Doublet Group distance statistics: 54601

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 2, 0, 0, 2, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.008, 0.016, 0.023, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.016 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.010, 0.021, 0.032, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.021 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.009, 0.021, 0.032, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.006, 0.018, 0.030, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.008, 0.022, 0.036, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.022 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.012, 0.028, 0.044, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.028 std_dev=0.016
O2	A	0, 0.018, 0.042, 0.065, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.042 std_dev=0.024
N1	A	0, 0.005, 0.029, 0.053, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.029 std_dev=0.024
O4'	A	0, 0.036, 0.131, 0.226, 0.329 max_d=0.329 avg_d=0.131 std_dev=0.095
O4	A	0, -0.024, 0.080, 0.185, 0.364 max_d=0.364 avg_d=0.080 std_dev=0.105
C4'	B	0, 0.198, 0.347, 0.496, 0.545 max_d=0.545 avg_d=0.347 std_dev=0.149
C5'	B	0, 0.135, 0.294, 0.453, 0.690 max_d=0.690 avg_d=0.294 std_dev=0.159
C2'	A	0, 0.012, 0.174, 0.336, 0.530 max_d=0.530 avg_d=0.174 std_dev=0.162
P	B	0, 0.134, 0.304, 0.473, 0.610 max_d=0.610 avg_d=0.304 std_dev=0.169
C4'	A	0, 0.047, 0.234, 0.420, 0.549 max_d=0.549 avg_d=0.234 std_dev=0.187
O4'	B	0, 0.165, 0.354, 0.543, 0.636 max_d=0.636 avg_d=0.354 std_dev=0.189
C3'	B	0, 0.205, 0.412, 0.619, 0.662 max_d=0.662 avg_d=0.412 std_dev=0.207
O2'	A	0, 0.148, 0.400, 0.651, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.400 std_dev=0.251
C3'	A	0, 0.029, 0.288, 0.547, 0.757 max_d=0.757 avg_d=0.288 std_dev=0.259
N3	B	0, 0.220, 0.483, 0.746, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.483 std_dev=0.263
C1'	B	0, 0.171, 0.435, 0.699, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.435 std_dev=0.264
C4	B	0, 0.188, 0.461, 0.734, 0.847 max_d=0.847 avg_d=0.461 std_dev=0.273
N9	B	0, 0.175, 0.450, 0.726, 0.826 max_d=0.826 avg_d=0.450 std_dev=0.276
OP1	B	0, 0.122, 0.400, 0.677, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.400 std_dev=0.277
OP1	A	0, 0.277, 0.562, 0.847, 0.973 max_d=0.973 avg_d=0.562 std_dev=0.285
C5'	A	0, 0.129, 0.418, 0.707, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.418 std_dev=0.289
C2	B	0, 0.228, 0.522, 0.816, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.522 std_dev=0.294
C2'	B	0, 0.184, 0.486, 0.789, 0.934 max_d=0.934 avg_d=0.486 std_dev=0.303
C5	B	0, 0.168, 0.473, 0.779, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.473 std_dev=0.305
O3'	B	0, 0.234, 0.540, 0.846, 1.047 max_d=1.047 avg_d=0.540 std_dev=0.306
C8	B	0, 0.151, 0.463, 0.776, 0.934 max_d=0.934 avg_d=0.463 std_dev=0.312
