Doublet Group distance statistics: 54614

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.004, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.021
O4	A	0, 0.000, 0.022, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C2	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C1'	A	0, 0.000, 0.032, 0.064, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.032 std_dev=0.032
P	B	0, 0.000, 0.048, 0.097, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.048 std_dev=0.048
O2	A	0, 0.000, 0.062, 0.123, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.062 std_dev=0.062
N3	B	0, 0.000, 0.234, 0.467, 0.467 max_d=0.467 avg_d=0.234 std_dev=0.234
C2	B	0, 0.000, 0.247, 0.495, 0.495 max_d=0.495 avg_d=0.247 std_dev=0.247
C6	B	0, 0.000, 0.259, 0.519, 0.519 max_d=0.519 avg_d=0.259 std_dev=0.259
C5	B	0, 0.000, 0.268, 0.537, 0.537 max_d=0.537 avg_d=0.268 std_dev=0.268
C4	B	0, 0.000, 0.285, 0.569, 0.569 max_d=0.569 avg_d=0.285 std_dev=0.285
N1	B	0, 0.000, 0.294, 0.588, 0.588 max_d=0.588 avg_d=0.294 std_dev=0.294
O5'	B	0, 0.000, 0.301, 0.603, 0.603 max_d=0.603 avg_d=0.301 std_dev=0.301
N2	B	0, 0.000, 0.324, 0.648, 0.648 max_d=0.648 avg_d=0.324 std_dev=0.324
O6	B	0, 0.000, 0.336, 0.672, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.336 std_dev=0.336
N7	B	0, 0.000, 0.390, 0.780, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.390 std_dev=0.390
N9	B	0, 0.000, 0.442, 0.883, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.442 std_dev=0.442
C8	B	0, 0.000, 0.499, 0.998, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.499 std_dev=0.499
C1'	B	0, 0.000, 0.563, 1.127, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.563 std_dev=0.563
O2'	B	0, 0.000, 0.658, 1.317, 1.317 max_d=1.317 avg_d=0.658 std_dev=0.658
C2'	B	0, 0.000, 0.713, 1.426, 1.426 max_d=1.426 avg_d=0.713 std_dev=0.713
C5'	B	0, 0.000, 0.722, 1.445, 1.445 max_d=1.445 avg_d=0.722 std_dev=0.722
O4'	B	0, 0.000, 0.751, 1.501, 1.501 max_d=1.501 avg_d=0.751 std_dev=0.751
C4'	B	0, 0.000, 0.937, 1.874, 1.874 max_d=1.874 avg_d=0.937 std_dev=0.937
C3'	B	0, 0.000, 1.048, 2.096, 2.096 max_d=2.096 avg_d=1.048 std_dev=1.048
OP2	B	0, 0.000, 1.280, 2.560, 2.560 max_d=2.560 avg_d=1.280 std_dev=1.280
O4'	A	0, 0.000, 1.289, 2.579, 2.579 max_d=2.579 avg_d=1.289 std_dev=1.289
C2'	A	0, 0.000, 1.389, 2.778, 2.778 max_d=2.778 avg_d=1.389 std_dev=1.389
OP1	B	0, 0.000, 1.444, 2.889, 2.889 max_d=2.889 avg_d=1.444 std_dev=1.444
O2'	A	0, 0.000, 1.725, 3.449, 3.449 max_d=3.449 avg_d=1.725 std_dev=1.725
C4'	A	0, 0.000, 1.788, 3.577, 3.577 max_d=3.577 avg_d=1.788 std_dev=1.788
O3'	B	0, 0.000, 1.841, 3.683, 3.683 max_d=3.683 avg_d=1.841 std_dev=1.841
C3'	A	0, 0.000, 2.091, 4.183, 4.183 max_d=4.183 avg_d=2.091 std_dev=2.091
