Doublet Group distance statistics: 54612

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.001, 0.008, 0.015, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.007
C6	A	0, -0.002, 0.008, 0.018, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.008 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.003, 0.015, 0.027, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.002, 0.017, 0.032, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.017 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.001, 0.020, 0.038, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.020 std_dev=0.019
C2	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.024 std_dev=0.024
N1	A	0, -0.004, 0.022, 0.047, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.022 std_dev=0.025
O4	A	0, 0.003, 0.033, 0.063, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.033 std_dev=0.030
O2	A	0, -0.005, 0.047, 0.099, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.047 std_dev=0.052
C2'	A	0, 0.045, 0.181, 0.317, 0.328 max_d=0.328 avg_d=0.181 std_dev=0.136
O4'	A	0, -0.012, 0.186, 0.385, 0.461 max_d=0.461 avg_d=0.186 std_dev=0.199
C5'	B	0, 0.107, 0.373, 0.639, 0.602 max_d=0.602 avg_d=0.373 std_dev=0.266
C4'	A	0, -0.014, 0.260, 0.534, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.260 std_dev=0.274
C8	B	0, 0.131, 0.458, 0.785, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.458 std_dev=0.327
N7	B	0, 0.147, 0.502, 0.858, 0.755 max_d=0.755 avg_d=0.502 std_dev=0.355
O4'	B	0, 0.127, 0.485, 0.843, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.485 std_dev=0.358
N9	B	0, 0.117, 0.489, 0.861, 0.901 max_d=0.901 avg_d=0.489 std_dev=0.372
C5	B	0, 0.135, 0.515, 0.896, 0.906 max_d=0.906 avg_d=0.515 std_dev=0.380
C1'	B	0, 0.140, 0.536, 0.932, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.536 std_dev=0.396
O2'	A	0, -0.027, 0.375, 0.776, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.375 std_dev=0.402
C4	B	0, 0.112, 0.514, 0.916, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.514 std_dev=0.402
C3'	A	0, 0.057, 0.468, 0.879, 1.000 max_d=1.000 avg_d=0.468 std_dev=0.411
C6	B	0, 0.144, 0.575, 1.005, 1.038 max_d=1.038 avg_d=0.575 std_dev=0.431
O6	B	0, 0.184, 0.646, 1.107, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.646 std_dev=0.462
N3	B	0, 0.119, 0.590, 1.060, 1.152 max_d=1.152 avg_d=0.590 std_dev=0.471
C4'	B	0, 0.147, 0.621, 1.096, 1.151 max_d=1.151 avg_d=0.621 std_dev=0.474
N1	B	0, 0.098, 0.588, 1.078, 1.199 max_d=1.199 avg_d=0.588 std_dev=0.490
C2	B	0, 0.100, 0.610, 1.120, 1.248 max_d=1.248 avg_d=0.610 std_dev=0.510
C2'	B	0, 0.209, 0.726, 1.242, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.726 std_dev=0.516
P	A	0, -0.008, 0.529, 1.067, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.529 std_dev=0.537
OP1	A	0, 0.232, 0.795, 1.359, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.795 std_dev=0.564
