Doublet Group distance statistics: 54595

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 4, 5, 2, 5, 3, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.008 std_dev=0.005
N3	A	0, -0.001, 0.005, 0.011, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.005 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.005, 0.013, 0.020, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.007, 0.018, 0.030, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.008, 0.020, 0.031, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.007, 0.019, 0.031, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.019 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.016, 0.042, 0.069, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.042 std_dev=0.027
O4'	A	0, 0.023, 0.089, 0.156, 0.240 max_d=0.240 avg_d=0.089 std_dev=0.067
O4	A	0, 0.057, 0.129, 0.202, 0.289 max_d=0.289 avg_d=0.129 std_dev=0.073
C2'	A	0, 0.036, 0.117, 0.197, 0.318 max_d=0.318 avg_d=0.117 std_dev=0.081
O2'	A	0, 0.041, 0.159, 0.277, 0.509 max_d=0.509 avg_d=0.159 std_dev=0.118
C4'	A	0, 0.057, 0.195, 0.332, 0.467 max_d=0.467 avg_d=0.195 std_dev=0.137
C3'	A	0, 0.047, 0.207, 0.367, 0.460 max_d=0.460 avg_d=0.207 std_dev=0.160
C6	B	0, 0.128, 0.315, 0.502, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.315 std_dev=0.187
C5	B	0, 0.151, 0.341, 0.531, 0.786 max_d=0.786 avg_d=0.341 std_dev=0.190
O6	B	0, 0.143, 0.350, 0.557, 0.874 max_d=0.874 avg_d=0.350 std_dev=0.207
N1	B	0, 0.154, 0.362, 0.569, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.362 std_dev=0.207
C5'	A	0, 0.133, 0.345, 0.557, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.345 std_dev=0.212
C4	B	0, 0.143, 0.359, 0.576, 0.929 max_d=0.929 avg_d=0.359 std_dev=0.216
N7	B	0, 0.215, 0.441, 0.666, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.441 std_dev=0.226
O3'	A	0, 0.069, 0.300, 0.530, 0.645 max_d=0.645 avg_d=0.300 std_dev=0.230
N9	B	0, 0.202, 0.449, 0.697, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.449 std_dev=0.248
O5'	B	0, 0.134, 0.387, 0.641, 1.075 max_d=1.075 avg_d=0.387 std_dev=0.254
C2	B	0, 0.144, 0.401, 0.658, 1.170 max_d=1.170 avg_d=0.401 std_dev=0.257
O4'	B	0, 0.092, 0.352, 0.613, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.352 std_dev=0.261
N3	B	0, 0.125, 0.386, 0.647, 1.156 max_d=1.156 avg_d=0.386 std_dev=0.261
C8	B	0, 0.228, 0.492, 0.755, 0.873 max_d=0.873 avg_d=0.492 std_dev=0.263
C1'	B	0, 0.228, 0.539, 0.850, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.539 std_dev=0.311
N2	B	0, 0.201, 0.528, 0.856, 1.409 max_d=1.409 avg_d=0.528 std_dev=0.327
P	B	0, 0.308, 0.669, 1.030, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.669 std_dev=0.361
C5'	B	0, 0.088, 0.486, 0.884, 1.617 max_d=1.617 avg_d=0.486 std_dev=0.398
