Doublet Group distance statistics: 54577

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.002, 0.003, 0.004 max_d=0.004 avg_d=0.002 std_dev=0.001
C6	A	0, 0.002, 0.005, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.005 std_dev=0.003
C4	A	0, 0.003, 0.007, 0.012, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.007 std_dev=0.006
O4	A	0, 0.006, 0.015, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.001, 0.010, 0.020, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.010 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.001, 0.016, 0.032, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.016 std_dev=0.015
O3'	A	0, 0.095, 0.292, 0.489, 0.493 max_d=0.493 avg_d=0.292 std_dev=0.197
C4'	A	0, 0.094, 0.324, 0.555, 0.543 max_d=0.543 avg_d=0.324 std_dev=0.231
O4'	A	0, 0.069, 0.306, 0.543, 0.570 max_d=0.570 avg_d=0.306 std_dev=0.237
C2'	A	0, 0.013, 0.264, 0.516, 0.562 max_d=0.562 avg_d=0.264 std_dev=0.251
C3'	A	0, 0.064, 0.317, 0.569, 0.586 max_d=0.586 avg_d=0.317 std_dev=0.252
O2'	A	0, 0.068, 0.459, 0.850, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.459 std_dev=0.391
P	A	0, 0.156, 0.558, 0.960, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.558 std_dev=0.402
O5'	A	0, 0.198, 0.600, 1.002, 1.047 max_d=1.047 avg_d=0.600 std_dev=0.402
O2	B	0, 0.322, 0.779, 1.237, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.779 std_dev=0.458
C2	B	0, 0.330, 0.804, 1.279, 1.230 max_d=1.230 avg_d=0.804 std_dev=0.475
C5'	A	0, 0.138, 0.622, 1.107, 1.202 max_d=1.202 avg_d=0.622 std_dev=0.485
N1	B	0, 0.345, 0.846, 1.348, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.846 std_dev=0.502
C1'	B	0, 0.366, 0.875, 1.384, 1.259 max_d=1.259 avg_d=0.875 std_dev=0.509
N3	B	0, 0.329, 0.871, 1.413, 1.479 max_d=1.479 avg_d=0.871 std_dev=0.542
OP2	A	0, 0.287, 0.861, 1.435, 1.604 max_d=1.604 avg_d=0.861 std_dev=0.574
C6	B	0, 0.331, 0.919, 1.507, 1.626 max_d=1.626 avg_d=0.919 std_dev=0.588
O4'	B	0, 0.430, 1.028, 1.627, 1.448 max_d=1.448 avg_d=1.028 std_dev=0.599
C2'	B	0, 0.435, 1.068, 1.702, 1.643 max_d=1.643 avg_d=1.068 std_dev=0.634
C4	B	0, 0.331, 0.969, 1.608, 1.766 max_d=1.766 avg_d=0.969 std_dev=0.638
C5	B	0, 0.317, 0.982, 1.647, 1.849 max_d=1.849 avg_d=0.982 std_dev=0.665
O2'	B	0, 0.424, 1.118, 1.812, 1.848 max_d=1.848 avg_d=1.118 std_dev=0.694
O5'	B	0, 0.500, 1.200, 1.899, 1.759 max_d=1.759 avg_d=1.200 std_dev=0.699
C4'	B	0, 0.518, 1.239, 1.959, 1.796 max_d=1.796 avg_d=1.239 std_dev=0.721
C3'	B	0, 0.514, 1.244, 1.975, 1.863 max_d=1.863 avg_d=1.244 std_dev=0.730
N4	B	0, 0.379, 1.118, 1.857, 2.040 max_d=2.040 avg_d=1.118 std_dev=0.739
C5'	B	0, 0.569, 1.349, 2.129, 1.864 max_d=1.864 avg_d=1.349 std_dev=0.780
OP1	A	0, 0.281, 1.072, 1.862, 2.233 max_d=2.233 avg_d=1.072 std_dev=0.791
OP2	B	0, 0.573, 1.406, 2.240, 2.113 max_d=2.113 avg_d=1.406 std_dev=0.834
P	B	0, 0.593, 1.427, 2.261, 2.082 max_d=2.082 avg_d=1.427 std_dev=0.834
O3'	B	0, 0.561, 1.410, 2.258, 2.244 max_d=2.244 avg_d=1.410 std_dev=0.849
OP1	B	0, 0.716, 1.708, 2.699, 2.374 max_d=2.374 avg_d=1.708 std_dev=0.991

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.18	0.88	0.33	0.35
C2	0.02	0.00	0.12	0.06	0.00	0.03	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.02	0.00	0.09	0.22	1.02	0.42	0.39
