Doublet Group distance statistics: 54597

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 3, 2, 3, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.004, 0.009, 0.015, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.006, 0.012, 0.017, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.004, 0.012, 0.019, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.001, 0.014, 0.027, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.014 std_dev=0.013
N3	A	0, -0.002, 0.013, 0.027, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.013 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.001, 0.016, 0.031, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.016 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.001, 0.017, 0.034, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.017 std_dev=0.017
O4	A	0, 0.021, 0.045, 0.070, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.045 std_dev=0.024
O2	A	0, -0.003, 0.040, 0.083, 0.161 max_d=0.161 avg_d=0.040 std_dev=0.043
N9	B	0, 0.205, 0.410, 0.615, 0.847 max_d=0.847 avg_d=0.410 std_dev=0.205
C1'	B	0, 0.173, 0.383, 0.593, 0.914 max_d=0.914 avg_d=0.383 std_dev=0.210
O4'	B	0, 0.176, 0.391, 0.606, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.391 std_dev=0.215
C4	B	0, 0.248, 0.469, 0.691, 0.896 max_d=0.896 avg_d=0.469 std_dev=0.221
C8	B	0, 0.205, 0.449, 0.692, 0.935 max_d=0.935 avg_d=0.449 std_dev=0.243
N3	B	0, 0.271, 0.515, 0.760, 0.974 max_d=0.974 avg_d=0.515 std_dev=0.245
C5	B	0, 0.279, 0.532, 0.785, 0.922 max_d=0.922 avg_d=0.532 std_dev=0.253
C2	B	0, 0.317, 0.588, 0.859, 1.045 max_d=1.045 avg_d=0.588 std_dev=0.271
P	B	0, 0.206, 0.489, 0.771, 1.007 max_d=1.007 avg_d=0.489 std_dev=0.283
N1	B	0, 0.343, 0.626, 0.908, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.626 std_dev=0.283
N7	B	0, 0.249, 0.532, 0.815, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.532 std_dev=0.283
C6	B	0, 0.329, 0.617, 0.906, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.617 std_dev=0.289
N2	B	0, 0.367, 0.674, 0.981, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.674 std_dev=0.307
O5'	B	0, 0.133, 0.474, 0.815, 1.305 max_d=1.305 avg_d=0.474 std_dev=0.341
C2'	B	0, 0.194, 0.547, 0.900, 1.348 max_d=1.348 avg_d=0.547 std_dev=0.353
O6	B	0, 0.347, 0.701, 1.054, 1.371 max_d=1.371 avg_d=0.701 std_dev=0.354
C4'	B	0, 0.043, 0.418, 0.794, 1.467 max_d=1.467 avg_d=0.418 std_dev=0.375
C3'	B	0, 0.171, 0.561, 0.952, 1.519 max_d=1.519 avg_d=0.561 std_dev=0.391
O2'	B	0, 0.272, 0.788, 1.305, 2.004 max_d=2.004 avg_d=0.788 std_dev=0.516
C5'	B	0, -0.041, 0.486, 1.012, 2.129 max_d=2.129 avg_d=0.486 std_dev=0.527
OP1	B	0, 0.165, 0.803, 1.440, 2.623 max_d=2.623 avg_d=0.803 std_dev=0.637
O3'	B	0, 0.032, 0.710, 1.387, 2.349 max_d=2.349 avg_d=0.710 std_dev=0.678
O4'	A	0, -0.392, 0.308, 1.007, 2.615 max_d=2.615 avg_d=0.308 std_dev=0.700
