Doublet Group distance statistics: 54573

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 2, 1, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.004, 0.008, 0.013, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.007, 0.011, 0.016, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.011 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.003, 0.008, 0.012, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.006, 0.012, 0.018, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.007, 0.013, 0.018, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.013 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.012 std_dev=0.007
O2	A	0, 0.013, 0.033, 0.052, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.033 std_dev=0.019
O4	A	0, 0.018, 0.065, 0.112, 0.153 max_d=0.153 avg_d=0.065 std_dev=0.047
O4'	A	0, 0.030, 0.084, 0.139, 0.185 max_d=0.185 avg_d=0.084 std_dev=0.054
C2'	A	0, 0.031, 0.094, 0.157, 0.189 max_d=0.189 avg_d=0.094 std_dev=0.063
C4'	A	0, 0.015, 0.078, 0.141, 0.219 max_d=0.219 avg_d=0.078 std_dev=0.063
C3'	A	0, 0.023, 0.104, 0.184, 0.266 max_d=0.266 avg_d=0.104 std_dev=0.081
O2'	A	0, 0.068, 0.151, 0.234, 0.302 max_d=0.302 avg_d=0.151 std_dev=0.083
O3'	A	0, 0.022, 0.150, 0.279, 0.361 max_d=0.361 avg_d=0.150 std_dev=0.129
C5'	A	0, 0.060, 0.213, 0.367, 0.543 max_d=0.543 avg_d=0.213 std_dev=0.154
O5'	A	0, 0.081, 0.298, 0.516, 0.675 max_d=0.675 avg_d=0.298 std_dev=0.217
C5	B	0, 0.162, 0.388, 0.613, 0.728 max_d=0.728 avg_d=0.388 std_dev=0.225
C4	B	0, 0.252, 0.510, 0.769, 0.872 max_d=0.872 avg_d=0.510 std_dev=0.259
O4'	B	0, 0.199, 0.472, 0.746, 1.007 max_d=1.007 avg_d=0.472 std_dev=0.274
N1	B	0, 0.158, 0.437, 0.715, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.437 std_dev=0.279
C2	B	0, 0.252, 0.532, 0.811, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.532 std_dev=0.279
C6	B	0, 0.123, 0.408, 0.694, 0.854 max_d=0.854 avg_d=0.408 std_dev=0.285
N3	B	0, 0.299, 0.600, 0.902, 1.031 max_d=1.031 avg_d=0.600 std_dev=0.301
N4	B	0, 0.356, 0.672, 0.987, 1.106 max_d=1.106 avg_d=0.672 std_dev=0.316
O2	B	0, 0.343, 0.665, 0.986, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.665 std_dev=0.322
C1'	B	0, 0.218, 0.541, 0.864, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.541 std_dev=0.323
O5'	B	0, 0.283, 0.624, 0.965, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.624 std_dev=0.341
C5'	B	0, 0.226, 0.583, 0.940, 1.273 max_d=1.273 avg_d=0.583 std_dev=0.357
P	A	0, 0.136, 0.497, 0.857, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.497 std_dev=0.360
C4'	B	0, 0.244, 0.615, 0.987, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.615 std_dev=0.371
C2'	B	0, 0.245, 0.636, 1.027, 1.357 max_d=1.357 avg_d=0.636 std_dev=0.391
P	B	0, 0.293, 0.689, 1.085, 1.265 max_d=1.265 avg_d=0.689 std_dev=0.396
OP2	B	0, 0.328, 0.755, 1.181, 1.363 max_d=1.363 avg_d=0.755 std_dev=0.427
OP2	A	0, 0.211, 0.642, 1.073, 1.358 max_d=1.358 avg_d=0.642 std_dev=0.431
OP1	A	0, 0.299, 0.735, 1.171, 1.564 max_d=1.564 avg_d=0.735 std_dev=0.436
C3'	B	0, 0.277, 0.731, 1.184, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.731 std_dev=0.453
O2'	B	0, 0.099, 0.567, 1.036, 1.552 max_d=1.552 avg_d=0.567 std_dev=0.468
