Doublet Group distance statistics: 54599

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 0, 0, 1, 3, 3, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.006, 0.009, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.008, 0.012, 0.017, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.012 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.009, 0.014, 0.019, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.014 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.007, 0.012, 0.018, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.012 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.011, 0.017, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.017 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.011, 0.017, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.017 std_dev=0.007
O4	A	0, 0.018, 0.030, 0.041, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.030 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.014, 0.026, 0.038, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.026 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.017, 0.031, 0.046, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.031 std_dev=0.015
O4'	A	0, 0.005, 0.186, 0.367, 0.584 max_d=0.584 avg_d=0.186 std_dev=0.181
C2'	A	0, 0.012, 0.196, 0.380, 0.634 max_d=0.634 avg_d=0.196 std_dev=0.184
C3'	A	0, 0.256, 0.475, 0.693, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.475 std_dev=0.218
C4'	A	0, 0.029, 0.258, 0.488, 0.714 max_d=0.714 avg_d=0.258 std_dev=0.230
O2'	A	0, 0.184, 0.421, 0.657, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.421 std_dev=0.236
N2	B	0, 0.443, 0.726, 1.008, 1.063 max_d=1.063 avg_d=0.726 std_dev=0.283
C2	B	0, 0.414, 0.699, 0.984, 1.050 max_d=1.050 avg_d=0.699 std_dev=0.285
C8	B	0, 0.363, 0.649, 0.935, 1.058 max_d=1.058 avg_d=0.649 std_dev=0.286
C4	B	0, 0.363, 0.649, 0.936, 1.047 max_d=1.047 avg_d=0.649 std_dev=0.287
N3	B	0, 0.376, 0.664, 0.951, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.664 std_dev=0.288
N9	B	0, 0.337, 0.628, 0.918, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.628 std_dev=0.291
C5	B	0, 0.389, 0.681, 0.973, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.681 std_dev=0.292
N7	B	0, 0.388, 0.681, 0.974, 1.005 max_d=1.005 avg_d=0.681 std_dev=0.293
N1	B	0, 0.434, 0.733, 1.031, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.733 std_dev=0.298
C6	B	0, 0.423, 0.733, 1.043, 1.037 max_d=1.037 avg_d=0.733 std_dev=0.310
C1'	B	0, 0.315, 0.638, 0.961, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.638 std_dev=0.323
P	A	0, 0.483, 0.816, 1.150, 1.487 max_d=1.487 avg_d=0.816 std_dev=0.334
O6	B	0, 0.451, 0.794, 1.137, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.794 std_dev=0.343
O4'	B	0, 0.320, 0.693, 1.065, 1.461 max_d=1.461 avg_d=0.693 std_dev=0.372
O3'	A	0, 0.665, 1.042, 1.420, 1.583 max_d=1.583 avg_d=1.042 std_dev=0.378
OP1	A	0, 0.642, 1.061, 1.481, 1.797 max_d=1.797 avg_d=1.061 std_dev=0.419
C2'	B	0, 0.491, 0.914, 1.338, 1.698 max_d=1.698 avg_d=0.914 std_dev=0.424
O5'	A	0, 0.449, 0.879, 1.308, 1.707 max_d=1.707 avg_d=0.879 std_dev=0.429
OP2	A	0, 0.448, 0.878, 1.308, 1.655 max_d=1.655 avg_d=0.878 std_dev=0.430
O2'	B	0, 0.474, 0.923, 1.372, 1.736 max_d=1.736 avg_d=0.923 std_dev=0.449
C5'	A	0, 0.113, 0.575, 1.036, 1.449 max_d=1.449 avg_d=0.575 std_dev=0.462
OP2	B	0, 0.549, 1.020, 1.490, 1.888 max_d=1.888 avg_d=1.020 std_dev=0.470
C4'	B	0, 0.501, 0.997, 1.493, 2.052 max_d=2.052 avg_d=0.997 std_dev=0.496
C3'	B	0, 0.583, 1.092, 1.601, 2.136 max_d=2.136 avg_d=1.092 std_dev=0.509
O3'	B	0, 0.662, 1.256, 1.849, 2.512 max_d=2.512 avg_d=1.256 std_dev=0.594
C5'	B	0, 0.673, 1.270, 1.866, 2.553 max_d=2.553 avg_d=1.270 std_dev=0.596
P	B	0, 0.771, 1.368, 1.966, 2.582 max_d=2.582 avg_d=1.368 std_dev=0.598
