Doublet Group distance statistics: 54596

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 7, 4, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.008, 0.014, 0.021, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.013 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.036, 0.053, 0.070, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.053 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.046, 0.065, 0.083, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.065 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.048, 0.066, 0.084, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.066 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.046, 0.065, 0.083, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.065 std_dev=0.019
C6	A	0, 0.047, 0.066, 0.085, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.066 std_dev=0.019
O2	A	0, 0.095, 0.140, 0.185, 0.221 max_d=0.221 avg_d=0.140 std_dev=0.045
O4	A	0, 0.160, 0.254, 0.348, 0.461 max_d=0.461 avg_d=0.254 std_dev=0.094
O3'	A	0, 0.495, 0.669, 0.843, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.669 std_dev=0.174
C4'	A	0, 0.614, 0.829, 1.045, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.829 std_dev=0.216
C5	B	0, 0.576, 0.797, 1.018, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.797 std_dev=0.221
O4'	A	0, 0.694, 0.921, 1.149, 1.050 max_d=1.050 avg_d=0.921 std_dev=0.228
C3'	A	0, 0.592, 0.825, 1.059, 1.177 max_d=1.177 avg_d=0.825 std_dev=0.233
C4	B	0, 0.628, 0.867, 1.107, 1.232 max_d=1.232 avg_d=0.867 std_dev=0.240
C6	B	0, 0.687, 0.944, 1.202, 1.207 max_d=1.207 avg_d=0.944 std_dev=0.258
N7	B	0, 0.708, 0.974, 1.239, 1.206 max_d=1.206 avg_d=0.974 std_dev=0.266
N1	B	0, 0.781, 1.065, 1.349, 1.334 max_d=1.334 avg_d=1.065 std_dev=0.284
C2	B	0, 0.739, 1.023, 1.307, 1.452 max_d=1.452 avg_d=1.023 std_dev=0.284
N3	B	0, 0.675, 0.959, 1.243, 1.489 max_d=1.489 avg_d=0.959 std_dev=0.284
N9	B	0, 0.854, 1.159, 1.463, 1.452 max_d=1.452 avg_d=1.159 std_dev=0.304
C8	B	0, 0.869, 1.190, 1.511, 1.533 max_d=1.533 avg_d=1.190 std_dev=0.321
C2'	A	0, 0.974, 1.297, 1.621, 1.563 max_d=1.563 avg_d=1.297 std_dev=0.324
O6	B	0, 0.858, 1.203, 1.548, 1.503 max_d=1.503 avg_d=1.203 std_dev=0.345
N2	B	0, 0.964, 1.319, 1.675, 1.701 max_d=1.701 avg_d=1.319 std_dev=0.355
C2'	B	0, 1.077, 1.454, 1.831, 1.853 max_d=1.853 avg_d=1.454 std_dev=0.377
OP1	A	0, 0.557, 0.937, 1.316, 1.653 max_d=1.653 avg_d=0.937 std_dev=0.380
C5'	A	0, 1.108, 1.506, 1.905, 1.984 max_d=1.984 avg_d=1.506 std_dev=0.399
P	A	0, 0.968, 1.368, 1.769, 1.893 max_d=1.893 avg_d=1.368 std_dev=0.401
C1'	B	0, 1.133, 1.549, 1.966, 1.987 max_d=1.987 avg_d=1.549 std_dev=0.416
O5'	A	0, 1.289, 1.739, 2.188, 2.126 max_d=2.126 avg_d=1.739 std_dev=0.449
C3'	B	0, 1.087, 1.540, 1.992, 2.090 max_d=2.090 avg_d=1.540 std_dev=0.453