N1	B	0, 0.207, 0.530, 0.854, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.530 std_dev=0.324
C6	B	0, 0.179, 0.506, 0.833, 1.151 max_d=1.151 avg_d=0.506 std_dev=0.327
O5'	B	0, 0.137, 0.468, 0.799, 1.083 max_d=1.083 avg_d=0.468 std_dev=0.331
N2	B	0, 0.259, 0.591, 0.922, 1.109 max_d=1.109 avg_d=0.591 std_dev=0.331
N7	B	0, 0.133, 0.467, 0.802, 0.987 max_d=0.987 avg_d=0.467 std_dev=0.334
P	A	0, 0.199, 0.535, 0.871, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.535 std_dev=0.336
O2'	B	0, 0.230, 0.587, 0.944, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.587 std_dev=0.357
O6	B	0, 0.154, 0.524, 0.894, 1.297 max_d=1.297 avg_d=0.524 std_dev=0.370
O5'	A	0, 0.164, 0.578, 0.991, 1.465 max_d=1.465 avg_d=0.578 std_dev=0.413
O3'	A	0, -0.037, 0.478, 0.993, 1.498 max_d=1.498 avg_d=0.478 std_dev=0.515
OP2	B	0, 0.028, 0.555, 1.082, 1.620 max_d=1.620 avg_d=0.555 std_dev=0.527
OP2	A	0, 0.270, 0.855, 1.440, 1.788 max_d=1.788 avg_d=0.855 std_dev=0.585

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.19	0.03	0.01	0.07	0.25	0.21	0.08
C2	0.03	0.00	0.04	0.05	0.01	0.03	0.01	0.11	0.02	0.01	0.01	0.00	0.13	0.30	0.02	0.04	0.18	0.26	0.24	0.13
C2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.06	0.03	0.11	0.07	0.11	0.04	0.03	0.08	0.01	0.05	0.07	0.02	0.07	0.40	0.25	0.12
C3'	0.04	0.05	0.01	0.00	0.10	0.01	0.17	0.02	0.16	0.04	0.03	0.13	0.03	0.01	0.10	0.01	0.12	0.49	0.20	0.19
C4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.10	0.01	0.24	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.16	0.00	0.05	0.34	0.32	0.37	0.25
C4'	0.02	0.03	0.03	0.01	0.10	0.00	0.14	0.01	0.12	0.04	0.06	0.06	0.02	0.04	0.11	0.01	0.03	0.27	0.10	0.04
C5	0.02	0.01	0.11	0.17	0.01	0.14	0.00	0.26	0.00	0.01	0.01	0.02	0.13	0.10	0.01	0.05	0.37	0.33	0.40	0.26
C5'	0.02	0.11	0.07	0.02	0.24	0.01	0.26	0.00	0.21	0.11	0.18	0.06	0.06	0.06	0.26	0.01	0.01	0.17	0.05	0.02
C6	0.02	0.02	0.11	0.16	0.01	0.12	0.00	0.21	0.00	0.01	0.02	0.02	0.12	0.10	0.01	0.05	0.30	0.29	0.31	0.20
N1	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.18	0.02	0.02	0.17	0.25	0.24	0.13
N3	0.03	0.01	0.03	0.03	0.01	0.06	0.01	0.18	0.02	0.01	0.00	0.01	0.14	0.25	0.02	0.05	0.26	0.28	0.29	0.19
O2	0.04	0.00	0.08	0.13	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.01	0.01	0.00	0.17	0.42	0.03	0.06	0.12	0.26	0.21	0.10
O2'	0.03	0.13	0.01	0.03	0.13	0.02	0.13	0.06	0.12	0.09	0.14	0.17	0.00	0.09	0.14	0.03	0.08	0.49	0.33	0.18
O3'	0.19	0.30	0.05	0.01	0.16	0.04	0.10	0.06	0.10	0.18	0.25	0.42	0.09	0.00	0.16	0.11	0.13	0.62	0.24	0.27
O4	0.03	0.02	0.07	0.10	0.00	0.11	0.01	0.26	0.01	0.02	0.02	0.03	0.14	0.16	0.00	0.06	0.37	0.35	0.43	0.29
O4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.05	0.06	0.03	0.11	0.06	0.00	0.09	0.14	0.23	0.12
O5'	0.07	0.18	0.07	0.12	0.34	0.03	0.37	0.01	0.30	0.17	0.26	0.12	0.08	0.13	0.37	0.09	0.00	0.03	0.03	0.01
