Doublet Group distance statistics: 54572

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 3, 4, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.003, 0.004, 0.004 max_d=0.004 avg_d=0.003 std_dev=0.001
C4	A	0, 0.004, 0.007, 0.010, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.007 std_dev=0.003
C6	A	0, 0.002, 0.005, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.005 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.004, 0.007, 0.010, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.007 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.004, 0.008, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.004, 0.009, 0.013, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.007, 0.013, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.013 std_dev=0.006
O4	A	0, 0.008, 0.014, 0.021, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.014 std_dev=0.006
O2	A	0, 0.010, 0.025, 0.040, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.025 std_dev=0.015
O3'	A	0, 0.107, 0.255, 0.403, 0.572 max_d=0.572 avg_d=0.255 std_dev=0.148
N1	B	0, 0.280, 0.458, 0.636, 0.664 max_d=0.664 avg_d=0.458 std_dev=0.178
C4'	A	0, 0.231, 0.410, 0.589, 0.708 max_d=0.708 avg_d=0.410 std_dev=0.179
C6	B	0, 0.284, 0.473, 0.661, 0.666 max_d=0.666 avg_d=0.473 std_dev=0.188
N3	B	0, 0.197, 0.386, 0.576, 0.734 max_d=0.734 avg_d=0.386 std_dev=0.189
C3'	A	0, 0.212, 0.406, 0.600, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.406 std_dev=0.194
C2	B	0, 0.210, 0.407, 0.604, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.407 std_dev=0.197
N4	B	0, 0.213, 0.420, 0.628, 0.772 max_d=0.772 avg_d=0.420 std_dev=0.208
C5	B	0, 0.206, 0.415, 0.624, 0.693 max_d=0.693 avg_d=0.415 std_dev=0.209
C4	B	0, 0.140, 0.356, 0.571, 0.729 max_d=0.729 avg_d=0.356 std_dev=0.216
C1'	B	0, 0.336, 0.556, 0.777, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.556 std_dev=0.220
O4'	A	0, 0.263, 0.486, 0.709, 0.877 max_d=0.877 avg_d=0.486 std_dev=0.223
O2	B	0, 0.233, 0.474, 0.716, 0.818 max_d=0.818 avg_d=0.474 std_dev=0.241
O4'	B	0, 0.340, 0.589, 0.838, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.589 std_dev=0.249
C2'	A	0, 0.306, 0.555, 0.804, 0.984 max_d=0.984 avg_d=0.555 std_dev=0.249
C4'	B	0, 0.414, 0.748, 1.082, 1.288 max_d=1.288 avg_d=0.748 std_dev=0.334
C5'	A	0, 0.407, 0.752, 1.097, 1.363 max_d=1.363 avg_d=0.752 std_dev=0.345
C2'	B	0, 0.530, 0.916, 1.303, 1.417 max_d=1.417 avg_d=0.916 std_dev=0.386
C3'	B	0, 0.541, 0.936, 1.332, 1.429 max_d=1.429 avg_d=0.936 std_dev=0.395
O2'	A	0, 0.553, 0.985, 1.417, 1.702 max_d=1.702 avg_d=0.985 std_dev=0.432
O3'	B	0, 0.497, 0.958, 1.418, 1.765 max_d=1.765 avg_d=0.958 std_dev=0.460
C5'	B	0, 0.682, 1.164, 1.646, 1.677 max_d=1.677 avg_d=1.164 std_dev=0.482
O5'	A	0, 0.531, 1.030, 1.528, 2.018 max_d=2.018 avg_d=1.030 std_dev=0.498
O2'	B	0, 0.577, 1.101, 1.625, 1.954 max_d=1.954 avg_d=1.101 std_dev=0.524
P	A	0, 0.639, 1.196, 1.754, 2.066 max_d=2.066 avg_d=1.196 std_dev=0.557
O5'	B	0, 0.792, 1.355, 1.918, 2.082 max_d=2.082 avg_d=1.355 std_dev=0.563
P	B	0, 1.001, 1.679, 2.357, 2.613 max_d=2.613 avg_d=1.679 std_dev=0.678
OP2	B	0, 1.018, 1.728, 2.437, 2.616 max_d=2.616 avg_d=1.728 std_dev=0.709
OP1	A	0, 0.732, 1.533, 2.333, 2.726 max_d=2.726 avg_d=1.533 std_dev=0.800
OP2	A	0, 0.694, 1.536, 2.378, 3.009 max_d=3.009 avg_d=1.536 std_dev=0.842
