Doublet Group distance statistics: 54554

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.008, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.000, 0.014, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.000, 0.019, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.000, 0.020, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C2	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N1	A	0, 0.000, 0.029, 0.057, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.029 std_dev=0.029
C1'	A	0, 0.000, 0.030, 0.059, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.030 std_dev=0.030
O2	A	0, 0.000, 0.030, 0.060, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.030 std_dev=0.030
O4	A	0, 0.000, 0.053, 0.105, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.053 std_dev=0.053
N3	B	0, 0.000, 0.309, 0.618, 0.618 max_d=0.618 avg_d=0.309 std_dev=0.309
C2	B	0, 0.000, 0.368, 0.736, 0.736 max_d=0.736 avg_d=0.368 std_dev=0.368
C4	B	0, 0.000, 0.494, 0.988, 0.988 max_d=0.988 avg_d=0.494 std_dev=0.494
N1	B	0, 0.000, 0.592, 1.184, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.592 std_dev=0.592
N9	B	0, 0.000, 0.611, 1.221, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.611 std_dev=0.611
C1'	B	0, 0.000, 0.645, 1.291, 1.291 max_d=1.291 avg_d=0.645 std_dev=0.645
O3'	B	0, 0.000, 0.650, 1.299, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.650 std_dev=0.650
C5	B	0, 0.000, 0.670, 1.340, 1.340 max_d=1.340 avg_d=0.670 std_dev=0.670
C6	B	0, 0.000, 0.724, 1.448, 1.448 max_d=1.448 avg_d=0.724 std_dev=0.724
C8	B	0, 0.000, 0.765, 1.529, 1.529 max_d=1.529 avg_d=0.765 std_dev=0.765
N7	B	0, 0.000, 0.816, 1.632, 1.632 max_d=1.632 avg_d=0.816 std_dev=0.816
N6	B	0, 0.000, 0.945, 1.891, 1.891 max_d=1.891 avg_d=0.945 std_dev=0.945
C2'	B	0, 0.000, 1.038, 2.076, 2.076 max_d=2.076 avg_d=1.038 std_dev=1.038
O4'	A	0, 0.000, 1.073, 2.146, 2.146 max_d=2.146 avg_d=1.073 std_dev=1.073
C2'	A	0, 0.000, 1.083, 2.167, 2.167 max_d=2.167 avg_d=1.083 std_dev=1.083
C3'	B	0, 0.000, 1.117, 2.235, 2.235 max_d=2.235 avg_d=1.117 std_dev=1.117
O3'	A	0, 0.000, 1.163, 2.325, 2.325 max_d=2.325 avg_d=1.163 std_dev=1.163
C3'	A	0, 0.000, 1.315, 2.629, 2.629 max_d=2.629 avg_d=1.315 std_dev=1.315
O4'	B	0, 0.000, 1.391, 2.782, 2.782 max_d=2.782 avg_d=1.391 std_dev=1.391
C4'	A	0, 0.000, 1.495, 2.990, 2.990 max_d=2.990 avg_d=1.495 std_dev=1.495
O2'	B	0, 0.000, 1.555, 3.109, 3.109 max_d=3.109 avg_d=1.555 std_dev=1.555
C4'	B	0, 0.000, 1.645, 3.291, 3.291 max_d=3.291 avg_d=1.645 std_dev=1.645
O2'	A	0, 0.000, 1.656, 3.313, 3.313 max_d=3.313 avg_d=1.656 std_dev=1.656
C5'	A	0, 0.000, 2.420, 4.841, 4.841 max_d=4.841 avg_d=2.420 std_dev=2.420
