Doublet Group distance statistics: 54600

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 4, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.006, 0.009, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.001, 0.005, 0.010, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.005 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.003, 0.010, 0.018, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.002, 0.010, 0.019, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.002, 0.012, 0.021, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.002, 0.011, 0.021, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.011 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.001, 0.011, 0.021, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.011 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.004, 0.023, 0.041, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.023 std_dev=0.019
O4	A	0, 0.009, 0.030, 0.052, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.030 std_dev=0.022
O4'	A	0, 0.074, 0.176, 0.279, 0.372 max_d=0.372 avg_d=0.176 std_dev=0.103
C2'	A	0, 0.095, 0.205, 0.315, 0.375 max_d=0.375 avg_d=0.205 std_dev=0.110
C6	B	0, 0.148, 0.334, 0.519, 0.640 max_d=0.640 avg_d=0.334 std_dev=0.185
O6	B	0, 0.128, 0.321, 0.515, 0.571 max_d=0.571 avg_d=0.321 std_dev=0.194
C5	B	0, 0.136, 0.353, 0.570, 0.801 max_d=0.801 avg_d=0.353 std_dev=0.217
N1	B	0, 0.148, 0.387, 0.626, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.387 std_dev=0.239
N7	B	0, 0.136, 0.376, 0.616, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.376 std_dev=0.240
O4'	B	0, 0.168, 0.420, 0.672, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.420 std_dev=0.252
C4'	A	0, 0.148, 0.426, 0.703, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.426 std_dev=0.277
O2'	A	0, 0.206, 0.484, 0.763, 0.997 max_d=0.997 avg_d=0.484 std_dev=0.279
C3'	A	0, 0.187, 0.472, 0.757, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.472 std_dev=0.285
C4	B	0, 0.117, 0.412, 0.708, 1.173 max_d=1.173 avg_d=0.412 std_dev=0.296
C2	B	0, 0.126, 0.438, 0.751, 1.267 max_d=1.267 avg_d=0.438 std_dev=0.312
C8	B	0, 0.132, 0.447, 0.762, 1.223 max_d=1.223 avg_d=0.447 std_dev=0.315
C4'	B	0, 0.149, 0.477, 0.804, 1.286 max_d=1.286 avg_d=0.477 std_dev=0.328
N3	B	0, 0.104, 0.452, 0.799, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.452 std_dev=0.348
N9	B	0, 0.109, 0.463, 0.818, 1.393 max_d=1.393 avg_d=0.463 std_dev=0.355
C5'	B	0, 0.106, 0.478, 0.850, 1.484 max_d=1.484 avg_d=0.478 std_dev=0.372
N2	B	0, 0.117, 0.509, 0.902, 1.569 max_d=1.569 avg_d=0.509 std_dev=0.392
C1'	B	0, 0.092, 0.539, 0.986, 1.735 max_d=1.735 avg_d=0.539 std_dev=0.447
OP1	B	0, 0.220, 0.709, 1.198, 1.852 max_d=1.852 avg_d=0.709 std_dev=0.489
C5'	A	0, 0.172, 0.678, 1.185, 1.969 max_d=1.969 avg_d=0.678 std_dev=0.507