C2'	A	0, -0.418, 0.333, 1.084, 2.809 max_d=2.809 avg_d=0.333 std_dev=0.751
OP2	B	0, -0.166, 0.746, 1.657, 3.628 max_d=3.628 avg_d=0.746 std_dev=0.912
O2'	A	0, -0.505, 0.419, 1.343, 3.463 max_d=3.463 avg_d=0.419 std_dev=0.924
C4'	A	0, -0.524, 0.443, 1.410, 3.634 max_d=3.634 avg_d=0.443 std_dev=0.967
C3'	A	0, -0.624, 0.509, 1.642, 4.244 max_d=4.244 avg_d=0.509 std_dev=1.133
O3'	A	0, -0.839, 0.717, 2.272, 5.846 max_d=5.846 avg_d=0.717 std_dev=1.556
C5'	A	0, -0.967, 0.794, 2.554, 6.595 max_d=6.595 avg_d=0.794 std_dev=1.761
O5'	A	0, -1.112, 0.944, 3.000, 7.736 max_d=7.736 avg_d=0.944 std_dev=2.056
P	A	0, -1.399, 1.339, 4.077, 10.358 max_d=10.358 avg_d=1.339 std_dev=2.738
OP1	A	0, -1.149, 1.734, 4.618, 11.046 max_d=11.046 avg_d=1.734 std_dev=2.884
OP2	A	0, -1.578, 1.571, 4.721, 11.977 max_d=11.977 avg_d=1.571 std_dev=3.150

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.07	0.01	0.01	0.02	0.00	0.08	0.32	0.17	0.12
C2	0.04	0.00	0.13	0.08	0.01	0.20	0.01	0.32	0.01	0.01	0.00	0.01	0.22	0.06	0.01	0.24	0.43	0.98	0.36	0.56
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.10	0.02	0.10	0.23	0.00	0.01	0.05	0.00	0.05	0.16	0.15	0.06
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.10	0.00	0.17	0.01	0.18	0.06	0.07	0.18	0.01	0.01	0.10	0.00	0.10	0.19	0.16	0.09
C4	0.02	0.01	0.04	0.10	0.00	0.09	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.11	0.00	0.05	0.21	0.41	0.69	0.25
C4'	0.00	0.20	0.01	0.00	0.09	0.00	0.27	0.01	0.30	0.05	0.12	0.42	0.02	0.01	0.08	0.00	0.01	0.06	0.12	0.03
C5	0.01	0.01	0.08	0.17	0.01	0.27	0.00	0.47	0.00	0.01	0.01	0.02	0.19	0.14	0.01	0.23	0.59	0.31	1.11	0.70
C5'	0.02	0.32	0.01	0.01	0.15	0.01	0.47	0.00	0.50	0.08	0.20	0.71	0.02	0.02	0.15	0.00	0.01	0.12	0.23	0.01
C6	0.01	0.01	0.10	0.18	0.01	0.30	0.00	0.50	0.00	0.00	0.01	0.01	0.22	0.13	0.01	0.28	0.61	0.31	0.96	0.68
N1	0.02	0.01	0.02	0.06	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.06	0.01	0.02	0.13	0.38	0.36	0.16
N3	0.04	0.00	0.10	0.07	0.00	0.12	0.01	0.20	0.01	0.02	0.00	0.03	0.15	0.08	0.01	0.14	0.30	0.89	0.33	0.42
O2	0.07	0.01	0.23	0.18	0.03	0.42	0.02	0.71	0.01	0.01	0.03	0.00	0.43	0.09	0.03	0.45	0.91	1.54	0.86	1.13
O2'	0.01	0.22	0.00	0.01	0.04	0.02	0.19	0.02	0.22	0.01	0.15	0.43	0.00	0.03	0.04	0.03	0.04	0.14	0.09	0.04
O3'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.11	0.01	0.14	0.02	0.13	0.06	0.08	0.09	0.03	0.00	0.12	0.01	0.16	0.41	0.23	0.17
O4	0.02	0.01	0.05	0.10	0.00	0.08	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.12	0.00	0.04	0.21	0.44	0.75	0.26
O4'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.05	0.00	0.23	0.00	0.28	0.02	0.14	0.45	0.03	0.01	0.04	0.00	0.10	0.36	0.16	0.15