O3'	A	0, 0.000, 2.828, 5.656, 5.656 max_d=5.656 avg_d=2.828 std_dev=2.828
C5'	A	0, 0.000, 3.250, 6.501, 6.501 max_d=6.501 avg_d=3.250 std_dev=3.250
O5'	A	0, 0.000, 3.734, 7.467, 7.467 max_d=7.467 avg_d=3.734 std_dev=3.734
OP1	A	0, 0.000, 5.020, 10.040, 10.040 max_d=10.040 avg_d=5.020 std_dev=5.020
P	A	0, 0.000, 5.030, 10.060, 10.060 max_d=10.060 avg_d=5.030 std_dev=5.030
OP2	A	0, 0.000, 5.691, 11.382, 11.382 max_d=11.382 avg_d=5.691 std_dev=5.691

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.06	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.38	0.13	0.09
C2	0.04	0.00	0.24	0.01	0.00	0.23	0.01	0.41	0.01	0.00	0.00	0.00	0.33	0.08	0.00	0.29	0.53	1.22	0.21	0.75
C2'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.03	0.00	0.12	0.01	0.17	0.02	0.17	0.43	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.04	0.19	0.03
C3'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.00	0.13	0.01	0.13	0.05	0.02	0.06	0.01	0.00	0.08	0.01	0.04	0.22	0.14	0.10
C4	0.03	0.00	0.03	0.08	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.00	0.06	0.13	0.57	0.72	0.03
C4'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.07	0.00	0.29	0.00	0.33	0.04	0.14	0.48	0.02	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.13	0.02
C5	0.01	0.01	0.12	0.13	0.00	0.29	0.00	0.50	0.00	0.01	0.01	0.00	0.24	0.06	0.00	0.31	0.63	0.04	1.24	0.63
C5'	0.01	0.41	0.01	0.01	0.11	0.00	0.50	0.00	0.54	0.05	0.28	0.87	0.02	0.01	0.10	0.02	0.00	0.17	0.30	0.00
C6	0.01	0.01	0.17	0.13	0.01	0.33	0.00	0.54	0.00	0.01	0.01	0.01	0.30	0.05	0.00	0.38	0.66	0.11	1.09	0.63
N1	0.02	0.00	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.03	0.06	0.50	0.36	0.06
N3	0.04	0.00	0.17	0.02	0.00	0.14	0.01	0.28	0.01	0.01	0.00	0.01	0.23	0.09	0.00	0.17	0.36	1.14	0.06	0.59
O2	0.06	0.00	0.43	0.06	0.01	0.48	0.00	0.87	0.01	0.01	0.01	0.00	0.64	0.10	0.01	0.57	1.12	1.86	0.91	1.43
O2'	0.00	0.33	0.00	0.01	0.00	0.02	0.24	0.02	0.30	0.01	0.23	0.64	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.08	0.03
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.08	0.00	0.06	0.01	0.05	0.05	0.09	0.10	0.01	0.00	0.09	0.00	0.04	0.49	0.07	0.17
O4	0.03	0.00	0.03	0.08	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.00	0.05	0.12	0.61	0.78	0.02
O4'	0.00	0.29	0.00	0.01	0.06	0.00	0.31	0.02	0.38	0.03	0.17	0.57	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.42	0.05	0.13
O5'	0.01	0.53	0.03	0.04	0.13	0.01	0.63	0.00	0.66	0.06	0.36	1.12	0.04	0.04	0.12	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00
