Doublet Group distance statistics: 54568

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 10, 11, 9, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.006, 0.009, 0.012, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.006, 0.010, 0.014, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.003, 0.014, 0.024, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.004, 0.015, 0.025, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.015 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.008, 0.030, 0.051, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.030 std_dev=0.021
O4'	A	0, 0.017, 0.076, 0.136, 0.330 max_d=0.330 avg_d=0.076 std_dev=0.060
C2'	A	0, 0.030, 0.094, 0.159, 0.323 max_d=0.323 avg_d=0.094 std_dev=0.065
O4	A	0, 0.016, 0.087, 0.157, 0.295 max_d=0.295 avg_d=0.087 std_dev=0.071
C3'	A	0, 0.048, 0.137, 0.226, 0.516 max_d=0.516 avg_d=0.137 std_dev=0.089
C4'	A	0, 0.042, 0.135, 0.227, 0.497 max_d=0.497 avg_d=0.135 std_dev=0.092
C2	B	0, 0.168, 0.301, 0.434, 0.704 max_d=0.704 avg_d=0.301 std_dev=0.133
O2'	A	0, 0.103, 0.238, 0.373, 0.551 max_d=0.551 avg_d=0.238 std_dev=0.135
O3'	A	0, 0.073, 0.209, 0.345, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.209 std_dev=0.136
N1	B	0, 0.171, 0.314, 0.456, 0.603 max_d=0.603 avg_d=0.314 std_dev=0.143
O5'	A	0, 0.071, 0.216, 0.360, 0.880 max_d=0.880 avg_d=0.216 std_dev=0.145
C5'	A	0, 0.068, 0.217, 0.365, 0.854 max_d=0.854 avg_d=0.217 std_dev=0.149
O2	B	0, 0.230, 0.382, 0.534, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.382 std_dev=0.152
C6	B	0, 0.228, 0.384, 0.539, 0.789 max_d=0.789 avg_d=0.384 std_dev=0.155
N3	B	0, 0.146, 0.303, 0.461, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.303 std_dev=0.157
C5	B	0, 0.192, 0.351, 0.510, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.351 std_dev=0.159
C1'	B	0, 0.204, 0.365, 0.525, 0.699 max_d=0.699 avg_d=0.365 std_dev=0.160
C2'	B	0, 0.214, 0.377, 0.540, 0.677 max_d=0.677 avg_d=0.377 std_dev=0.163
P	A	0, 0.122, 0.286, 0.449, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.286 std_dev=0.163
C4	B	0, 0.117, 0.282, 0.447, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.282 std_dev=0.165
C3'	B	0, 0.250, 0.425, 0.600, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.425 std_dev=0.175
O3'	B	0, 0.239, 0.420, 0.601, 0.808 max_d=0.808 avg_d=0.420 std_dev=0.181
OP2	A	0, 0.144, 0.325, 0.507, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.325 std_dev=0.182
C4'	B	0, 0.219, 0.420, 0.621, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.420 std_dev=0.201
O4'	B	0, 0.217, 0.419, 0.621, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.419 std_dev=0.202
N4	B	0, 0.145, 0.347, 0.549, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.347 std_dev=0.202
O5'	B	0, 0.258, 0.463, 0.668, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.463 std_dev=0.205
O2'	B	0, 0.139, 0.350, 0.560, 0.975 max_d=0.975 avg_d=0.350 std_dev=0.211
OP1	A	0, 0.169, 0.391, 0.612, 1.246 max_d=1.246 avg_d=0.391 std_dev=0.222
C5'	B	0, 0.211, 0.442, 0.672, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.442 std_dev=0.230
