Doublet Group distance statistics: 54543

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.007, 0.011, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.001, 0.006, 0.011, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.006 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.003, 0.013, 0.022, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.002, 0.015, 0.028, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.015 std_dev=0.013
C2	A	0, -0.001, 0.012, 0.025, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.012 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C1'	A	0, -0.001, 0.016, 0.032, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.016 std_dev=0.016
O2	A	0, -0.004, 0.025, 0.054, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.025 std_dev=0.029
O4	A	0, -0.009, 0.041, 0.092, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.041 std_dev=0.050
N6	B	0, 0.239, 0.458, 0.678, 0.657 max_d=0.657 avg_d=0.458 std_dev=0.220
C6	B	0, 0.236, 0.459, 0.682, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.459 std_dev=0.223
N1	B	0, 0.209, 0.453, 0.696, 0.752 max_d=0.752 avg_d=0.453 std_dev=0.243
C5	B	0, 0.286, 0.539, 0.792, 0.772 max_d=0.772 avg_d=0.539 std_dev=0.253
O4'	A	0, 0.141, 0.395, 0.649, 0.705 max_d=0.705 avg_d=0.395 std_dev=0.254
C2	B	0, 0.279, 0.540, 0.802, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.540 std_dev=0.261
C4	B	0, 0.309, 0.582, 0.856, 0.817 max_d=0.817 avg_d=0.582 std_dev=0.273
N3	B	0, 0.318, 0.597, 0.875, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.597 std_dev=0.278
C4'	A	0, 0.168, 0.463, 0.757, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.463 std_dev=0.294
O5'	A	0, 0.274, 0.579, 0.884, 0.956 max_d=0.956 avg_d=0.579 std_dev=0.305
C3'	A	0, 0.167, 0.473, 0.779, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.473 std_dev=0.306
N7	B	0, 0.313, 0.624, 0.936, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.624 std_dev=0.312
N9	B	0, 0.344, 0.667, 0.989, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.667 std_dev=0.322
C8	B	0, 0.342, 0.687, 1.032, 1.086 max_d=1.086 avg_d=0.687 std_dev=0.345
C2'	A	0, 0.152, 0.497, 0.843, 0.929 max_d=0.929 avg_d=0.497 std_dev=0.346
C1'	B	0, 0.387, 0.740, 1.092, 1.131 max_d=1.131 avg_d=0.740 std_dev=0.353
C2'	B	0, 0.300, 0.655, 1.010, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.655 std_dev=0.355
C5'	A	0, 0.311, 0.705, 1.100, 1.170 max_d=1.170 avg_d=0.705 std_dev=0.394
C5'	B	0, 0.391, 0.794, 1.197, 1.310 max_d=1.310 avg_d=0.794 std_dev=0.403
O2'	B	0, 0.421, 0.828, 1.235, 1.197 max_d=1.197 avg_d=0.828 std_dev=0.407
OP2	B	0, 0.419, 0.847, 1.276, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.847 std_dev=0.428
C4'	B	0, 0.421, 0.851, 1.281, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.851 std_dev=0.430
OP1	A	0, 0.270, 0.705, 1.139, 1.252 max_d=1.252 avg_d=0.705 std_dev=0.435
O5'	B	0, 0.416, 0.859, 1.301, 1.356 max_d=1.356 avg_d=0.859 std_dev=0.443
O4'	B	0, 0.369, 0.824, 1.279, 1.467 max_d=1.467 avg_d=0.824 std_dev=0.455
P	A	0, 0.342, 0.802, 1.262, 1.372 max_d=1.372 avg_d=0.802 std_dev=0.460
C3'	B	0, 0.519, 1.024, 1.530, 1.604 max_d=1.604 avg_d=1.024 std_dev=0.505
P	B	0, 0.442, 0.954, 1.466, 1.633 max_d=1.633 avg_d=0.954 std_dev=0.512
O3'	A	0, 0.151, 0.716, 1.281, 1.409 max_d=1.409 avg_d=0.716 std_dev=0.565
OP2	A	0, 0.473, 1.072, 1.672, 1.840 max_d=1.840 avg_d=1.072 std_dev=0.599
OP1	B	0, 0.495, 1.167, 1.839, 1.972 max_d=1.972 avg_d=1.167 std_dev=0.672
O2'	A	0, 0.238, 0.920, 1.601, 1.762 max_d=1.762 avg_d=0.920 std_dev=0.681
O3'	B	0, 0.630, 1.416, 2.202, 2.426 max_d=2.426 avg_d=1.416 std_dev=0.786