OP1	B	0, 1.251, 2.124, 2.997, 3.301 max_d=3.301 avg_d=2.124 std_dev=0.873

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.08	0.25	0.29	0.13
C2	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.06	0.00	0.07	0.18	0.35	0.35	0.08
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.03	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00	0.13	0.16	0.30	0.15
C3'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.10	0.13	0.15	0.10
C4	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.04	0.00	0.02	0.18	0.27	0.52	0.12
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.20	0.07	0.09
C5	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.03	0.00	0.03	0.13	0.20	0.58	0.18
C5'	0.02	0.08	0.05	0.01	0.07	0.00	0.05	0.00	0.04	0.05	0.09	0.11	0.04	0.05	0.08	0.01	0.00	0.06	0.16	0.01
C6	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.03	0.00	0.05	0.11	0.19	0.53	0.19
N1	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.04	0.00	0.01	0.13	0.26	0.40	0.13
N3	0.00	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.05	0.00	0.05	0.20	0.34	0.42	0.09
O2	0.02	0.00	0.05	0.03	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.14	0.08	0.00	0.11	0.20	0.43	0.26	0.08
O2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.04	0.06	0.03	0.08	0.14	0.00	0.02	0.04	0.01	0.14	0.16	0.33	0.15
O3'	0.04	0.06	0.01	0.00	0.04	0.01	0.03	0.05	0.03	0.04	0.05	0.08	0.02	0.00	0.04	0.03	0.08	0.20	0.09	0.07
O4	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.04	0.00	0.02	0.19	0.27	0.54	0.12
O4'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.05	0.11	0.01	0.03	0.02	0.00	0.07	0.26	0.26	0.16
O5'	0.08	0.18	0.13	0.10	0.18	0.01	0.13	0.00	0.11	0.13	0.20	0.20	0.14	0.08	0.19	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.25	0.35	0.16	0.13	0.27	0.20	0.20	0.06	0.19	0.26	0.34	0.43	0.16	0.20	0.27	0.26	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.29	0.35	0.30	0.15	0.52	0.07	0.58	0.16	0.53	0.40	0.42	0.26	0.33	0.09	0.54	0.26	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.13	0.08	0.15	0.10	0.12	0.09	0.18	0.01	0.19	0.13	0.09	0.08	0.15	0.07	0.12	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.19	0.18	0.18	0.14	0.20	0.12	0.35	0.12	0.14	0.18	0.15	0.23	0.32	0.44	0.21	0.43	0.50	0.18	0.31
C2	0.16	0.16	0.12	0.11	0.13	0.16	0.12	0.38	0.13	0.15	0.15	0.13	0.19	0.22	0.36	0.17	0.51	0.53	0.25	0.39
C2'	0.06	0.16	0.11	0.12	0.14	0.26	0.10	0.37	0.08	0.09	0.18	0.16	0.22	0.26	0.32	0.29	0.44	0.49	0.20	0.32
C3'	0.09	0.19	0.14	0.14	0.15	0.24	0.10	0.36	0.09	0.11	0.20	0.16	0.25	0.29	0.34	0.24	0.42	0.52	0.21	0.32
C4	0.10	0.12	0.09	0.10	0.09	0.19	0.07	0.36	0.05	0.07	0.11	0.10	0.15	0.16	0.25	0.22	0.52	0.40	0.23	0.34
C4'	0.13	0.22	0.19	0.18	0.15	0.21	0.10	0.35	0.10	0.14	0.21	0.15	0.29	0.34	0.41	0.19	0.40	0.53	0.22	0.33
C5	0.12	0.08	0.12	0.13	0.11	0.23	0.09	0.34	0.07	0.05	0.11	0.15	0.13	0.22	0.27	0.29	0.50	0.36	0.18	0.29
C5'	0.09	0.20	0.13	0.13	0.14	0.28	0.10	0.38	0.10	0.11	0.20	0.14	0.28	0.29	0.25	0.25	0.42	0.52	0.26	0.35
C6	0.09	0.12	0.13	0.13	0.13	0.23	0.10	0.34	0.08	0.06	0.15	0.16	0.16	0.27	0.32	0.30	0.47	0.39	0.15	0.27
N1	0.12	0.16	0.14	0.13	0.13	0.20	0.11	0.36	0.11	0.12	0.16	0.14	0.20	0.27	0.38	0.24	0.47	0.47	0.18	0.32
N3	0.12	0.14	0.08	0.08	0.12	0.16	0.11	0.38	0.11	0.12	0.14	0.12	0.16	0.16	0.29	0.16	0.53	0.48	0.27	0.39