O5'	A	0, 0.034, 0.631, 1.227, 1.431 max_d=1.431 avg_d=0.631 std_dev=0.596
N2	B	0, 0.127, 0.725, 1.324, 1.465 max_d=1.465 avg_d=0.725 std_dev=0.598
O2'	B	0, 0.178, 0.785, 1.392, 1.478 max_d=1.478 avg_d=0.785 std_dev=0.607
C5'	A	0, -0.083, 0.539, 1.160, 1.409 max_d=1.409 avg_d=0.539 std_dev=0.621
OP2	A	0, -0.040, 0.666, 1.372, 1.644 max_d=1.644 avg_d=0.666 std_dev=0.706
C3'	B	0, 0.196, 0.969, 1.743, 1.893 max_d=1.893 avg_d=0.969 std_dev=0.773
O3'	A	0, 0.070, 0.881, 1.691, 1.956 max_d=1.956 avg_d=0.881 std_dev=0.810
O5'	B	0, -0.013, 0.823, 1.659, 1.969 max_d=1.969 avg_d=0.823 std_dev=0.836
O3'	B	0, 0.215, 1.380, 2.545, 2.850 max_d=2.850 avg_d=1.380 std_dev=1.165
P	B	0, -0.360, 1.461, 3.282, 4.028 max_d=4.028 avg_d=1.461 std_dev=1.821
OP1	B	0, -0.530, 1.671, 3.872, 4.780 max_d=4.780 avg_d=1.671 std_dev=2.201
OP2	B	0, -0.357, 1.889, 4.135, 5.044 max_d=5.044 avg_d=1.889 std_dev=2.246

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.29	0.01	0.00	0.42	0.09	0.31	0.09
C2	0.03	0.00	0.05	0.03	0.00	0.04	0.02	0.18	0.01	0.00	0.00	0.00	0.23	0.38	0.00	0.03	0.48	0.05	0.32	0.13
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.02	0.08	0.10	0.09	0.02	0.03	0.12	0.00	0.07	0.05	0.02	0.42	0.16	0.24	0.06
C3'	0.03	0.03	0.00	0.00	0.17	0.00	0.27	0.01	0.26	0.08	0.05	0.18	0.00	0.02	0.19	0.01	0.07	0.40	0.59	0.36
C4	0.01	0.00	0.04	0.17	0.00	0.12	0.00	0.30	0.01	0.01	0.00	0.00	0.21	0.10	0.01	0.02	0.46	0.02	0.39	0.09
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.12	0.00	0.15	0.01	0.13	0.06	0.08	0.06	0.08	0.05	0.13	0.00	0.01	0.08	0.45	0.12
C5	0.00	0.02	0.08	0.27	0.00	0.15	0.00	0.31	0.00	0.01	0.01	0.02	0.13	0.08	0.01	0.06	0.45	0.04	0.44	0.08
C5'	0.04	0.18	0.10	0.01	0.30	0.01	0.31	0.00	0.25	0.17	0.25	0.12	0.05	0.07	0.33	0.02	0.00	0.37	0.39	0.01
C6	0.01	0.01	0.09	0.26	0.01	0.13	0.00	0.25	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.07	0.01	0.07	0.48	0.01	0.42	0.10
N1	0.01	0.00	0.02	0.08	0.01	0.06	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.19	0.01	0.02	0.49	0.05	0.34	0.13
N3	0.02	0.00	0.03	0.05	0.00	0.08	0.01	0.25	0.00	0.01	0.00	0.01	0.25	0.29	0.00	0.02	0.47	0.02	0.36	0.11
O2	0.06	0.00	0.12	0.18	0.00	0.06	0.02	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.29	0.61	0.01	0.06	0.47	0.09	0.27	0.15
O2'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.21	0.08	0.13	0.05	0.07	0.12	0.25	0.29	0.00	0.04	0.22	0.08	0.34	0.26	0.13	0.05
O3'	0.29	0.38	0.07	0.02	0.10	0.05	0.08	0.07	0.07	0.19	0.29	0.61	0.04	0.00	0.08	0.18	0.42	0.87	0.79	0.70
O4	0.01	0.00	0.05	0.19	0.01	0.13	0.01	0.33	0.01	0.01	0.00	0.01	0.22	0.08	0.00	0.01	0.44	0.04	0.39	0.08
O4'	0.00	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.06	0.02	0.07	0.02	0.02	0.06	0.08	0.18	0.01	0.00	0.34	0.22	0.29	0.14