C5'	B	0, 0.000, 2.507, 5.014, 5.014 max_d=5.014 avg_d=2.507 std_dev=2.507
O5'	B	0, 0.000, 2.544, 5.089, 5.089 max_d=5.089 avg_d=2.544 std_dev=2.544
OP2	B	0, 0.000, 3.159, 6.318, 6.318 max_d=6.318 avg_d=3.159 std_dev=3.159
P	B	0, 0.000, 3.282, 6.564, 6.564 max_d=6.564 avg_d=3.282 std_dev=3.282
O5'	A	0, 0.000, 3.506, 7.012, 7.012 max_d=7.012 avg_d=3.506 std_dev=3.506
OP1	B	0, 0.000, 3.817, 7.634, 7.634 max_d=7.634 avg_d=3.817 std_dev=3.817
OP2	A	0, 0.000, 4.634, 9.268, 9.268 max_d=9.268 avg_d=4.634 std_dev=4.634
P	A	0, 0.000, 4.741, 9.483, 9.483 max_d=9.483 avg_d=4.741 std_dev=4.741
OP1	A	0, 0.000, 5.260, 10.520, 10.520 max_d=10.520 avg_d=5.260 std_dev=5.260

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.24	0.03	0.00	0.14	0.15	0.24	0.16
C2	0.00	0.00	0.26	0.26	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.02	0.01	0.18	0.19	0.57	0.29	0.31
C2'	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.01	0.19	0.17	0.24	0.02	0.18	0.46	0.01	0.01	0.01	0.02	0.15	0.01	0.03	0.08
C3'	0.01	0.26	0.00	0.00	0.28	0.00	0.21	0.01	0.15	0.17	0.30	0.27	0.02	0.01	0.31	0.01	0.31	0.13	0.13	0.16
C4	0.02	0.01	0.00	0.28	0.00	0.17	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.02	0.32	0.06	0.01	0.06	0.59	1.49	0.79	0.93
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.17	0.00	0.26	0.00	0.26	0.09	0.05	0.13	0.22	0.00	0.18	0.01	0.00	0.37	0.09	0.09
C5	0.03	0.01	0.19	0.21	0.01	0.26	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.02	0.53	0.03	0.02	0.23	0.78	1.70	1.00	1.15
C5'	0.04	0.04	0.17	0.01	0.19	0.00	0.31	0.00	0.28	0.06	0.04	0.18	0.04	0.16	0.22	0.01	0.00	0.20	0.13	0.01
C6	0.03	0.00	0.24	0.15	0.01	0.26	0.00	0.28	0.00	0.00	0.01	0.00	0.51	0.04	0.02	0.28	0.70	1.31	0.84	0.95
N1	0.01	0.00	0.02	0.17	0.01	0.09	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.17	0.07	0.02	0.02	0.35	0.69	0.45	0.48
N3	0.01	0.01	0.18	0.30	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.04	0.00	0.10	0.34	0.99	0.48	0.56
O2	0.00	0.00	0.46	0.27	0.02	0.13	0.02	0.18	0.00	0.00	0.02	0.00	0.40	0.02	0.03	0.34	0.06	0.14	0.03	0.01
O2'	0.01	0.08	0.01	0.02	0.32	0.22	0.53	0.04	0.51	0.17	0.08	0.40	0.00	0.03	0.33	0.15	0.25	0.02	0.17	0.17
O3'	0.24	0.02	0.01	0.01	0.06	0.00	0.03	0.16	0.04	0.07	0.04	0.02	0.03	0.00	0.10	0.15	0.35	0.31	0.24	0.17
O4	0.03	0.01	0.01	0.31	0.01	0.18	0.02	0.22	0.02	0.02	0.00	0.03	0.33	0.10	0.00	0.07	0.64	1.70	0.87	1.04
O4'	0.00	0.18	0.02	0.01	0.06	0.01	0.23	0.01	0.28	0.02	0.10	0.34	0.15	0.15	0.07	0.00	0.00	0.02	0.24	0.04
