Doublet Group distance statistics: 54574

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 0, 1, 2, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.016 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.002, 0.012, 0.022, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.012 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.007, 0.019, 0.030, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.004, 0.017, 0.031, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.017 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.000, 0.014, 0.029, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.014 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.005, 0.022, 0.039, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.022 std_dev=0.017
O2	A	0, 0.009, 0.040, 0.072, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.040 std_dev=0.032
O4	A	0, 0.011, 0.047, 0.083, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.047 std_dev=0.036
O4'	A	0, 0.014, 0.051, 0.087, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.051 std_dev=0.036
C2'	A	0, 0.022, 0.071, 0.121, 0.160 max_d=0.160 avg_d=0.071 std_dev=0.049
O2'	A	0, 0.037, 0.102, 0.167, 0.211 max_d=0.211 avg_d=0.102 std_dev=0.065
C4'	A	0, 0.024, 0.099, 0.174, 0.219 max_d=0.219 avg_d=0.099 std_dev=0.075
C5'	A	0, 0.045, 0.122, 0.200, 0.257 max_d=0.257 avg_d=0.122 std_dev=0.078
C3'	A	0, 0.036, 0.123, 0.210, 0.259 max_d=0.259 avg_d=0.123 std_dev=0.087
O5'	A	0, 0.076, 0.192, 0.307, 0.347 max_d=0.347 avg_d=0.192 std_dev=0.116
O3'	A	0, 0.078, 0.204, 0.330, 0.371 max_d=0.371 avg_d=0.204 std_dev=0.126
P	A	0, 0.192, 0.350, 0.509, 0.572 max_d=0.572 avg_d=0.350 std_dev=0.158
O2	B	0, 0.186, 0.384, 0.582, 0.698 max_d=0.698 avg_d=0.384 std_dev=0.198
OP1	A	0, 0.278, 0.486, 0.694, 0.717 max_d=0.717 avg_d=0.486 std_dev=0.208
C2	B	0, 0.161, 0.375, 0.589, 0.722 max_d=0.722 avg_d=0.375 std_dev=0.214
OP2	A	0, 0.273, 0.488, 0.703, 0.737 max_d=0.737 avg_d=0.488 std_dev=0.215
N3	B	0, 0.155, 0.375, 0.595, 0.690 max_d=0.690 avg_d=0.375 std_dev=0.220
C4	B	0, 0.182, 0.423, 0.663, 0.703 max_d=0.703 avg_d=0.423 std_dev=0.240
N4	B	0, 0.185, 0.433, 0.681, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.433 std_dev=0.248
N1	B	0, 0.164, 0.414, 0.664, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.414 std_dev=0.250
C1'	B	0, 0.156, 0.420, 0.684, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.420 std_dev=0.264
C5	B	0, 0.228, 0.502, 0.776, 0.822 max_d=0.822 avg_d=0.502 std_dev=0.274
C6	B	0, 0.210, 0.493, 0.776, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.493 std_dev=0.283
O4'	B	0, 0.173, 0.473, 0.772, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.473 std_dev=0.300
C2'	B	0, 0.211, 0.528, 0.844, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.528 std_dev=0.317
O2'	B	0, 0.228, 0.583, 0.937, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.583 std_dev=0.354
C4'	B	0, 0.158, 0.520, 0.882, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.520 std_dev=0.362
C3'	B	0, 0.223, 0.592, 0.961, 1.289 max_d=1.289 avg_d=0.592 std_dev=0.369
O5'	B	0, 0.240, 0.640, 1.040, 1.344 max_d=1.344 avg_d=0.640 std_dev=0.400
C5'	B	0, 0.184, 0.595, 1.005, 1.367 max_d=1.367 avg_d=0.595 std_dev=0.410
O3'	B	0, 0.272, 0.705, 1.139, 1.440 max_d=1.440 avg_d=0.705 std_dev=0.433