C4'	B	0, 0.076, 0.480, 0.884, 1.667 max_d=1.667 avg_d=0.480 std_dev=0.404
C3'	B	0, 0.174, 0.700, 1.225, 2.225 max_d=2.225 avg_d=0.700 std_dev=0.525
OP1	B	0, 0.326, 0.868, 1.410, 1.951 max_d=1.951 avg_d=0.868 std_dev=0.542
C2'	B	0, 0.311, 0.876, 1.441, 1.910 max_d=1.910 avg_d=0.876 std_dev=0.565
O3'	B	0, 0.334, 1.152, 1.969, 2.808 max_d=2.808 avg_d=1.152 std_dev=0.818
OP2	B	0, 0.346, 1.165, 1.984, 2.654 max_d=2.654 avg_d=1.165 std_dev=0.819
O2'	B	0, 0.353, 1.394, 2.435, 3.031 max_d=3.031 avg_d=1.394 std_dev=1.041
O5'	A	0, 0.241, 1.505, 2.770, 2.968 max_d=2.968 avg_d=1.505 std_dev=1.264
P	A	0, 0.368, 2.099, 3.829, 3.961 max_d=3.961 avg_d=2.099 std_dev=1.730
OP2	A	0, 0.488, 2.308, 4.129, 4.311 max_d=4.311 avg_d=2.308 std_dev=1.820
OP1	A	0, 0.497, 2.486, 4.474, 4.648 max_d=4.648 avg_d=2.486 std_dev=1.988

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.50	0.53	0.39	0.54
C2	0.01	0.00	0.05	0.03	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.10	0.00	0.03	0.74	0.85	0.85	0.91
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.03	0.05	0.02	0.05	0.08	0.00	0.01	0.07	0.01	0.53	0.45	0.30	0.45
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.06	0.02	0.03	0.07	0.01	0.01	0.06	0.00	0.13	0.10	0.21	0.05
C4	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.04	0.00	0.02	1.01	1.31	1.33	1.34
C4'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.06	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.05	0.00	0.01	0.17	0.22	0.02
C5	0.01	0.00	0.06	0.07	0.01	0.06	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	1.06	1.39	1.33	1.39
C5'	0.02	0.05	0.03	0.01	0.11	0.00	0.13	0.00	0.12	0.06	0.08	0.02	0.02	0.01	0.13	0.01	0.01	0.37	0.32	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.97	1.19	1.07	1.19
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.76	0.87	0.79	0.90
N3	0.01	0.00	0.05	0.03	0.00	0.02	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.08	0.00	0.02	0.88	1.07	1.11	1.13
O2	0.02	0.00	0.08	0.07	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.14	0.01	0.04	0.58	0.63	0.66	0.72
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.02	0.07	0.14	0.00	0.01	0.05	0.01	0.48	0.36	0.32	0.42
O3'	0.06	0.10	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.08	0.14	0.01	0.00	0.04	0.03	0.10	0.17	0.31	0.16
O4	0.01	0.00	0.07	0.06	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.04	0.00	0.03	1.06	1.43	1.47	1.44
O4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.03	0.00	0.32	0.46	0.19	0.38
