Doublet Group distance statistics: 54556

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.000, 0.022, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C2	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C1'	A	0, 0.000, 0.025, 0.049, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.025 std_dev=0.025
C6	A	0, 0.000, 0.025, 0.050, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.025
O2	A	0, 0.000, 0.034, 0.068, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.034 std_dev=0.034
O4	A	0, 0.000, 0.067, 0.133, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.067 std_dev=0.067
C3'	A	0, 0.000, 0.088, 0.176, 0.176 max_d=0.176 avg_d=0.088 std_dev=0.088
C2'	A	0, 0.000, 0.115, 0.230, 0.230 max_d=0.230 avg_d=0.115 std_dev=0.115
O4'	A	0, 0.000, 0.195, 0.391, 0.391 max_d=0.391 avg_d=0.195 std_dev=0.195
O3'	A	0, 0.000, 0.231, 0.461, 0.461 max_d=0.461 avg_d=0.231 std_dev=0.231
C4'	A	0, 0.000, 0.261, 0.521, 0.521 max_d=0.521 avg_d=0.261 std_dev=0.261
O2'	A	0, 0.000, 0.288, 0.575, 0.575 max_d=0.575 avg_d=0.288 std_dev=0.288
C5'	A	0, 0.000, 0.419, 0.838, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.419 std_dev=0.419
C6	B	0, 0.000, 0.420, 0.841, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.420 std_dev=0.420
C2	B	0, 0.000, 0.424, 0.848, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.424 std_dev=0.424
N3	B	0, 0.000, 0.434, 0.869, 0.869 max_d=0.869 avg_d=0.434 std_dev=0.434
N6	B	0, 0.000, 0.435, 0.871, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.435 std_dev=0.435
C5	B	0, 0.000, 0.439, 0.877, 0.877 max_d=0.877 avg_d=0.439 std_dev=0.439
N1	B	0, 0.000, 0.446, 0.892, 0.892 max_d=0.892 avg_d=0.446 std_dev=0.446
C4	B	0, 0.000, 0.466, 0.932, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.466 std_dev=0.466
N7	B	0, 0.000, 0.494, 0.988, 0.988 max_d=0.988 avg_d=0.494 std_dev=0.494
O5'	A	0, 0.000, 0.521, 1.041, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.521 std_dev=0.521
P	A	0, 0.000, 0.560, 1.120, 1.120 max_d=1.120 avg_d=0.560 std_dev=0.560
N9	B	0, 0.000, 0.594, 1.188, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.594 std_dev=0.594
OP1	A	0, 0.000, 0.597, 1.194, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.597 std_dev=0.597
C8	B	0, 0.000, 0.599, 1.197, 1.197 max_d=1.197 avg_d=0.599 std_dev=0.599
C1'	B	0, 0.000, 0.762, 1.524, 1.524 max_d=1.524 avg_d=0.762 std_dev=0.762
O4'	B	0, 0.000, 1.163, 2.326, 2.326 max_d=2.326 avg_d=1.163 std_dev=1.163
O2'	B	0, 0.000, 1.232, 2.465, 2.465 max_d=2.465 avg_d=1.232 std_dev=1.232
OP2	A	0, 0.000, 1.364, 2.728, 2.728 max_d=2.728 avg_d=1.364 std_dev=1.364
C2'	B	0, 0.000, 1.376, 2.752, 2.752 max_d=2.752 avg_d=1.376 std_dev=1.376
O5'	B	0, 0.000, 1.573, 3.146, 3.146 max_d=3.146 avg_d=1.573 std_dev=1.573
C4'	B	0, 0.000, 1.709, 3.417, 3.417 max_d=3.417 avg_d=1.709 std_dev=1.709
C3'	B	0, 0.000, 1.749, 3.498, 3.498 max_d=3.498 avg_d=1.749 std_dev=1.749
C5'	B	0, 0.000, 1.973, 3.946, 3.946 max_d=3.946 avg_d=1.973 std_dev=1.973
P	B	0, 0.000, 2.135, 4.270, 4.270 max_d=4.270 avg_d=2.135 std_dev=2.135
O3'	B	0, 0.000, 2.137, 4.274, 4.274 max_d=4.274 avg_d=2.137 std_dev=2.137
OP1	B	0, 0.000, 2.499, 4.999, 4.999 max_d=4.999 avg_d=2.499 std_dev=2.499
OP2	B	0, 0.000, 2.646, 5.292, 5.292 max_d=5.292 avg_d=2.646 std_dev=2.646

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.30	0.01
C2	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.07	0.01	0.03	0.01	0.09	0.54	0.11
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.02	0.00	0.00	0.04	0.03	0.04	0.14
