Doublet Group distance statistics: 54592

back

Distances from reference structure (by RMSD)

10, 21, 13, 7, 3, 1, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.010, 0.015, 0.019, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.015 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.009, 0.013, 0.018, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.005, 0.014, 0.022, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.014 std_dev=0.009
O2	A	0, 0.028, 0.053, 0.079, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.053 std_dev=0.025
O4	A	0, 0.012, 0.067, 0.123, 0.266 max_d=0.266 avg_d=0.067 std_dev=0.055
C2'	A	0, 0.036, 0.115, 0.194, 0.532 max_d=0.532 avg_d=0.115 std_dev=0.079
O4'	A	0, 0.009, 0.092, 0.174, 0.477 max_d=0.477 avg_d=0.092 std_dev=0.082
C4'	A	0, 0.029, 0.172, 0.315, 1.110 max_d=1.110 avg_d=0.172 std_dev=0.143
N3	B	0, 0.064, 0.209, 0.353, 0.662 max_d=0.662 avg_d=0.209 std_dev=0.144
C2	B	0, 0.066, 0.219, 0.372, 0.748 max_d=0.748 avg_d=0.219 std_dev=0.153
C4	B	0, 0.050, 0.204, 0.358, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.204 std_dev=0.154
N1	B	0, 0.046, 0.216, 0.386, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.216 std_dev=0.170
C5	B	0, 0.040, 0.215, 0.389, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.215 std_dev=0.174
N9	B	0, 0.043, 0.225, 0.407, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.225 std_dev=0.182
N2	B	0, 0.078, 0.260, 0.442, 0.888 max_d=0.888 avg_d=0.260 std_dev=0.182
C6	B	0, 0.033, 0.215, 0.398, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.215 std_dev=0.182
C5'	A	0, 0.083, 0.272, 0.461, 1.101 max_d=1.101 avg_d=0.272 std_dev=0.189
C1'	B	0, 0.043, 0.249, 0.454, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.249 std_dev=0.205
N7	B	0, 0.043, 0.253, 0.462, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.253 std_dev=0.210
C8	B	0, 0.040, 0.253, 0.465, 1.295 max_d=1.295 avg_d=0.253 std_dev=0.212
O6	B	0, 0.024, 0.242, 0.460, 1.338 max_d=1.338 avg_d=0.242 std_dev=0.218
O2'	A	0, -0.022, 0.232, 0.485, 1.490 max_d=1.490 avg_d=0.232 std_dev=0.254
O5'	A	0, 0.054, 0.314, 0.575, 1.493 max_d=1.493 avg_d=0.314 std_dev=0.260
C2'	B	0, 0.027, 0.290, 0.554, 1.519 max_d=1.519 avg_d=0.290 std_dev=0.263
C3'	A	0, -0.103, 0.209, 0.520, 1.556 max_d=1.556 avg_d=0.209 std_dev=0.312
C4'	B	0, 0.017, 0.331, 0.644, 1.653 max_d=1.653 avg_d=0.331 std_dev=0.314
C3'	B	0, 0.018, 0.332, 0.647, 1.872 max_d=1.872 avg_d=0.332 std_dev=0.314
O4'	B	0, -0.010, 0.304, 0.618, 2.105 max_d=2.105 avg_d=0.304 std_dev=0.314
P	A	0, 0.015, 0.381, 0.747, 2.237 max_d=2.237 avg_d=0.381 std_dev=0.366
O2'	B	0, -0.021, 0.354, 0.729, 2.570 max_d=2.570 avg_d=0.354 std_dev=0.375
O3'	B	0, -0.007, 0.412, 0.831, 2.775 max_d=2.775 avg_d=0.412 std_dev=0.419
OP2	A	0, -0.024, 0.447, 0.918, 3.451 max_d=3.451 avg_d=0.447 std_dev=0.471
OP1	B	0, -0.013, 0.466, 0.944, 2.510 max_d=2.510 avg_d=0.466 std_dev=0.479
C5'	B	0, -0.107, 0.389, 0.885, 3.374 max_d=3.374 avg_d=0.389 std_dev=0.496
O5'	B	0, -0.146, 0.396, 0.938, 3.634 max_d=3.634 avg_d=0.396 std_dev=0.542
P	B	0, -0.198, 0.447, 1.092, 4.082 max_d=4.082 avg_d=0.447 std_dev=0.645
O3'	A	0, -0.363, 0.290, 0.942, 3.238 max_d=3.238 avg_d=0.290 std_dev=0.652
OP1	A	0, -0.161, 0.506, 1.174, 3.668 max_d=3.668 avg_d=0.506 std_dev=0.667
OP2	B	0, -0.464, 0.576, 1.616, 5.774 max_d=5.774 avg_d=0.576 std_dev=1.040

