Doublet Group distance statistics: 54561

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.014, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.000, 0.017, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C6	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C1'	A	0, 0.000, 0.029, 0.058, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.029
C2	A	0, 0.000, 0.029, 0.058, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.029
N1	A	0, 0.000, 0.033, 0.066, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.033 std_dev=0.033
O2	A	0, 0.000, 0.039, 0.078, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.039 std_dev=0.039
O4	A	0, 0.000, 0.061, 0.123, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.061 std_dev=0.061
N1	B	0, 0.000, 0.148, 0.296, 0.296 max_d=0.296 avg_d=0.148 std_dev=0.148
C6	B	0, 0.000, 0.237, 0.474, 0.474 max_d=0.474 avg_d=0.237 std_dev=0.237
C2'	A	0, 0.000, 0.304, 0.609, 0.609 max_d=0.609 avg_d=0.304 std_dev=0.304
C5	B	0, 0.000, 0.341, 0.683, 0.683 max_d=0.683 avg_d=0.341 std_dev=0.341
O4'	A	0, 0.000, 0.363, 0.727, 0.727 max_d=0.727 avg_d=0.363 std_dev=0.363
C4'	B	0, 0.000, 0.365, 0.731, 0.731 max_d=0.731 avg_d=0.365 std_dev=0.365
C2	B	0, 0.000, 0.372, 0.743, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.372 std_dev=0.372
C4	B	0, 0.000, 0.500, 1.000, 1.000 max_d=1.000 avg_d=0.500 std_dev=0.500
N7	B	0, 0.000, 0.514, 1.029, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.514 std_dev=0.514
N6	B	0, 0.000, 0.525, 1.050, 1.050 max_d=1.050 avg_d=0.525 std_dev=0.525
N3	B	0, 0.000, 0.573, 1.147, 1.147 max_d=1.147 avg_d=0.573 std_dev=0.573
O4'	B	0, 0.000, 0.595, 1.191, 1.191 max_d=1.191 avg_d=0.595 std_dev=0.595
C5'	A	0, 0.000, 0.637, 1.275, 1.275 max_d=1.275 avg_d=0.637 std_dev=0.637
P	A	0, 0.000, 0.654, 1.307, 1.307 max_d=1.307 avg_d=0.654 std_dev=0.654
C8	B	0, 0.000, 0.659, 1.319, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.659 std_dev=0.659
C4'	A	0, 0.000, 0.686, 1.372, 1.372 max_d=1.372 avg_d=0.686 std_dev=0.686
N9	B	0, 0.000, 0.715, 1.430, 1.430 max_d=1.430 avg_d=0.715 std_dev=0.715
O2'	A	0, 0.000, 0.750, 1.499, 1.499 max_d=1.499 avg_d=0.750 std_dev=0.750
OP2	A	0, 0.000, 0.843, 1.686, 1.686 max_d=1.686 avg_d=0.843 std_dev=0.843
C3'	A	0, 0.000, 0.896, 1.793, 1.793 max_d=1.793 avg_d=0.896 std_dev=0.896
O5'	A	0, 0.000, 0.903, 1.805, 1.805 max_d=1.805 avg_d=0.903 std_dev=0.903
OP1	A	0, 0.000, 1.004, 2.009, 2.009 max_d=2.009 avg_d=1.004 std_dev=1.004
C1'	B	0, 0.000, 1.006, 2.012, 2.012 max_d=2.012 avg_d=1.006 std_dev=1.006
C3'	B	0, 0.000, 1.115, 2.231, 2.231 max_d=2.231 avg_d=1.115 std_dev=1.115
O3'	B	0, 0.000, 1.282, 2.564, 2.564 max_d=2.564 avg_d=1.282 std_dev=1.282