O5'	B	0, 0.998, 1.636, 2.275, 2.824 max_d=2.824 avg_d=1.636 std_dev=0.638
OP1	B	0, 1.160, 1.938, 2.716, 3.289 max_d=3.289 avg_d=1.938 std_dev=0.778

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.17	0.01	0.00	0.14	0.19	0.11	0.07
C2	0.01	0.00	0.07	0.04	0.00	0.06	0.01	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.17	0.00	0.07	0.17	0.13	0.19	0.07
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.02	0.03	0.06	0.17	0.08	0.01	0.05	0.12	0.00	0.04	0.02	0.01	0.13	0.22	0.21	0.16
C3'	0.02	0.04	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.06	0.03	0.04	0.06	0.01	0.01	0.05	0.02	0.05	0.27	0.10	0.11
C4	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.10	0.00	0.33	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.12	0.00	0.03	0.19	0.11	0.25	0.12
C4'	0.01	0.06	0.03	0.01	0.10	0.00	0.11	0.00	0.10	0.06	0.08	0.04	0.05	0.04	0.10	0.00	0.01	0.20	0.13	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.06	0.00	0.11	0.00	0.35	0.00	0.01	0.00	0.01	0.11	0.11	0.01	0.04	0.18	0.12	0.26	0.12
C5'	0.12	0.24	0.17	0.01	0.33	0.00	0.35	0.00	0.32	0.24	0.29	0.19	0.12	0.08	0.34	0.01	0.01	0.24	0.23	0.02
C6	0.01	0.00	0.08	0.06	0.00	0.10	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.12	0.01	0.05	0.17	0.10	0.21	0.09
N1	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.24	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.14	0.01	0.02	0.17	0.13	0.17	0.07
N3	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.08	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.15	0.00	0.06	0.18	0.11	0.22	0.09
O2	0.02	0.00	0.12	0.06	0.01	0.04	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00	0.20	0.20	0.01	0.10	0.15	0.15	0.17	0.07
O2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.07	0.05	0.11	0.12	0.12	0.04	0.08	0.20	0.00	0.04	0.07	0.02	0.13	0.24	0.27	0.19
O3'	0.17	0.17	0.04	0.01	0.12	0.04	0.11	0.08	0.12	0.14	0.15	0.20	0.04	0.00	0.11	0.20	0.05	0.39	0.14	0.16
O4	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.10	0.01	0.34	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.11	0.00	0.03	0.20	0.13	0.27	0.13
O4'	0.00	0.07	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.10	0.02	0.20	0.03	0.00	0.21	0.26	0.10	0.15
O5'	0.14	0.17	0.13	0.05	0.19	0.01	0.18	0.01	0.17	0.17	0.18	0.15	0.13	0.05	0.20	0.21	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.19	0.13	0.22	0.27	0.11	0.20	0.12	0.24	0.10	0.13	0.11	0.15	0.24	0.39	0.13	0.26	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.19	0.21	0.10	0.25	0.13	0.26	0.23	0.21	0.17	0.22	0.17	0.27	0.14	0.27	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.07	0.16	0.11	0.12	0.03	0.12	0.02	0.09	0.07	0.09	0.07	0.19	0.16	0.13	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.12	0.13	0.15	0.13	0.18	0.14	0.23	0.13	0.15	0.13	0.12	0.12	0.14	0.14	0.12	0.15	0.18	0.16	0.13	0.19	0.34	0.19
C2	0.13	0.06	0.13	0.11	0.08	0.15	0.08	0.17	0.09	0.10	0.07	0.09	0.08	0.10	0.10	0.15	0.12	0.16	0.10	0.12	0.16	0.28	0.15
C2'	0.13	0.14	0.13	0.17	0.14	0.21	0.18	0.29	0.20	0.18	0.17	0.13	0.12	0.20	0.14	0.13	0.17	0.20	0.17	0.22	0.22	0.40	0.23
C3'	0.17	0.12	0.18	0.24	0.14	0.27	0.15	0.35	0.15	0.20	0.13	0.11	0.12	0.18	0.17	0.18	0.24	0.24	0.19	0.16	0.26	0.45	0.28
C4	0.08	0.18	0.10	0.08	0.11	0.10	0.15	0.13	0.19	0.10	0.21	0.20	0.12	0.13	0.08	0.12	0.11	0.13	0.09	0.21	0.10	0.25	0.12
C4'	0.17	0.11	0.18	0.19	0.12	0.22	0.10	0.26	0.10	0.10	0.11	0.11	0.12	0.10	0.13	0.20	0.20	0.20	0.14	0.11	0.12	0.27	0.14
C5	0.08	0.22	0.11	0.08	0.15	0.10	0.16	0.15	0.19	0.11	0.22	0.24	0.18	0.13	0.10	0.12	0.10	0.13	0.10	0.19	0.10	0.27	0.13
C5'	0.20	0.22	0.21	0.14	0.18	0.12	0.14	0.12	0.14	0.11	0.18	0.24	0.22	0.11	0.16	0.26	0.15	0.13	0.25	0.12	0.25	0.14	0.19
C6	0.09	0.17	0.10	0.09	0.13	0.13	0.14	0.18	0.15	0.11	0.17	0.18	0.15	0.12	0.11	0.11	0.09	0.15	0.12	0.15	0.13	0.29	0.15