O5'	0.14	0.19	0.15	0.31	0.59	0.00	0.78	0.00	0.70	0.35	0.34	0.06	0.25	0.35	0.64	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.15	0.57	0.01	0.13	1.49	0.37	1.70	0.20	1.31	0.69	0.99	0.14	0.02	0.31	1.70	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.29	0.03	0.13	0.79	0.09	1.00	0.13	0.84	0.45	0.48	0.03	0.17	0.24	0.87	0.24	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.31	0.08	0.16	0.93	0.09	1.15	0.01	0.95	0.48	0.56	0.01	0.17	0.17	1.04	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.46	0.07	0.24	0.31	0.20	0.40	0.12	0.16	0.13	0.41	0.21	0.11	0.32	0.28	0.38	0.22	0.44	0.56	0.43	0.33	1.05	0.22
C2	0.39	0.04	0.24	0.18	0.22	0.09	0.18	0.27	0.03	0.37	0.15	0.13	0.14	0.29	0.35	0.40	0.37	0.26	0.07	0.03	1.41	0.57
C2'	0.01	0.18	0.31	0.22	0.13	0.06	0.23	0.34	0.32	0.12	0.27	0.11	0.46	0.23	0.07	0.34	0.04	0.15	0.17	0.40	1.67	0.88
C3'	0.27	0.14	0.07	0.12	0.01	0.37	0.19	0.16	0.38	0.03	0.33	0.00	0.64	0.17	0.12	0.20	0.29	0.53	0.28	0.03	1.20	0.44
C4	0.34	0.10	0.16	0.07	0.14	0.09	0.03	0.57	0.17	0.24	0.25	0.09	0.27	0.12	0.27	0.40	0.35	0.11	0.28	0.41	1.71	0.94
C4'	0.38	0.36	0.13	0.37	0.05	0.65	0.25	0.57	0.58	0.18	0.59	0.12	0.89	0.09	0.19	0.07	0.46	0.72	0.76	0.61	0.65	0.12
C5	0.37	0.16	0.09	0.10	0.08	0.09	0.09	0.36	0.33	0.20	0.34	0.03	0.47	0.02	0.25	0.22	0.37	0.32	0.17	0.44	1.70	0.92
C5'	0.20	0.60	0.08	0.28	0.33	0.67	0.60	0.66	0.93	0.13	0.87	0.34	1.30	0.49	0.06	0.38	0.36	0.69	0.77	0.55	0.59	0.14
C6	0.40	0.15	0.12	0.18	0.11	0.25	0.04	0.11	0.31	0.27	0.32	0.05	0.50	0.08	0.29	0.16	0.39	0.46	0.09	0.17	1.48	0.66
N1	0.41	0.09	0.20	0.21	0.17	0.24	0.08	0.09	0.17	0.35	0.25	0.09	0.36	0.22	0.34	0.26	0.39	0.42	0.18	0.06	1.34	0.50
N3	0.36	0.03	0.23	0.13	0.21	0.04	0.16	0.47	0.03	0.32	0.14	0.13	0.13	0.25	0.32	0.47	0.35	0.13	0.13	0.18	1.56	0.75
O2	0.38	0.00	0.28	0.20	0.24	0.08	0.24	0.25	0.07	0.40	0.07	0.14	0.02	0.35	0.36	0.45	0.36	0.23	0.12	0.17	1.32	0.47
O2'	0.11	0.20	0.42	0.41	0.15	0.29	0.16	0.59	0.19	0.11	0.20	0.17	0.19	0.12	0.11	0.41	0.23	0.03	0.39	0.60	1.80	1.08
O3'	0.23	0.27	0.09	0.09	0.08	0.32	0.24	0.11	0.45	0.03	0.44	0.10	0.68	0.17	0.08	0.21	0.26	0.48	0.25	0.05	1.18	0.47
O4	0.29	0.08	0.15	0.00	0.12	0.26	0.02	0.80	0.14	0.18	0.20	0.09	0.20	0.08	0.22	0.48	0.32	0.07	0.49	0.58	1.78	1.09
O4'	0.54	0.31	0.36	0.53	0.10	0.72	0.05	0.61	0.46	0.45	0.55	0.03	0.77	0.20	0.39	0.23	0.60	0.79	0.88	0.83	0.54	0.28
O5'	0.40	0.51	0.13	0.53	0.21	0.92	0.54	0.91	0.92	0.03	0.85	0.21	1.37	0.43	0.08	0.18	0.62	0.91	0.99	0.73	0.41	0.34
OP1	1.67	0.49	1.38	1.89	0.87	2.33	0.38	2.23	0.11	0.96	0.01	0.91	0.70	0.42	1.22	1.02	2.06	2.27	2.15	1.55	0.65	1.37
OP2	0.68	0.35	0.41	0.97	0.03	1.54	0.41	1.68	0.78	0.13	0.70	0.02	1.21	0.33	0.29	0.09	1.01	1.41	1.64	1.26	0.43	1.04
P	0.84	0.23	0.57	1.08	0.11	1.55	0.29	1.57	0.72	0.27	0.63	0.12	1.21	0.20	0.44	0.17	1.17	1.47	1.57	1.16	0.20	0.89

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.20	0.60	0.02