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.18	0.01	0.00	0.12	0.37	0.16	0.14
C2	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.17	0.01	0.03	0.12	0.44	0.27	0.14
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.10	0.05	0.02	0.05	0.08	0.00	0.03	0.05	0.02	0.21	0.37	0.14	0.23
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.16	0.00	0.20	0.01	0.19	0.09	0.11	0.07	0.02	0.01	0.17	0.01	0.05	0.09	0.11	0.06
C4	0.01	0.01	0.04	0.16	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.03	0.00	0.02	0.15	0.52	0.39	0.16
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.04	0.04	0.02	0.14	0.02	0.06	0.00	0.02	0.13	0.08	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.20	0.00	0.08	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.09	0.01	0.03	0.16	0.54	0.39	0.16
C5'	0.04	0.05	0.10	0.01	0.09	0.01	0.11	0.00	0.09	0.05	0.07	0.04	0.05	0.11	0.10	0.01	0.01	0.09	0.16	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.19	0.01	0.08	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.08	0.01	0.03	0.14	0.51	0.30	0.15
N1	0.00	0.01	0.02	0.09	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.08	0.01	0.01	0.12	0.44	0.24	0.14
N3	0.01	0.00	0.05	0.11	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.11	0.01	0.02	0.13	0.48	0.34	0.15
O2	0.02	0.00	0.08	0.07	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.17	0.29	0.01	0.04	0.12	0.40	0.24	0.14
O2'	0.01	0.15	0.00	0.02	0.17	0.14	0.13	0.05	0.11	0.10	0.17	0.17	0.00	0.05	0.18	0.08	0.14	0.29	0.11	0.18
O3'	0.18	0.17	0.03	0.01	0.03	0.02	0.09	0.11	0.08	0.08	0.11	0.29	0.05	0.00	0.04	0.11	0.20	0.18	0.27	0.21
O4	0.01	0.01	0.05	0.17	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.04	0.00	0.02	0.16	0.53	0.42	0.17
O4'	0.00	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.08	0.11	0.02	0.00	0.07	0.31	0.15	0.11
O5'	0.12	0.12	0.21	0.05	0.15	0.02	0.16	0.01	0.14	0.12	0.13	0.12	0.14	0.20	0.16	0.07	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.37	0.44	0.37	0.09	0.52	0.13	0.54	0.09	0.51	0.44	0.48	0.40	0.29	0.18	0.53	0.31	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.27	0.14	0.11	0.39	0.08	0.39	0.16	0.30	0.24	0.34	0.24	0.11	0.27	0.42	0.15	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.14	0.23	0.06	0.16	0.03	0.16	0.01	0.15	0.14	0.15	0.14	0.18	0.21	0.17	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.12	0.18	0.08	0.09	0.09	0.13	0.19	0.16	0.10	0.14	0.13	0.10	0.15	0.06	0.31	0.14	0.12	0.40	0.19	0.10	0.48	0.34
C2	0.12	0.14	0.17	0.10	0.08	0.10	0.07	0.14	0.13	0.12	0.15	0.16	0.11	0.09	0.09	0.25	0.13	0.09	0.35	0.16	0.14	0.54	0.35
C2'	0.06	0.13	0.15	0.05	0.09	0.12	0.12	0.25	0.14	0.11	0.13	0.15	0.11	0.14	0.06	0.29	0.12	0.17	0.43	0.17	0.10	0.50	0.36
C3'	0.10	0.14	0.16	0.06	0.09	0.20	0.13	0.38	0.12	0.18	0.11	0.18	0.14	0.20	0.09	0.34	0.13	0.27	0.56	0.16	0.26	0.60	0.50
C4	0.09	0.12	0.17	0.14	0.06	0.10	0.07	0.10	0.07	0.13	0.10	0.17	0.09	0.12	0.09	0.19	0.16	0.08	0.31	0.11	0.21	0.43	0.30
C4'	0.12	0.13	0.12	0.08	0.15	0.22	0.19	0.38	0.18	0.23	0.15	0.13	0.12	0.24	0.15	0.30	0.11	0.31	0.53	0.21	0.24	0.56	0.45
C5	0.08	0.12	0.19	0.17	0.07	0.10	0.10	0.10	0.11	0.12	0.12	0.16	0.09	0.12	0.09	0.21	0.21	0.08	0.30	0.13	0.20	0.33	0.26
C5'	0.19	0.16	0.18	0.13	0.17	0.24	0.18	0.36	0.17	0.22	0.16	0.17	0.16	0.22	0.18	0.33	0.20	0.36	0.42	0.18	0.26	0.59	0.40
C6	0.08	0.13	0.20	0.15	0.08	0.09	0.11	0.10	0.13	0.12	0.13	0.15	0.10	0.13	0.08	0.25	0.20	0.09	0.32	0.15	0.17	0.35	0.26
N1	0.09	0.12	0.18	0.10	0.06	0.08	0.09	0.13	0.13	0.10	0.14	0.15	0.10	0.11	0.06	0.27	0.15	0.09	0.35	0.16	0.12	0.45	0.31
N3	0.11	0.13	0.16	0.11	0.07	0.10	0.05	0.11	0.08	0.13	0.13	0.17	0.10	0.11	0.10	0.21	0.13	0.09	0.32	0.11	0.18	0.52	0.33
O2	0.14	0.15	0.17	0.10	0.10	0.13	0.11	0.19	0.16	0.13	0.17	0.16	0.12	0.11	0.12	0.26	0.12	0.12	0.38	0.19	0.15	0.63	0.39
O2'	0.13	0.17	0.23	0.13	0.09	0.14	0.15	0.21	0.22	0.12	0.21	0.19	0.11	0.15	0.08	0.39	0.22	0.14	0.29	0.27	0.18	0.46	0.24
O3'	0.16	0.18	0.09	0.18	0.24	0.32	0.36	0.56	0.36	0.42	0.25	0.16	0.16	0.48	0.26	0.29	0.12	0.38	0.80	0.43	0.49	0.83	0.76
O4	0.10	0.12	0.17	0.16	0.10	0.13	0.12	0.14	0.11	0.15	0.11	0.17	0.10	0.16	0.11	0.17	0.17	0.10	0.31	0.14	0.24	0.43	0.31
O4'	0.07	0.14	0.15	0.05	0.13	0.12	0.18	0.24	0.19	0.17	0.16	0.14	0.12	0.21	0.11	0.31	0.13	0.20	0.42	0.21	0.13	0.46	0.34
O5'	0.20	0.18	0.25	0.19	0.16	0.21	0.17	0.28	0.16	0.19	0.16	0.20	0.19	0.20	0.17	0.37	0.29	0.32	0.34	0.17	0.22	0.53	0.34
OP1	0.43	0.46	0.24	0.28	0.46	0.42	0.48	0.43	0.49	0.44	0.48	0.45	0.45	0.46	0.44	0.32	0.33	0.52	0.48	0.50	0.44	0.76	0.57
OP2	0.15	0.27	0.22	0.19	0.18	0.22	0.20	0.29	0.24	0.19	0.27	0.32	0.22	0.20	0.15	0.21	0.26	0.30	0.29	0.25	0.23	0.41	0.23
P	0.22	0.13	0.29	0.27	0.14	0.23	0.14	0.24	0.12	0.18	0.11	0.16	0.15	0.18	0.17	0.38	0.38	0.31	0.25	0.14	0.24	0.54	0.32