N1	0.10	0.10	0.09	0.09	0.08	0.14	0.10	0.19	0.11	0.10	0.11	0.10	0.08	0.10	0.09	0.10	0.09	0.15	0.11	0.12	0.15	0.30	0.16
N3	0.12	0.08	0.12	0.10	0.08	0.13	0.12	0.15	0.15	0.10	0.14	0.08	0.07	0.12	0.09	0.16	0.12	0.15	0.09	0.18	0.14	0.26	0.13
O2	0.18	0.17	0.19	0.17	0.17	0.18	0.13	0.19	0.10	0.15	0.12	0.19	0.19	0.14	0.17	0.21	0.18	0.19	0.12	0.09	0.21	0.28	0.17
O2'	0.16	0.22	0.16	0.22	0.23	0.23	0.31	0.32	0.33	0.28	0.28	0.19	0.19	0.34	0.22	0.12	0.21	0.21	0.27	0.37	0.33	0.47	0.32
O3'	0.36	0.30	0.38	0.45	0.35	0.44	0.37	0.52	0.34	0.44	0.31	0.27	0.31	0.42	0.39	0.34	0.45	0.41	0.36	0.34	0.46	0.66	0.47
O4	0.09	0.22	0.12	0.11	0.14	0.10	0.17	0.12	0.22	0.11	0.25	0.25	0.15	0.15	0.10	0.14	0.14	0.12	0.09	0.24	0.10	0.24	0.11
O4'	0.14	0.12	0.14	0.16	0.13	0.19	0.13	0.23	0.13	0.15	0.12	0.11	0.12	0.14	0.14	0.13	0.16	0.18	0.12	0.13	0.15	0.32	0.17
O5'	0.17	0.25	0.18	0.11	0.20	0.13	0.18	0.23	0.20	0.11	0.23	0.28	0.24	0.13	0.16	0.22	0.12	0.11	0.17	0.18	0.14	0.29	0.15
OP1	0.23	0.23	0.22	0.20	0.24	0.20	0.25	0.23	0.25	0.26	0.24	0.23	0.23	0.26	0.24	0.23	0.19	0.22	0.36	0.25	0.39	0.19	0.29
OP2	0.14	0.17	0.14	0.14	0.15	0.17	0.14	0.23	0.15	0.13	0.16	0.19	0.17	0.13	0.13	0.17	0.15	0.16	0.16	0.15	0.14	0.29	0.14
P	0.11	0.15	0.12	0.09	0.12	0.11	0.11	0.18	0.12	0.10	0.14	0.17	0.14	0.10	0.11	0.16	0.10	0.10	0.19	0.12	0.19	0.20	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.06	0.01	0.05	0.12	0.03
C2	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.08	0.02	0.08	0.00	0.10	0.14	0.08
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.05	0.05	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.03	0.07	0.12	0.06
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.04	0.05	0.08	0.06	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.03	0.09	0.12	0.08
C4	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.04	0.01	0.08	0.01	0.08	0.13	0.07
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.02	0.11	0.09	0.01
C5	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.03	0.01	0.09	0.00	0.11	0.14	0.08
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.04	0.04	0.04	0.03	0.04	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.04	0.16	0.08	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.09	0.00	0.13	0.14	0.09
C8	0.00	0.01	0.03	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.10	0.01	0.08	0.14	0.06
N1	0.02	0.00	0.04	0.05	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.02	0.09	0.00	0.12	0.14	0.09
N2	0.02	0.00	0.05	0.08	0.01	0.04	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.10	0.03	0.08	0.01	0.09	0.14	0.08
N3	0.02	0.00	0.05	0.06	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.07	0.02	0.07	0.00	0.07	0.13	0.07
N7	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.10	0.01	0.12	0.14	0.08
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.08	0.01	0.05	0.13	0.05
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.02	0.04	0.05	0.04	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.05	0.03	0.09	0.11	0.05
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.04	0.02	0.03	0.03	0.04	0.05	0.07	0.10	0.07	0.04	0.02	0.03	0.00	0.02	0.13	0.04	0.13	0.13	0.10
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.09	0.02	0.10	0.13	0.05
O5'	0.06	0.08	0.05	0.09	0.08	0.01	0.09	0.00	0.09	0.10	0.09	0.08	0.07	0.10	0.08	0.05	0.13	0.09	0.00	0.10	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.10	0.00	0.16	0.14	0.10
OP1	0.05	0.10	0.07	0.09	0.08	0.11	0.11	0.16	0.13	0.08	0.12	0.09	0.07	0.12	0.05	0.09	0.13	0.10	0.02	0.16	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.14	0.12	0.12	0.13	0.09	0.14	0.08	0.14	0.14	0.14	0.14	0.13	0.14	0.13	0.11	0.13	0.13	0.02	0.14	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.08	0.06	0.08	0.07	0.01	0.08	0.01	0.09	0.06	0.09	0.08	0.07	0.08	0.05	0.05	0.10	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00