Doublet Group distance statistics: 54605

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.001, 0.017, 0.034, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.000, 0.017, 0.033, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C6	A	0, 0.000, 0.018, 0.035, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.018 std_dev=0.017
N1	A	0, -0.003, 0.024, 0.050, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.024 std_dev=0.027
C2	A	0, -0.002, 0.027, 0.056, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.027 std_dev=0.029
O4	A	0, 0.004, 0.035, 0.066, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.035 std_dev=0.031
C1'	A	0, 0.000, 0.033, 0.066, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.033 std_dev=0.033
O2	A	0, -0.011, 0.072, 0.155, 0.203 max_d=0.203 avg_d=0.072 std_dev=0.083
O4'	A	0, 0.029, 0.118, 0.207, 0.221 max_d=0.221 avg_d=0.118 std_dev=0.089
C2'	A	0, 0.036, 0.130, 0.224, 0.222 max_d=0.222 avg_d=0.130 std_dev=0.094
O2'	A	0, 0.045, 0.160, 0.274, 0.273 max_d=0.273 avg_d=0.160 std_dev=0.115
C4'	A	0, 0.038, 0.162, 0.286, 0.327 max_d=0.327 avg_d=0.162 std_dev=0.124
C3'	A	0, 0.047, 0.177, 0.307, 0.349 max_d=0.349 avg_d=0.177 std_dev=0.130
O3'	A	0, 0.065, 0.265, 0.465, 0.535 max_d=0.535 avg_d=0.265 std_dev=0.200
C5'	A	0, 0.079, 0.283, 0.488, 0.504 max_d=0.504 avg_d=0.283 std_dev=0.205
O6	B	0, 0.123, 0.384, 0.645, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.384 std_dev=0.261
C6	B	0, 0.103, 0.373, 0.643, 0.689 max_d=0.689 avg_d=0.373 std_dev=0.270
C5	B	0, 0.061, 0.332, 0.602, 0.725 max_d=0.725 avg_d=0.332 std_dev=0.271
N9	B	0, 0.049, 0.344, 0.639, 0.787 max_d=0.787 avg_d=0.344 std_dev=0.295
C4	B	0, 0.065, 0.361, 0.658, 0.757 max_d=0.757 avg_d=0.361 std_dev=0.297
C1'	B	0, 0.082, 0.395, 0.708, 0.810 max_d=0.810 avg_d=0.395 std_dev=0.313
N1	B	0, 0.126, 0.448, 0.769, 0.764 max_d=0.764 avg_d=0.448 std_dev=0.321
C8	B	0, 0.001, 0.331, 0.661, 0.881 max_d=0.881 avg_d=0.331 std_dev=0.330
N7	B	0, 0.005, 0.336, 0.666, 0.885 max_d=0.885 avg_d=0.336 std_dev=0.331
C3'	B	0, 0.069, 0.408, 0.746, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.408 std_dev=0.339
O4'	B	0, 0.099, 0.440, 0.781, 0.827 max_d=0.827 avg_d=0.440 std_dev=0.341
N3	B	0, 0.094, 0.442, 0.791, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.442 std_dev=0.348
C4'	B	0, 0.026, 0.386, 0.745, 0.967 max_d=0.967 avg_d=0.386 std_dev=0.360
C2'	B	0, 0.099, 0.469, 0.839, 0.868 max_d=0.868 avg_d=0.469 std_dev=0.370
C2	B	0, 0.123, 0.499, 0.875, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.499 std_dev=0.376
N2	B	0, 0.162, 0.641, 1.119, 1.156 max_d=1.156 avg_d=0.641 std_dev=0.479
O2'	B	0, 0.116, 0.719, 1.321, 1.455 max_d=1.455 avg_d=0.719 std_dev=0.603
C5'	B	0, 0.089, 0.692, 1.295, 1.464 max_d=1.464 avg_d=0.692 std_dev=0.603