C2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.02	0.01	0.10	0.10	0.12	0.01	0.08	0.22	0.00	0.02	0.02	0.02	0.30	0.70	0.27	0.11
C3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.11	0.03	0.13	0.03	0.03	0.13	0.02	0.00	0.04	0.03	0.29	0.50	0.41	0.04
C4	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.12	0.00	0.37	0.00	0.00	0.00	0.01	0.13	0.05	0.00	0.06	0.25	0.89	0.54	0.34
C4'	0.02	0.03	0.01	0.00	0.12	0.00	0.15	0.00	0.14	0.06	0.07	0.02	0.01	0.01	0.12	0.00	0.02	0.46	0.30	0.18
C5	0.01	0.00	0.10	0.11	0.00	0.15	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.10	0.00	0.03	0.25	0.80	0.53	0.28
C5'	0.08	0.20	0.10	0.03	0.37	0.00	0.42	0.00	0.38	0.24	0.28	0.11	0.08	0.08	0.39	0.02	0.01	0.30	0.37	0.01
C6	0.01	0.00	0.12	0.13	0.00	0.14	0.00	0.38	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.12	0.01	0.04	0.26	0.85	0.44	0.29
N1	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.24	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.06	0.00	0.04	0.23	0.96	0.39	0.36
N3	0.02	0.00	0.08	0.03	0.00	0.07	0.00	0.28	0.01	0.01	0.00	0.01	0.22	0.02	0.00	0.09	0.23	0.99	0.48	0.38
O2	0.03	0.00	0.22	0.13	0.01	0.02	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00	0.40	0.07	0.01	0.13	0.20	1.03	0.40	0.41
O2'	0.01	0.25	0.00	0.02	0.13	0.01	0.07	0.08	0.08	0.08	0.22	0.40	0.00	0.02	0.14	0.01	0.37	0.71	0.31	0.04
O3'	0.08	0.02	0.02	0.00	0.05	0.01	0.10	0.08	0.12	0.06	0.02	0.07	0.02	0.00	0.05	0.14	0.21	0.53	0.43	0.06
O4	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.12	0.00	0.39	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.05	0.00	0.06	0.25	0.85	0.59	0.33
O4'	0.00	0.09	0.02	0.03	0.06	0.00	0.03	0.02	0.04	0.04	0.09	0.13	0.01	0.14	0.06	0.00	0.35	0.83	0.51	0.52
O5'	0.18	0.22	0.30	0.29	0.25	0.02	0.25	0.01	0.26	0.23	0.23	0.20	0.37	0.21	0.25	0.35	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.88	1.02	0.70	0.50	0.89	0.46	0.80	0.30	0.85	0.96	0.99	1.03	0.71	0.53	0.85	0.83	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.33	0.42	0.27	0.41	0.54	0.30	0.53	0.37	0.44	0.39	0.48	0.40	0.31	0.43	0.59	0.51	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.35	0.39	0.11	0.04	0.34	0.18	0.28	0.01	0.29	0.36	0.38	0.41	0.04	0.06	0.33	0.52	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.14	0.20	0.22	0.17	0.29	0.07	0.27	0.06	0.10	0.20	0.23	0.17	0.27	0.24	0.28	0.20	0.17	0.11	0.15
C2	0.18	0.10	0.15	0.16	0.11	0.21	0.20	0.20	0.23	0.17	0.10	0.09	0.10	0.19	0.16	0.23	0.17	0.17	0.15	0.15
C2'	0.12	0.12	0.13	0.15	0.07	0.17	0.08	0.17	0.12	0.10	0.12	0.07	0.15	0.16	0.15	0.16	0.16	0.12	0.14	0.13
C3'	0.09	0.17	0.10	0.11	0.18	0.13	0.12	0.13	0.09	0.11	0.20	0.20	0.18	0.12	0.12	0.11	0.09	0.07	0.07	0.07
C4	0.11	0.14	0.10	0.10	0.17	0.12	0.18	0.10	0.17	0.14	0.15	0.16	0.12	0.14	0.10	0.11	0.06	0.08	0.07	0.05
C4'	0.20	0.33	0.18	0.17	0.39	0.11	0.37	0.10	0.33	0.30	0.38	0.40	0.30	0.13	0.14	0.15	0.13	0.14	0.22	0.17
C5	0.10	0.11	0.13	0.12	0.07	0.12	0.08	0.08	0.09	0.09	0.10	0.06	0.16	0.20	0.13	0.08	0.03	0.04	0.04	0.01
C5'	0.51	0.54	0.48	0.44	0.50	0.40	0.49	0.35	0.51	0.54	0.53	0.48	0.54	0.42	0.40	0.48	0.35	0.33	0.34	0.33
C6	0.15	0.12	0.18	0.17	0.04	0.18	0.02	0.14	0.06	0.09	0.10	0.05	0.18	0.26	0.19	0.14	0.07	0.07	0.05	0.04
N1	0.18	0.11	0.18	0.18	0.06	0.23	0.06	0.20	0.12	0.12	0.12	0.09	0.15	0.24	0.19	0.23	0.15	0.13	0.10	0.11
