Doublet Group distance statistics: 54585

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.010, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.000, 0.016, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C6	A	0, 0.000, 0.016, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.000, 0.017, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
O4	A	0, 0.000, 0.030, 0.059, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.030 std_dev=0.030
O2	A	0, 0.000, 0.037, 0.073, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.037 std_dev=0.037
O4'	B	0, 0.000, 0.236, 0.473, 0.473 max_d=0.473 avg_d=0.236 std_dev=0.236
O3'	B	0, 0.000, 0.238, 0.476, 0.476 max_d=0.476 avg_d=0.238 std_dev=0.238
O4'	A	0, 0.000, 0.243, 0.486, 0.486 max_d=0.486 avg_d=0.243 std_dev=0.243
C4'	A	0, 0.000, 0.250, 0.499, 0.499 max_d=0.499 avg_d=0.250 std_dev=0.250
C4'	B	0, 0.000, 0.253, 0.507, 0.507 max_d=0.507 avg_d=0.253 std_dev=0.253
C3'	B	0, 0.000, 0.284, 0.568, 0.568 max_d=0.568 avg_d=0.284 std_dev=0.284
C3'	A	0, 0.000, 0.290, 0.580, 0.580 max_d=0.580 avg_d=0.290 std_dev=0.290
C1'	B	0, 0.000, 0.362, 0.725, 0.725 max_d=0.725 avg_d=0.362 std_dev=0.362
C2'	A	0, 0.000, 0.370, 0.740, 0.740 max_d=0.740 avg_d=0.370 std_dev=0.370
C5'	B	0, 0.000, 0.399, 0.798, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.399 std_dev=0.399
C2'	B	0, 0.000, 0.418, 0.836, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.418 std_dev=0.418
C5'	A	0, 0.000, 0.425, 0.851, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.425 std_dev=0.425
N1	B	0, 0.000, 0.446, 0.892, 0.892 max_d=0.892 avg_d=0.446 std_dev=0.446
O5'	B	0, 0.000, 0.455, 0.911, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.455 std_dev=0.455
C6	B	0, 0.000, 0.500, 1.000, 1.000 max_d=1.000 avg_d=0.500 std_dev=0.500
O5'	A	0, 0.000, 0.524, 1.048, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.524 std_dev=0.524
O3'	A	0, 0.000, 0.579, 1.157, 1.157 max_d=1.157 avg_d=0.579 std_dev=0.579
P	B	0, 0.000, 0.650, 1.301, 1.301 max_d=1.301 avg_d=0.650 std_dev=0.650
P	A	0, 0.000, 0.661, 1.321, 1.321 max_d=1.321 avg_d=0.661 std_dev=0.661
OP2	B	0, 0.000, 0.691, 1.383, 1.383 max_d=1.383 avg_d=0.691 std_dev=0.691
C2	B	0, 0.000, 0.741, 1.483, 1.483 max_d=1.483 avg_d=0.741 std_dev=0.741
O2'	A	0, 0.000, 0.744, 1.487, 1.487 max_d=1.487 avg_d=0.744 std_dev=0.744
OP1	B	0, 0.000, 0.751, 1.502, 1.502 max_d=1.502 avg_d=0.751 std_dev=0.751
C5	B	0, 0.000, 0.796, 1.591, 1.591 max_d=1.591 avg_d=0.796 std_dev=0.796
O2	B	0, 0.000, 0.879, 1.758, 1.758 max_d=1.758 avg_d=0.879 std_dev=0.879
O2'	B	0, 0.000, 0.896, 1.791, 1.791 max_d=1.791 avg_d=0.896 std_dev=0.896
N3	B	0, 0.000, 0.949, 1.899, 1.899 max_d=1.899 avg_d=0.949 std_dev=0.949
C4	B	0, 0.000, 0.968, 1.936, 1.936 max_d=1.936 avg_d=0.968 std_dev=0.968
OP1	A	0, 0.000, 1.181, 2.362, 2.362 max_d=2.362 avg_d=1.181 std_dev=1.181
N4	B	0, 0.000, 1.243, 2.487, 2.487 max_d=2.487 avg_d=1.243 std_dev=1.243
OP2	A	0, 0.000, 1.552, 3.103, 3.103 max_d=3.103 avg_d=1.552 std_dev=1.552

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.19	0.01	0.00	0.12	0.30	0.47	0.06
C2	0.01	0.00	0.06	0.02	0.01	0.04	0.01	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.20	0.01	0.08	0.20	0.35	0.60	0.11
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.09	0.12	0.10	0.01	0.03	0.12	0.01	0.01	0.03	0.02	0.17	0.34	0.22	0.14
