Doublet Group distance statistics: 54616

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.000, 0.012, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.012
O4	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C6	A	0, 0.000, 0.025, 0.050, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.025
N3	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N1	A	0, 0.000, 0.028, 0.055, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.028 std_dev=0.028
C2	A	0, 0.000, 0.034, 0.068, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.034 std_dev=0.034
C1'	A	0, 0.000, 0.038, 0.076, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.038 std_dev=0.038
O2	A	0, 0.000, 0.086, 0.172, 0.172 max_d=0.172 avg_d=0.086 std_dev=0.086
C2'	A	0, 0.000, 0.319, 0.637, 0.637 max_d=0.637 avg_d=0.319 std_dev=0.319
O4'	A	0, 0.000, 0.337, 0.674, 0.674 max_d=0.674 avg_d=0.337 std_dev=0.337
O2'	A	0, 0.000, 0.392, 0.785, 0.785 max_d=0.785 avg_d=0.392 std_dev=0.392
N2	B	0, 0.000, 0.434, 0.869, 0.869 max_d=0.869 avg_d=0.434 std_dev=0.434
C6	B	0, 0.000, 0.439, 0.877, 0.877 max_d=0.877 avg_d=0.439 std_dev=0.439
C5	B	0, 0.000, 0.439, 0.878, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.439 std_dev=0.439
C2	B	0, 0.000, 0.441, 0.882, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.441 std_dev=0.441
N1	B	0, 0.000, 0.446, 0.893, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.446 std_dev=0.446
N7	B	0, 0.000, 0.457, 0.915, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.457 std_dev=0.457
N3	B	0, 0.000, 0.459, 0.918, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.459 std_dev=0.459
C4	B	0, 0.000, 0.466, 0.933, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.466 std_dev=0.466
O6	B	0, 0.000, 0.467, 0.933, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.467 std_dev=0.467
N9	B	0, 0.000, 0.506, 1.012, 1.012 max_d=1.012 avg_d=0.506 std_dev=0.506
C3'	A	0, 0.000, 0.509, 1.019, 1.019 max_d=1.019 avg_d=0.509 std_dev=0.509
C8	B	0, 0.000, 0.511, 1.022, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.511 std_dev=0.511
C4'	A	0, 0.000, 0.538, 1.076, 1.076 max_d=1.076 avg_d=0.538 std_dev=0.538
O5'	B	0, 0.000, 0.584, 1.169, 1.169 max_d=1.169 avg_d=0.584 std_dev=0.584
P	B	0, 0.000, 0.592, 1.185, 1.185 max_d=1.185 avg_d=0.592 std_dev=0.592
O4'	B	0, 0.000, 0.595, 1.189, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.595 std_dev=0.595
OP1	B	0, 0.000, 0.601, 1.201, 1.201 max_d=1.201 avg_d=0.601 std_dev=0.601
C1'	B	0, 0.000, 0.621, 1.243, 1.243 max_d=1.243 avg_d=0.621 std_dev=0.621
O3'	A	0, 0.000, 0.658, 1.316, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.658 std_dev=0.658
C5'	B	0, 0.000, 0.714, 1.427, 1.427 max_d=1.427 avg_d=0.714 std_dev=0.714
P	A	0, 0.000, 0.726, 1.453, 1.453 max_d=1.453 avg_d=0.726 std_dev=0.726
C4'	B	0, 0.000, 0.755, 1.509, 1.509 max_d=1.509 avg_d=0.755 std_dev=0.755
C2'	B	0, 0.000, 0.758, 1.515, 1.515 max_d=1.515 avg_d=0.758 std_dev=0.758
OP2	A	0, 0.000, 0.777, 1.554, 1.554 max_d=1.554 avg_d=0.777 std_dev=0.777
OP1	A	0, 0.000, 0.822, 1.644, 1.644 max_d=1.644 avg_d=0.822 std_dev=0.822
C3'	B	0, 0.000, 0.864, 1.729, 1.729 max_d=1.729 avg_d=0.864 std_dev=0.864
O2'	B	0, 0.000, 0.887, 1.774, 1.774 max_d=1.774 avg_d=0.887 std_dev=0.887
O5'	A	0, 0.000, 0.934, 1.868, 1.868 max_d=1.868 avg_d=0.934 std_dev=0.934
C5'	A	0, 0.000, 0.995, 1.989, 1.989 max_d=1.989 avg_d=0.995 std_dev=0.995
O3'	B	0, 0.000, 1.005, 2.009, 2.009 max_d=2.009 avg_d=1.005 std_dev=1.005
OP2	B	0, 0.000, 1.045, 2.090, 2.090 max_d=2.090 avg_d=1.045 std_dev=1.045

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.43	0.18	0.10
C2	0.05	0.00	0.00	0.13	0.01	0.07	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.13	0.02	0.01	0.00	0.35	0.21	0.05