C3'	B	0, 0.095, 0.611, 1.128, 2.026 max_d=2.026 avg_d=0.611 std_dev=0.517
O5'	B	0, -0.048, 0.473, 0.995, 1.930 max_d=1.930 avg_d=0.473 std_dev=0.522
P	B	0, 0.078, 0.618, 1.159, 2.124 max_d=2.124 avg_d=0.618 std_dev=0.541
O3'	B	0, 0.106, 0.680, 1.254, 2.186 max_d=2.186 avg_d=0.680 std_dev=0.574
C2'	B	0, 0.069, 0.653, 1.238, 2.274 max_d=2.274 avg_d=0.653 std_dev=0.585
O5'	A	0, 0.124, 0.715, 1.306, 2.269 max_d=2.269 avg_d=0.715 std_dev=0.591
O3'	A	0, 0.226, 0.836, 1.447, 1.687 max_d=1.687 avg_d=0.836 std_dev=0.611
OP2	B	0, 0.039, 0.751, 1.463, 2.746 max_d=2.746 avg_d=0.751 std_dev=0.712
O2'	B	0, 0.069, 0.794, 1.518, 2.779 max_d=2.779 avg_d=0.794 std_dev=0.725
P	A	0, -0.161, 0.892, 1.945, 3.950 max_d=3.950 avg_d=0.892 std_dev=1.053
OP2	A	0, -0.343, 1.055, 2.452, 5.166 max_d=5.166 avg_d=1.055 std_dev=1.398
OP1	A	0, -0.532, 1.082, 2.695, 5.863 max_d=5.863 avg_d=1.082 std_dev=1.613

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.22	0.01	0.01	0.12	0.11	0.30	0.09
C2	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.03	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.14	0.24	0.01	0.04	0.24	0.10	0.47	0.11
C2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.06	0.02	0.09	0.16	0.09	0.03	0.03	0.07	0.01	0.03	0.06	0.01	0.30	0.57	0.60	0.43
C3'	0.02	0.03	0.01	0.00	0.14	0.01	0.19	0.03	0.18	0.08	0.07	0.06	0.02	0.01	0.14	0.02	0.09	0.51	0.25	0.24
C4	0.01	0.00	0.06	0.14	0.00	0.08	0.00	0.27	0.00	0.01	0.00	0.01	0.17	0.12	0.00	0.03	0.35	0.24	0.55	0.19
C4'	0.02	0.03	0.02	0.01	0.08	0.00	0.12	0.01	0.12	0.03	0.03	0.08	0.16	0.04	0.08	0.01	0.01	0.14	0.05	0.05
C5	0.01	0.01	0.09	0.19	0.00	0.12	0.00	0.32	0.00	0.01	0.00	0.01	0.16	0.13	0.00	0.02	0.37	0.25	0.49	0.19
C5'	0.07	0.13	0.16	0.03	0.27	0.01	0.32	0.00	0.29	0.17	0.19	0.07	0.12	0.12	0.28	0.02	0.01	0.04	0.11	0.02
C6	0.01	0.01	0.09	0.18	0.00	0.12	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.01	0.13	0.13	0.01	0.02	0.33	0.16	0.42	0.13
N1	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.03	0.01	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.15	0.01	0.01	0.23	0.08	0.40	0.09
N3	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.03	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.16	0.19	0.00	0.03	0.30	0.17	0.54	0.15
O2	0.02	0.00	0.07	0.06	0.01	0.08	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.16	0.35	0.01	0.06	0.18	0.07	0.46	0.10
O2'	0.03	0.14	0.01	0.02	0.17	0.16	0.16	0.12	0.13	0.10	0.16	0.16	0.00	0.08	0.19	0.09	0.28	0.67	0.72	0.49
O3'	0.22	0.24	0.03	0.01	0.12	0.04	0.13	0.12	0.13	0.15	0.19	0.35	0.08	0.00	0.12	0.18	0.16	0.49	0.31	0.23
O4	0.01	0.01	0.06	0.14	0.00	0.08	0.00	0.28	0.01	0.01	0.00	0.01	0.19	0.12	0.00	0.03	0.38	0.29	0.58	0.22
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.06	0.09	0.18	0.03	0.00	0.08	0.27	0.07	0.21
