Doublet Group distance statistics: 54583

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.003, 0.006, 0.006 max_d=0.006 avg_d=0.003 std_dev=0.003
C6	A	0, 0.000, 0.011, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.000, 0.012, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.012
O4	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C2	A	0, 0.000, 0.022, 0.044, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C1'	A	0, 0.000, 0.036, 0.071, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.036 std_dev=0.036
O2	A	0, 0.000, 0.060, 0.121, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.060 std_dev=0.060
N1	B	0, 0.000, 0.168, 0.336, 0.336 max_d=0.336 avg_d=0.168 std_dev=0.168
C2	B	0, 0.000, 0.318, 0.636, 0.636 max_d=0.636 avg_d=0.318 std_dev=0.318
C3'	A	0, 0.000, 0.331, 0.661, 0.661 max_d=0.661 avg_d=0.331 std_dev=0.331
O3'	A	0, 0.000, 0.426, 0.852, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.426 std_dev=0.426
C1'	B	0, 0.000, 0.569, 1.138, 1.138 max_d=1.138 avg_d=0.569 std_dev=0.569
O4'	A	0, 0.000, 0.581, 1.163, 1.163 max_d=1.163 avg_d=0.581 std_dev=0.581
C2'	A	0, 0.000, 0.583, 1.165, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.583 std_dev=0.583
C6	B	0, 0.000, 0.618, 1.237, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.618 std_dev=0.618
O2	B	0, 0.000, 0.656, 1.311, 1.311 max_d=1.311 avg_d=0.656 std_dev=0.656
N3	B	0, 0.000, 0.679, 1.358, 1.358 max_d=1.358 avg_d=0.679 std_dev=0.679
O4'	B	0, 0.000, 0.848, 1.696, 1.696 max_d=1.696 avg_d=0.848 std_dev=0.848
C4	B	0, 0.000, 0.893, 1.786, 1.786 max_d=1.786 avg_d=0.893 std_dev=0.893
C5	B	0, 0.000, 0.899, 1.797, 1.797 max_d=1.797 avg_d=0.899 std_dev=0.899
C4'	A	0, 0.000, 0.915, 1.830, 1.830 max_d=1.830 avg_d=0.915 std_dev=0.915
O2'	A	0, 0.000, 1.075, 2.150, 2.150 max_d=2.150 avg_d=1.075 std_dev=1.075
C2'	B	0, 0.000, 1.179, 2.358, 2.358 max_d=2.358 avg_d=1.179 std_dev=1.179
C3'	B	0, 0.000, 1.229, 2.459, 2.459 max_d=2.459 avg_d=1.229 std_dev=1.229
C4'	B	0, 0.000, 1.285, 2.570, 2.570 max_d=2.570 avg_d=1.285 std_dev=1.285
N4	B	0, 0.000, 1.344, 2.688, 2.688 max_d=2.688 avg_d=1.344 std_dev=1.344
O2'	B	0, 0.000, 1.351, 2.701, 2.701 max_d=2.701 avg_d=1.351 std_dev=1.351
C5'	B	0, 0.000, 1.504, 3.008, 3.008 max_d=3.008 avg_d=1.504 std_dev=1.504
O3'	B	0, 0.000, 1.619, 3.239, 3.239 max_d=3.239 avg_d=1.619 std_dev=1.619
O5'	B	0, 0.000, 1.891, 3.783, 3.783 max_d=3.783 avg_d=1.891 std_dev=1.891
C5'	A	0, 0.000, 1.898, 3.796, 3.796 max_d=3.796 avg_d=1.898 std_dev=1.898
O5'	A	0, 0.000, 2.281, 4.561, 4.561 max_d=4.561 avg_d=2.281 std_dev=2.281
OP2	B	0, 0.000, 2.515, 5.030, 5.030 max_d=5.030 avg_d=2.515 std_dev=2.515
P	B	0, 0.000, 2.555, 5.110, 5.110 max_d=5.110 avg_d=2.555 std_dev=2.555
OP1	B	0, 0.000, 2.696, 5.391, 5.391 max_d=5.391 avg_d=2.696 std_dev=2.696
OP2	A	0, 0.000, 3.071, 6.143, 6.143 max_d=6.143 avg_d=3.071 std_dev=3.071
P	A	0, 0.000, 3.364, 6.728, 6.728 max_d=6.728 avg_d=3.364 std_dev=3.364
OP1	A	0, 0.000, 4.622, 9.244, 9.244 max_d=9.244 avg_d=4.622 std_dev=4.622

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.04	0.02	0.06	0.01	0.02	0.04	0.06	0.00	0.05	0.03	0.00	0.21	0.07	0.17	0.11
C2	0.04	0.00	0.04	0.01	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.12	0.00	0.06	0.19	0.13	0.08	0.13
