Doublet Group distance statistics: 54590

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 10, 20, 16, 4, 1, 1, 2, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.005, 0.007, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.005 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.003, 0.006, 0.009, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.006 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.003, 0.008, 0.012, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.003, 0.008, 0.014, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.002, 0.008, 0.013, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.010 std_dev=0.006
O2	A	0, 0.008, 0.019, 0.029, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.019 std_dev=0.010
O4	A	0, 0.003, 0.032, 0.062, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.032 std_dev=0.030
C2'	A	0, -0.028, 0.115, 0.258, 0.787 max_d=0.787 avg_d=0.115 std_dev=0.143
O4'	A	0, -0.027, 0.118, 0.263, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.118 std_dev=0.145
O2'	A	0, -0.019, 0.130, 0.279, 0.755 max_d=0.755 avg_d=0.130 std_dev=0.149
N3	B	0, 0.107, 0.299, 0.491, 1.060 max_d=1.060 avg_d=0.299 std_dev=0.192
C4	B	0, 0.086, 0.287, 0.487, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.287 std_dev=0.201
C2	B	0, 0.109, 0.316, 0.524, 1.195 max_d=1.195 avg_d=0.316 std_dev=0.208
C4'	A	0, -0.019, 0.195, 0.409, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.195 std_dev=0.214
C5	B	0, 0.069, 0.288, 0.507, 1.027 max_d=1.027 avg_d=0.288 std_dev=0.219
N9	B	0, 0.084, 0.308, 0.532, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.308 std_dev=0.224
N1	B	0, 0.098, 0.323, 0.549, 1.225 max_d=1.225 avg_d=0.323 std_dev=0.226
N2	B	0, 0.129, 0.358, 0.588, 1.339 max_d=1.339 avg_d=0.358 std_dev=0.229
C6	B	0, 0.078, 0.308, 0.539, 1.119 max_d=1.119 avg_d=0.308 std_dev=0.230
C3'	A	0, -0.031, 0.200, 0.431, 1.306 max_d=1.306 avg_d=0.200 std_dev=0.231
N7	B	0, 0.063, 0.309, 0.555, 1.175 max_d=1.175 avg_d=0.309 std_dev=0.246
C1'	B	0, 0.101, 0.348, 0.594, 1.052 max_d=1.052 avg_d=0.348 std_dev=0.246
C8	B	0, 0.071, 0.322, 0.573, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.322 std_dev=0.251
O6	B	0, 0.081, 0.341, 0.602, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.341 std_dev=0.261
O4'	B	0, 0.092, 0.390, 0.687, 1.579 max_d=1.579 avg_d=0.390 std_dev=0.297
C3'	B	0, 0.166, 0.463, 0.761, 1.507 max_d=1.507 avg_d=0.463 std_dev=0.298
C2'	B	0, 0.090, 0.423, 0.755, 1.749 max_d=1.749 avg_d=0.423 std_dev=0.332
O3'	A	0, -0.044, 0.297, 0.639, 1.928 max_d=1.928 avg_d=0.297 std_dev=0.342
C5'	A	0, -0.003, 0.343, 0.689, 2.009 max_d=2.009 avg_d=0.343 std_dev=0.346
C4'	B	0, 0.104, 0.482, 0.861, 2.175 max_d=2.175 avg_d=0.482 std_dev=0.379
O3'	B	0, 0.162, 0.568, 0.975, 1.841 max_d=1.841 avg_d=0.568 std_dev=0.407
O5'	B	0, 0.138, 0.551, 0.965, 2.374 max_d=2.374 avg_d=0.551 std_dev=0.414
OP2	B	0, 0.158, 0.646, 1.133, 2.435 max_d=2.435 avg_d=0.646 std_dev=0.488
O2'	B	0, -0.004, 0.493, 0.990, 2.793 max_d=2.793 avg_d=0.493 std_dev=0.497
C5'	B	0, 0.050, 0.578, 1.107, 3.200 max_d=3.200 avg_d=0.578 std_dev=0.528
O5'	A	0, -0.049, 0.484, 1.016, 2.840 max_d=2.840 avg_d=0.484 std_dev=0.532
P	B	0, 0.109, 0.671, 1.232, 2.868 max_d=2.868 avg_d=0.671 std_dev=0.562
P	A	0, -0.268, 0.633, 1.534, 4.023 max_d=4.023 avg_d=0.633 std_dev=0.901
OP2	A	0, -0.313, 0.712, 1.736, 4.848 max_d=4.848 avg_d=0.712 std_dev=1.025
OP1	B	0, -0.157, 0.868, 1.894, 5.779 max_d=5.779 avg_d=0.868 std_dev=1.025
OP1	A	0, -0.537, 0.783, 2.103, 6.191 max_d=6.191 avg_d=0.783 std_dev=1.320

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.24	0.18	0.17