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.28	0.02	0.00	0.10	0.12	0.09	0.10
C2	0.01	0.00	0.09	0.08	0.01	0.02	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.25	0.01	0.04	0.12	0.18	0.13	0.13
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.02	0.10	0.17	0.12	0.02	0.05	0.18	0.00	0.05	0.05	0.02	0.32	0.33	0.29	0.31
C3'	0.02	0.08	0.00	0.00	0.11	0.00	0.10	0.02	0.09	0.07	0.10	0.07	0.01	0.01	0.11	0.01	0.05	0.21	0.08	0.15
C4	0.02	0.01	0.05	0.11	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.21	0.14	0.00	0.03	0.14	0.16	0.19	0.14
C4'	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.04	0.03	0.03	0.01	0.13	0.04	0.04	0.01	0.01	0.08	0.03	0.05
C5	0.01	0.00	0.10	0.10	0.00	0.05	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.00	0.24	0.10	0.00	0.05	0.14	0.13	0.19	0.14
C5'	0.06	0.09	0.17	0.02	0.13	0.00	0.14	0.00	0.13	0.10	0.11	0.06	0.06	0.20	0.13	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01
C6	0.01	0.00	0.12	0.09	0.01	0.04	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.12	0.01	0.05	0.14	0.12	0.17	0.13
N1	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.03	0.01	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.20	0.01	0.02	0.13	0.15	0.13	0.12
N3	0.01	0.00	0.05	0.10	0.00	0.03	0.01	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.20	0.00	0.03	0.13	0.18	0.16	0.14
O2	0.01	0.00	0.18	0.07	0.01	0.01	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.31	0.01	0.06	0.11	0.20	0.11	0.13
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.21	0.13	0.24	0.06	0.21	0.12	0.15	0.13	0.00	0.06	0.23	0.07	0.32	0.50	0.30	0.38
O3'	0.28	0.25	0.05	0.01	0.14	0.04	0.10	0.20	0.12	0.20	0.20	0.31	0.06	0.00	0.13	0.21	0.19	0.40	0.36	0.39
O4	0.02	0.01	0.05	0.11	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.23	0.13	0.00	0.03	0.14	0.15	0.20	0.14
O4'	0.00	0.04	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.03	0.06	0.07	0.21	0.03	0.00	0.06	0.11	0.06	0.06
O5'	0.10	0.12	0.32	0.05	0.14	0.01	0.14	0.01	0.14	0.13	0.13	0.11	0.32	0.19	0.14	0.06	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.12	0.18	0.33	0.21	0.16	0.08	0.13	0.01	0.12	0.15	0.18	0.20	0.50	0.40	0.15	0.11	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.09	0.13	0.29	0.08	0.19	0.03	0.19	0.06	0.17	0.13	0.16	0.11	0.30	0.36	0.20	0.06	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.10	0.13	0.31	0.15	0.14	0.05	0.14	0.01	0.13	0.12	0.14	0.13	0.38	0.39	0.14	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.29	0.11	0.17	0.24	0.17	0.20	0.12	0.12	0.10	0.21	0.10	0.15	0.13	0.13	0.23	0.23	0.16	0.28	0.06	0.18	0.44	0.21
C2	0.16	0.07	0.13	0.09	0.05	0.05	0.10	0.15	0.12	0.06	0.11	0.05	0.15	0.10	0.07	0.33	0.12	0.07	0.13	0.17	0.36	0.18
C2'	0.28	0.27	0.13	0.15	0.28	0.10	0.28	0.18	0.28	0.26	0.27	0.27	0.26	0.27	0.27	0.23	0.09	0.20	0.10	0.19	0.47	0.23
C3'	0.24	0.14	0.14	0.17	0.16	0.15	0.15	0.11	0.15	0.17	0.15	0.16	0.18	0.15	0.19	0.15	0.15	0.26	0.07	0.21	0.49	0.24
C4	0.15	0.15	0.16	0.15	0.18	0.17	0.20	0.26	0.19	0.20	0.17	0.15	0.20	0.21	0.18	0.45	0.27	0.21	0.26	0.22	0.27	0.22
C4'	0.19	0.10	0.17	0.15	0.11	0.14	0.11	0.11	0.13	0.13	0.12	0.11	0.17	0.11	0.14	0.16	0.15	0.25	0.09	0.22	0.51	0.26
C5	0.13	0.12	0.12	0.13	0.15	0.15	0.19	0.26	0.18	0.20	0.15	0.11	0.20	0.21	0.15	0.33	0.18	0.14	0.25	0.19	0.27	0.20
C5'	0.10	0.11	0.23	0.06	0.09	0.04	0.12	0.13	0.15	0.08	0.14	0.09	0.18	0.12	0.08	0.19	0.07	0.15	0.10	0.13	0.50	0.22
C6	0.13	0.08	0.06	0.06	0.08	0.07	0.14	0.19	0.15	0.12	0.12	0.06	0.18	0.16	0.08	0.24	0.08	0.10	0.16	0.14	0.34	0.17
N1	0.19	0.06	0.09	0.12	0.07	0.09	0.09	0.14	0.12	0.08	0.10	0.06	0.15	0.10	0.10	0.26	0.07	0.15	0.09	0.14	0.38	0.18
N3	0.12	0.12	0.15	0.07	0.13	0.09	0.16	0.20	0.17	0.14	0.15	0.10	0.18	0.16	0.11	0.43	0.22	0.12	0.21	0.21	0.31	0.20