O5'	B	0, 0.000, 1.548, 3.095, 3.095 max_d=3.095 avg_d=1.548 std_dev=1.548
O3'	A	0, 0.000, 1.566, 3.131, 3.131 max_d=3.131 avg_d=1.566 std_dev=1.566
C5'	B	0, 0.000, 1.576, 3.151, 3.151 max_d=3.151 avg_d=1.576 std_dev=1.576
C2'	B	0, 0.000, 1.752, 3.503, 3.503 max_d=3.503 avg_d=1.752 std_dev=1.752
P	B	0, 0.000, 2.430, 4.860, 4.860 max_d=4.860 avg_d=2.430 std_dev=2.430
OP2	B	0, 0.000, 2.567, 5.134, 5.134 max_d=5.134 avg_d=2.567 std_dev=2.567
OP1	B	0, 0.000, 2.739, 5.477, 5.477 max_d=5.477 avg_d=2.739 std_dev=2.739
O2'	B	0, 0.000, 2.825, 5.650, 5.650 max_d=5.650 avg_d=2.825 std_dev=2.825

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.07	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.27	0.02	0.00	0.05	0.13	0.52	0.30
C2	0.03	0.00	0.07	0.11	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.18	0.23	0.02	0.09	0.09	0.06	0.44	0.28
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.02	0.02	0.17	0.04	0.01	0.06	0.11	0.00	0.01	0.03	0.01	0.32	0.09	0.71	0.43
C3'	0.02	0.11	0.00	0.00	0.29	0.00	0.35	0.01	0.31	0.16	0.19	0.02	0.01	0.00	0.32	0.01	0.05	0.57	0.06	0.10
C4	0.01	0.01	0.03	0.29	0.00	0.10	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.30	0.06	0.00	0.01	0.33	0.03	0.24	0.18
C4'	0.00	0.01	0.02	0.00	0.10	0.00	0.16	0.00	0.16	0.05	0.03	0.09	0.26	0.00	0.11	0.00	0.01	0.45	0.12	0.03
C5	0.00	0.01	0.02	0.35	0.00	0.16	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.29	0.19	0.01	0.05	0.39	0.08	0.22	0.18
C5'	0.07	0.07	0.17	0.01	0.05	0.00	0.10	0.00	0.07	0.03	0.02	0.12	0.08	0.18	0.07	0.01	0.00	0.27	0.08	0.00
C6	0.01	0.01	0.04	0.31	0.00	0.16	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.24	0.15	0.00	0.08	0.30	0.05	0.36	0.24
N1	0.01	0.00	0.01	0.16	0.01	0.05	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.10	0.01	0.01	0.11	0.03	0.47	0.30
N3	0.03	0.00	0.06	0.19	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.12	0.02	0.06	0.21	0.03	0.34	0.23
O2	0.05	0.00	0.11	0.02	0.01	0.09	0.01	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.43	0.02	0.14	0.01	0.11	0.49	0.29
O2'	0.00	0.18	0.00	0.01	0.30	0.26	0.29	0.08	0.24	0.18	0.25	0.09	0.00	0.03	0.32	0.16	0.24	0.25	0.82	0.36
O3'	0.27	0.23	0.01	0.00	0.06	0.00	0.19	0.18	0.15	0.10	0.12	0.43	0.03	0.00	0.08	0.18	0.18	1.20	0.34	0.55
O4	0.02	0.02	0.03	0.32	0.00	0.11	0.01	0.07	0.00	0.01	0.02	0.02	0.32	0.08	0.00	0.01	0.38	0.04	0.16	0.14
O4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.06	0.14	0.16	0.18	0.01	0.00	0.08	0.23	0.30	0.15