C2	0.01	0.00	0.07	0.07	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.09	0.01	0.03	0.30	0.52	0.42	0.42
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.11	0.00	0.02	0.04	0.00	0.18	0.17	0.10	0.15
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.07	0.04	0.07	0.09	0.01	0.01	0.07	0.01	0.23	0.13	0.07	0.16
C4	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.07	0.00	0.02	0.43	0.91	0.64	0.67
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.03	0.02	0.04	0.01	0.05	0.00	0.01	0.22	0.08	0.07
C5	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.08	0.00	0.04	0.44	0.96	0.62	0.69
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.08	0.00	0.09	0.00	0.08	0.05	0.06	0.04	0.04	0.02	0.09	0.01	0.01	0.11	0.11	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.08	0.01	0.05	0.39	0.75	0.48	0.56
N1	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.29	0.50	0.37	0.39
N3	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.09	0.01	0.02	0.37	0.72	0.55	0.55
O2	0.01	0.00	0.11	0.09	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.13	0.01	0.05	0.24	0.38	0.36	0.32
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.03	0.04	0.03	0.04	0.04	0.01	0.05	0.10	0.00	0.03	0.04	0.03	0.04	0.31	0.09	0.10
O3'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.07	0.01	0.08	0.02	0.08	0.04	0.09	0.13	0.03	0.00	0.08	0.01	0.16	0.19	0.14	0.07
O4	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.02	0.45	1.02	0.70	0.73
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.02	0.00	0.04	0.21	0.10	0.09
O5'	0.14	0.30	0.18	0.23	0.43	0.01	0.44	0.01	0.39	0.29	0.37	0.24	0.04	0.16	0.45	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.24	0.52	0.17	0.13	0.91	0.22	0.96	0.11	0.75	0.50	0.72	0.38	0.31	0.19	1.02	0.21	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	0.42	0.10	0.07	0.64	0.08	0.62	0.11	0.48	0.37	0.55	0.36	0.09	0.14	0.70	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.42	0.15	0.16	0.67	0.07	0.69	0.01	0.56	0.39	0.55	0.32	0.10	0.07	0.73	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.10	0.16	0.11	0.14	0.21	0.18	0.23	0.17	0.20	0.13	0.15	0.09	0.21	0.16	0.25	0.30	0.23	0.26	0.19	0.54	0.19	0.27
C2	0.15	0.15	0.14	0.17	0.09	0.26	0.12	0.29	0.12	0.18	0.12	0.21	0.14	0.19	0.14	0.18	0.31	0.25	0.30	0.14	0.64	0.23	0.33
C2'	0.18	0.09	0.21	0.11	0.13	0.18	0.16	0.21	0.16	0.19	0.12	0.13	0.09	0.20	0.16	0.33	0.25	0.19	0.24	0.19	0.46	0.16	0.21
C3'	0.14	0.13	0.15	0.11	0.13	0.20	0.19	0.22	0.21	0.19	0.18	0.16	0.10	0.22	0.15	0.23	0.30	0.21	0.25	0.24	0.54	0.18	0.25
C4	0.17	0.20	0.16	0.18	0.13	0.27	0.10	0.34	0.08	0.19	0.16	0.25	0.18	0.19	0.16	0.17	0.27	0.26	0.33	0.10	0.87	0.27	0.44
C4'	0.16	0.18	0.11	0.15	0.18	0.23	0.22	0.24	0.23	0.21	0.21	0.18	0.15	0.23	0.18	0.16	0.38	0.26	0.28	0.26	0.59	0.21	0.31
C5	0.15	0.18	0.13	0.15	0.13	0.24	0.16	0.31	0.13	0.20	0.13	0.25	0.15	0.22	0.15	0.13	0.26	0.25	0.30	0.18	0.83	0.23	0.41
C5'	0.21	0.29	0.12	0.20	0.26	0.27	0.29	0.29	0.32	0.26	0.32	0.30	0.25	0.29	0.24	0.13	0.44	0.31	0.34	0.34	0.71	0.26	0.40
C6	0.14	0.12	0.12	0.13	0.12	0.22	0.17	0.27	0.16	0.20	0.11	0.22	0.11	0.22	0.15	0.13	0.27	0.24	0.28	0.20	0.73	0.21	0.36
N1	0.14	0.10	0.12	0.13	0.10	0.22	0.15	0.26	0.14	0.19	0.10	0.19	0.08	0.20	0.14	0.17	0.29	0.24	0.28	0.17	0.65	0.21	0.32
N3	0.17	0.19	0.17	0.19	0.11	0.28	0.09	0.34	0.09	0.18	0.15	0.24	0.17	0.17	0.14	0.17	0.30	0.26	0.33	0.12	0.77	0.26	0.39
O2	0.19	0.17	0.18	0.21	0.15	0.28	0.15	0.30	0.14	0.20	0.15	0.20	0.17	0.20	0.18	0.25	0.34	0.26	0.31	0.15	0.54	0.24	0.29
O2'	0.23	0.14	0.29	0.12	0.17	0.20	0.18	0.23	0.17	0.22	0.15	0.15	0.15	0.21	0.20	0.45	0.23	0.20	0.23	0.19	0.37	0.16	0.19
O3'	0.15	0.15	0.18	0.10	0.13	0.18	0.18	0.21	0.21	0.19	0.20	0.18	0.10	0.21	0.14	0.28	0.28	0.19	0.24	0.25	0.49	0.16	0.22