O2'	B	0, 1.339, 1.819, 2.300, 2.391 max_d=2.391 avg_d=1.819 std_dev=0.480
P	B	0, 1.332, 1.829, 2.326, 2.473 max_d=2.473 avg_d=1.829 std_dev=0.497
C4'	B	0, 1.385, 1.892, 2.400, 2.316 max_d=2.316 avg_d=1.892 std_dev=0.507
O4'	B	0, 1.280, 1.797, 2.315, 2.537 max_d=2.537 avg_d=1.797 std_dev=0.518
O3'	B	0, 1.238, 1.769, 2.299, 2.445 max_d=2.445 avg_d=1.769 std_dev=0.531
C5'	B	0, 1.518, 2.069, 2.620, 2.579 max_d=2.579 avg_d=2.069 std_dev=0.551
OP2	A	0, 1.320, 1.902, 2.484, 2.606 max_d=2.606 avg_d=1.902 std_dev=0.582
O2'	A	0, 1.859, 2.463, 3.066, 2.760 max_d=2.760 avg_d=2.463 std_dev=0.603
O5'	B	0, 1.849, 2.503, 3.158, 3.243 max_d=3.243 avg_d=2.503 std_dev=0.655
OP2	B	0, 1.922, 2.578, 3.234, 3.213 max_d=3.213 avg_d=2.578 std_dev=0.656
OP1	B	0, 1.939, 2.644, 3.348, 3.404 max_d=3.404 avg_d=2.644 std_dev=0.704

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.04	0.02	0.05	0.02	0.01	0.08	0.14	0.12	0.08
C2	0.02	0.00	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.09	0.01	0.02	0.11	0.16	0.20	0.13
C2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.04	0.01	0.06	0.04	0.06	0.02	0.02	0.08	0.01	0.02	0.04	0.01	0.07	0.18	0.14	0.09
C3'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.07	0.02	0.02	0.08	0.01	0.01	0.05	0.01	0.05	0.14	0.10	0.05
C4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.05	0.01	0.05	0.13	0.20	0.29	0.17
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.07	0.02	0.03	0.04	0.03	0.03	0.07	0.00	0.01	0.12	0.05	0.02
C5	0.03	0.01	0.06	0.07	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.06	0.01	0.05	0.13	0.21	0.30	0.18
C5'	0.02	0.05	0.04	0.02	0.12	0.01	0.13	0.00	0.11	0.06	0.08	0.04	0.03	0.04	0.13	0.01	0.01	0.13	0.06	0.02
C6	0.03	0.01	0.06	0.07	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.06	0.01	0.05	0.12	0.18	0.24	0.15
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.02	0.01	0.11	0.16	0.19	0.13
N3	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.07	0.01	0.03	0.11	0.17	0.25	0.14
O2	0.04	0.00	0.08	0.08	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.14	0.02	0.04	0.11	0.16	0.19	0.12
O2'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.06	0.03	0.07	0.03	0.07	0.04	0.06	0.11	0.00	0.04	0.06	0.02	0.07	0.20	0.19	0.11
O3'	0.05	0.09	0.02	0.01	0.05	0.03	0.06	0.04	0.06	0.05	0.07	0.14	0.04	0.00	0.05	0.05	0.06	0.15	0.12	0.06
O4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.05	0.00	0.06	0.13	0.22	0.32	0.18
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.03	0.04	0.02	0.05	0.06	0.00	0.08	0.11	0.12	0.07
O5'	0.08	0.11	0.07	0.05	0.13	0.01	0.13	0.01	0.12	0.11	0.11	0.11	0.07	0.06	0.13	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.14	0.16	0.18	0.14	0.20	0.12	0.21	0.13	0.18	0.16	0.17	0.16	0.20	0.15	0.22	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.20	0.14	0.10	0.29	0.05	0.30	0.06	0.24	0.19	0.25	0.19	0.19	0.12	0.32	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.13	0.09	0.05	0.17	0.02	0.18	0.02	0.15	0.13	0.14	0.12	0.11	0.06	0.18	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.21	0.24	0.19	0.09	0.16	0.13	0.18	0.16	0.28	0.21	0.28	0.13	0.24	0.21	0.23	0.18	0.26	0.11	0.22	0.10	0.07	0.03