O3'	B	0, -0.004, 0.612, 1.228, 1.599 max_d=1.599 avg_d=0.612 std_dev=0.616
O5'	A	0, -0.111, 0.679, 1.468, 1.998 max_d=1.998 avg_d=0.679 std_dev=0.790
O5'	B	0, 0.090, 0.887, 1.685, 2.122 max_d=2.122 avg_d=0.887 std_dev=0.798
P	A	0, -0.113, 0.728, 1.570, 2.140 max_d=2.140 avg_d=0.728 std_dev=0.842
OP2	A	0, -0.164, 0.707, 1.579, 2.190 max_d=2.190 avg_d=0.707 std_dev=0.871
OP1	A	0, -0.162, 0.940, 2.042, 2.790 max_d=2.790 avg_d=0.940 std_dev=1.102
P	B	0, 0.260, 1.597, 2.933, 2.943 max_d=2.943 avg_d=1.597 std_dev=1.336
OP1	B	0, 0.215, 1.807, 3.399, 4.043 max_d=4.043 avg_d=1.807 std_dev=1.592
OP2	B	0, 0.255, 2.541, 4.827, 4.912 max_d=4.912 avg_d=2.541 std_dev=2.286

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.10	0.02	0.01	0.02	0.01	0.21	0.21	0.01	0.11
C2	0.05	0.00	0.06	0.07	0.01	0.05	0.02	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.00	0.05	0.46	0.43	0.32	0.36
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.07	0.01	0.07	0.02	0.05	0.04	0.07	0.06	0.00	0.01	0.07	0.00	0.24	0.32	0.05	0.18
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.10	0.01	0.09	0.02	0.07	0.05	0.09	0.06	0.02	0.00	0.11	0.01	0.32	0.44	0.07	0.24
C4	0.03	0.01	0.07	0.10	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.12	0.01	0.04	0.64	0.60	0.56	0.55
C4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.06	0.00	0.06	0.01	0.05	0.04	0.05	0.08	0.02	0.03	0.07	0.00	0.02	0.16	0.29	0.03
C5	0.02	0.02	0.07	0.09	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.02	0.06	0.11	0.01	0.05	0.66	0.60	0.54	0.56
C5'	0.01	0.06	0.02	0.02	0.09	0.01	0.08	0.00	0.07	0.06	0.08	0.09	0.02	0.05	0.10	0.01	0.01	0.25	0.44	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.08	0.02	0.05	0.58	0.50	0.35	0.44
N1	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.03	0.03	0.05	0.01	0.03	0.44	0.39	0.23	0.32
N3	0.03	0.00	0.07	0.09	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.01	0.03	0.56	0.52	0.46	0.46
O2	0.10	0.01	0.06	0.06	0.01	0.08	0.02	0.09	0.02	0.03	0.01	0.00	0.07	0.06	0.02	0.11	0.39	0.37	0.26	0.30
O2'	0.02	0.05	0.00	0.02	0.06	0.02	0.06	0.02	0.04	0.03	0.06	0.07	0.00	0.02	0.06	0.03	0.04	0.14	0.15	0.05
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.12	0.03	0.11	0.05	0.08	0.05	0.11	0.06	0.02	0.00	0.14	0.02	0.20	0.45	0.15	0.19
O4	0.02	0.00	0.07	0.11	0.01	0.07	0.01	0.10	0.02	0.01	0.01	0.02	0.06	0.14	0.00	0.04	0.67	0.66	0.65	0.60
O4'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.03	0.03	0.11	0.03	0.02	0.04	0.00	0.02	0.06	0.21	0.05
O5'	0.21	0.46	0.24	0.32	0.64	0.02	0.66	0.01	0.58	0.44	0.56	0.39	0.04	0.20	0.67	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01