O5'	0.08	0.43	0.05	0.10	0.21	0.01	0.59	0.01	0.61	0.13	0.30	0.91	0.04	0.16	0.21	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.32	0.98	0.16	0.19	0.41	0.06	0.31	0.12	0.31	0.38	0.89	1.54	0.14	0.41	0.44	0.36	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.36	0.15	0.16	0.69	0.12	1.11	0.23	0.96	0.36	0.33	0.86	0.09	0.23	0.75	0.16	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.56	0.06	0.09	0.25	0.03	0.70	0.01	0.68	0.16	0.42	1.13	0.04	0.17	0.26	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.18	0.12	0.18	0.17	0.24	0.24	0.40	0.25	0.25	0.20	0.19	0.16	0.31	0.16	0.20	0.25	0.19	0.26	0.30	0.63	0.19	0.16
C2	0.23	0.22	0.17	0.18	0.16	0.19	0.18	0.27	0.21	0.19	0.18	0.26	0.23	0.26	0.16	0.26	0.35	0.21	0.25	0.27	0.69	0.33	0.19
C2'	0.61	0.29	0.57	0.54	0.33	0.51	0.20	0.41	0.17	0.31	0.20	0.32	0.37	0.18	0.43	0.76	0.55	0.60	0.62	0.19	0.13	0.47	0.54
C3'	0.61	0.43	0.57	0.56	0.54	0.48	0.54	0.50	0.48	0.69	0.43	0.39	0.47	0.63	0.62	0.69	0.48	0.56	0.92	0.46	0.47	0.92	1.00
C4	0.20	0.17	0.27	0.23	0.09	0.20	0.19	0.22	0.23	0.16	0.17	0.24	0.19	0.24	0.09	0.40	0.50	0.17	0.18	0.30	0.60	0.25	0.14
C4'	0.19	0.25	0.18	0.24	0.26	0.32	0.35	0.36	0.37	0.33	0.32	0.23	0.23	0.41	0.24	0.27	0.32	0.21	0.30	0.42	0.17	0.44	0.46
C5	0.15	0.18	0.23	0.22	0.15	0.24	0.23	0.28	0.26	0.19	0.22	0.20	0.17	0.27	0.11	0.45	0.49	0.19	0.17	0.30	0.54	0.14	0.12
C5'	0.27	0.33	0.33	0.43	0.36	0.54	0.58	0.46	0.64	0.51	0.50	0.27	0.27	0.70	0.30	0.43	0.59	0.36	0.35	0.79	0.30	0.71	0.62
C6	0.15	0.17	0.16	0.20	0.17	0.26	0.24	0.34	0.25	0.23	0.20	0.19	0.17	0.29	0.14	0.38	0.41	0.20	0.19	0.29	0.54	0.13	0.12
N1	0.17	0.17	0.12	0.16	0.14	0.22	0.22	0.34	0.23	0.21	0.18	0.19	0.16	0.29	0.12	0.27	0.32	0.19	0.23	0.28	0.63	0.20	0.15
N3	0.24	0.22	0.23	0.21	0.15	0.19	0.16	0.23	0.20	0.17	0.16	0.29	0.25	0.24	0.15	0.33	0.43	0.19	0.23	0.28	0.66	0.35	0.17
O2	0.25	0.28	0.17	0.19	0.22	0.19	0.20	0.28	0.23	0.21	0.24	0.32	0.28	0.25	0.20	0.23	0.31	0.23	0.30	0.27	0.76	0.44	0.25
O2'	0.54	0.23	0.51	0.50	0.21	0.53	0.20	0.36	0.27	0.13	0.21	0.28	0.29	0.25	0.28	0.79	0.58	0.58	0.44	0.41	0.22	0.22	0.31
O3'	0.80	0.51	0.82	0.88	0.65	0.83	0.64	0.91	0.54	0.84	0.50	0.47	0.58	0.74	0.77	0.94	0.84	0.81	1.30	0.50	1.02	1.22	1.48
O4	0.21	0.17	0.32	0.28	0.10	0.21	0.19	0.19	0.25	0.15	0.18	0.27	0.20	0.23	0.11	0.44	0.56	0.17	0.17	0.32	0.58	0.29	0.14
O4'	0.36	0.18	0.45	0.58	0.21	0.69	0.21	0.76	0.22	0.25	0.20	0.18	0.21	0.23	0.26	0.36	0.66	0.52	0.36	0.25	0.58	0.14	0.16
O5'	0.26	0.49	0.27	0.31	0.55	0.41	0.85	0.24	0.93	0.76	0.72	0.40	0.40	1.02	0.46	0.44	0.52	0.29	0.49	1.11	0.38	0.97	0.77
OP1	0.43	0.82	0.54	0.76	0.77	0.86	1.14	0.75	1.36	0.85	1.16	0.70	0.61	1.21	0.60	0.65	1.05	0.57	0.51	1.63	0.24	0.73	0.59
OP2	0.44	0.43	0.49	0.56	0.43	0.63	0.77	0.32	0.89	0.67	0.63	0.47	0.41	0.99	0.36	0.70	0.92	0.53	0.48	1.20	0.55	1.22	0.90
P	0.25	0.50	0.31	0.49	0.53	0.64	0.95	0.44	1.12	0.75	0.85	0.36	0.33	1.12	0.39	0.52	0.80	0.46	0.36	1.41	0.28	0.92	0.66

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.20	0.00	0.10	0.01	0.39	0.11	0.13