O5'	0.05	0.09	0.32	0.05	0.33	0.01	0.39	0.00	0.30	0.11	0.21	0.01	0.24	0.18	0.38	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.13	0.06	0.09	0.57	0.03	0.45	0.08	0.27	0.05	0.03	0.03	0.11	0.25	1.20	0.04	0.23	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.52	0.44	0.71	0.06	0.24	0.12	0.22	0.08	0.36	0.47	0.34	0.49	0.82	0.34	0.16	0.30	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.30	0.28	0.43	0.10	0.18	0.03	0.18	0.00	0.24	0.30	0.23	0.29	0.36	0.55	0.14	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.33	0.26	0.45	0.23	0.23	0.22	0.06	0.56	0.03	0.13	0.07	0.33	0.20	0.02	0.25	0.64	0.23	0.25	0.36	1.04	1.07	0.82
C2	0.34	0.18	0.21	0.03	0.25	0.25	0.15	0.59	0.07	0.22	0.09	0.26	0.01	0.14	0.30	0.42	0.02	0.19	0.41	1.16	1.25	0.92
C2'	0.29	0.28	0.37	0.10	0.21	0.34	0.08	0.77	0.02	0.11	0.13	0.32	0.12	0.02	0.22	0.62	0.12	0.32	0.59	1.31	1.31	1.09
C3'	0.39	0.53	0.55	0.32	0.29	0.16	0.04	0.58	0.00	0.02	0.27	0.53	0.27	0.12	0.25	0.78	0.38	0.21	0.47	1.28	1.20	1.01
C4	0.08	0.11	0.30	0.19	0.10	0.16	0.09	0.24	0.10	0.07	0.10	0.11	0.09	0.07	0.09	0.28	0.21	0.07	0.08	0.94	0.71	0.48
C4'	0.43	0.59	0.68	0.51	0.37	0.02	0.15	0.35	0.10	0.14	0.36	0.57	0.19	0.01	0.32	0.80	0.55	0.13	0.20	0.88	0.81	0.64
C5	0.04	0.13	0.22	0.10	0.05	0.17	0.01	0.23	0.05	0.04	0.10	0.10	0.02	0.07	0.02	0.27	0.14	0.14	0.04	0.82	0.58	0.39
C5'	0.33	0.53	0.56	0.48	0.30	0.01	0.10	0.24	0.09	0.06	0.36	0.49	0.18	0.04	0.24	0.58	0.50	0.14	0.08	0.74	0.61	0.47
C6	0.11	0.16	0.01	0.01	0.09	0.21	0.00	0.36	0.00	0.01	0.09	0.16	0.09	0.08	0.07	0.00	0.02	0.21	0.16	0.90	0.76	0.55
N1	0.24	0.19	0.20	0.07	0.18	0.24	0.06	0.52	0.01	0.10	0.08	0.24	0.10	0.02	0.19	0.32	0.06	0.24	0.32	1.05	1.04	0.77
N3	0.25	0.13	0.07	0.13	0.20	0.21	0.16	0.45	0.10	0.22	0.10	0.17	0.07	0.16	0.24	0.09	0.13	0.09	0.29	1.15	1.13	0.80
O2	0.48	0.19	0.44	0.10	0.32	0.27	0.19	0.75	0.07	0.30	0.07	0.33	0.01	0.19	0.40	0.78	0.11	0.19	0.57	1.26	1.46	1.12
O2'	0.44	0.06	0.52	0.18	0.22	0.26	0.08	0.74	0.08	0.26	0.10	0.22	0.23	0.13	0.33	0.86	0.18	0.19	0.49	1.15	1.24	0.98
O3'	0.92	0.94	1.14	0.85	0.73	0.33	0.39	0.17	0.28	0.42	0.57	1.01	0.09	0.21	0.71	1.46	0.96	0.27	0.10	0.97	0.90	0.71
O4	0.02	0.09	0.50	0.30	0.07	0.10	0.10	0.08	0.12	0.07	0.10	0.07	0.15	0.10	0.05	0.52	0.32	0.04	0.08	0.83	0.45	0.27
O4'	0.40	0.48	0.62	0.47	0.34	0.03	0.14	0.29	0.06	0.16	0.26	0.49	0.20	0.05	0.31	0.69	0.47	0.13	0.11	0.74	0.71	0.51
O5'	0.07	0.34	0.19	0.13	0.03	0.27	0.20	0.50	0.18	0.28	0.15	0.27	0.47	0.40	0.05	0.21	0.16	0.36	0.36	1.11	0.92	0.77
OP1	0.21	0.34	0.28	0.24	0.21	0.18	0.12	0.41	0.14	0.08	0.27	0.31	0.03	0.04	0.17	0.30	0.25	0.23	0.22	0.89	0.68	0.58
OP2	0.55	0.71	0.47	0.44	0.51	0.19	0.31	0.05	0.32	0.24	0.55	0.69	0.08	0.13	0.45	0.50	0.45	0.19	0.10	0.77	0.49	0.35
P	0.45	0.62	0.48	0.46	0.43	0.11	0.27	0.10	0.29	0.20	0.50	0.59	0.08	0.12	0.37	0.48	0.47	0.06	0.06	0.69	0.46	0.33