OP1	0.21	0.43	0.32	0.44	0.60	0.16	0.60	0.25	0.50	0.39	0.52	0.37	0.14	0.45	0.66	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.01	0.32	0.05	0.07	0.56	0.29	0.54	0.44	0.35	0.23	0.46	0.26	0.15	0.15	0.65	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.36	0.18	0.24	0.55	0.03	0.56	0.02	0.44	0.32	0.46	0.30	0.05	0.19	0.60	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.16	0.23	0.11	0.11	0.14	0.12	0.42	0.17	0.06	0.18	0.17	0.12	0.07	0.07	0.48	0.04	0.12	0.35	0.17	0.72	0.43	0.44
C2	0.19	0.12	0.30	0.03	0.03	0.11	0.03	0.36	0.11	0.20	0.15	0.16	0.06	0.13	0.13	0.46	0.17	0.19	0.35	0.13	0.42	0.72	0.42
C2'	0.16	0.14	0.29	0.07	0.09	0.13	0.10	0.45	0.15	0.06	0.16	0.16	0.10	0.06	0.07	0.55	0.09	0.12	0.39	0.17	0.76	0.44	0.50
C3'	0.19	0.15	0.37	0.04	0.11	0.12	0.10	0.48	0.15	0.07	0.17	0.18	0.12	0.06	0.10	0.66	0.19	0.12	0.43	0.16	0.82	0.51	0.57
C4	0.15	0.14	0.30	0.14	0.04	0.12	0.05	0.40	0.08	0.21	0.15	0.20	0.08	0.18	0.13	0.36	0.31	0.25	0.47	0.13	0.26	1.05	0.57
C4'	0.24	0.18	0.36	0.10	0.16	0.11	0.14	0.45	0.16	0.11	0.18	0.20	0.17	0.10	0.15	0.68	0.06	0.06	0.36	0.15	0.93	0.48	0.56
C5	0.10	0.19	0.31	0.16	0.06	0.15	0.10	0.44	0.18	0.13	0.22	0.22	0.12	0.09	0.06	0.36	0.33	0.26	0.50	0.19	0.33	0.91	0.56
C5'	0.28	0.19	0.47	0.04	0.17	0.07	0.13	0.45	0.14	0.11	0.17	0.21	0.19	0.08	0.17	0.80	0.18	0.03	0.37	0.12	0.96	0.63	0.62
C6	0.10	0.20	0.31	0.08	0.11	0.15	0.14	0.44	0.20	0.08	0.22	0.21	0.14	0.07	0.05	0.42	0.25	0.22	0.44	0.20	0.48	0.66	0.48
N1	0.15	0.14	0.30	0.01	0.05	0.13	0.08	0.39	0.15	0.12	0.17	0.16	0.08	0.04	0.07	0.47	0.15	0.17	0.37	0.16	0.53	0.58	0.42
N3	0.18	0.14	0.30	0.08	0.06	0.11	0.06	0.38	0.07	0.23	0.15	0.19	0.08	0.19	0.15	0.40	0.24	0.22	0.40	0.08	0.29	0.94	0.50
O2	0.23	0.12	0.31	0.04	0.06	0.12	0.06	0.33	0.13	0.22	0.16	0.16	0.06	0.15	0.16	0.50	0.13	0.19	0.30	0.17	0.45	0.65	0.37
O2'	0.18	0.14	0.23	0.13	0.11	0.13	0.11	0.43	0.16	0.08	0.16	0.16	0.11	0.08	0.10	0.53	0.03	0.08	0.34	0.18	0.86	0.40	0.49
O3'	0.20	0.15	0.38	0.04	0.11	0.12	0.10	0.51	0.15	0.08	0.17	0.18	0.12	0.07	0.11	0.69	0.19	0.11	0.46	0.16	0.90	0.65	0.64
O4	0.15	0.14	0.29	0.18	0.08	0.12	0.10	0.40	0.06	0.22	0.11	0.21	0.10	0.21	0.15	0.32	0.35	0.26	0.49	0.14	0.27	1.24	0.65
O4'	0.19	0.18	0.26	0.17	0.16	0.15	0.15	0.43	0.17	0.10	0.19	0.20	0.17	0.11	0.13	0.55	0.08	0.09	0.34	0.16	0.85	0.37	0.48
O5'	0.22	0.62	0.28	0.02	0.44	0.05	0.42	0.25	0.53	0.17	0.62	0.68	0.54	0.26	0.27	0.34	0.01	0.06	0.25	0.52	0.91	0.37	0.49
OP1	0.05	0.61	0.10	0.02	0.35	0.10	0.33	0.18	0.47	0.03	0.59	0.71	0.50	0.14	0.14	0.09	0.02	0.04	0.28	0.47	1.14	0.69	0.64
OP2	0.03	0.72	0.12	0.02	0.43	0.27	0.43	0.49	0.60	0.08	0.72	0.82	0.58	0.23	0.18	0.08	0.00	0.15	0.59	0.61	0.91	0.71	0.76
P	0.07	0.62	0.13	0.01	0.38	0.13	0.36	0.26	0.49	0.05	0.60	0.71	0.52	0.17	0.17	0.13	0.00	0.05	0.33	0.48	1.00	0.48	0.58

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.03	0.56	0.37	0.12
C2	0.01	0.00	0.16	0.39	0.03	0.29	0.01	0.53	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.06	0.45	0.04	0.35	0.01	0.62	1.75	0.93