C2'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.02	0.02	0.04	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.53	0.12	0.17
C3'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.00	0.02	0.00	0.05	0.04	0.12	0.18	0.00	0.00	0.08	0.01	0.07	0.48	0.09	0.19
C4	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.09	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.06	0.00	0.02	0.03	0.27	0.22	0.01
C4'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.09	0.00	0.05	0.00	0.01	0.04	0.09	0.06	0.03	0.01	0.11	0.00	0.01	0.26	0.15	0.06
C5	0.00	0.01	0.07	0.02	0.00	0.05	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.34	0.19	0.06
C5'	0.02	0.17	0.01	0.00	0.22	0.00	0.15	0.00	0.07	0.10	0.22	0.16	0.02	0.02	0.25	0.00	0.00	0.02	0.14	0.00
C6	0.01	0.01	0.07	0.05	0.01	0.01	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.01	0.07	0.45	0.17	0.12
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.01	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.00	0.05	0.43	0.18	0.10
N3	0.04	0.00	0.02	0.12	0.01	0.09	0.00	0.22	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.12	0.02	0.00	0.03	0.29	0.23	0.02
O2	0.08	0.00	0.04	0.18	0.02	0.06	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.00	0.16	0.19	0.03	0.04	0.01	0.35	0.20	0.06
O2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.09	0.03	0.06	0.02	0.03	0.04	0.12	0.16	0.00	0.01	0.10	0.06	0.03	0.44	0.19	0.08
O3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.06	0.01	0.03	0.02	0.06	0.03	0.12	0.19	0.01	0.00	0.08	0.01	0.04	0.43	0.08	0.18
O4	0.01	0.02	0.04	0.08	0.00	0.11	0.00	0.25	0.01	0.00	0.02	0.03	0.10	0.08	0.00	0.03	0.05	0.20	0.21	0.02
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.03	0.00	0.05	0.33	0.16	0.07
O5'	0.05	0.00	0.06	0.07	0.03	0.01	0.01	0.00	0.07	0.05	0.03	0.01	0.03	0.04	0.05	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.43	0.35	0.53	0.48	0.27	0.26	0.34	0.02	0.45	0.43	0.29	0.35	0.44	0.43	0.20	0.33	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.18	0.21	0.12	0.09	0.22	0.15	0.19	0.14	0.17	0.18	0.23	0.20	0.19	0.08	0.21	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.10	0.05	0.17	0.19	0.01	0.06	0.06	0.00	0.12	0.10	0.02	0.06	0.08	0.18	0.02	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.16	0.12	0.15	0.02	0.18	0.07	0.19	0.03	0.23	0.15	0.22	0.09	0.22	0.11	0.07	0.12	0.17	0.14	0.02	0.42	0.27	0.23
C2	0.07	0.12	0.06	0.08	0.04	0.12	0.10	0.12	0.04	0.17	0.10	0.20	0.05	0.18	0.08	0.02	0.06	0.11	0.07	0.08	0.36	0.17	0.15
C2'	0.08	0.13	0.10	0.12	0.02	0.14	0.10	0.16	0.03	0.22	0.09	0.20	0.09	0.24	0.09	0.06	0.08	0.12	0.14	0.07	0.43	0.32	0.25
C3'	0.07	0.17	0.07	0.05	0.09	0.04	0.02	0.03	0.03	0.04	0.11	0.22	0.17	0.07	0.07	0.08	0.06	0.05	0.07	0.02	0.18	0.15	0.04
C4	0.16	0.06	0.16	0.16	0.18	0.17	0.23	0.17	0.20	0.25	0.11	0.06	0.11	0.27	0.19	0.13	0.13	0.17	0.13	0.22	0.38	0.20	0.19
C4'	0.13	0.25	0.13	0.08	0.20	0.05	0.16	0.06	0.18	0.09	0.22	0.27	0.24	0.09	0.17	0.15	0.06	0.08	0.14	0.15	0.10	0.07	0.04
C5	0.21	0.10	0.21	0.20	0.24	0.20	0.27	0.19	0.23	0.30	0.14	0.04	0.15	0.30	0.24	0.20	0.18	0.19	0.16	0.23	0.37	0.23	0.22
C5'	0.28	0.24	0.30	0.28	0.25	0.28	0.20	0.32	0.17	0.23	0.19	0.24	0.27	0.18	0.29	0.28	0.22	0.29	0.38	0.13	0.21	0.16	0.30
C6	0.19	0.01	0.19	0.19	0.20	0.19	0.25	0.18	0.18	0.30	0.06	0.11	0.07	0.31	0.23	0.17	0.16	0.19	0.15	0.18	0.37	0.24	0.22
N1	0.11	0.11	0.11	0.12	0.08	0.15	0.15	0.15	0.08	0.23	0.07	0.19	0.04	0.25	0.13	0.07	0.10	0.14	0.11	0.10	0.38	0.22	0.19
N3	0.10	0.05	0.09	0.11	0.09	0.14	0.15	0.14	0.11	0.19	0.01	0.14	0.01	0.21	0.12	0.05	0.08	0.13	0.08	0.15	0.37	0.17	0.16
O2	0.01	0.18	0.01	0.02	0.05	0.07	0.00	0.07	0.07	0.08	0.18	0.23	0.12	0.09	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.03	0.33	0.12	0.10
O2'	0.18	0.13	0.21	0.26	0.05	0.28	0.08	0.32	0.04	0.28	0.14	0.20	0.05	0.26	0.15	0.16	0.22	0.25	0.29	0.05	0.61	0.48	0.42