C2	0.01	0.00	0.15	0.18	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.30	0.07	0.20	0.01	0.52	0.40	0.15
C2'	0.00	0.15	0.00	0.01	0.07	0.03	0.05	0.15	0.07	0.13	0.10	0.19	0.15	0.10	0.04	0.00	0.08	0.02	0.32	0.06	0.43	0.31	0.36
C3'	0.02	0.18	0.01	0.00	0.17	0.00	0.21	0.01	0.23	0.18	0.21	0.17	0.15	0.21	0.14	0.02	0.02	0.01	0.13	0.24	0.18	0.21	0.13
C4	0.01	0.01	0.07	0.17	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.15	0.24	0.04	0.22	0.01	0.51	0.38	0.14
C4'	0.01	0.04	0.03	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.09	0.12	0.06	0.03	0.03	0.13	0.07	0.18	0.04	0.00	0.01	0.11	0.22	0.15	0.05
C5	0.01	0.01	0.05	0.21	0.00	0.10	0.00	0.20	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.22	0.24	0.03	0.29	0.01	0.57	0.51	0.17
C5'	0.05	0.11	0.15	0.01	0.14	0.00	0.20	0.00	0.20	0.22	0.16	0.08	0.09	0.24	0.13	0.09	0.14	0.02	0.01	0.23	0.18	0.24	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.23	0.01	0.09	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.21	0.27	0.04	0.30	0.00	0.59	0.56	0.18
C8	0.00	0.01	0.13	0.18	0.00	0.12	0.00	0.22	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.22	0.17	0.04	0.30	0.01	0.53	0.43	0.16
N1	0.01	0.01	0.10	0.21	0.00	0.06	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.18	0.29	0.06	0.26	0.01	0.57	0.50	0.17
N2	0.01	0.01	0.19	0.17	0.02	0.03	0.02	0.08	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.17	0.33	0.08	0.18	0.03	0.51	0.37	0.15
N3	0.01	0.01	0.15	0.15	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.13	0.28	0.06	0.18	0.01	0.48	0.32	0.13
N7	0.01	0.01	0.10	0.21	0.00	0.13	0.00	0.24	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.25	0.22	0.03	0.33	0.01	0.59	0.56	0.19
N9	0.00	0.01	0.04	0.14	0.00	0.07	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.14	0.18	0.01	0.20	0.01	0.47	0.30	0.13
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.15	0.18	0.22	0.09	0.21	0.22	0.18	0.17	0.13	0.25	0.14	0.00	0.10	0.13	0.26	0.24	0.37	0.27	0.32
O3'	0.20	0.30	0.08	0.02	0.24	0.04	0.24	0.14	0.27	0.17	0.29	0.33	0.28	0.22	0.18	0.10	0.00	0.14	0.19	0.28	0.26	0.30	0.16
O4'	0.00	0.07	0.02	0.01	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.04	0.06	0.08	0.06	0.03	0.01	0.13	0.14	0.00	0.10	0.04	0.37	0.10	0.19
O5'	0.10	0.20	0.32	0.13	0.22	0.01	0.29	0.01	0.30	0.30	0.26	0.18	0.18	0.33	0.20	0.26	0.19	0.10	0.00	0.33	0.01	0.01	0.01
O6	0.01	0.01	0.06	0.24	0.01	0.11	0.01	0.23	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.24	0.28	0.04	0.33	0.00	0.63	0.63	0.20
OP1	0.39	0.52	0.43	0.18	0.51	0.22	0.57	0.18	0.59	0.53	0.57	0.51	0.48	0.59	0.47	0.37	0.26	0.37	0.01	0.63	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.40	0.31	0.21	0.38	0.15	0.51	0.24	0.56	0.43	0.50	0.37	0.32	0.56	0.30	0.27	0.30	0.10	0.01	0.63	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.15	0.36	0.13	0.14	0.05	0.17	0.02	0.18	0.16	0.17	0.15	0.13	0.19	0.13	0.32	0.16	0.19	0.01	0.20	0.01	0.00	0.00