OP1	0.38	1.22	0.04	0.22	0.57	0.01	0.04	0.17	0.11	0.50	1.14	1.86	0.01	0.49	0.61	0.42	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.21	0.19	0.14	0.72	0.13	1.24	0.30	1.09	0.36	0.06	0.91	0.08	0.07	0.78	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.75	0.03	0.10	0.03	0.02	0.63	0.00	0.63	0.06	0.59	1.43	0.03	0.17	0.02	0.13	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.39	0.02	0.47	0.46	0.10	0.58	0.00	0.42	0.12	0.22	0.10	0.03	0.08	0.06	0.25	0.35	0.74	0.53	0.15	0.20	0.59	0.02	0.01
C2	0.38	0.04	0.37	0.31	0.13	0.46	0.03	0.33	0.14	0.28	0.14	0.06	0.09	0.13	0.28	0.39	0.65	0.49	0.09	0.24	0.85	0.33	0.01
C2'	0.46	0.43	0.43	0.50	0.47	0.38	0.45	0.50	0.42	0.47	0.42	0.41	0.45	0.44	0.49	0.55	0.25	0.40	0.75	0.40	0.11	0.57	0.74
C3'	0.44	0.53	0.47	0.54	0.66	0.33	0.83	0.63	0.81	0.90	0.66	0.41	0.50	0.99	0.67	0.51	0.22	0.32	1.16	0.91	0.83	1.29	1.42
C4	0.27	0.09	0.24	0.28	0.08	0.36	0.01	0.23	0.16	0.16	0.19	0.12	0.04	0.06	0.19	0.33	0.74	0.36	0.05	0.23	0.78	0.36	0.01
C4'	0.30	0.17	0.37	0.41	0.19	0.59	0.49	0.26	0.61	0.36	0.42	0.06	0.03	0.62	0.07	0.33	0.75	0.47	0.34	0.81	0.38	0.71	0.79
C5	0.26	0.11	0.25	0.37	0.02	0.40	0.07	0.24	0.18	0.09	0.19	0.12	0.00	0.01	0.14	0.28	0.88	0.34	0.07	0.23	0.64	0.24	0.01
C5'	0.44	0.17	0.50	0.59	0.23	0.79	0.71	0.34	0.87	0.54	0.56	0.02	0.03	0.93	0.09	0.55	1.05	0.63	0.42	1.20	0.69	1.13	1.04
C6	0.32	0.09	0.34	0.45	0.03	0.49	0.07	0.30	0.18	0.11	0.17	0.08	0.02	0.02	0.17	0.30	0.91	0.43	0.09	0.24	0.59	0.16	0.02
N1	0.38	0.05	0.40	0.41	0.09	0.52	0.02	0.35	0.16	0.21	0.15	0.06	0.07	0.05	0.25	0.36	0.77	0.51	0.10	0.24	0.69	0.19	0.01
N3	0.33	0.05	0.30	0.26	0.13	0.40	0.04	0.27	0.14	0.25	0.16	0.08	0.08	0.13	0.26	0.38	0.65	0.43	0.06	0.24	0.87	0.40	0.01
O2	0.39	0.03	0.40	0.27	0.15	0.46	0.06	0.35	0.12	0.32	0.13	0.06	0.10	0.17	0.30	0.42	0.55	0.51	0.10	0.24	0.93	0.35	0.03
O2'	0.44	0.34	0.39	0.49	0.31	0.46	0.18	0.48	0.16	0.17	0.24	0.38	0.39	0.08	0.33	0.63	0.39	0.47	0.52	0.08	0.08	0.03	0.40
O3'	0.76	0.65	0.85	1.00	0.83	0.80	0.93	1.14	0.88	1.10	0.74	0.54	0.67	1.10	0.90	0.92	0.77	0.68	1.65	0.93	1.53	1.60	2.00
O4	0.21	0.11	0.16	0.22	0.06	0.30	0.00	0.19	0.14	0.14	0.19	0.15	0.02	0.07	0.15	0.30	0.70	0.30	0.03	0.20	0.80	0.41	0.00
O4'	0.78	0.10	0.89	0.96	0.20	1.12	0.11	0.81	0.29	0.17	0.15	0.16	0.30	0.15	0.41	0.82	1.31	0.98	0.30	0.50	0.35	0.14	0.10
O5'	0.38	0.26	0.38	0.47	0.36	0.70	0.92	0.22	1.11	0.73	0.73	0.03	0.03	1.19	0.21	0.52	1.03	0.60	0.56	1.50	0.65	1.41	1.13
OP1	0.22	0.76	0.33	0.58	0.71	0.76	1.32	0.35	1.66	0.90	1.31	0.54	0.43	1.45	0.44	0.48	1.23	0.49	0.44	2.15	0.56	1.16	0.98
OP2	0.68	0.27	0.61	0.61	0.03	0.79	0.62	0.17	0.80	0.54	0.29	0.61	0.48	0.99	0.09	0.87	1.25	0.80	0.62	1.32	0.91	1.75	1.33
P	0.46	0.31	0.48	0.63	0.40	0.82	1.05	0.31	1.32	0.78	0.88	0.03	0.03	1.32	0.21	0.69	1.28	0.67	0.51	1.84	0.69	1.46	1.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.25	0.00	0.13	0.00	0.52	0.02	0.19
C2	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.31	0.33	0.03	0.01	0.00	0.72	0.48	0.05