O3'	0.10	0.18	0.10	0.08	0.12	0.07	0.05	0.07	0.05	0.00	0.13	0.22	0.18	0.03	0.10	0.11	0.08	0.08	0.11	0.00	0.12	0.14	0.00
O4	0.17	0.11	0.16	0.16	0.19	0.18	0.23	0.17	0.22	0.25	0.15	0.01	0.14	0.26	0.20	0.14	0.14	0.17	0.13	0.24	0.38	0.20	0.19
O4'	0.01	0.26	0.00	0.05	0.15	0.10	0.11	0.11	0.17	0.05	0.24	0.29	0.22	0.02	0.06	0.05	0.04	0.07	0.03	0.14	0.30	0.19	0.12
O5'	0.29	0.37	0.28	0.21	0.33	0.18	0.27	0.16	0.26	0.22	0.31	0.39	0.38	0.20	0.31	0.28	0.18	0.26	0.24	0.22	0.03	0.00	0.13
OP1	0.17	0.43	0.13	0.03	0.33	0.03	0.33	0.05	0.38	0.21	0.43	0.46	0.38	0.26	0.26	0.13	0.04	0.13	0.17	0.38	0.07	0.04	0.12
OP2	0.04	0.08	0.06	0.07	0.02	0.04	0.10	0.01	0.09	0.12	0.01	0.17	0.10	0.15	0.02	0.09	0.11	0.03	0.03	0.12	0.18	0.09	0.05
P	0.09	0.25	0.07	0.03	0.16	0.02	0.12	0.02	0.15	0.05	0.21	0.30	0.23	0.06	0.12	0.08	0.00	0.08	0.09	0.13	0.05	0.09	0.02

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.08	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.03	0.10	0.06	0.02
C2	0.06	0.00	0.04	0.05	0.02	0.06	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.06	0.07	0.11	0.01	0.12	0.13	0.07
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.02	0.04	0.04	0.04	0.05	0.03	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.05	0.06	0.13	0.04
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.07	0.04	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.02	0.07	0.02
C4	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.09	0.01	0.13	0.11	0.05
C4'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.09	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01
C5	0.02	0.01	0.04	0.03	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.03	0.01	0.09	0.01	0.17	0.11	0.05
C5'	0.02	0.08	0.02	0.00	0.05	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.06	0.10	0.07	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.03	0.06	0.01
C6	0.03	0.00	0.04	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.04	0.01	0.10	0.00	0.17	0.12	0.06
C8	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.06	0.02	0.05	0.09	0.02	0.17	0.10	0.05
N1	0.04	0.00	0.04	0.04	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.05	0.04	0.10	0.01	0.15	0.12	0.06
N2	0.08	0.00	0.05	0.07	0.03	0.09	0.01	0.10	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.03	0.09	0.10	0.12	0.02	0.10	0.14	0.08
N3	0.05	0.01	0.03	0.04	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.05	0.07	0.10	0.00	0.10	0.12	0.07
N7	0.00	0.01	0.05	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.07	0.02	0.04	0.09	0.02	0.19	0.11	0.05
N9	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.04	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.08	0.02	0.13	0.09	0.04
O2'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.06	0.02	0.06	0.06	0.04	0.03	0.01	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.08	0.06	0.17	0.06
O3'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.05	0.09	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.03	0.05	0.01
O4'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.04	0.10	0.07	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.10	0.04	0.03
O5'	0.05	0.11	0.04	0.00	0.09	0.00	0.09	0.00	0.10	0.09	0.10	0.12	0.10	0.09	0.08	0.04	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00
O6	0.03	0.01	0.05	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.08	0.04	0.00	0.10	0.00	0.18	0.13	0.07
OP1	0.10	0.12	0.06	0.02	0.13	0.03	0.17	0.03	0.17	0.17	0.15	0.10	0.10	0.19	0.13	0.06	0.03	0.10	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00
OP2	0.06	0.13	0.13	0.07	0.11	0.02	0.11	0.06	0.12	0.10	0.12	0.14	0.12	0.11	0.09	0.17	0.05	0.04	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00
P	0.02	0.07	0.04	0.02	0.05	0.01	0.05	0.01	0.06	0.05	0.06	0.08	0.07	0.05	0.04	0.06	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00