C2	0.00	0.00	0.23	0.00	0.00	0.39	0.00	0.63	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.63	0.10	0.45	0.24	0.07	1.34	0.50
C2'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.13	0.01	0.07	0.05	0.12	0.11	0.18	0.22	0.09	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.16	0.03	0.54	0.08
C3'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.21	0.12	0.18	0.02
C4	0.01	0.00	0.13	0.00	0.00	0.19	0.01	0.34	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.33	0.05	0.23	0.03	0.23	1.14	0.28
C4'	0.01	0.39	0.01	0.00	0.19	0.00	0.09	0.00	0.18	0.19	0.31	0.36	0.12	0.10	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.05	0.10	0.03
C5	0.02	0.00	0.07	0.01	0.01	0.09	0.00	0.23	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.18	0.03	0.07	0.09	0.37	1.18	0.21
C5'	0.04	0.63	0.05	0.00	0.34	0.00	0.23	0.00	0.37	0.19	0.55	0.57	0.29	0.06	0.09	0.05	0.04	0.00	0.00	0.01	0.10	0.02
C6	0.02	0.01	0.12	0.01	0.01	0.18	0.00	0.37	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.31	0.06	0.17	0.00	0.30	1.31	0.33
C8	0.03	0.01	0.11	0.02	0.01	0.19	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.27	0.03	0.27	0.41	0.58	0.76	0.15
N1	0.01	0.00	0.18	0.00	0.00	0.31	0.01	0.55	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.51	0.08	0.34	0.15	0.16	1.39	0.46
N3	0.00	0.00	0.22	0.00	0.00	0.36	0.00	0.57	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.60	0.10	0.46	0.21	0.08	1.21	0.42
N6	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.12	0.00	0.29	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.22	0.05	0.09	0.07	0.39	1.29	0.28
N7	0.03	0.00	0.04	0.02	0.00	0.10	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.12	0.01	0.17	0.33	0.59	0.96	0.03
N9	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.09	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.14	0.33	0.87	0.07
O2'	0.01	0.63	0.00	0.01	0.33	0.00	0.18	0.05	0.31	0.27	0.51	0.60	0.22	0.12	0.03	0.00	0.01	0.01	0.22	0.12	0.60	0.12
O3'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.05	0.02	0.03	0.04	0.06	0.03	0.08	0.10	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.17	0.12	0.14	0.00
O4'	0.01	0.45	0.01	0.00	0.23	0.00	0.07	0.00	0.17	0.27	0.34	0.46	0.09	0.17	0.01	0.01	0.03	0.00	0.23	0.30	0.34	0.07
O5'	0.08	0.24	0.16	0.21	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.41	0.15	0.21	0.07	0.33	0.14	0.22	0.17	0.23	0.00	0.00	0.00	0.01
OP1	0.20	0.07	0.03	0.12	0.23	0.05	0.37	0.01	0.30	0.58	0.16	0.08	0.39	0.59	0.33	0.12	0.12	0.30	0.00	0.00	0.01	0.01
OP2	0.60	1.34	0.54	0.18	1.14	0.10	1.18	0.10	1.31	0.76	1.39	1.21	1.29	0.96	0.87	0.60	0.14	0.34	0.00	0.01	0.00	0.01
P	0.02	0.50	0.08	0.02	0.28	0.03	0.21	0.02	0.33	0.15	0.46	0.42	0.28	0.03	0.07	0.12	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00