P	B	0, 0.241, 0.477, 0.713, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.477 std_dev=0.236
OP2	B	0, 0.278, 0.521, 0.765, 1.282 max_d=1.282 avg_d=0.521 std_dev=0.244
OP1	B	0, 0.220, 0.565, 0.910, 1.667 max_d=1.667 avg_d=0.565 std_dev=0.345

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.10	0.10	0.06
C2	0.01	0.00	0.05	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.04	0.01	0.02	0.05	0.10	0.12	0.08
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.07	0.00	0.01	0.05	0.01	0.04	0.14	0.13	0.09
C3'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.02	0.06	0.02	0.03	0.06	0.02	0.01	0.04	0.01	0.03	0.15	0.14	0.09
C4	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.04	0.00	0.02	0.06	0.10	0.12	0.08
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.02	0.03	0.05	0.01	0.04	0.00	0.01	0.11	0.06	0.04
C5	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.02	0.07	0.10	0.12	0.08
C5'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.05	0.01	0.07	0.00	0.06	0.03	0.04	0.03	0.04	0.02	0.06	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.02	0.06	0.09	0.11	0.08
N1	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.09	0.11	0.07
N3	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.04	0.01	0.02	0.05	0.11	0.13	0.08
O2	0.02	0.00	0.07	0.06	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.08	0.01	0.03	0.05	0.11	0.12	0.08
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.05	0.05	0.03	0.04	0.03	0.02	0.07	0.10	0.00	0.04	0.06	0.04	0.03	0.16	0.12	0.08
O3'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.04	0.08	0.04	0.00	0.05	0.01	0.04	0.19	0.16	0.11
O4	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.05	0.00	0.03	0.06	0.12	0.13	0.09
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.03	0.00	0.05	0.08	0.08	0.05
O5'	0.04	0.05	0.04	0.03	0.06	0.01	0.07	0.01	0.06	0.04	0.05	0.05	0.03	0.04	0.06	0.05	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.10	0.10	0.14	0.15	0.10	0.11	0.10	0.07	0.09	0.09	0.11	0.11	0.16	0.19	0.12	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.12	0.13	0.14	0.12	0.06	0.12	0.02	0.11	0.11	0.13	0.12	0.12	0.16	0.13	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.08	0.09	0.09	0.08	0.04	0.08	0.01	0.08	0.07	0.08	0.08	0.08	0.11	0.09	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.09	0.07	0.08	0.10	0.08	0.14	0.14	0.12	0.06	0.09	0.11	0.18	0.06	0.07	0.06	0.17	0.15	0.12	0.12
C2	0.07	0.14	0.06	0.06	0.09	0.06	0.14	0.07	0.13	0.07	0.14	0.10	0.20	0.07	0.07	0.08	0.10	0.07	0.15	0.08
C2'	0.08	0.10	0.09	0.10	0.10	0.09	0.15	0.15	0.13	0.08	0.10	0.12	0.19	0.08	0.10	0.08	0.19	0.19	0.15	0.15
C3'	0.06	0.08	0.08	0.10	0.11	0.10	0.14	0.17	0.13	0.06	0.09	0.13	0.17	0.07	0.08	0.06	0.20	0.22	0.15	0.17
C4	0.06	0.10	0.06	0.06	0.10	0.06	0.17	0.08	0.13	0.06	0.11	0.13	0.16	0.06	0.06	0.06	0.10	0.07	0.18	0.09
C4'	0.05	0.08	0.08	0.10	0.11	0.12	0.13	0.19	0.11	0.07	0.09	0.13	0.15	0.06	0.06	0.08	0.20	0.24	0.14	0.17
C5	0.08	0.08	0.08	0.08	0.15	0.08	0.20	0.11	0.16	0.09	0.09	0.19	0.14	0.08	0.07	0.07	0.12	0.08	0.16	0.08
C5'	0.07	0.09	0.08	0.10	0.12	0.12	0.14	0.19	0.11	0.08	0.10	0.14	0.15	0.07	0.06	0.09	0.19	0.24	0.13	0.16