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.00	0.08	0.02	0.08	0.04	0.04	0.01	0.01	0.00	0.07	0.03	0.24	0.33	0.16	0.17
C4	0.00	0.01	0.03	0.06	0.00	0.03	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.10	0.00	0.02	0.21	0.18	0.82	0.24
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.05	0.12	0.00	0.03	0.00	0.02	0.33	0.23	0.10
C5	0.01	0.01	0.09	0.08	0.00	0.02	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.26	0.05	0.00	0.02	0.16	0.10	0.85	0.25
C5'	0.06	0.14	0.12	0.02	0.16	0.01	0.15	0.00	0.12	0.12	0.16	0.13	0.02	0.16	0.18	0.02	0.00	0.04	0.33	0.00
C6	0.01	0.01	0.10	0.08	0.00	0.01	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.26	0.05	0.00	0.03	0.13	0.13	0.77	0.20
N1	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.14	0.01	0.02	0.16	0.26	0.63	0.13
N3	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.04	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.17	0.01	0.06	0.23	0.29	0.71	0.18
O2	0.02	0.00	0.12	0.01	0.01	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.21	0.26	0.02	0.12	0.20	0.47	0.46	0.04
O2'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.15	0.12	0.26	0.02	0.26	0.09	0.03	0.21	0.00	0.03	0.15	0.05	0.05	0.22	0.22	0.05
O3'	0.19	0.20	0.01	0.00	0.10	0.00	0.05	0.16	0.05	0.14	0.17	0.26	0.03	0.00	0.10	0.12	0.19	0.34	0.08	0.18
O4	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.03	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.02	0.15	0.10	0.00	0.02	0.22	0.17	0.87	0.26
O4'	0.00	0.08	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.06	0.12	0.05	0.12	0.02	0.00	0.24	0.26	0.55	0.13
O5'	0.12	0.20	0.17	0.24	0.21	0.02	0.16	0.00	0.13	0.16	0.23	0.20	0.05	0.19	0.22	0.24	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.30	0.35	0.34	0.33	0.18	0.33	0.10	0.04	0.13	0.26	0.29	0.47	0.22	0.34	0.17	0.26	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.47	0.60	0.22	0.16	0.82	0.23	0.85	0.33	0.77	0.63	0.71	0.46	0.22	0.08	0.87	0.55	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.11	0.14	0.17	0.24	0.10	0.25	0.00	0.20	0.13	0.18	0.04	0.05	0.18	0.26	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.17	0.21	0.15	0.27	0.16	0.26	0.13	0.19	0.13	0.24	0.29	0.13	0.48	0.13	0.07	0.16	0.19	0.14	0.17
C2	0.11	0.03	0.08	0.08	0.02	0.07	0.07	0.04	0.06	0.02	0.01	0.02	0.06	0.29	0.08	0.09	0.17	0.19	0.18	0.19
C2'	0.03	0.40	0.11	0.09	0.52	0.13	0.46	0.12	0.36	0.30	0.50	0.57	0.34	0.38	0.08	0.00	0.11	0.15	0.07	0.14
C3'	0.02	0.33	0.16	0.06	0.42	0.07	0.37	0.07	0.29	0.24	0.41	0.46	0.30	0.43	0.00	0.04	0.07	0.07	0.05	0.08
C4	0.21	0.26	0.03	0.11	0.14	0.05	0.00	0.09	0.01	0.17	0.25	0.13	0.32	0.13	0.10	0.17	0.05	0.06	0.07	0.06
C4'	0.14	0.46	0.11	0.00	0.51	0.03	0.44	0.02	0.37	0.36	0.52	0.54	0.45	0.42	0.03	0.13	0.02	0.01	0.05	0.01
C5	0.23	0.20	0.08	0.13	0.06	0.08	0.21	0.07	0.13	0.10	0.12	0.09	0.32	0.18	0.11	0.16	0.02	0.02	0.00	0.02
C5'	0.29	0.71	0.01	0.10	0.76	0.08	0.67	0.12	0.57	0.56	0.78	0.80	0.70	0.28	0.11	0.26	0.21	0.21	0.26	0.21
C6	0.19	0.04	0.13	0.14	0.20	0.10	0.29	0.01	0.21	0.01	0.07	0.24	0.17	0.28	0.12	0.13	0.05	0.06	0.03	0.05
N1	0.14	0.03	0.14	0.13	0.17	0.11	0.21	0.05	0.16	0.04	0.10	0.19	0.04	0.35	0.11	0.11	0.12	0.14	0.11	0.13
N3	0.16	0.17	0.03	0.08	0.12	0.04	0.04	0.04	0.03	0.12	0.17	0.12	0.19	0.18	0.08	0.13	0.14	0.15	0.17	0.16