C2	0.28	0.19	0.32	0.26	0.13	0.21	0.16	0.19	0.14	0.38	0.21	0.27	0.11	0.35	0.27	0.31	0.26	0.29	0.10	0.24	0.12	0.11	0.06
C2'	0.23	0.20	0.21	0.17	0.09	0.15	0.13	0.14	0.16	0.26	0.20	0.30	0.14	0.23	0.19	0.21	0.15	0.25	0.07	0.21	0.11	0.12	0.05
C3'	0.19	0.21	0.15	0.09	0.10	0.10	0.13	0.07	0.18	0.17	0.20	0.27	0.16	0.17	0.13	0.19	0.07	0.21	0.07	0.21	0.11	0.06	0.03
C4	0.24	0.14	0.28	0.22	0.16	0.17	0.23	0.19	0.14	0.37	0.13	0.27	0.08	0.39	0.26	0.28	0.22	0.23	0.13	0.21	0.10	0.10	0.04
C4'	0.16	0.21	0.12	0.07	0.12	0.07	0.15	0.14	0.19	0.15	0.21	0.25	0.17	0.16	0.11	0.18	0.07	0.17	0.14	0.21	0.15	0.05	0.05
C5	0.21	0.15	0.24	0.18	0.15	0.14	0.22	0.19	0.16	0.34	0.12	0.29	0.08	0.35	0.23	0.23	0.18	0.20	0.15	0.22	0.10	0.10	0.06
C5'	0.16	0.20	0.15	0.12	0.13	0.12	0.15	0.15	0.18	0.14	0.20	0.26	0.17	0.16	0.12	0.25	0.13	0.15	0.15	0.20	0.16	0.05	0.04
C6	0.21	0.17	0.22	0.17	0.13	0.14	0.19	0.19	0.13	0.31	0.14	0.31	0.10	0.32	0.22	0.21	0.17	0.20	0.15	0.19	0.10	0.09	0.06
N1	0.25	0.19	0.27	0.21	0.12	0.17	0.16	0.19	0.13	0.33	0.18	0.29	0.11	0.31	0.24	0.25	0.20	0.26	0.11	0.20	0.10	0.09	0.04
N3	0.27	0.16	0.32	0.26	0.15	0.20	0.20	0.19	0.11	0.39	0.18	0.27	0.09	0.38	0.28	0.32	0.26	0.27	0.10	0.19	0.11	0.12	0.05
O2	0.32	0.19	0.37	0.31	0.13	0.25	0.13	0.19	0.20	0.38	0.24	0.25	0.12	0.31	0.28	0.36	0.30	0.34	0.10	0.31	0.15	0.14	0.11
O2'	0.28	0.21	0.28	0.26	0.14	0.23	0.16	0.21	0.16	0.32	0.20	0.29	0.16	0.27	0.24	0.26	0.25	0.31	0.11	0.21	0.12	0.13	0.08
O3'	0.22	0.21	0.17	0.13	0.13	0.14	0.14	0.06	0.19	0.16	0.22	0.26	0.18	0.14	0.15	0.20	0.09	0.26	0.01	0.21	0.03	0.01	0.01
O4	0.24	0.12	0.30	0.23	0.17	0.18	0.26	0.19	0.17	0.39	0.11	0.24	0.07	0.40	0.27	0.30	0.24	0.22	0.13	0.25	0.10	0.11	0.04
O4'	0.19	0.21	0.17	0.13	0.07	0.13	0.13	0.20	0.19	0.20	0.22	0.27	0.14	0.18	0.15	0.18	0.13	0.21	0.16	0.21	0.13	0.06	0.06
O5'	0.16	0.17	0.14	0.09	0.09	0.10	0.14	0.13	0.14	0.18	0.13	0.29	0.15	0.19	0.12	0.23	0.10	0.14	0.15	0.18	0.10	0.08	0.06
OP1	0.32	0.16	0.35	0.31	0.18	0.32	0.16	0.26	0.12	0.24	0.09	0.25	0.22	0.21	0.24	0.49	0.35	0.31	0.28	0.16	0.20	0.17	0.17
OP2	0.13	0.25	0.13	0.10	0.15	0.13	0.25	0.15	0.31	0.23	0.29	0.36	0.16	0.29	0.14	0.22	0.13	0.13	0.21	0.37	0.21	0.17	0.17
P	0.14	0.12	0.15	0.12	0.06	0.14	0.14	0.16	0.16	0.16	0.12	0.25	0.10	0.20	0.10	0.27	0.16	0.13	0.19	0.21	0.10	0.08	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.02	0.03	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.05	0.07	0.05	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.04	0.03	0.11	0.09	0.09
C2	0.06	0.00	0.06	0.08	0.01	0.10	0.01	0.24	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.06	0.10	0.24	0.02	0.14	0.22	0.18