C3'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.07	0.02	0.09	0.14
C4	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.05	0.00	0.04	0.03	0.16	0.78	0.25
C4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.08	0.02	0.01	0.06	0.01	0.02	0.06	0.01	0.02	0.01	0.10	0.02
C5	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.09	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.01	0.00	0.08	0.05	0.15	0.78	0.27
C5'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.01	0.13	0.00	0.11	0.04	0.04	0.04	0.00	0.04	0.11	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02
C6	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.00	0.00	0.08	0.03	0.09	0.65	0.19
N1	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.06	0.51	0.10
N3	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.13	0.67	0.18
O2	0.02	0.00	0.05	0.02	0.00	0.06	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.09	0.00	0.08	0.03	0.07	0.46	0.06
O2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.05	0.01	0.08	0.00	0.07	0.01	0.00	0.10	0.00	0.02	0.07	0.01	0.04	0.06	0.03	0.19
O3'	0.03	0.07	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01	0.04	0.00	0.03	0.07	0.09	0.02	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.05	0.12
O4	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.05	0.00	0.05	0.05	0.20	0.84	0.29
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.08	0.02	0.01	0.08	0.01	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.37	0.07
O5'	0.01	0.01	0.04	0.07	0.03	0.02	0.05	0.02	0.03	0.00	0.01	0.03	0.04	0.08	0.05	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00
OP1	0.00	0.09	0.03	0.02	0.16	0.01	0.15	0.02	0.09	0.06	0.13	0.07	0.06	0.01	0.20	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.30	0.54	0.04	0.09	0.78	0.10	0.78	0.03	0.65	0.51	0.67	0.46	0.03	0.05	0.84	0.37	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.01	0.11	0.14	0.14	0.25	0.02	0.27	0.02	0.19	0.10	0.18	0.06	0.19	0.12	0.29	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.05	0.18	0.27	0.11	0.59	0.03	0.73	0.06	0.12	0.05	0.12	0.17	0.04	0.17	0.15	0.55	0.55	0.54	0.90	0.54	0.64
C2	0.23	0.01	0.13	0.32	0.06	0.59	0.04	0.70	0.13	0.06	0.12	0.08	0.22	0.03	0.13	0.06	0.66	0.56	0.51	0.74	0.52	0.58
C2'	0.34	0.08	0.32	0.41	0.18	0.72	0.12	0.89	0.03	0.23	0.01	0.16	0.06	0.15	0.26	0.25	0.66	0.64	0.69	1.14	0.79	0.84
C3'	0.28	0.09	0.23	0.28	0.14	0.60	0.08	0.77	0.01	0.16	0.02	0.14	0.08	0.09	0.20	0.21	0.52	0.55	0.57	1.03	0.59	0.70
C4	0.30	0.04	0.26	0.41	0.10	0.63	0.04	0.69	0.12	0.07	0.08	0.14	0.20	0.04	0.17	0.17	0.73	0.60	0.52	0.72	0.51	0.57
C4'	0.19	0.11	0.11	0.10	0.10	0.42	0.04	0.55	0.01	0.07	0.05	0.14	0.09	0.01	0.12	0.17	0.33	0.41	0.37	0.82	0.27	0.46
C5	0.36	0.14	0.36	0.41	0.21	0.64	0.09	0.74	0.01	0.18	0.03	0.22	0.12	0.07	0.27	0.31	0.66	0.60	0.58	0.89	0.54	0.65
C5'	0.17	0.18	0.14	0.03	0.14	0.33	0.10	0.45	0.11	0.08	0.16	0.18	0.06	0.05	0.13	0.23	0.22	0.32	0.30	0.82	0.15	0.39
C6	0.33	0.14	0.31	0.35	0.20	0.62	0.11	0.74	0.02	0.19	0.04	0.21	0.10	0.10	0.25	0.28	0.60	0.58	0.58	0.95	0.55	0.67
N1	0.28	0.06	0.21	0.32	0.13	0.60	0.03	0.73	0.06	0.13	0.04	0.14	0.17	0.04	0.19	0.17	0.61	0.57	0.55	0.87	0.54	0.63
N3	0.24	0.02	0.15	0.36	0.04	0.60	0.07	0.67	0.16	0.04	0.14	0.07	0.23	0.06	0.11	0.06	0.72	0.57	0.50	0.67	0.51	0.55
O2	0.19	0.06	0.06	0.29	0.01	0.57	0.07	0.67	0.16	0.03	0.16	0.03	0.24	0.05	0.09	0.02	0.65	0.54	0.49	0.69	0.51	0.55
O2'	0.41	0.04	0.39	0.57	0.19	0.88	0.13	1.08	0.00	0.29	0.04	0.15	0.08	0.20	0.31	0.27	0.85	0.77	0.86	1.27	1.05	1.03