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.06	0.01	0.07	0.12	0.07	0.05	0.05	0.04	0.00	0.01	0.06	0.03	0.25	0.38	0.27	0.35
C3'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.00	0.10	0.02	0.11	0.05	0.04	0.01	0.01	0.01	0.07	0.00	0.04	0.12	0.34	0.26
C4	0.03	0.00	0.06	0.07	0.00	0.10	0.00	0.36	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.08	0.66	0.65	0.31	0.41
C4'	0.04	0.06	0.01	0.00	0.10	0.00	0.18	0.01	0.18	0.04	0.00	0.18	0.02	0.02	0.10	0.00	0.02	0.21	0.30	0.04
C5	0.02	0.00	0.07	0.10	0.00	0.18	0.00	0.53	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.03	0.00	0.15	0.89	1.09	0.60	0.77
C5'	0.06	0.01	0.12	0.02	0.36	0.01	0.53	0.00	0.50	0.22	0.13	0.26	0.09	0.06	0.37	0.02	0.00	0.30	0.34	0.01
C6	0.01	0.00	0.07	0.11	0.00	0.18	0.00	0.50	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.03	0.00	0.16	0.84	0.98	0.60	0.74
N1	0.02	0.00	0.05	0.05	0.01	0.04	0.01	0.22	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.05	0.45	0.32	0.23	0.25
N3	0.04	0.00	0.05	0.04	0.00	0.00	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.02	0.06	0.09	0.00	0.00	0.36	0.12	0.01	0.02
O2	0.06	0.00	0.04	0.01	0.01	0.18	0.00	0.26	0.00	0.01	0.02	0.00	0.19	0.21	0.02	0.17	0.14	0.67	0.38	0.53
O2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.02	0.02	0.13	0.09	0.15	0.01	0.06	0.19	0.00	0.03	0.02	0.01	0.25	0.51	0.33	0.45
O3'	0.05	0.12	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.06	0.03	0.05	0.09	0.21	0.03	0.00	0.03	0.11	0.04	0.01	0.37	0.23
O4	0.03	0.00	0.06	0.07	0.00	0.10	0.00	0.37	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.08	0.68	0.71	0.30	0.42
O4'	0.00	0.06	0.03	0.00	0.08	0.00	0.15	0.02	0.16	0.05	0.00	0.17	0.01	0.11	0.08	0.00	0.06	0.28	0.04	0.15
O5'	0.21	0.19	0.25	0.04	0.66	0.02	0.89	0.00	0.84	0.45	0.36	0.14	0.25	0.04	0.68	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.07	0.13	0.38	0.12	0.65	0.21	1.09	0.30	0.98	0.32	0.12	0.67	0.51	0.01	0.71	0.28	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.17	0.08	0.27	0.34	0.31	0.30	0.60	0.34	0.60	0.23	0.01	0.38	0.33	0.37	0.30	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.11	0.13	0.35	0.26	0.41	0.04	0.77	0.01	0.74	0.25	0.02	0.53	0.45	0.23	0.42	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.13	0.24	0.14	0.04	0.00	0.24	0.10	0.30	0.13	0.14	0.01	0.36	0.47	0.73	0.13	0.12	0.11	0.35	0.27
C2	0.05	0.06	0.09	0.16	0.09	0.24	0.20	0.20	0.20	0.07	0.03	0.09	0.20	0.23	0.64	0.17	0.41	0.37	0.83	0.69
C2'	0.02	0.37	0.04	0.36	0.20	0.11	0.01	0.01	0.07	0.10	0.38	0.23	0.62	0.27	0.98	0.00	0.18	0.16	0.43	0.31
C3'	0.12	0.21	0.17	0.26	0.04	0.03	0.16	0.16	0.22	0.05	0.22	0.08	0.44	0.48	0.87	0.16	0.05	0.05	0.12	0.10
C4	0.13	0.00	0.29	0.08	0.15	0.10	0.10	0.16	0.02	0.04	0.11	0.21	0.07	0.34	0.34	0.13	0.33	0.28	1.05	0.73
C4'	0.32	0.04	0.41	0.05	0.16	0.14	0.32	0.22	0.38	0.25	0.03	0.13	0.13	0.81	0.59	0.28	0.03	0.04	0.04	0.04
C5	0.22	0.08	0.43	0.15	0.23	0.03	0.11	0.01	0.02	0.06	0.25	0.34	0.04	0.52	0.31	0.00	0.18	0.14	0.85	0.53
C5'	0.35	0.26	0.48	0.12	0.29	0.01	0.33	0.03	0.35	0.32	0.25	0.28	0.20	1.02	0.57	0.17	0.19	0.16	0.18	0.12
C6	0.24	0.13	0.42	0.09	0.17	0.06	0.01	0.06	0.11	0.08	0.25	0.25	0.21	0.58	0.42	0.06	0.14	0.10	0.67	0.42
N1	0.17	0.13	0.26	0.07	0.03	0.06	0.13	0.02	0.19	0.09	0.16	0.07	0.29	0.43	0.60	0.01	0.23	0.19	0.63	0.47
N3	0.05	0.01	0.14	0.06	0.04	0.23	0.07	0.26	0.08	0.05	0.01	0.04	0.02	0.21	0.49	0.22	0.44	0.40	1.05	0.82