O5'	0.50	0.74	0.53	0.13	1.01	0.01	1.06	0.01	0.97	0.76	0.88	0.58	0.48	0.10	1.06	0.32	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.53	0.85	0.45	0.10	1.31	0.17	1.39	0.37	1.19	0.87	1.07	0.63	0.36	0.17	1.43	0.46	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.39	0.85	0.30	0.21	1.33	0.22	1.33	0.32	1.07	0.79	1.11	0.66	0.32	0.31	1.47	0.19	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.54	0.91	0.45	0.05	1.34	0.02	1.39	0.01	1.19	0.90	1.13	0.72	0.42	0.16	1.44	0.38	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.19	0.14	0.16	0.06	0.20	0.13	0.28	0.12	0.22	0.15	0.27	0.13	0.23	0.14	0.19	0.35	0.17	0.13	0.16	0.15	0.41	0.20
C2	0.20	0.12	0.25	0.19	0.14	0.19	0.18	0.26	0.17	0.22	0.13	0.22	0.11	0.23	0.19	0.25	0.40	0.19	0.14	0.22	0.15	0.37	0.19
C2'	0.14	0.19	0.10	0.12	0.05	0.22	0.12	0.32	0.13	0.21	0.15	0.27	0.13	0.22	0.11	0.22	0.36	0.14	0.11	0.18	0.13	0.47	0.21
C3'	0.12	0.21	0.13	0.11	0.09	0.19	0.13	0.30	0.16	0.18	0.19	0.28	0.17	0.21	0.08	0.16	0.25	0.10	0.10	0.19	0.13	0.49	0.22
C4	0.22	0.12	0.34	0.15	0.14	0.24	0.17	0.29	0.18	0.21	0.17	0.23	0.09	0.21	0.19	0.44	0.61	0.23	0.17	0.22	0.20	0.26	0.16
C4'	0.12	0.22	0.12	0.10	0.11	0.20	0.13	0.31	0.15	0.20	0.19	0.28	0.19	0.21	0.09	0.18	0.28	0.10	0.13	0.17	0.15	0.37	0.18
C5	0.24	0.16	0.34	0.16	0.13	0.26	0.16	0.31	0.16	0.23	0.18	0.30	0.08	0.21	0.20	0.54	0.66	0.24	0.18	0.19	0.22	0.24	0.17
C5'	0.16	0.21	0.11	0.16	0.12	0.28	0.14	0.41	0.14	0.21	0.17	0.27	0.19	0.20	0.13	0.37	0.40	0.11	0.20	0.15	0.26	0.23	0.13
C6	0.23	0.18	0.29	0.16	0.12	0.25	0.16	0.31	0.15	0.24	0.17	0.31	0.10	0.23	0.20	0.47	0.58	0.23	0.17	0.18	0.20	0.28	0.17
N1	0.20	0.15	0.23	0.16	0.10	0.21	0.15	0.29	0.14	0.23	0.14	0.27	0.09	0.23	0.18	0.30	0.45	0.20	0.15	0.18	0.16	0.35	0.18
N3	0.21	0.11	0.30	0.18	0.15	0.21	0.18	0.27	0.19	0.22	0.16	0.21	0.12	0.22	0.19	0.32	0.49	0.21	0.16	0.23	0.17	0.31	0.17
O2	0.19	0.15	0.23	0.24	0.16	0.16	0.19	0.23	0.18	0.22	0.14	0.21	0.15	0.24	0.19	0.18	0.29	0.17	0.13	0.24	0.16	0.44	0.22
O2'	0.15	0.18	0.12	0.14	0.08	0.20	0.14	0.29	0.15	0.21	0.16	0.27	0.13	0.23	0.12	0.18	0.31	0.14	0.10	0.21	0.15	0.57	0.26
O3'	0.13	0.27	0.22	0.15	0.16	0.16	0.19	0.22	0.24	0.17	0.27	0.31	0.22	0.22	0.12	0.18	0.15	0.14	0.10	0.27	0.22	0.62	0.31
O4	0.21	0.14	0.35	0.15	0.15	0.25	0.18	0.30	0.20	0.20	0.20	0.22	0.11	0.20	0.18	0.46	0.67	0.24	0.17	0.24	0.22	0.23	0.16
O4'	0.14	0.21	0.11	0.14	0.06	0.21	0.13	0.29	0.13	0.24	0.17	0.28	0.17	0.24	0.13	0.20	0.35	0.17	0.15	0.15	0.17	0.35	0.19
O5'	0.10	0.36	0.36	0.61	0.14	0.75	0.14	1.16	0.16	0.33	0.27	0.50	0.30	0.30	0.14	0.22	0.77	0.35	0.98	0.16	1.18	0.72	0.95
OP1	0.39	0.64	0.10	0.38	0.38	0.38	0.21	0.95	0.27	0.17	0.47	0.83	0.63	0.18	0.25	0.76	0.38	0.20	0.91	0.19	1.46	0.95	1.15
OP2	0.13	0.53	0.18	0.66	0.25	0.82	0.21	1.24	0.28	0.30	0.43	0.72	0.45	0.29	0.16	0.53	0.89	0.37	1.01	0.26	1.39	0.80	1.06
P	0.21	0.62	0.13	0.58	0.33	0.71	0.23	1.21	0.31	0.22	0.50	0.79	0.56	0.21	0.18	0.58	0.74	0.21	1.01	0.27	1.43	0.86	1.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.34	0.00	0.19	0.01	0.33	0.42	0.28