O5'	0.42	0.48	0.42	0.07	0.46	0.01	0.45	0.00	0.48	0.49	0.47	0.47	0.34	0.42	0.44	0.34	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.09	0.05	0.16	0.40	0.02	0.08	0.04	0.37	0.01	0.05	0.02	0.09	0.26	0.87	0.04	0.22	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.31	0.32	0.24	0.59	0.39	0.45	0.44	0.39	0.42	0.34	0.36	0.27	0.13	0.79	0.39	0.29	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.09	0.13	0.06	0.36	0.09	0.12	0.08	0.01	0.10	0.13	0.11	0.15	0.05	0.70	0.08	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.18	0.28	0.12	0.11	0.07	0.21	0.06	0.28	0.11	0.25	0.19	0.12	0.21	0.02	0.52	0.31	0.06	0.20	0.34	0.11	0.06	0.07
C2	0.26	0.07	0.33	0.27	0.03	0.17	0.22	0.10	0.33	0.13	0.24	0.10	0.10	0.25	0.11	0.31	0.12	0.14	0.45	0.43	0.44	0.58	0.49
C2'	0.15	0.20	0.23	0.04	0.11	0.01	0.18	0.07	0.26	0.07	0.26	0.22	0.13	0.16	0.02	0.55	0.45	0.03	0.06	0.31	0.12	0.30	0.19
C3'	0.10	0.28	0.17	0.08	0.14	0.03	0.15	0.16	0.24	0.03	0.29	0.33	0.21	0.06	0.04	0.53	0.56	0.07	0.24	0.25	0.51	0.80	0.63
C4	0.23	0.08	0.39	0.26	0.05	0.17	0.21	0.10	0.34	0.11	0.29	0.09	0.09	0.21	0.10	0.29	0.17	0.12	0.40	0.46	0.28	0.65	0.42
C4'	0.05	0.36	0.08	0.19	0.27	0.10	0.30	0.04	0.36	0.17	0.38	0.37	0.30	0.24	0.18	0.51	0.64	0.11	0.13	0.37	0.46	0.57	0.51
C5	0.19	0.20	0.41	0.18	0.08	0.13	0.23	0.09	0.36	0.11	0.34	0.20	0.05	0.22	0.05	0.44	0.29	0.08	0.27	0.44	0.04	0.40	0.19
C5'	0.35	0.68	0.17	0.49	0.56	0.30	0.56	0.13	0.63	0.40	0.68	0.70	0.63	0.47	0.46	0.31	1.00	0.32	0.11	0.63	0.66	0.53	0.59
C6	0.18	0.24	0.38	0.13	0.12	0.10	0.26	0.07	0.37	0.13	0.35	0.24	0.11	0.24	0.02	0.53	0.35	0.05	0.21	0.44	0.03	0.24	0.09
N1	0.21	0.18	0.33	0.17	0.10	0.11	0.26	0.07	0.35	0.14	0.31	0.18	0.09	0.26	0.02	0.45	0.26	0.08	0.30	0.43	0.19	0.31	0.23
N3	0.26	0.02	0.36	0.30	0.07	0.19	0.20	0.11	0.33	0.13	0.24	0.11	0.15	0.22	0.14	0.25	0.11	0.15	0.48	0.46	0.46	0.73	0.55
O2	0.29	0.05	0.28	0.31	0.06	0.19	0.18	0.12	0.28	0.13	0.16	0.10	0.13	0.24	0.15	0.25	0.05	0.19	0.51	0.40	0.63	0.65	0.62
O2'	0.15	0.18	0.18	0.03	0.09	0.12	0.08	0.15	0.14	0.05	0.17	0.23	0.16	0.09	0.05	0.47	0.44	0.06	0.25	0.18	0.27	0.14	0.10
O3'	0.45	0.23	0.44	0.25	0.37	0.29	0.42	0.48	0.35	0.56	0.27	0.18	0.26	0.52	0.46	0.75	0.33	0.43	0.60	0.37	0.70	1.31	0.98
O4	0.23	0.02	0.39	0.28	0.08	0.19	0.18	0.11	0.31	0.11	0.26	0.09	0.13	0.19	0.12	0.22	0.15	0.13	0.44	0.44	0.33	0.78	0.50
O4'	0.04	0.27	0.18	0.04	0.25	0.08	0.33	0.11	0.37	0.27	0.34	0.26	0.21	0.34	0.18	0.55	0.43	0.11	0.17	0.41	0.13	0.05	0.09
O5'	0.09	0.28	0.05	0.47	0.19	0.36	0.18	0.27	0.23	0.11	0.27	0.33	0.24	0.13	0.13	0.50	1.08	0.22	0.07	0.23	0.48	0.41	0.44
OP1	0.12	0.27	0.36	0.17	0.16	0.08	0.21	0.13	0.30	0.09	0.32	0.30	0.18	0.17	0.08	0.91	0.65	0.09	0.55	0.34	1.22	1.04	1.08
OP2	0.54	0.85	0.34	0.71	0.75	0.59	0.79	0.49	0.86	0.66	0.89	0.86	0.77	0.73	0.66	0.15	1.27	0.59	0.34	0.89	0.46	0.23	0.32
P	0.11	0.35	0.10	0.38	0.26	0.25	0.29	0.16	0.35	0.21	0.37	0.37	0.28	0.26	0.20	0.57	0.96	0.21	0.16	0.38	0.76	0.56	0.63

