28	0.10	0.12	0.19	0.11	0.27	0.15	0.35	0.17	0.35	0.21	0.42	0.25	0.12	0.24	0.28	0.05	0.16	0.11	0.23	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.15	0.00	0.23	0.18	0.39	0.24
C2	0.03	0.00	0.05	0.05	0.00	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.23	0.03	0.17	0.31	0.49	0.24
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.05	0.04	0.05	0.04	0.05	0.02	0.00	0.05	0.02	0.39	0.28	0.57	0.38
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.06	0.03	0.05	0.03	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.19	0.11	0.39	0.16
C4	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.18	0.01	0.24	0.34	0.56	0.31
C4'	0.00	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.05	0.02	0.03	0.03	0.05	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.15	0.21	0.04
C5	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.16	0.02	0.29	0.44	0.70	0.39
C5'	0.02	0.04	0.02	0.03	0.06	0.00	0.08	0.00	0.08	0.10	0.06	0.03	0.09	0.11	0.06	0.02	0.04	0.01	0.01	0.21	0.23	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.18	0.02	0.26	0.45	0.70	0.38
C8	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.11	0.03	0.37	0.45	0.77	0.47
N1	0.02	0.00	0.04	0.03	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.21	0.02	0.21	0.39	0.60	0.31
N3	0.03	0.00	0.05	0.05	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.23	0.03	0.17	0.27	0.44	0.23
N6	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.17	0.03	0.29	0.52	0.78	0.42
N7	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.12	0.03	0.35	0.51	0.83	0.48
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.14	0.01	0.28	0.32	0.57	0.34
O2'	0.02	0.10	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.05	0.07	0.07	0.09	0.05	0.06	0.02	0.00	0.04	0.02	0.39	0.35	0.65	0.41
O3'	0.15	0.23	0.05	0.01	0.18	0.02	0.16	0.04	0.18	0.11	0.21	0.23	0.17	0.12	0.14	0.04	0.00	0.10	0.07	0.19	0.36	0.12
O4'	0.00	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.02	0.10	0.00	0.07	0.05	0.16	0.10
O5'	0.23	0.17	0.39	0.19	0.24	0.01	0.29	0.01	0.26	0.37	0.21	0.17	0.29	0.35	0.28	0.39	0.07	0.07	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.18	0.31	0.28	0.11	0.34	0.15	0.44	0.21	0.45	0.45	0.39	0.27	0.52	0.51	0.32	0.35	0.19	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.39	0.49	0.57	0.39	0.56	0.21	0.70	0.23	0.70	0.77	0.60	0.44	0.78	0.83	0.57	0.65	0.36	0.16	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.24	0.24	0.38	0.16	0.31	0.04	0.39	0.01	0.38	0.47	0.31	0.23	0.42	0.48	0.34	0.41	0.12	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00