P	B	0, 0.340, 0.790, 1.240, 1.556 max_d=1.556 avg_d=0.790 std_dev=0.450
OP2	B	0, 0.430, 0.917, 1.404, 1.633 max_d=1.633 avg_d=0.917 std_dev=0.487
OP1	B	0, 0.341, 0.832, 1.323, 1.734 max_d=1.734 avg_d=0.832 std_dev=0.491

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.15	0.06	0.03
C2	0.04	0.00	0.05	0.07	0.01	0.05	0.02	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.07	0.01	0.03	0.06	0.24	0.05	0.07
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.04	0.09	0.00	0.02	0.04	0.01	0.05	0.14	0.11	0.03
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.00	0.06	0.02	0.05	0.04	0.07	0.10	0.01	0.00	0.07	0.02	0.05	0.09	0.14	0.04
C4	0.02	0.01	0.03	0.06	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.01	0.03	0.09	0.33	0.13	0.16
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.08	0.05	0.01	0.03	0.00	0.02	0.04	0.10	0.03
C5	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.03	0.10	0.33	0.15	0.17
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.04	0.01	0.05	0.00	0.04	0.04	0.04	0.07	0.05	0.04	0.06	0.01	0.01	0.05	0.07	0.03
C6	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.08	0.26	0.09	0.12
N1	0.02	0.00	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.05	0.21	0.04	0.06
N3	0.03	0.00	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.01	0.03	0.07	0.29	0.07	0.11
O2	0.06	0.01	0.09	0.10	0.01	0.08	0.02	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.11	0.01	0.06	0.06	0.21	0.09	0.05
O2'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.02	0.04	0.04	0.10	0.16	0.05
O3'	0.02	0.07	0.02	0.00	0.08	0.01	0.07	0.04	0.05	0.04	0.08	0.11	0.04	0.00	0.09	0.02	0.05	0.07	0.19	0.06
O4	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.00	0.03	0.10	0.37	0.17	0.18
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.06	0.04	0.02	0.03	0.00	0.05	0.12	0.04	0.05
O5'	0.04	0.06	0.05	0.05	0.09	0.02	0.10	0.01	0.08	0.05	0.07	0.06	0.04	0.05	0.10	0.05	0.00	0.03	0.03	0.01
OP1	0.15	0.24	0.14	0.09	0.33	0.04	0.33	0.05	0.26	0.21	0.29	0.21	0.10	0.07	0.37	0.12	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.05	0.11	0.14	0.13	0.10	0.15	0.07	0.09	0.04	0.07	0.09	0.16	0.19	0.17	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.03	0.07	0.03	0.04	0.16	0.03	0.17	0.03	0.12	0.06	0.11	0.05	0.05	0.06	0.18	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.25	0.23	0.23	0.24	0.21	0.23	0.19	0.23	0.23	0.25	0.21	0.25	0.24	0.23	0.23	0.18	0.20	0.15	0.19
C2	0.17	0.19	0.18	0.16	0.14	0.15	0.15	0.14	0.16	0.17	0.17	0.11	0.20	0.20	0.17	0.16	0.13	0.17	0.10	0.14
C2'	0.20	0.23	0.21	0.21	0.23	0.19	0.22	0.17	0.21	0.21	0.24	0.22	0.23	0.22	0.21	0.20	0.16	0.18	0.14	0.17
C3'	0.21	0.23	0.21	0.21	0.22	0.20	0.22	0.18	0.22	0.22	0.23	0.22	0.23	0.23	0.21	0.21	0.18	0.19	0.18	0.20
C4	0.12	0.12	0.13	0.09	0.11	0.09	0.13	0.08	0.11	0.10	0.11	0.13	0.17	0.20	0.11	0.10	0.10	0.15	0.12	0.13
C4'	0.24	0.25	0.24	0.25	0.25	0.23	0.25	0.21	0.25	0.24	0.25	0.24	0.25	0.25	0.25	0.25	0.22	0.23	0.22	0.24
C5	0.19	0.18	0.19	0.15	0.12	0.15	0.12	0.10	0.14	0.17	0.15	0.11	0.21	0.24	0.16	0.17	0.11	0.16	0.11	0.14
C5'	0.23	0.23	0.23	0.25	0.23	0.24	0.25	0.23	0.24	0.23	0.23	0.23	0.23	0.24	0.25	0.25	0.23	0.25	0.25	0.26
C6	0.21	0.20	0.20	0.19	0.14	0.19	0.15	0.15	0.18	0.20	0.17	0.10	0.22	0.23	0.19	0.21	0.16	0.19	0.13	0.18
N1	0.20	0.21	0.20	0.19	0.16	0.18	0.17	0.16	0.19	0.20	0.19	0.11	0.22	0.22	0.19	0.20	0.15	0.18	0.12	0.17