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.17	0.00	0.13	0.33	0.28	0.09
C2	0.01	0.00	0.50	0.36	0.00	0.26	0.01	0.34	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.42	0.26	0.46	0.12	0.42	0.43	0.30
C2'	0.00	0.50	0.00	0.01	0.28	0.02	0.16	0.02	0.27	0.20	0.41	0.49	0.21	0.07	0.02	0.00	0.01	0.02	0.23	0.75	0.45	0.45
C3'	0.01	0.36	0.01	0.00	0.32	0.01	0.38	0.03	0.42	0.24	0.41	0.31	0.45	0.33	0.22	0.02	0.01	0.02	0.26	0.45	0.17	0.28
C4	0.00	0.00	0.28	0.32	0.00	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.18	0.24	0.16	0.25	0.17	0.02
C4'	0.02	0.26	0.02	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.30	0.15	0.26	0.08	0.25	0.09	0.25	0.01	0.00	0.02	0.10	0.24	0.10
C5	0.00	0.01	0.16	0.38	0.00	0.08	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.12	0.25	0.11	0.37	0.05	0.13	0.23
C5'	0.02	0.34	0.02	0.03	0.02	0.01	0.19	0.00	0.07	0.53	0.17	0.33	0.20	0.48	0.19	0.21	0.11	0.01	0.00	0.18	0.11	0.01
C6	0.00	0.01	0.27	0.42	0.00	0.00	0.01	0.07	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.32	0.21	0.28	0.10	0.05	0.14
C8	0.00	0.01	0.20	0.24	0.01	0.30	0.01	0.53	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.51	0.09	0.23	0.69	0.14	0.47	0.55
N1	0.01	0.00	0.41	0.41	0.00	0.15	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.24	0.32	0.37	0.04	0.28	0.23	0.12
N3	0.01	0.00	0.49	0.31	0.00	0.26	0.01	0.33	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.42	0.18	0.46	0.12	0.44	0.47	0.31
N6	0.02	0.00	0.21	0.45	0.01	0.08	0.02	0.20	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.04	0.02	0.09	0.37	0.13	0.41	0.06	0.25	0.31
N7	0.00	0.02	0.07	0.33	0.00	0.25	0.01	0.48	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.42	0.20	0.11	0.66	0.18	0.52	0.56
N9	0.00	0.01	0.02	0.22	0.00	0.09	0.01	0.19	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.17	0.05	0.01	0.33	0.17	0.02	0.13
O2'	0.00	0.42	0.00	0.02	0.08	0.25	0.12	0.21	0.01	0.51	0.24	0.42	0.09	0.42	0.17	0.00	0.03	0.18	0.02	0.63	0.37	0.30
O3'	0.17	0.26	0.01	0.01	0.18	0.01	0.25	0.11	0.32	0.09	0.32	0.18	0.37	0.20	0.05	0.03	0.00	0.07	0.20	0.22	0.04	0.14
O4'	0.00	0.46	0.02	0.02	0.24	0.00	0.11	0.01	0.21	0.23	0.37	0.46	0.13	0.11	0.01	0.18	0.07	0.00	0.25	0.13	0.35	0.03
O5'	0.13	0.12	0.23	0.26	0.16	0.02	0.37	0.00	0.28	0.69	0.04	0.12	0.41	0.66	0.33	0.02	0.20	0.25	0.00	0.00	0.02	0.00
OP1	0.33	0.42	0.75	0.45	0.25	0.10	0.05	0.18	0.10	0.14	0.28	0.44	0.06	0.18	0.17	0.63	0.22	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.28	0.43	0.45	0.17	0.17	0.24	0.13	0.11	0.05	0.47	0.23	0.47	0.25	0.52	0.02	0.37	0.04	0.35	0.02	0.00	0.00	0.01
P	0.09	0.30	0.45	0.28	0.02	0.10	0.23	0.01	0.14	0.55	0.12	0.31	0.31	0.56	0.13	0.30	0.14	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00