O3'	0.28	0.05	0.20	0.30	0.11	0.64	0.03	0.80	0.06	0.14	0.05	0.12	0.16	0.05	0.18	0.17	0.57	0.60	0.58	0.98	0.61	0.70
O4	0.29	0.01	0.27	0.47	0.04	0.64	0.10	0.65	0.16	0.00	0.11	0.09	0.21	0.11	0.12	0.15	0.81	0.60	0.48	0.60	0.47	0.51
O4'	0.18	0.10	0.08	0.09	0.09	0.41	0.01	0.53	0.04	0.04	0.02	0.13	0.15	0.02	0.11	0.13	0.35	0.41	0.36	0.74	0.24	0.43
O5'	0.34	0.34	0.37	0.25	0.33	0.50	0.31	0.63	0.32	0.29	0.33	0.34	0.29	0.28	0.32	0.43	0.43	0.46	0.50	1.10	0.41	0.63
OP1	0.28	0.24	0.42	0.26	0.26	0.44	0.28	0.59	0.27	0.29	0.25	0.24	0.28	0.30	0.27	0.44	0.36	0.33	0.50	1.27	0.55	0.73
OP2	0.65	0.59	0.60	0.79	0.67	0.51	0.68	0.34	0.63	0.70	0.58	0.63	0.61	0.71	0.68	0.49	0.69	0.55	0.46	0.25	0.51	0.26
P	0.01	0.01	0.08	0.08	0.02	0.17	0.03	0.32	0.02	0.05	0.01	0.00	0.03	0.06	0.02	0.14	0.05	0.11	0.19	0.86	0.15	0.36

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.21	0.00	0.14	0.08	0.03	0.11
C2	0.01	0.00	0.24	0.17	0.01	0.03	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.11	0.14	0.13	0.22	0.10	0.10
C2'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.12	0.01	0.07	0.16	0.13	0.11	0.20	0.22	0.10	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.34	0.11	0.15	0.26
C3'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.17	0.00	0.22	0.01	0.24	0.18	0.22	0.13	0.27	0.23	0.14	0.01	0.00	0.02	0.02	0.49	0.13	0.15
C4	0.00	0.01	0.12	0.17	0.00	0.01	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.07	0.08	0.13	0.27	0.10	0.12
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.02	0.03	0.01	0.05	0.02	0.22	0.00	0.01	0.01	0.31	0.12	0.05
C5	0.01	0.01	0.07	0.22	0.00	0.01	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.13	0.03	0.05	0.11	0.40	0.17	0.12
C5'	0.07	0.13	0.16	0.01	0.11	0.00	0.10	0.00	0.11	0.06	0.13	0.12	0.11	0.08	0.08	0.05	0.17	0.01	0.01	0.24	0.27	0.00
C6	0.01	0.00	0.13	0.24	0.01	0.00	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.04	0.08	0.10	0.39	0.19	0.11
C8	0.00	0.01	0.11	0.18	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.24	0.07	0.08	0.10	0.44	0.15	0.14
N1	0.01	0.00	0.20	0.22	0.01	0.02	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.12	0.11	0.31	0.15	0.10
N3	0.01	0.01	0.22	0.13	0.00	0.03	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.15	0.14	0.14	0.19	0.06	0.11
N6	0.01	0.00	0.10	0.27	0.01	0.01	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.10	0.06	0.08	0.47	0.24	0.11
N7	0.00	0.01	0.04	0.23	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.23	0.10	0.03	0.09	0.51	0.22	0.14
N9	0.00	0.01	0.00	0.14	0.00	0.02	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.06	0.00	0.13	0.26	0.07	0.13
O2'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.05	0.22	0.13	0.05	0.08	0.24	0.02	0.10	0.12	0.23	0.12	0.00	0.03	0.13	0.24	0.09	0.12	0.21
O3'	0.21	0.11	0.01	0.00	0.07	0.00	0.03	0.17	0.04	0.07	0.02	0.15	0.10	0.10	0.06	0.03	0.00	0.16	0.18	0.90	0.30	0.42
O4'	0.00	0.14	0.00	0.02	0.08	0.01	0.05	0.01	0.08	0.08	0.12	0.14	0.06	0.03	0.00	0.13	0.16	0.00	0.04	0.10	0.03	0.04
O5'	0.14	0.13	0.34	0.02	0.13	0.01	0.11	0.01	0.10	0.10	0.11	0.14	0.08	0.09	0.13	0.24	0.18	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.08	0.22	0.11	0.49	0.27	0.31	0.40	0.24	0.39	0.44	0.31	0.19	0.47	0.51	0.26	0.09	0.90	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.03	0.10	0.15	0.13	0.10	0.12	0.17	0.27	0.19	0.15	0.15	0.06	0.24	0.22	0.07	0.12	0.30	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.10	0.26	0.15	0.12	0.05	0.12	0.00	0.11	0.14	0.10	0.11	0.11	0.14	0.13	0.21	0.42	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00