O2	0.21	0.18	0.16	0.15	0.14	0.16	0.15	0.40	0.16	0.18	0.16	0.14	0.21	0.23	0.40	0.15	0.50	0.62	0.31	0.45
O2'	0.06	0.15	0.10	0.12	0.13	0.23	0.10	0.35	0.09	0.07	0.16	0.15	0.21	0.24	0.32	0.26	0.43	0.48	0.18	0.30
O3'	0.11	0.17	0.17	0.17	0.12	0.18	0.09	0.33	0.09	0.11	0.17	0.13	0.24	0.31	0.39	0.18	0.38	0.55	0.19	0.32
O4	0.12	0.15	0.11	0.11	0.07	0.19	0.04	0.35	0.05	0.10	0.14	0.09	0.19	0.14	0.21	0.20	0.52	0.38	0.27	0.36
O4'	0.18	0.24	0.23	0.21	0.16	0.21	0.11	0.36	0.11	0.16	0.22	0.16	0.31	0.38	0.50	0.20	0.43	0.51	0.20	0.32
O5'	0.20	0.22	0.12	0.13	0.20	0.45	0.21	0.47	0.23	0.19	0.23	0.21	0.29	0.24	0.01	0.43	0.50	0.57	0.28	0.40
OP1	0.08	0.14	0.08	0.09	0.09	0.43	0.22	0.51	0.24	0.08	0.12	0.09	0.30	0.32	0.01	0.35	0.51	0.69	0.23	0.44
OP2	0.46	0.80	0.52	0.19	0.71	0.06	0.55	0.10	0.47	0.59	0.82	0.75	0.93	0.79	0.01	0.18	0.10	0.26	0.42	0.21
P	0.11	0.31	0.18	0.01	0.22	0.24	0.11	0.27	0.08	0.17	0.31	0.23	0.43	0.38	0.00	0.15	0.26	0.39	0.14	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.00	0.13	0.07	0.23	0.11
C2	0.02	0.00	0.06	0.05	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.14	0.05	0.24	0.13	0.22	0.13
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.09	0.04	0.11	0.02	0.04	0.04	0.13	0.00	0.01	0.02	0.11	0.09	0.22	0.10
C3'	0.02	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.08	0.01	0.03	0.03	0.11	0.01	0.01	0.01	0.07	0.15	0.16	0.07
C4	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.06	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.10	0.03	0.34	0.16	0.16	0.17
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.08	0.04	0.04	0.06	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.09	0.18	0.08
C5	0.01	0.00	0.09	0.08	0.00	0.08	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.06	0.03	0.36	0.16	0.20	0.19
C5'	0.03	0.08	0.04	0.01	0.17	0.00	0.21	0.00	0.19	0.10	0.11	0.18	0.04	0.05	0.03	0.01	0.01	0.14	0.11	0.02
C6	0.00	0.00	0.11	0.08	0.00	0.08	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.05	0.04	0.33	0.13	0.17	0.14
N1	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.10	0.02	0.25	0.10	0.18	0.10
N3	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.13	0.05	0.29	0.16	0.19	0.15
N4	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.06	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.10	0.03	0.36	0.18	0.18	0.20
O2	0.02	0.00	0.13	0.11	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.23	0.18	0.08	0.19	0.14	0.28	0.14
O2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.05	0.00	0.08	0.05	0.09	0.03	0.10	0.06	0.23	0.00	0.05	0.01	0.11	0.10	0.23	0.11
O3'	0.09	0.14	0.01	0.01	0.10	0.03	0.06	0.03	0.05	0.10	0.13	0.10	0.18	0.05	0.00	0.06	0.03	0.14	0.17	0.08
O4'	0.00	0.05	0.02	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.05	0.03	0.08	0.01	0.06	0.00	0.05	0.07	0.28	0.17
O5'	0.13	0.24	0.11	0.07	0.34	0.01	0.36	0.01	0.33	0.25	0.29	0.36	0.19	0.11	0.03	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.07	0.13	0.09	0.15	0.16	0.09	0.16	0.14	0.13	0.10	0.16	0.18	0.14	0.10	0.14	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.23	0.22	0.22	0.16	0.16	0.18	0.20	0.11	0.17	0.18	0.19	0.18	0.28	0.23	0.17	0.28	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.13	0.10	0.07	0.17	0.08	0.19	0.02	0.14	0.10	0.15	0.20	0.14	0.11	0.08	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00