O2	0.19	0.09	0.17	0.14	0.09	0.09	0.07	0.13	0.09	0.08	0.09	0.10	0.12	0.07	0.11	0.32	0.13	0.10	0.11	0.17	0.37	0.18
O2'	0.41	0.45	0.32	0.31	0.49	0.16	0.57	0.10	0.59	0.51	0.51	0.43	0.63	0.60	0.47	0.42	0.17	0.26	0.08	0.33	0.49	0.28
O3'	0.27	0.45	0.38	0.20	0.39	0.17	0.45	0.18	0.51	0.33	0.50	0.40	0.57	0.41	0.32	0.42	0.24	0.20	0.19	0.32	0.56	0.33
O4	0.22	0.19	0.24	0.24	0.23	0.26	0.23	0.29	0.21	0.24	0.19	0.20	0.20	0.23	0.23	0.55	0.38	0.31	0.30	0.25	0.23	0.24
O4'	0.19	0.13	0.14	0.18	0.11	0.18	0.16	0.14	0.21	0.10	0.18	0.11	0.27	0.16	0.12	0.12	0.16	0.26	0.09	0.17	0.46	0.23
O5'	0.08	0.14	0.21	0.13	0.11	0.10	0.15	0.20	0.18	0.11	0.17	0.11	0.21	0.15	0.08	0.10	0.12	0.12	0.17	0.10	0.34	0.08
OP1	0.10	0.13	0.23	0.25	0.10	0.22	0.12	0.37	0.14	0.12	0.14	0.11	0.15	0.13	0.09	0.11	0.24	0.11	0.32	0.27	0.07	0.17
OP2	0.12	0.16	0.37	0.25	0.16	0.19	0.19	0.29	0.19	0.18	0.18	0.15	0.22	0.20	0.15	0.26	0.17	0.10	0.29	0.27	0.26	0.17
P	0.08	0.12	0.26	0.20	0.11	0.16	0.13	0.30	0.14	0.11	0.14	0.11	0.16	0.14	0.09	0.13	0.17	0.10	0.26	0.19	0.20	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.21	0.00	0.13	0.20	0.16	0.13
C2	0.03	0.00	0.19	0.12	0.00	0.01	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.20	0.19	0.08	0.16	0.26	0.27	0.19
C2'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.15	0.04	0.19	0.12	0.21	0.04	0.15	0.04	0.00	0.05	0.01	0.30	0.47	0.27	0.40
C3'	0.02	0.12	0.00	0.00	0.09	0.00	0.08	0.02	0.09	0.07	0.11	0.12	0.09	0.08	0.06	0.01	0.01	0.02	0.03	0.12	0.14	0.16
C4	0.02	0.00	0.07	0.09	0.00	0.02	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.16	0.05	0.16	0.25	0.26	0.19
C4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.04	0.08	0.02	0.01	0.05	0.08	0.03	0.15	0.01	0.01	0.02	0.03	0.07	0.04
C5	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.12	0.04	0.17	0.27	0.30	0.22
C5'	0.05	0.10	0.15	0.02	0.11	0.01	0.14	0.00	0.15	0.14	0.13	0.09	0.17	0.16	0.09	0.06	0.18	0.02	0.01	0.02	0.06	0.02
C6	0.02	0.00	0.04	0.09	0.01	0.04	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.13	0.04	0.17	0.27	0.32	0.22
C8	0.02	0.00	0.19	0.07	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.28	0.08	0.07	0.16	0.26	0.27	0.21
N1	0.03	0.00	0.12	0.11	0.01	0.02	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.17	0.06	0.17	0.27	0.30	0.21
N3	0.03	0.00	0.21	0.12	0.00	0.01	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.23	0.20	0.08	0.15	0.24	0.24	0.17
N6	0.02	0.01	0.04	0.09	0.01	0.05	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.11	0.04	0.18	0.27	0.35	0.23
N7	0.01	0.00	0.15	0.08	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.27	0.08	0.05	0.17	0.27	0.32	0.22
N9	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.14	0.03	0.15	0.24	0.23	0.18
O2'	0.02	0.20	0.00	0.01	0.02	0.15	0.12	0.06	0.07	0.28	0.08	0.23	0.13	0.27	0.10	0.00	0.09	0.10	0.26	0.59	0.21	0.41
O3'	0.21	0.19	0.05	0.01	0.16	0.01	0.12	0.18	0.13	0.08	0.17	0.20	0.11	0.08	0.14	0.09	0.00	0.15	0.14	0.12	0.27	0.19
O4'	0.00	0.08	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.02	0.04	0.07	0.06	0.08	0.04	0.05	0.03	0.10	0.15	0.00	0.12	0.15	0.25	0.14
O5'	0.13	0.16	0.30	0.03	0.16	0.02	0.17	0.01	0.17	0.16	0.17	0.15	0.18	0.17	0.15	0.26	0.14	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.20	0.26	0.47	0.12	0.25	0.03	0.27	0.02	0.27	0.26	0.27	0.24	0.27	0.27	0.24	0.59	0.12	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.27	0.27	0.14	0.26	0.07	0.30	0.06	0.32	0.27	0.30	0.24	0.35	0.32	0.23	0.21	0.27	0.25	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.19	0.40	0.16	0.19	0.04	0.22	0.02	0.22	0.21	0.21	0.17	0.23	0.22	0.18	0.41	0.19	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00