OP1	0.25	0.26	0.40	0.49	0.32	0.27	0.33	0.17	0.29	0.25	0.28	0.26	0.49	0.62	0.35	0.14	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.24	0.25	0.20	0.37	0.10	0.40	0.05	0.31	0.24	0.29	0.21	0.33	0.24	0.43	0.23	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.13	0.12	0.19	0.25	0.04	0.26	0.02	0.20	0.13	0.19	0.10	0.18	0.27	0.29	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.18	0.13	0.10	0.11	0.13	0.14	0.23	0.13	0.25	0.16	0.24	0.14	0.23	0.16	0.13	0.12	0.14	0.52	0.15	0.06	0.56	0.26
C2	0.18	0.25	0.18	0.14	0.17	0.16	0.15	0.24	0.17	0.24	0.24	0.30	0.21	0.21	0.18	0.19	0.17	0.18	0.51	0.15	0.07	0.57	0.24
C2'	0.16	0.22	0.15	0.10	0.11	0.12	0.14	0.15	0.14	0.26	0.20	0.30	0.16	0.23	0.16	0.14	0.10	0.16	0.40	0.15	0.15	0.55	0.22
C3'	0.20	0.20	0.20	0.18	0.11	0.17	0.14	0.17	0.10	0.29	0.16	0.29	0.14	0.24	0.19	0.15	0.17	0.20	0.15	0.11	0.35	0.16	0.04
C4	0.19	0.30	0.20	0.14	0.19	0.15	0.20	0.23	0.21	0.26	0.29	0.37	0.24	0.27	0.20	0.22	0.15	0.17	0.51	0.19	0.10	0.60	0.26
C4'	0.17	0.17	0.15	0.11	0.11	0.11	0.13	0.13	0.10	0.24	0.13	0.25	0.14	0.20	0.17	0.13	0.12	0.14	0.24	0.11	0.30	0.16	0.05
C5	0.17	0.28	0.17	0.13	0.18	0.15	0.21	0.24	0.19	0.26	0.25	0.36	0.22	0.29	0.18	0.20	0.14	0.15	0.52	0.22	0.12	0.61	0.28
C5'	0.14	0.27	0.13	0.10	0.13	0.12	0.13	0.14	0.15	0.17	0.22	0.36	0.21	0.15	0.13	0.14	0.13	0.11	0.16	0.15	0.55	0.08	0.15
C6	0.16	0.25	0.16	0.13	0.17	0.15	0.21	0.24	0.19	0.26	0.22	0.33	0.20	0.29	0.18	0.17	0.14	0.15	0.52	0.21	0.12	0.60	0.28
N1	0.15	0.23	0.14	0.12	0.13	0.14	0.14	0.24	0.14	0.24	0.21	0.29	0.18	0.24	0.15	0.15	0.15	0.14	0.53	0.14	0.08	0.59	0.26
N3	0.19	0.29	0.20	0.15	0.20	0.16	0.19	0.23	0.23	0.25	0.29	0.34	0.24	0.25	0.20	0.22	0.17	0.19	0.51	0.21	0.07	0.58	0.24
O2	0.19	0.24	0.19	0.16	0.17	0.17	0.15	0.24	0.19	0.21	0.24	0.28	0.21	0.15	0.18	0.19	0.20	0.19	0.48	0.18	0.09	0.53	0.21
O2'	0.19	0.22	0.19	0.18	0.11	0.21	0.14	0.27	0.16	0.27	0.21	0.30	0.15	0.24	0.17	0.19	0.21	0.20	0.50	0.20	0.12	0.78	0.38
O3'	0.32	0.13	0.35	0.37	0.22	0.30	0.29	0.32	0.22	0.47	0.14	0.21	0.11	0.42	0.34	0.25	0.34	0.31	0.02	0.26	0.02	0.02	0.01
O4	0.19	0.30	0.20	0.11	0.19	0.13	0.20	0.20	0.22	0.26	0.30	0.37	0.23	0.27	0.20	0.24	0.11	0.17	0.50	0.22	0.10	0.60	0.25
O4'	0.13	0.16	0.11	0.10	0.11	0.13	0.14	0.22	0.13	0.20	0.14	0.20	0.14	0.20	0.14	0.12	0.11	0.12	0.49	0.15	0.10	0.42	0.21
O5'	0.15	0.39	0.13	0.09	0.18	0.10	0.15	0.10	0.21	0.14	0.33	0.51	0.30	0.12	0.13	0.15	0.10	0.11	0.17	0.17	0.61	0.23	0.17
OP1	0.27	0.22	0.29	0.30	0.13	0.34	0.11	0.37	0.17	0.18	0.22	0.33	0.18	0.13	0.18	0.33	0.34	0.30	0.37	0.22	0.67	0.52	0.41
OP2	0.16	0.32	0.15	0.14	0.24	0.17	0.34	0.24	0.40	0.32	0.38	0.41	0.22	0.37	0.23	0.14	0.16	0.15	0.21	0.47	0.74	0.29	0.29
P	0.14	0.19	0.14	0.11	0.14	0.14	0.22	0.15	0.25	0.24	0.24	0.28	0.11	0.26	0.16	0.14	0.14	0.13	0.14	0.31	0.60	0.27	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.13	0.04	0.18	0.07	0.09