O5'	0.12	0.24	0.30	0.09	0.35	0.01	0.37	0.01	0.33	0.23	0.30	0.18	0.28	0.16	0.38	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.11	0.10	0.57	0.51	0.24	0.14	0.25	0.04	0.16	0.08	0.17	0.07	0.67	0.49	0.29	0.27	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.30	0.47	0.60	0.25	0.55	0.05	0.49	0.11	0.42	0.40	0.54	0.46	0.72	0.31	0.58	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.11	0.43	0.24	0.19	0.05	0.19	0.02	0.13	0.09	0.15	0.10	0.49	0.23	0.22	0.21	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.19	0.11	0.11	0.10	0.13	0.13	0.20	0.13	0.20	0.16	0.27	0.15	0.19	0.14	0.13	0.10	0.10	0.19	0.14	0.12	0.28	0.15
C2	0.08	0.14	0.07	0.10	0.06	0.12	0.07	0.17	0.06	0.11	0.08	0.19	0.14	0.14	0.06	0.06	0.11	0.10	0.21	0.11	0.16	0.38	0.20
C2'	0.15	0.14	0.13	0.16	0.12	0.18	0.14	0.27	0.11	0.20	0.10	0.20	0.13	0.19	0.15	0.16	0.11	0.15	0.32	0.13	0.22	0.43	0.31
C3'	0.21	0.20	0.18	0.16	0.14	0.16	0.16	0.21	0.13	0.25	0.16	0.30	0.15	0.23	0.20	0.21	0.18	0.17	0.24	0.14	0.20	0.25	0.18
C4	0.14	0.20	0.14	0.13	0.15	0.14	0.13	0.17	0.13	0.12	0.17	0.23	0.19	0.12	0.13	0.14	0.17	0.13	0.18	0.12	0.17	0.38	0.20
C4'	0.15	0.22	0.10	0.08	0.16	0.14	0.17	0.23	0.17	0.19	0.19	0.28	0.18	0.19	0.16	0.15	0.09	0.11	0.23	0.18	0.20	0.23	0.17
C5	0.19	0.19	0.19	0.16	0.17	0.15	0.15	0.18	0.12	0.17	0.13	0.22	0.20	0.16	0.18	0.22	0.21	0.15	0.16	0.12	0.13	0.34	0.17
C5'	0.13	0.16	0.11	0.16	0.15	0.22	0.16	0.27	0.15	0.18	0.14	0.23	0.15	0.19	0.16	0.16	0.17	0.16	0.25	0.16	0.25	0.23	0.19
C6	0.20	0.09	0.20	0.16	0.15	0.15	0.14	0.18	0.10	0.20	0.03	0.15	0.14	0.18	0.19	0.22	0.20	0.15	0.16	0.12	0.11	0.32	0.16
N1	0.13	0.11	0.12	0.11	0.07	0.13	0.11	0.18	0.08	0.18	0.07	0.19	0.09	0.18	0.13	0.13	0.13	0.11	0.18	0.12	0.12	0.32	0.16
N3	0.10	0.16	0.10	0.11	0.11	0.13	0.08	0.17	0.09	0.08	0.12	0.19	0.16	0.10	0.09	0.08	0.13	0.12	0.21	0.12	0.19	0.40	0.22
O2	0.12	0.17	0.12	0.14	0.11	0.15	0.07	0.19	0.08	0.10	0.11	0.22	0.19	0.14	0.09	0.12	0.13	0.12	0.26	0.12	0.19	0.41	0.23
O2'	0.36	0.22	0.39	0.47	0.24	0.49	0.20	0.53	0.17	0.26	0.16	0.25	0.27	0.23	0.29	0.40	0.45	0.40	0.54	0.19	0.43	0.58	0.51
O3'	0.57	0.24	0.57	0.54	0.42	0.55	0.44	0.57	0.35	0.61	0.25	0.23	0.30	0.55	0.54	0.56	0.51	0.56	0.58	0.35	0.58	0.49	0.52
O4	0.14	0.25	0.14	0.13	0.17	0.14	0.15	0.16	0.18	0.11	0.24	0.27	0.21	0.11	0.14	0.15	0.18	0.14	0.18	0.16	0.19	0.39	0.21
O4'	0.24	0.21	0.23	0.20	0.12	0.21	0.14	0.25	0.14	0.24	0.19	0.32	0.12	0.20	0.21	0.23	0.22	0.20	0.19	0.16	0.19	0.18	0.14
O5'	0.13	0.22	0.10	0.13	0.15	0.17	0.17	0.22	0.16	0.20	0.18	0.35	0.18	0.21	0.16	0.14	0.14	0.14	0.20	0.17	0.17	0.17	0.10
OP1	0.44	1.04	0.45	0.37	0.69	0.26	0.66	0.14	0.79	0.44	0.96	1.29	0.87	0.52	0.51	0.61	0.42	0.34	0.21	0.77	0.10	0.28	0.10
OP2	0.12	0.28	0.12	0.17	0.13	0.16	0.15	0.16	0.13	0.22	0.17	0.50	0.23	0.23	0.14	0.23	0.26	0.12	0.12	0.16	0.19	0.15	0.12
P	0.20	0.58	0.21	0.23	0.33	0.21	0.29	0.19	0.38	0.17	0.51	0.79	0.46	0.20	0.22	0.30	0.26	0.21	0.20	0.35	0.14	0.22	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.02	0.08	0.00	0.09	0.01	0.21	0.12	0.10