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.17	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.35	0.02	0.51	0.20	0.39
C3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.15	0.00	0.26	0.01	0.24	0.35	0.14	0.04	0.02	0.36	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00	0.29	0.07	0.03	0.01
C4	0.00	0.00	0.02	0.15	0.00	0.05	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.24	0.14	0.02	0.04	0.00	0.71	0.44	0.05
C4'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.09	0.15	0.04	0.04	0.01	0.15	0.07	0.21	0.04	0.00	0.02	0.11	0.01	0.17	0.03
C5	0.00	0.00	0.02	0.26	0.00	0.10	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.02	0.02	0.14	0.00	0.77	0.65	0.03
C5'	0.06	0.01	0.17	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.10	0.12	0.06	0.02	0.01	0.14	0.04	0.04	0.12	0.01	0.00	0.13	0.17	0.31	0.00
C6	0.00	0.00	0.02	0.24	0.00	0.09	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.30	0.02	0.02	0.15	0.00	0.78	0.74	0.06
C8	0.00	0.00	0.01	0.35	0.00	0.15	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.20	0.01	0.15	0.00	0.74	0.50	0.01
N1	0.01	0.00	0.02	0.14	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.32	0.18	0.03	0.09	0.00	0.76	0.64	0.01
N2	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.04	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.31	0.46	0.03	0.02	0.00	0.71	0.43	0.07
N3	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.27	0.35	0.02	0.03	0.00	0.69	0.36	0.09
N7	0.00	0.00	0.02	0.36	0.00	0.15	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.20	0.02	0.21	0.00	0.78	0.72	0.07
N9	0.00	0.01	0.01	0.19	0.00	0.07	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.05	0.01	0.01	0.00	0.66	0.30	0.09
O2'	0.00	0.31	0.00	0.01	0.24	0.21	0.25	0.04	0.30	0.13	0.32	0.31	0.27	0.19	0.15	0.00	0.00	0.16	0.26	0.31	0.39	0.18	0.32
O3'	0.25	0.33	0.01	0.01	0.14	0.04	0.02	0.12	0.02	0.20	0.18	0.46	0.35	0.20	0.05	0.00	0.00	0.20	0.15	0.06	0.37	0.16	0.20
O4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.16	0.20	0.00	0.04	0.02	0.36	0.07	0.08
O5'	0.13	0.01	0.35	0.00	0.04	0.02	0.14	0.00	0.15	0.15	0.09	0.02	0.03	0.21	0.01	0.26	0.15	0.04	0.00	0.20	0.01	0.01	0.00
O6	0.00	0.00	0.02	0.29	0.00	0.11	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.31	0.06	0.02	0.20	0.00	0.78	0.86	0.11
OP1	0.52	0.72	0.51	0.07	0.71	0.01	0.77	0.17	0.78	0.74	0.76	0.71	0.69	0.78	0.66	0.39	0.37	0.36	0.01	0.78	0.00	0.00	0.00
OP2	0.02	0.48	0.20	0.03	0.44	0.17	0.65	0.31	0.74	0.50	0.64	0.43	0.36	0.72	0.30	0.18	0.16	0.07	0.01	0.86	0.00	0.00	0.00
P	0.19	0.05	0.39	0.01	0.05	0.03	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.07	0.09	0.07	0.09	0.32	0.20	0.08	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00