N3	0.13	0.13	0.14	0.12	0.10	0.12	0.13	0.11	0.13	0.12	0.10	0.12	0.17	0.19	0.12	0.12	0.12	0.16	0.11	0.14
O2	0.18	0.21	0.20	0.19	0.20	0.17	0.19	0.16	0.19	0.19	0.22	0.18	0.22	0.21	0.20	0.16	0.14	0.18	0.10	0.15
O2'	0.21	0.23	0.22	0.22	0.24	0.20	0.23	0.18	0.22	0.22	0.24	0.25	0.23	0.22	0.23	0.21	0.18	0.19	0.17	0.20
O3'	0.21	0.24	0.21	0.22	0.24	0.20	0.23	0.18	0.22	0.22	0.25	0.25	0.24	0.22	0.21	0.21	0.18	0.19	0.18	0.20
O4	0.10	0.14	0.14	0.10	0.17	0.08	0.17	0.11	0.15	0.12	0.16	0.18	0.17	0.21	0.12	0.08	0.14	0.16	0.16	0.16
O4'	0.25	0.26	0.25	0.25	0.25	0.23	0.26	0.21	0.25	0.25	0.26	0.24	0.25	0.25	0.25	0.25	0.21	0.22	0.19	0.22
O5'	0.17	0.17	0.17	0.19	0.16	0.18	0.17	0.18	0.18	0.17	0.16	0.14	0.18	0.19	0.19	0.19	0.19	0.21	0.22	0.22
OP1	0.17	0.19	0.17	0.18	0.18	0.15	0.20	0.20	0.20	0.19	0.19	0.17	0.20	0.15	0.16	0.15	0.14	0.10	0.17	0.13
OP2	0.10	0.12	0.10	0.15	0.13	0.12	0.14	0.20	0.13	0.11	0.13	0.14	0.13	0.10	0.15	0.10	0.14	0.13	0.20	0.15
P	0.10	0.12	0.10	0.13	0.12	0.11	0.13	0.15	0.13	0.12	0.12	0.11	0.13	0.12	0.13	0.11	0.12	0.13	0.17	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.10	0.04	0.05
C2	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02	0.05	0.09	0.06	0.05
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.02	0.05	0.04	0.00	0.01	0.01	0.03	0.11	0.06	0.06
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.02	0.07	0.04	0.05	0.09	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.08	0.05
C4	0.02	0.00	0.04	0.08	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.09	0.04	0.09	0.08	0.11	0.09
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.03	0.05	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.09	0.06	0.05
C5	0.02	0.00	0.05	0.09	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.10	0.05	0.10	0.09	0.12	0.10
C5'	0.02	0.04	0.02	0.02	0.08	0.01	0.09	0.00	0.08	0.05	0.06	0.09	0.03	0.03	0.04	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01
C6	0.02	0.00	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.05	0.08	0.08	0.09	0.08
N1	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.03	0.05	0.08	0.06	0.06
N3	0.02	0.00	0.02	0.05	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.06	0.04	0.07	0.08	0.08	0.07
N4	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.12	0.05	0.10	0.09	0.13	0.10
O2	0.02	0.01	0.04	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.08	0.03	0.02	0.03	0.10	0.04	0.05
O2'	0.02	0.05	0.00	0.01	0.04	0.03	0.04	0.03	0.03	0.03	0.05	0.04	0.08	0.00	0.03	0.02	0.04	0.14	0.08	0.08
O3'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.09	0.01	0.10	0.04	0.08	0.03	0.06	0.12	0.03	0.03	0.00	0.01	0.02	0.09	0.10	0.06
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.03	0.04	0.05	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.09	0.04	0.05
O5'	0.03	0.05	0.03	0.02	0.09	0.02	0.10	0.01	0.08	0.05	0.07	0.10	0.03	0.04	0.02	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.10	0.09	0.11	0.09	0.08	0.09	0.09	0.02	0.08	0.08	0.08	0.09	0.10	0.14	0.09	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.04	0.06	0.06	0.08	0.11	0.06	0.12	0.05	0.09	0.06	0.08	0.13	0.04	0.08	0.10	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.05	0.06	0.05	0.09	0.05	0.10	0.01	0.08	0.06	0.07	0.10	0.05	0.08	0.06	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00