C6	0.08	0.08	0.09	0.09	0.16	0.09	0.20	0.12	0.17	0.10	0.10	0.18	0.14	0.09	0.08	0.08	0.14	0.10	0.14	0.09
N1	0.06	0.09	0.07	0.07	0.11	0.07	0.17	0.11	0.15	0.07	0.09	0.13	0.17	0.06	0.07	0.06	0.13	0.10	0.13	0.08
N3	0.06	0.13	0.05	0.06	0.09	0.06	0.15	0.07	0.13	0.07	0.15	0.11	0.19	0.06	0.07	0.07	0.09	0.08	0.18	0.09
O2	0.12	0.18	0.10	0.08	0.12	0.09	0.13	0.07	0.13	0.12	0.18	0.11	0.23	0.10	0.10	0.12	0.10	0.07	0.15	0.08
O2'	0.11	0.13	0.12	0.13	0.11	0.12	0.14	0.17	0.13	0.10	0.12	0.12	0.21	0.12	0.13	0.12	0.23	0.26	0.20	0.22
O3'	0.07	0.09	0.10	0.12	0.11	0.12	0.15	0.19	0.13	0.07	0.09	0.13	0.16	0.09	0.10	0.08	0.22	0.28	0.18	0.21
O4	0.06	0.13	0.06	0.06	0.10	0.06	0.14	0.07	0.11	0.07	0.15	0.13	0.18	0.07	0.06	0.06	0.09	0.09	0.20	0.10
O4'	0.06	0.08	0.08	0.10	0.11	0.12	0.13	0.18	0.11	0.07	0.09	0.13	0.16	0.07	0.07	0.09	0.18	0.20	0.13	0.14
O5'	0.09	0.09	0.10	0.11	0.15	0.13	0.17	0.19	0.14	0.10	0.11	0.17	0.14	0.09	0.08	0.11	0.19	0.21	0.13	0.15
OP1	0.10	0.10	0.10	0.10	0.17	0.11	0.20	0.15	0.17	0.11	0.12	0.21	0.15	0.10	0.09	0.10	0.16	0.19	0.11	0.13
OP2	0.14	0.14	0.14	0.14	0.22	0.14	0.24	0.16	0.21	0.16	0.17	0.26	0.16	0.14	0.12	0.14	0.17	0.15	0.13	0.11
P	0.09	0.10	0.10	0.11	0.17	0.12	0.19	0.17	0.16	0.11	0.12	0.20	0.14	0.09	0.07	0.11	0.17	0.19	0.11	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.05	0.07	0.07	0.06
C2	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.07	0.05	0.12	0.12	0.17	0.13
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.04	0.02	0.02	0.03	0.03	0.00	0.02	0.01	0.05	0.10	0.06	0.06
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.04	0.09	0.08	0.06
C4	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.05	0.02	0.11	0.14	0.21	0.14
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.05	0.04	0.10	0.15	0.19	0.14
C5'	0.02	0.07	0.03	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.07	0.04	0.07	0.07	0.11	0.03	0.03	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.05	0.05	0.10	0.13	0.15	0.12
N1	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.08	0.10	0.12	0.09
N3	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.06	0.03	0.12	0.14	0.21	0.14
N4	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.03	0.12	0.15	0.24	0.15
O2	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.09	0.09	0.14	0.14	0.18	0.15
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.05	0.01	0.08	0.03	0.08	0.03	0.05	0.05	0.10	0.00	0.06	0.01	0.06	0.12	0.09	0.08
O3'	0.04	0.07	0.02	0.01	0.05	0.02	0.05	0.03	0.05	0.05	0.06	0.05	0.09	0.06	0.00	0.02	0.04	0.11	0.09	0.07
O4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.03	0.03	0.09	0.01	0.02	0.00	0.05	0.05	0.07	0.05
O5'	0.05	0.12	0.05	0.04	0.11	0.01	0.10	0.01	0.10	0.08	0.12	0.12	0.14	0.06	0.04	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.07	0.12	0.10	0.09	0.14	0.06	0.15	0.05	0.13	0.10	0.14	0.15	0.14	0.12	0.11	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.17	0.06	0.08	0.21	0.03	0.19	0.02	0.15	0.12	0.21	0.24	0.18	0.09	0.09	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.13	0.06	0.06	0.14	0.02	0.14	0.01	0.12	0.09	0.14	0.15	0.15	0.08	0.07	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00