OP1	B	0, 0.310, 0.799, 1.287, 1.503 max_d=1.503 avg_d=0.799 std_dev=0.489
O3'	B	0, 0.345, 0.950, 1.556, 2.100 max_d=2.100 avg_d=0.950 std_dev=0.606

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.05	0.07	0.07	0.06
C2	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.01	0.03	0.04	0.05	0.08	0.04
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.03	0.04	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.06	0.08	0.07	0.06
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.06	0.04	0.03
C4	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.03	0.01	0.02	0.09	0.09	0.15	0.09
C4'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.02	0.01	0.03	0.11	0.12	0.17	0.12
C5'	0.02	0.04	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.05	0.03	0.04	0.07	0.03	0.02	0.05	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.02	0.01	0.04	0.10	0.12	0.15	0.12
N1	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.07	0.07	0.10	0.07
N3	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.01	0.02	0.06	0.06	0.12	0.06
O2	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.02	0.01	0.00	0.06	0.08	0.02	0.07	0.03	0.06	0.05	0.04
O2'	0.02	0.04	0.00	0.02	0.06	0.01	0.08	0.03	0.07	0.03	0.05	0.06	0.00	0.04	0.07	0.01	0.06	0.10	0.10	0.08
O3'	0.03	0.06	0.01	0.00	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.05	0.08	0.04	0.00	0.04	0.03	0.03	0.06	0.04	0.03
O4	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.04	0.00	0.03	0.09	0.08	0.17	0.10
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.02	0.07	0.01	0.03	0.03	0.00	0.05	0.06	0.06	0.05
O5'	0.05	0.04	0.06	0.03	0.09	0.01	0.11	0.00	0.10	0.07	0.06	0.03	0.06	0.03	0.09	0.05	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.07	0.05	0.08	0.06	0.09	0.04	0.12	0.05	0.12	0.07	0.06	0.06	0.10	0.06	0.08	0.06	0.02	0.00	0.00	0.01
OP2	0.07	0.08	0.07	0.04	0.15	0.02	0.17	0.01	0.15	0.10	0.12	0.05	0.10	0.04	0.17	0.06	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.06	0.04	0.06	0.03	0.09	0.02	0.12	0.01	0.12	0.07	0.06	0.04	0.08	0.03	0.10	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.09	0.11	0.14	0.09	0.10	0.10	0.06	0.13	0.09	0.12	0.13	0.11	0.12	0.11	0.12	0.12	0.15	0.26	0.18
C2	0.10	0.11	0.09	0.07	0.10	0.09	0.07	0.03	0.10	0.07	0.15	0.17	0.14	0.12	0.08	0.10	0.08	0.08	0.23	0.14
C2'	0.12	0.12	0.13	0.18	0.11	0.11	0.09	0.09	0.11	0.10	0.13	0.14	0.13	0.14	0.17	0.13	0.14	0.18	0.27	0.20
C3'	0.10	0.10	0.13	0.20	0.10	0.10	0.07	0.10	0.09	0.08	0.12	0.13	0.11	0.13	0.21	0.12	0.16	0.22	0.30	0.22
C4	0.12	0.06	0.13	0.08	0.06	0.11	0.11	0.04	0.13	0.09	0.09	0.12	0.12	0.16	0.20	0.07	0.06	0.06	0.16	0.09
C4'	0.09	0.08	0.12	0.17	0.09	0.08	0.07	0.07	0.09	0.07	0.10	0.12	0.09	0.13	0.18	0.13	0.16	0.20	0.29	0.21
C5	0.14	0.06	0.14	0.10	0.11	0.12	0.15	0.04	0.17	0.12	0.10	0.13	0.09	0.15	0.19	0.08	0.07	0.06	0.15	0.09
C5'	0.09	0.08	0.13	0.16	0.10	0.08	0.08	0.09	0.08	0.08	0.09	0.13	0.07	0.15	0.21	0.15	0.20	0.23	0.28	0.23
C6	0.13	0.08	0.13	0.09	0.11	0.10	0.15	0.02	0.18	0.11	0.11	0.13	0.10	0.14	0.12	0.11	0.08	0.07	0.19	0.11
N1	0.11	0.08	0.10	0.09	0.09	0.09	0.10	0.03	0.13	0.08	0.12	0.14	0.11	0.12	0.08	0.11	0.09	0.10	0.23	0.14