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.19	0.01	0.18	0.11	0.11
C2	0.01	0.00	0.04	0.10	0.01	0.12	0.00	0.20	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.07	0.10	0.32	0.01	0.35	0.38	0.35
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.11	0.04	0.24	0.13	0.11
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.05	0.14	0.05	0.15	0.10	0.13	0.06	0.01	0.01	0.01	0.10	0.07	0.30	0.14	0.15
C4	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.04	0.05	0.30	0.01	0.29	0.39	0.31
C4'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.05	0.11	0.08	0.16	0.11	0.09	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.05	0.11	0.24	0.06
C5	0.01	0.00	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.08	0.03	0.35	0.01	0.32	0.60	0.41
C5'	0.02	0.20	0.01	0.01	0.07	0.00	0.08	0.00	0.09	0.20	0.15	0.27	0.17	0.17	0.07	0.03	0.02	0.01	0.01	0.10	0.10	0.19	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.05	0.35	0.00	0.35	0.64	0.44
C8	0.01	0.01	0.04	0.14	0.00	0.11	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.13	0.06	0.42	0.01	0.25	0.58	0.42
N1	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.04	0.08	0.33	0.01	0.36	0.52	0.40
N2	0.02	0.00	0.04	0.15	0.01	0.16	0.01	0.27	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.12	0.11	0.35	0.01	0.37	0.36	0.36
N3	0.01	0.00	0.04	0.10	0.00	0.11	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.08	0.09	0.29	0.01	0.32	0.29	0.29
N7	0.01	0.01	0.04	0.13	0.00	0.09	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.14	0.03	0.42	0.01	0.30	0.73	0.48
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.30	0.01	0.24	0.33	0.27
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.04	0.03	0.03	0.03	0.04	0.04	0.07	0.12	0.08	0.03	0.02	0.00	0.03	0.03	0.04	0.04	0.17	0.25	0.10
O3'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.04	0.01	0.08	0.02	0.07	0.13	0.04	0.12	0.08	0.14	0.06	0.03	0.00	0.01	0.14	0.10	0.35	0.21	0.18
O4'	0.00	0.10	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.06	0.08	0.11	0.09	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.17	0.04	0.17	0.17	0.09
O5'	0.19	0.32	0.11	0.10	0.30	0.01	0.35	0.01	0.35	0.42	0.33	0.35	0.29	0.42	0.30	0.04	0.14	0.17	0.00	0.37	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.10	0.04	0.37	0.00	0.37	0.76	0.49
OP1	0.18	0.35	0.24	0.30	0.29	0.11	0.32	0.10	0.35	0.25	0.36	0.37	0.32	0.30	0.24	0.17	0.35	0.17	0.01	0.37	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.38	0.13	0.14	0.39	0.24	0.60	0.19	0.64	0.58	0.52	0.36	0.29	0.73	0.33	0.25	0.21	0.17	0.02	0.76	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.35	0.11	0.15	0.31	0.06	0.41	0.01	0.44	0.42	0.40	0.36	0.29	0.48	0.27	0.10	0.18	0.09	0.00	0.49	0.00	0.01	0.00