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.05	0.05	0.07	0.06	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.07	0.09	0.05
C3'	0.02	0.08	0.01	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.12	0.11	0.10	0.08	0.07	0.13	0.07	0.02	0.01	0.02	0.02	0.13	0.04	0.11	0.03
C4	0.03	0.01	0.03	0.08	0.00	0.09	0.01	0.22	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.06	0.05	0.20	0.02	0.06	0.19	0.11
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.09	0.00	0.11	0.01	0.12	0.10	0.11	0.11	0.09	0.12	0.07	0.07	0.03	0.00	0.01	0.14	0.05	0.08	0.03
C5	0.02	0.01	0.04	0.11	0.01	0.11	0.00	0.27	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.10	0.03	0.24	0.02	0.09	0.25	0.16
C5'	0.04	0.24	0.02	0.01	0.22	0.01	0.27	0.00	0.29	0.20	0.28	0.24	0.20	0.26	0.16	0.06	0.03	0.01	0.01	0.32	0.02	0.06	0.01
C6	0.03	0.01	0.04	0.12	0.02	0.12	0.01	0.29	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.10	0.11	0.05	0.27	0.01	0.12	0.28	0.20
C8	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.10	0.01	0.20	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.12	0.04	0.17	0.03	0.10	0.23	0.13
N1	0.05	0.00	0.05	0.10	0.02	0.11	0.01	0.28	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.08	0.08	0.27	0.01	0.13	0.26	0.20
N2	0.07	0.00	0.07	0.08	0.01	0.11	0.01	0.24	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.06	0.12	0.25	0.02	0.19	0.23	0.21
N3	0.05	0.01	0.06	0.07	0.01	0.09	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.12	0.05	0.09	0.20	0.02	0.11	0.18	0.13
N7	0.01	0.01	0.05	0.13	0.01	0.12	0.00	0.26	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.13	0.02	0.22	0.03	0.11	0.27	0.17
N9	0.00	0.02	0.02	0.07	0.01	0.07	0.01	0.16	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.14	0.03	0.06	0.16	0.08
O2'	0.02	0.14	0.01	0.02	0.08	0.07	0.08	0.06	0.10	0.06	0.12	0.16	0.12	0.07	0.04	0.00	0.05	0.06	0.09	0.10	0.13	0.09	0.09
O3'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.06	0.03	0.10	0.03	0.11	0.12	0.08	0.06	0.05	0.13	0.06	0.05	0.00	0.03	0.04	0.13	0.07	0.17	0.06
O4'	0.00	0.10	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.04	0.08	0.12	0.09	0.02	0.01	0.06	0.03	0.00	0.04	0.04	0.11	0.09	0.11
O5'	0.04	0.24	0.02	0.02	0.20	0.01	0.24	0.01	0.27	0.17	0.27	0.25	0.20	0.22	0.14	0.09	0.04	0.04	0.00	0.29	0.02	0.01	0.01
O6	0.03	0.02	0.05	0.13	0.02	0.14	0.02	0.32	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.10	0.13	0.04	0.29	0.00	0.15	0.31	0.23
OP1	0.11	0.14	0.07	0.04	0.06	0.05	0.09	0.02	0.12	0.10	0.13	0.19	0.11	0.11	0.06	0.13	0.07	0.11	0.02	0.15	0.00	0.02	0.01
OP2	0.09	0.22	0.09	0.11	0.19	0.08	0.25	0.06	0.28	0.23	0.26	0.23	0.18	0.27	0.16	0.09	0.17	0.09	0.01	0.31	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.18	0.05	0.03	0.11	0.03	0.16	0.01	0.20	0.13	0.20	0.21	0.13	0.17	0.08	0.09	0.06	0.11	0.01	0.23	0.01	0.01	0.00