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.24	0.00	0.54	0.01	0.43	0.58	0.47
C2	0.02	0.00	0.11	0.19	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.38	0.10	0.05	0.72	0.00	0.69	1.20	0.87
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.05	0.02	0.02	0.19	0.04	0.08	0.08	0.14	0.12	0.06	0.02	0.00	0.01	0.02	0.63	0.02	0.48	0.85	0.59
C3'	0.02	0.19	0.00	0.00	0.24	0.01	0.32	0.01	0.33	0.31	0.27	0.13	0.15	0.36	0.21	0.02	0.00	0.04	0.17	0.37	0.20	0.21	0.14
C4	0.01	0.00	0.05	0.24	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.33	0.03	0.02	0.77	0.00	0.80	1.15	0.92
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.10	0.11	0.07	0.02	0.03	0.12	0.06	0.32	0.01	0.00	0.00	0.12	0.09	0.14	0.08
C5	0.01	0.01	0.02	0.32	0.00	0.10	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.38	0.15	0.01	0.86	0.00	1.04	1.38	1.15
C5'	0.07	0.05	0.19	0.01	0.05	0.01	0.03	0.00	0.03	0.04	0.03	0.06	0.06	0.04	0.05	0.13	0.21	0.00	0.00	0.03	0.39	0.27	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.33	0.00	0.10	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.44	0.16	0.01	0.87	0.00	1.07	1.48	1.20
C8	0.01	0.01	0.08	0.31	0.01	0.11	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.24	0.19	0.05	0.87	0.00	1.07	1.18	1.12
N1	0.02	0.00	0.08	0.27	0.01	0.07	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.43	0.06	0.03	0.81	0.01	0.90	1.39	1.06
N2	0.03	0.00	0.14	0.13	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.36	0.20	0.06	0.66	0.01	0.57	1.14	0.77
N3	0.02	0.00	0.12	0.15	0.00	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.33	0.16	0.05	0.68	0.00	0.61	1.05	0.76
N7	0.01	0.01	0.06	0.36	0.00	0.12	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.33	0.25	0.04	0.91	0.00	1.21	1.42	1.27
N9	0.00	0.01	0.02	0.21	0.00	0.06	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.22	0.02	0.01	0.76	0.01	0.78	0.98	0.85
O2'	0.02	0.38	0.00	0.02	0.33	0.32	0.38	0.13	0.44	0.24	0.43	0.36	0.33	0.33	0.22	0.00	0.04	0.21	0.20	0.45	0.14	0.54	0.11
O3'	0.24	0.10	0.01	0.00	0.03	0.01	0.15	0.21	0.16	0.19	0.06	0.20	0.16	0.25	0.02	0.04	0.00	0.17	0.40	0.24	0.46	0.32	0.43
O4'	0.00	0.05	0.02	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.03	0.06	0.05	0.04	0.01	0.21	0.17	0.00	0.32	0.01	0.31	0.14	0.21
O5'	0.54	0.72	0.63	0.17	0.77	0.00	0.86	0.00	0.87	0.87	0.81	0.66	0.68	0.91	0.76	0.20	0.40	0.32	0.00	0.90	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.02	0.37	0.00	0.12	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.45	0.24	0.01	0.90	0.00	1.21	1.59	1.31
OP1	0.43	0.69	0.48	0.20	0.80	0.09	1.04	0.39	1.07	1.07	0.90	0.57	0.61	1.21	0.78	0.14	0.46	0.31	0.01	1.21	0.00	0.02	0.00
OP2	0.58	1.20	0.85	0.21	1.15	0.14	1.38	0.27	1.48	1.18	1.39	1.14	1.05	1.42	0.98	0.54	0.32	0.14	0.01	1.59	0.02	0.00	0.00
P	0.47	0.87	0.59	0.14	0.92	0.08	1.15	0.01	1.20	1.12	1.06	0.77	0.76	1.27	0.85	0.11	0.43	0.21	0.00	1.31	0.00	0.00	0.00