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.01	0.05	0.02	0.09	0.10	0.13	0.18	0.15	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.75	0.12	0.19
C3'	0.02	0.39	0.00	0.00	0.23	0.00	0.18	0.03	0.25	0.12	0.34	0.45	0.36	0.11	0.09	0.01	0.00	0.00	0.04	0.22	0.64	0.06	0.19
C4	0.02	0.03	0.08	0.23	0.00	0.17	0.00	0.31	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.25	0.04	0.16	0.02	0.05	1.13	0.51
C4'	0.01	0.29	0.01	0.00	0.17	0.00	0.13	0.00	0.18	0.08	0.25	0.34	0.27	0.10	0.06	0.04	0.03	0.00	0.01	0.17	0.57	0.09	0.16
C5	0.01	0.01	0.05	0.18	0.00	0.13	0.00	0.30	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.20	0.04	0.17	0.03	0.07	1.20	0.54
C5'	0.03	0.53	0.02	0.03	0.31	0.00	0.30	0.00	0.38	0.16	0.47	0.63	0.47	0.23	0.15	0.04	0.02	0.01	0.01	0.37	0.18	0.16	0.02
C6	0.01	0.01	0.09	0.25	0.01	0.18	0.01	0.38	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.06	0.29	0.03	0.25	0.01	0.31	1.49	0.73
C8	0.01	0.04	0.10	0.12	0.01	0.08	0.03	0.16	0.05	0.00	0.05	0.03	0.02	0.00	0.01	0.12	0.11	0.04	0.08	0.07	0.44	0.66	0.25
N1	0.01	0.01	0.13	0.34	0.03	0.25	0.02	0.47	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.03	0.04	0.05	0.41	0.03	0.32	0.00	0.56	1.73	0.89
N2	0.02	0.00	0.18	0.45	0.02	0.34	0.01	0.63	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.09	0.54	0.05	0.45	0.01	0.96	2.06	1.15
N3	0.02	0.00	0.15	0.36	0.01	0.27	0.01	0.47	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.05	0.39	0.04	0.27	0.01	0.35	1.42	0.72
N7	0.02	0.01	0.05	0.11	0.02	0.10	0.00	0.23	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.02	0.11	0.09	0.06	0.13	0.06	0.26	0.93	0.39
N9	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.06	0.02	0.15	0.03	0.01	0.04	0.04	0.03	0.02	0.00	0.04	0.08	0.02	0.05	0.05	0.32	0.72	0.26
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.02	0.04	0.06	0.04	0.06	0.12	0.05	0.09	0.05	0.11	0.04	0.00	0.03	0.06	0.05	0.09	0.96	0.23	0.27
O3'	0.02	0.45	0.01	0.00	0.25	0.03	0.20	0.02	0.29	0.11	0.41	0.54	0.39	0.09	0.08	0.03	0.00	0.02	0.10	0.27	0.88	0.33	0.34
O4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.03	0.04	0.03	0.05	0.04	0.06	0.02	0.06	0.02	0.00	0.06	0.02	0.40	0.40	0.11
O5'	0.05	0.35	0.01	0.04	0.16	0.01	0.17	0.01	0.25	0.08	0.32	0.45	0.27	0.13	0.05	0.05	0.10	0.06	0.00	0.24	0.01	0.01	0.01
O6	0.03	0.01	0.09	0.22	0.02	0.17	0.03	0.37	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.06	0.05	0.09	0.27	0.02	0.24	0.00	0.32	1.52	0.74
OP1	0.56	0.62	0.75	0.64	0.05	0.57	0.07	0.18	0.31	0.44	0.56	0.96	0.35	0.26	0.32	0.96	0.88	0.40	0.01	0.32	0.00	0.01	0.00
OP2	0.37	1.75	0.12	0.06	1.13	0.09	1.20	0.16	1.49	0.66	1.73	2.06	1.42	0.93	0.72	0.23	0.33	0.40	0.01	1.52	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.93	0.19	0.19	0.51	0.16	0.54	0.02	0.73	0.25	0.89	1.15	0.72	0.39	0.26	0.27	0.34	0.11	0.01	0.74	0.00	0.00	0.00