C2	0.02	0.00	0.05	0.07	0.00	0.18	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.13	0.20	0.21	0.00	0.22	0.25	0.18
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.03	0.06	0.05	0.05	0.04	0.04	0.06	0.04	0.00	0.04	0.02	0.06	0.07	0.31	0.11	0.14
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.08	0.04	0.10	0.07	0.07	0.02	0.01	0.01	0.00	0.06	0.03	0.29	0.10	0.12
C4	0.01	0.00	0.05	0.02	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.10	0.09	0.13	0.00	0.17	0.21	0.12
C4'	0.00	0.18	0.01	0.00	0.07	0.00	0.02	0.01	0.05	0.11	0.12	0.24	0.17	0.09	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.14	0.03	0.02
C5	0.01	0.00	0.06	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.09	0.03	0.08	0.01	0.13	0.24	0.13
C5'	0.04	0.22	0.03	0.02	0.11	0.01	0.05	0.00	0.08	0.13	0.16	0.29	0.22	0.11	0.04	0.02	0.03	0.01	0.01	0.06	0.07	0.03	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.02	0.00	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.10	0.06	0.10	0.00	0.13	0.26	0.14
C8	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.11	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.08	0.11	0.11	0.01	0.12	0.20	0.16
N1	0.02	0.00	0.05	0.04	0.01	0.12	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.12	0.14	0.16	0.00	0.17	0.25	0.14
N2	0.03	0.00	0.04	0.10	0.01	0.24	0.00	0.29	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.15	0.24	0.26	0.01	0.28	0.27	0.22
N3	0.02	0.00	0.04	0.07	0.00	0.17	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.12	0.20	0.21	0.00	0.24	0.23	0.18
N7	0.00	0.00	0.06	0.07	0.00	0.09	0.00	0.11	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.08	0.07	0.11	0.01	0.15	0.25	0.19
N9	0.00	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.08	0.01	0.08	0.01	0.14	0.16	0.09
O2'	0.02	0.12	0.00	0.01	0.07	0.01	0.04	0.02	0.06	0.05	0.10	0.15	0.12	0.03	0.02	0.00	0.06	0.01	0.06	0.05	0.34	0.14	0.16
O3'	0.08	0.13	0.04	0.01	0.10	0.02	0.09	0.03	0.10	0.08	0.12	0.15	0.12	0.08	0.08	0.06	0.00	0.06	0.06	0.10	0.28	0.10	0.11
O4'	0.00	0.20	0.02	0.00	0.09	0.00	0.03	0.01	0.06	0.11	0.14	0.24	0.20	0.07	0.01	0.01	0.06	0.00	0.03	0.04	0.08	0.12	0.06
O5'	0.09	0.21	0.06	0.06	0.13	0.01	0.08	0.01	0.10	0.11	0.16	0.26	0.21	0.11	0.08	0.06	0.06	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.07	0.03	0.00	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.10	0.04	0.08	0.00	0.14	0.28	0.17
OP1	0.21	0.22	0.31	0.29	0.17	0.14	0.13	0.07	0.13	0.12	0.17	0.28	0.24	0.15	0.14	0.34	0.28	0.08	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.25	0.11	0.10	0.21	0.03	0.24	0.03	0.26	0.20	0.25	0.27	0.23	0.25	0.16	0.14	0.10	0.12	0.01	0.28	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.18	0.14	0.12	0.12	0.02	0.13	0.01	0.14	0.16	0.14	0.22	0.18	0.19	0.09	0.16	0.11	0.06	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00