O2	0.06	0.05	0.09	0.33	0.21	0.41	0.33	0.33	0.28	0.07	0.05	0.24	0.23	0.07	0.77	0.28	0.56	0.51	0.81	0.79
O2'	0.03	0.47	0.01	0.34	0.27	0.08	0.00	0.07	0.08	0.13	0.50	0.32	0.74	0.19	0.98	0.03	0.14	0.12	0.38	0.29
O3'	0.33	0.09	0.34	0.03	0.13	0.30	0.41	0.50	0.49	0.25	0.11	0.08	0.38	0.62	0.64	0.43	0.22	0.19	0.29	0.20
O4	0.10	0.07	0.27	0.12	0.19	0.12	0.20	0.21	0.11	0.01	0.05	0.27	0.20	0.28	0.26	0.18	0.36	0.32	1.19	0.82
O4'	0.28	0.01	0.32	0.10	0.14	0.02	0.29	0.10	0.35	0.22	0.01	0.12	0.17	0.62	0.67	0.18	0.11	0.09	0.27	0.20
O5'	0.11	0.22	0.16	0.55	0.23	0.36	0.19	0.39	0.16	0.17	0.24	0.24	0.22	0.64	1.10	0.08	0.41	0.33	0.57	0.37
OP1	0.52	0.01	0.52	1.44	0.14	1.43	0.42	1.68	0.53	0.34	0.07	0.07	0.27	0.14	1.60	0.95	1.58	1.53	1.73	1.51
OP2	0.46	0.35	0.54	1.11	0.40	0.71	0.47	0.78	0.49	0.44	0.35	0.39	0.27	0.12	1.38	0.48	0.73	0.72	0.95	0.68
P	0.57	0.28	0.61	1.38	0.35	1.11	0.49	1.20	0.55	0.47	0.25	0.31	0.15	0.06	1.76	0.76	1.14	1.10	1.34	1.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.30	0.00	0.03	0.11	0.71	0.23
C2	0.01	0.00	0.18	0.20	0.01	0.05	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.10	0.16	0.05	0.17	0.40	0.76	0.15
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.05	0.01	0.07	0.17	0.11	0.03	0.15	0.06	0.30	0.00	0.01	0.02	0.05	0.15	0.75	0.13
C3'	0.02	0.20	0.00	0.00	0.29	0.01	0.27	0.02	0.21	0.17	0.26	0.31	0.13	0.01	0.01	0.01	0.33	0.49	0.13	0.35
C4	0.02	0.01	0.05	0.29	0.00	0.13	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.27	0.02	0.02	0.30	0.54	0.79	0.14
C4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.13	0.00	0.15	0.01	0.14	0.08	0.08	0.14	0.01	0.23	0.00	0.00	0.02	0.03	0.21	0.00
C5	0.01	0.00	0.07	0.27	0.00	0.15	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.32	0.07	0.08	0.32	0.44	0.84	0.19
C5'	0.05	0.04	0.17	0.02	0.13	0.01	0.15	0.00	0.12	0.05	0.09	0.15	0.01	0.05	0.20	0.01	0.01	0.12	0.04	0.02
C6	0.01	0.00	0.11	0.21	0.00	0.14	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.28	0.02	0.11	0.26	0.30	0.86	0.24
N1	0.01	0.00	0.03	0.17	0.01	0.08	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.16	0.12	0.02	0.17	0.29	0.79	0.20
N3	0.01	0.00	0.15	0.26	0.00	0.08	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.07	0.03	0.24	0.51	0.77	0.13
N4	0.02	0.01	0.06	0.31	0.00	0.14	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.29	0.06	0.03	0.33	0.61	0.76	0.11
O2	0.00	0.00	0.30	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.28	0.11	0.10	0.37	0.71	0.14
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.27	0.23	0.32	0.05	0.28	0.16	0.17	0.29	0.07	0.00	0.00	0.15	0.17	0.19	0.65	0.03
O3'	0.30	0.16	0.01	0.01	0.02	0.00	0.07	0.20	0.02	0.12	0.07	0.06	0.28	0.00	0.00	0.19	0.41	0.72	0.23	0.63
O4'	0.00	0.05	0.02	0.01	0.02	0.00	0.08	0.01	0.11	0.02	0.03	0.03	0.11	0.15	0.19	0.00	0.08	0.06	0.54	0.28
O5'	0.03	0.17	0.05	0.33	0.30	0.02	0.32	0.01	0.26	0.17	0.24	0.33	0.10	0.17	0.41	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.11	0.40	0.15	0.49	0.54	0.03	0.44	0.12	0.30	0.29	0.51	0.61	0.37	0.19	0.72	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.71	0.76	0.75	0.13	0.79	0.21	0.84	0.04	0.86	0.79	0.77	0.76	0.71	0.65	0.23	0.54	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.23	0.15	0.13	0.35	0.14	0.00	0.19	0.02	0.24	0.20	0.13	0.11	0.14	0.03	0.63	0.28	0.01	0.00	0.00	0.00