C2	0.02	0.00	0.25	0.15	0.01	0.11	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.37	0.21	0.15	0.01	0.18	0.24	0.17
C2'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.13	0.01	0.06	0.23	0.11	0.14	0.19	0.31	0.24	0.08	0.01	0.00	0.03	0.01	0.52	0.08	0.72	0.97	0.74
C3'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.22	0.00	0.33	0.01	0.32	0.38	0.24	0.09	0.11	0.41	0.23	0.01	0.01	0.02	0.08	0.37	0.31	0.32	0.22
C4	0.01	0.01	0.13	0.22	0.00	0.02	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.15	0.19	0.11	0.13	0.01	0.17	0.25	0.17
C4'	0.00	0.11	0.01	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.04	0.20	0.05	0.16	0.11	0.17	0.07	0.33	0.02	0.00	0.01	0.08	0.16	0.14	0.07
C5	0.00	0.01	0.06	0.33	0.00	0.07	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.30	0.03	0.05	0.12	0.01	0.19	0.31	0.19
C5'	0.09	0.17	0.23	0.01	0.10	0.00	0.06	0.00	0.08	0.11	0.13	0.22	0.17	0.10	0.05	0.09	0.23	0.01	0.01	0.07	0.06	0.04	0.01
C6	0.01	0.00	0.11	0.32	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.27	0.05	0.09	0.13	0.00	0.21	0.35	0.21
C8	0.01	0.01	0.14	0.38	0.00	0.20	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.40	0.20	0.12	0.13	0.01	0.19	0.29	0.18
N1	0.02	0.00	0.19	0.24	0.01	0.05	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.21	0.16	0.13	0.00	0.16	0.29	0.18
N2	0.03	0.00	0.31	0.09	0.01	0.16	0.01	0.22	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.19	0.50	0.24	0.17	0.01	0.21	0.23	0.18
N3	0.02	0.00	0.24	0.11	0.00	0.11	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.41	0.21	0.17	0.01	0.21	0.25	0.19
N7	0.01	0.01	0.08	0.41	0.01	0.17	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.42	0.21	0.06	0.16	0.01	0.26	0.37	0.24
N9	0.00	0.01	0.01	0.23	0.00	0.07	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.21	0.09	0.01	0.12	0.01	0.18	0.28	0.18
O2'	0.02	0.10	0.00	0.01	0.15	0.33	0.30	0.09	0.27	0.40	0.15	0.19	0.10	0.42	0.21	0.00	0.05	0.23	0.37	0.34	0.67	1.14	0.70
O3'	0.34	0.37	0.03	0.01	0.19	0.02	0.03	0.23	0.05	0.20	0.21	0.50	0.41	0.21	0.09	0.05	0.00	0.25	0.21	0.08	0.24	0.15	0.19
O4'	0.00	0.21	0.01	0.02	0.11	0.00	0.05	0.01	0.09	0.12	0.16	0.24	0.21	0.06	0.01	0.23	0.25	0.00	0.07	0.06	0.09	0.11	0.07
O5'	0.19	0.15	0.52	0.08	0.13	0.01	0.12	0.01	0.13	0.13	0.13	0.17	0.17	0.16	0.12	0.37	0.21	0.07	0.00	0.16	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.08	0.37	0.01	0.08	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.34	0.08	0.06	0.16	0.00	0.28	0.45	0.27
OP1	0.33	0.18	0.72	0.31	0.17	0.16	0.19	0.06	0.21	0.19	0.16	0.21	0.21	0.26	0.18	0.67	0.24	0.09	0.01	0.28	0.00	0.01	0.01
OP2	0.42	0.24	0.97	0.32	0.25	0.14	0.31	0.04	0.35	0.29	0.29	0.23	0.25	0.37	0.28	1.14	0.15	0.11	0.02	0.45	0.01	0.00	0.00
P	0.28	0.17	0.74	0.22	0.17	0.07	0.19	0.01	0.21	0.18	0.18	0.18	0.19	0.24	0.18	0.70	0.19	0.07	0.00	0.27	0.01	0.00	0.00