N3	0.11	0.10	0.11	0.05	0.07	0.10	0.08	0.03	0.11	0.08	0.14	0.14	0.15	0.15	0.14	0.09	0.07	0.06	0.21	0.11
O2	0.10	0.13	0.09	0.09	0.14	0.08	0.07	0.04	0.09	0.08	0.18	0.21	0.16	0.12	0.07	0.10	0.09	0.10	0.26	0.15
O2'	0.16	0.15	0.17	0.22	0.12	0.17	0.10	0.17	0.13	0.13	0.16	0.14	0.17	0.20	0.19	0.17	0.15	0.19	0.28	0.20
O3'	0.10	0.08	0.12	0.19	0.09	0.11	0.08	0.12	0.10	0.08	0.10	0.12	0.10	0.13	0.20	0.12	0.16	0.24	0.33	0.24
O4	0.13	0.07	0.15	0.12	0.05	0.12	0.11	0.06	0.13	0.10	0.06	0.09	0.14	0.19	0.26	0.07	0.07	0.10	0.15	0.09
O4'	0.10	0.08	0.12	0.15	0.09	0.09	0.09	0.05	0.12	0.09	0.10	0.13	0.09	0.13	0.14	0.13	0.13	0.16	0.26	0.18
O5'	0.10	0.07	0.14	0.17	0.07	0.09	0.06	0.10	0.06	0.08	0.06	0.09	0.08	0.15	0.22	0.16	0.22	0.24	0.27	0.24
OP1	0.09	0.07	0.13	0.14	0.10	0.12	0.10	0.21	0.07	0.07	0.08	0.13	0.08	0.16	0.24	0.19	0.32	0.39	0.36	0.36
OP2	0.14	0.11	0.17	0.13	0.08	0.14	0.09	0.20	0.09	0.11	0.09	0.09	0.12	0.18	0.23	0.22	0.28	0.28	0.24	0.27
P	0.09	0.06	0.13	0.15	0.07	0.10	0.08	0.16	0.06	0.07	0.05	0.09	0.07	0.16	0.25	0.17	0.26	0.28	0.27	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.07	0.01	0.04	0.13	0.04	0.05
C2	0.01	0.00	0.07	0.04	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.11	0.05	0.09	0.16	0.09	0.09
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.03	0.04	0.03	0.07	0.05	0.10	0.00	0.04	0.03	0.03	0.15	0.05	0.06
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.12	0.05	0.05	0.08	0.07	0.02	0.01	0.01	0.02	0.12	0.07	0.06
C4	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.05	0.03	0.09	0.11	0.14	0.08
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.02	0.14	0.02	0.01	0.02	0.11	0.05	0.05
C5	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.08	0.06	0.11	0.10	0.17	0.11
C5'	0.03	0.07	0.03	0.01	0.10	0.01	0.10	0.00	0.09	0.06	0.09	0.11	0.06	0.11	0.05	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.12	0.01	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.09	0.07	0.11	0.09	0.15	0.10
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.05	0.02	0.07	0.11	0.08	0.06
N3	0.01	0.01	0.07	0.05	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.09	0.04	0.10	0.14	0.11	0.09
N4	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.18	0.06	0.04	0.10	0.11	0.16	0.09
O2	0.02	0.01	0.10	0.07	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.18	0.19	0.08	0.12	0.21	0.11	0.13
O2'	0.02	0.16	0.00	0.02	0.16	0.14	0.13	0.11	0.09	0.09	0.18	0.18	0.18	0.00	0.05	0.08	0.16	0.34	0.21	0.22
O3'	0.07	0.11	0.04	0.01	0.05	0.02	0.08	0.05	0.09	0.05	0.09	0.06	0.19	0.05	0.00	0.03	0.04	0.17	0.13	0.10
O4'	0.01	0.05	0.03	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.07	0.02	0.04	0.04	0.08	0.08	0.03	0.00	0.05	0.10	0.05	0.04
O5'	0.04	0.09	0.03	0.02	0.09	0.02	0.11	0.01	0.11	0.07	0.10	0.10	0.12	0.16	0.04	0.05	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.13	0.16	0.15	0.12	0.11	0.11	0.10	0.05	0.09	0.11	0.14	0.11	0.21	0.34	0.17	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.04	0.09	0.05	0.07	0.14	0.05	0.17	0.07	0.15	0.08	0.11	0.16	0.11	0.21	0.13	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.09	0.06	0.06	0.08	0.05	0.11	0.01	0.10	0.06	0.09	0.09	0.13	0.22	0.10	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00