C2	0.04	0.00	0.07	0.07	0.01	0.07	0.01	0.18	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.17	0.06	0.08	0.34	0.03	0.18	0.32	0.16
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.06	0.06	0.08	0.06	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.07	0.05	0.24	0.07	0.07
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.09	0.01	0.14	0.02	0.14	0.17	0.10	0.06	0.06	0.17	0.10	0.02	0.01	0.02	0.05	0.16	0.30	0.11	0.05
C4	0.02	0.01	0.03	0.09	0.00	0.07	0.01	0.16	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.07	0.04	0.30	0.02	0.12	0.26	0.10
C4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.07	0.00	0.10	0.01	0.10	0.11	0.08	0.07	0.06	0.12	0.07	0.05	0.02	0.01	0.01	0.12	0.27	0.09	0.05
C5	0.02	0.01	0.03	0.14	0.01	0.10	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.08	0.13	0.03	0.34	0.02	0.13	0.32	0.10
C5'	0.02	0.18	0.01	0.02	0.16	0.01	0.20	0.00	0.22	0.16	0.21	0.18	0.16	0.20	0.12	0.05	0.04	0.01	0.01	0.24	0.29	0.11	0.02
C6	0.03	0.02	0.04	0.14	0.02	0.10	0.01	0.22	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.11	0.13	0.04	0.37	0.01	0.16	0.37	0.13
C8	0.01	0.01	0.06	0.17	0.00	0.11	0.01	0.16	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.19	0.06	0.26	0.03	0.17	0.21	0.10
N1	0.04	0.01	0.06	0.10	0.02	0.08	0.01	0.21	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.15	0.08	0.06	0.37	0.03	0.18	0.37	0.16
N2	0.05	0.01	0.08	0.06	0.01	0.07	0.02	0.18	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.20	0.09	0.10	0.33	0.05	0.22	0.32	0.19
N3	0.04	0.00	0.06	0.06	0.00	0.06	0.01	0.16	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.16	0.06	0.08	0.30	0.03	0.13	0.26	0.13
N7	0.01	0.01	0.05	0.17	0.01	0.12	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.19	0.05	0.32	0.03	0.14	0.29	0.09
N9	0.01	0.02	0.02	0.10	0.01	0.07	0.02	0.12	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.04	0.09	0.02	0.24	0.03	0.14	0.18	0.08
O2'	0.02	0.17	0.00	0.02	0.10	0.05	0.08	0.05	0.11	0.02	0.15	0.20	0.16	0.03	0.04	0.00	0.04	0.05	0.05	0.10	0.30	0.12	0.07
O3'	0.03	0.06	0.02	0.01	0.07	0.02	0.13	0.04	0.13	0.19	0.08	0.09	0.06	0.19	0.09	0.04	0.00	0.02	0.08	0.16	0.37	0.17	0.03
O4'	0.01	0.08	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.06	0.06	0.10	0.08	0.05	0.02	0.05	0.02	0.00	0.12	0.05	0.17	0.05	0.09
O5'	0.13	0.34	0.07	0.05	0.30	0.01	0.34	0.01	0.37	0.26	0.37	0.33	0.30	0.32	0.24	0.05	0.08	0.12	0.00	0.38	0.02	0.02	0.01
O6	0.04	0.03	0.05	0.16	0.02	0.12	0.02	0.24	0.01	0.03	0.03	0.05	0.03	0.03	0.03	0.10	0.16	0.05	0.38	0.00	0.18	0.40	0.12
OP1	0.18	0.18	0.24	0.30	0.12	0.27	0.13	0.29	0.16	0.17	0.18	0.22	0.13	0.14	0.14	0.30	0.37	0.17	0.02	0.18	0.00	0.02	0.01
OP2	0.07	0.32	0.07	0.11	0.26	0.09	0.32	0.11	0.37	0.21	0.37	0.32	0.26	0.29	0.18	0.12	0.17	0.05	0.02	0.40	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.16	0.07	0.05	0.10	0.05	0.10	0.02	0.13	0.10	0.16	0.19	0.13	0.09	0.08	0.07	0.03	0.09	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00