sequences=7
<param>
maxmove=0.1
pval=0.1
usescval=false
complexatt=true
cooling=1.0
currcool=1.0
attfactor=10.0
attvalpow=1
repfactor=10.0
repvalpow=1
dampening=1.0
minattract=1.0
cluster2d=false
blastpath=/home/sdh/apps/blast-2.2.17/bin/blastall -p blastp -M PAM70 -F F -e 10000 -b 500 -v 500
formatdbpath=/home/sdh/apps/blast-2.2.17/bin/formatdb
showinfo=true
zoom=1.0
dotsize=0
ovalsize=10
groupsize=4
usefoldchange=false
avgfoldchange=false
colorcutoffs=0.0;0.1;0.2;0.3;0.4;0.5;0.6;0.7;0.8;0.9;
colorarr=(230;230;230):(207;207;207):(184;184;184):(161;161;161):(138;138;138):(115;115;115):(92;92;92):(69;69;69):(46;46;46):(23;23;23):
</param>
<rotmtx>
1.0;0.0;0.0;
0.0;1.0;0.0;
0.0;0.0;1.0;
</rotmtx>
<seq>
>1YRJ-A1-B15
X
>3OHJ-A2519-A2544
X
>3F1F-A2673-A2698
X
>3F1H-A2673-A2698
X
>3OH7-A2519-A2544
X
>3OH5-A2519-A2544
X
>3OI1-A2519-A2544
X
</seq>
<hsp>
0 1:0.924369430871
0 2:0.872182461605
0 3:0.86822894072
0 4:1.0
0 5:0.976310744265
0 6:0.927115074339
1 2:0.56008328887
1 3:0.539489701214
1 4:0.539963779005
1 5:0.453173763928
1 6:0.337271094346
2 3:0.0551041140082
2 4:0.578161832262
2 5:0.493893017579
2 6:0.509006301491
3 4:0.590776362363
3 5:0.501978446041
3 6:0.50269041517
4 5:0.145275575549
4 6:0.481850120782
5 6:0.406695186421
</hsp>