O4	0.20	0.23	0.21	0.20	0.16	0.29	0.13	0.38	0.12	0.21	0.20	0.27	0.20	0.19	0.18	0.21	0.27	0.26	0.35	0.10	0.96	0.30	0.49
O4'	0.17	0.12	0.11	0.17	0.17	0.26	0.21	0.27	0.21	0.21	0.17	0.11	0.13	0.23	0.18	0.15	0.40	0.28	0.30	0.23	0.61	0.23	0.34
O5'	0.24	0.34	0.15	0.22	0.33	0.31	0.41	0.36	0.46	0.35	0.43	0.27	0.29	0.41	0.30	0.20	0.40	0.35	0.42	0.50	0.86	0.38	0.54
OP1	0.34	0.58	0.26	0.31	0.58	0.36	0.79	0.50	0.94	0.66	0.85	0.44	0.45	0.81	0.51	0.25	0.39	0.42	0.52	1.11	1.05	0.64	0.74
OP2	0.48	0.70	0.40	0.47	0.65	0.50	0.75	0.58	0.84	0.66	0.83	0.64	0.60	0.74	0.59	0.40	0.65	0.54	0.68	0.90	1.16	0.69	0.84
P	0.27	0.46	0.14	0.23	0.45	0.30	0.59	0.40	0.69	0.49	0.64	0.36	0.36	0.59	0.39	0.15	0.40	0.37	0.47	0.78	0.97	0.51	0.65

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.15	0.00	0.15	0.02	0.33	0.09	0.18
C2	0.03	0.00	0.13	0.11	0.00	0.02	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.10	0.06	0.14	0.01	0.50	0.17	0.23
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.11	0.06	0.06	0.10	0.16	0.13	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.25	0.05	0.32	0.17	0.27
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.11	0.00	0.14	0.01	0.15	0.12	0.13	0.10	0.09	0.14	0.09	0.01	0.01	0.01	0.09	0.16	0.23	0.12	0.12
C4	0.01	0.00	0.07	0.11	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.07	0.04	0.15	0.01	0.51	0.16	0.24
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.07	0.04	0.02	0.02	0.08	0.04	0.12	0.02	0.00	0.01	0.07	0.10	0.08	0.02
C5	0.01	0.00	0.04	0.14	0.00	0.06	0.00	0.17	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.06	0.03	0.16	0.01	0.61	0.21	0.27
C5'	0.06	0.12	0.11	0.01	0.13	0.00	0.17	0.00	0.18	0.17	0.15	0.10	0.10	0.19	0.12	0.03	0.10	0.01	0.01	0.20	0.12	0.18	0.01
C6	0.02	0.00	0.06	0.15	0.01	0.06	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.06	0.04	0.16	0.00	0.63	0.24	0.28
C8	0.01	0.00	0.06	0.12	0.00	0.07	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.07	0.03	0.17	0.01	0.59	0.18	0.28
N1	0.02	0.00	0.10	0.13	0.01	0.04	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.07	0.05	0.15	0.01	0.58	0.21	0.26
N2	0.03	0.00	0.16	0.10	0.01	0.02	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.14	0.07	0.14	0.01	0.47	0.16	0.21
N3	0.02	0.00	0.13	0.09	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.12	0.06	0.14	0.01	0.46	0.14	0.21
N7	0.01	0.00	0.04	0.14	0.00	0.08	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.13	0.09	0.02	0.17	0.01	0.67	0.24	0.30
N9	0.01	0.01	0.01	0.09	0.00	0.04	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.06	0.01	0.15	0.01	0.47	0.13	0.23
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.06	0.12	0.09	0.03	0.09	0.12	0.07	0.10	0.07	0.13	0.07	0.00	0.03	0.08	0.19	0.11	0.25	0.15	0.22
O3'	0.15	0.10	0.01	0.01	0.07	0.02	0.06	0.10	0.06	0.07	0.07	0.14	0.12	0.09	0.06	0.03	0.00	0.12	0.14	0.08	0.43	0.26	0.25
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.05	0.07	0.06	0.02	0.01	0.08	0.12	0.00	0.08	0.04	0.21	0.09	0.09
O5'	0.15	0.14	0.25	0.09	0.15	0.01	0.16	0.01	0.16	0.17	0.15	0.14	0.14	0.17	0.15	0.19	0.14	0.08	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.05	0.16	0.01	0.07	0.01	0.20	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.08	0.04	0.16	0.00	0.68	0.27	0.30
OP1	0.33	0.50	0.32	0.23	0.51	0.10	0.61	0.12	0.63	0.59	0.58	0.47	0.46	0.67	0.47	0.25	0.43	0.21	0.01	0.68	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.17	0.17	0.12	0.16	0.08	0.21	0.18	0.24	0.18	0.21	0.16	0.14	0.24	0.13	0.15	0.26	0.09	0.01	0.27	0.01	0.00	0.00
P	0.18	0.23	0.27	0.12	0.24	0.02	0.27	0.01	0.28	0.28	0.26	0.21	0.21	0.30	0.23	0.22	0.25	0.09	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00