N3	0.15	0.14	0.12	0.13	0.20	0.16	0.24	0.15	0.23	0.18	0.15	0.18	0.10	0.15	0.12	0.17	0.13	0.13	0.13	0.12
O2	0.19	0.10	0.15	0.18	0.15	0.24	0.26	0.24	0.28	0.19	0.12	0.13	0.10	0.18	0.17	0.26	0.23	0.22	0.21	0.21
O2'	0.30	0.28	0.30	0.33	0.33	0.33	0.39	0.32	0.39	0.32	0.28	0.31	0.25	0.31	0.33	0.33	0.35	0.32	0.36	0.32
O3'	0.15	0.11	0.17	0.23	0.17	0.29	0.08	0.31	0.08	0.07	0.18	0.24	0.12	0.21	0.25	0.25	0.28	0.25	0.21	0.24
O4	0.10	0.16	0.08	0.08	0.22	0.09	0.21	0.08	0.18	0.15	0.21	0.23	0.12	0.10	0.07	0.09	0.06	0.07	0.07	0.05
O4'	0.16	0.40	0.14	0.12	0.52	0.08	0.50	0.06	0.42	0.35	0.48	0.54	0.33	0.11	0.09	0.09	0.16	0.15	0.30	0.21
O5'	0.26	0.33	0.27	0.24	0.33	0.23	0.29	0.17	0.25	0.28	0.34	0.35	0.36	0.32	0.27	0.23	0.16	0.12	0.18	0.14
OP1	0.45	0.61	0.42	0.39	0.66	0.40	0.58	0.41	0.52	0.53	0.67	0.70	0.60	0.40	0.37	0.40	0.33	0.42	0.33	0.35
OP2	0.27	0.28	0.33	0.27	0.21	0.26	0.22	0.30	0.19	0.21	0.24	0.22	0.38	0.47	0.30	0.23	0.35	0.43	0.44	0.44
P	0.19	0.19	0.21	0.20	0.13	0.21	0.10	0.22	0.12	0.16	0.17	0.12	0.24	0.25	0.20	0.19	0.18	0.25	0.19	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.06	0.03	0.07	0.06
C2	0.02	0.00	0.03	0.06	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.06	0.02	0.13	0.10	0.17	0.15
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.00	0.01	0.00	0.07	0.02	0.07	0.05
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.06	0.04	0.07	0.07	0.05	0.03	0.00	0.01	0.07	0.02	0.07	0.05
C4	0.01	0.00	0.02	0.07	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.08	0.02	0.17	0.17	0.24	0.21
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.05	0.04	0.05	0.05	0.04	0.05	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.02
C5	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.02	0.17	0.18	0.24	0.22
C5'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.11	0.01	0.12	0.00	0.10	0.07	0.10	0.11	0.06	0.05	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.02	0.15	0.15	0.18	0.17
N1	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.12	0.09	0.14	0.13
N3	0.02	0.00	0.03	0.07	0.01	0.05	0.02	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.08	0.02	0.16	0.14	0.22	0.19
N4	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.02	0.17	0.18	0.26	0.22
O2	0.03	0.00	0.04	0.05	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.06	0.03	0.11	0.07	0.15	0.12
O2'	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.05	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.02	0.05	0.00	0.04	0.02	0.08	0.07	0.08	0.07
O3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.08	0.01	0.08	0.02	0.07	0.04	0.08	0.09	0.06	0.04	0.00	0.01	0.09	0.06	0.09	0.08
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02
O5'	0.06	0.13	0.07	0.07	0.17	0.02	0.17	0.00	0.15	0.12	0.16	0.17	0.11	0.08	0.09	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.03	0.10	0.02	0.02	0.17	0.03	0.18	0.03	0.15	0.09	0.14	0.18	0.07	0.07	0.06	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00
OP2	0.07	0.17	0.07	0.07	0.24	0.02	0.24	0.01	0.18	0.14	0.22	0.26	0.15	0.08	0.09	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00
P	0.06	0.15	0.05	0.05	0.21	0.02	0.22	0.01	0.17	0.13	0.19	0.22	0.12	0.07	0.08	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00