O2	0.04	0.03	0.06	0.04	0.02	0.04	0.03	0.10	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.31	0.04	0.03	0.22	0.26	0.24	0.26
O2'	0.06	0.37	0.23	0.24	0.54	0.27	0.45	0.27	0.31	0.24	0.51	0.61	0.32	0.55	0.28	0.11	0.23	0.34	0.17	0.28
O3'	0.16	0.38	0.05	0.11	0.46	0.12	0.44	0.12	0.39	0.34	0.44	0.49	0.34	0.39	0.17	0.22	0.10	0.09	0.10	0.08
O4	0.21	0.35	0.01	0.09	0.29	0.02	0.13	0.14	0.10	0.24	0.38	0.30	0.39	0.04	0.09	0.17	0.01	0.02	0.04	0.02
O4'	0.02	0.24	0.17	0.05	0.32	0.04	0.31	0.00	0.27	0.22	0.29	0.33	0.19	0.46	0.02	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01
O5'	0.28	0.24	0.66	0.54	0.30	0.52	0.13	0.47	0.00	0.01	0.36	0.38	0.32	0.94	0.52	0.29	0.38	0.42	0.34	0.39
OP1	0.34	0.42	0.02	0.24	0.41	0.30	0.39	0.30	0.38	0.39	0.42	0.42	0.43	0.29	0.35	0.42	0.33	0.37	0.29	0.34
OP2	0.65	0.47	0.87	0.67	0.42	0.65	0.50	0.64	0.56	0.57	0.39	0.36	0.46	0.90	0.46	0.58	0.64	0.53	0.67	0.62
P	0.16	0.13	0.51	0.33	0.15	0.28	0.05	0.26	0.02	0.01	0.20	0.20	0.19	0.71	0.23	0.12	0.20	0.18	0.21	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.08	0.00	0.02	0.09	0.03	0.03
C2	0.00	0.00	0.04	0.09	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.01	0.01	0.04	0.00	0.15	0.07
C2'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.14	0.01	0.15	0.11	0.12	0.07	0.09	0.16	0.03	0.01	0.03	0.01	0.26	0.34	0.28	0.31
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.14	0.00	0.17	0.01	0.17	0.11	0.11	0.14	0.05	0.00	0.00	0.01	0.06	0.14	0.01	0.09
C4	0.00	0.00	0.14	0.14	0.00	0.06	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.41	0.10	0.04	0.09	0.12	0.25	0.17
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.07	0.04	0.05	0.06	0.01	0.18	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01
C5	0.00	0.00	0.15	0.17	0.00	0.08	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.34	0.16	0.05	0.12	0.18	0.27	0.21
C5'	0.02	0.00	0.11	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.05	0.12	0.02	0.01	0.09	0.01	0.01
C6	0.00	0.00	0.12	0.17	0.00	0.07	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.24	0.15	0.04	0.10	0.14	0.20	0.16
N1	0.00	0.00	0.07	0.11	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.03	0.02	0.04	0.02	0.13	0.07
N3	0.00	0.00	0.09	0.11	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.38	0.03	0.03	0.07	0.05	0.20	0.12
N4	0.00	0.00	0.16	0.14	0.00	0.06	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.46	0.10	0.05	0.10	0.14	0.27	0.19
O2	0.00	0.00	0.03	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.09	0.01	0.02	0.06	0.11	0.03
O2'	0.02	0.29	0.01	0.00	0.41	0.18	0.34	0.05	0.24	0.21	0.38	0.46	0.19	0.00	0.05	0.11	0.22	0.38	0.37	0.32
O3'	0.08	0.01	0.03	0.00	0.10	0.04	0.16	0.12	0.15	0.03	0.03	0.10	0.09	0.05	0.00	0.03	0.05	0.00	0.08	0.02
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.03	0.05	0.01	0.11	0.03	0.00	0.09	0.04	0.12	0.08
O5'	0.02	0.04	0.26	0.06	0.09	0.01	0.12	0.01	0.10	0.04	0.07	0.10	0.02	0.22	0.05	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.09	0.00	0.34	0.14	0.12	0.01	0.18	0.09	0.14	0.02	0.05	0.14	0.06	0.38	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.03	0.15	0.28	0.01	0.25	0.02	0.27	0.01	0.20	0.13	0.20	0.27	0.11	0.37	0.08	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.03	0.07	0.31	0.09	0.17	0.01	0.21	0.01	0.16	0.07	0.12	0.19	0.03	0.32	0.02	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00