Doublet Group distance statistics: 54632

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.004, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.000, 0.011, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.000, 0.011, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.000, 0.011, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N2	A	0, 0.000, 0.013, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.000, 0.014, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.000, 0.028, 0.056, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.028 std_dev=0.028
O6	A	0, 0.000, 0.029, 0.057, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.029 std_dev=0.029
C8	A	0, 0.000, 0.031, 0.062, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.031
C2'	B	0, 0.000, 0.076, 0.153, 0.153 max_d=0.153 avg_d=0.076 std_dev=0.076
O4'	A	0, 0.000, 0.183, 0.365, 0.365 max_d=0.365 avg_d=0.183 std_dev=0.183
C2'	A	0, 0.000, 0.214, 0.427, 0.427 max_d=0.427 avg_d=0.214 std_dev=0.214
C4'	A	0, 0.000, 0.256, 0.513, 0.513 max_d=0.513 avg_d=0.256 std_dev=0.256
C5'	A	0, 0.000, 0.333, 0.667, 0.667 max_d=0.667 avg_d=0.333 std_dev=0.333
C3'	A	0, 0.000, 0.397, 0.795, 0.795 max_d=0.795 avg_d=0.397 std_dev=0.397
O2'	A	0, 0.000, 0.500, 0.999, 0.999 max_d=0.999 avg_d=0.500 std_dev=0.500
O2'	B	0, 0.000, 0.630, 1.260, 1.260 max_d=1.260 avg_d=0.630 std_dev=0.630
O5'	A	0, 0.000, 0.808, 1.616, 1.616 max_d=1.616 avg_d=0.808 std_dev=0.808
O3'	A	0, 0.000, 0.826, 1.652, 1.652 max_d=1.652 avg_d=0.826 std_dev=0.826
C1'	B	0, 0.000, 1.074, 2.148, 2.148 max_d=2.148 avg_d=1.074 std_dev=1.074
O4'	B	0, 0.000, 1.173, 2.347, 2.347 max_d=2.347 avg_d=1.173 std_dev=1.173
C3'	B	0, 0.000, 1.407, 2.815, 2.815 max_d=2.815 avg_d=1.407 std_dev=1.407
P	A	0, 0.000, 1.670, 3.340, 3.340 max_d=3.340 avg_d=1.670 std_dev=1.670
C4'	B	0, 0.000, 1.691, 3.381, 3.381 max_d=3.381 avg_d=1.691 std_dev=1.691
N9	B	0, 0.000, 1.798, 3.596, 3.596 max_d=3.596 avg_d=1.798 std_dev=1.798
O5'	B	0, 0.000, 1.839, 3.679, 3.679 max_d=3.679 avg_d=1.839 std_dev=1.839
C8	B	0, 0.000, 1.867, 3.733, 3.733 max_d=3.733 avg_d=1.867 std_dev=1.867
OP1	A	0, 0.000, 1.884, 3.769, 3.769 max_d=3.769 avg_d=1.884 std_dev=1.884
OP2	A	0, 0.000, 2.000, 4.000, 4.000 max_d=4.000 avg_d=2.000 std_dev=2.000
C5'	B	0, 0.000, 2.167, 4.333, 4.333 max_d=4.333 avg_d=2.167 std_dev=2.167
O3'	B	0, 0.000, 2.290, 4.580, 4.580 max_d=4.580 avg_d=2.290 std_dev=2.290
N7	B	0, 0.000, 3.112, 6.224, 6.224 max_d=6.224 avg_d=3.112 std_dev=3.112
C4	B	0, 0.000, 3.115, 6.230, 6.230 max_d=6.230 avg_d=3.115 std_dev=3.115
P	B	0, 0.000, 3.152, 6.305, 6.305 max_d=6.305 avg_d=3.152 std_dev=3.152
OP1	B	0, 0.000, 3.729, 7.458, 7.458 max_d=7.458 avg_d=3.729 std_dev=3.729
N3	B	0, 0.000, 3.756, 7.513, 7.513 max_d=7.513 avg_d=3.756 std_dev=3.756
C5	B	0, 0.000, 3.816, 7.632, 7.632 max_d=7.632 avg_d=3.816 std_dev=3.816
OP2	B	0, 0.000, 4.099, 8.199, 8.199 max_d=8.199 avg_d=4.099 std_dev=4.099
C2	B	0, 0.000, 5.012, 10.025, 10.025 max_d=10.025 avg_d=5.012 std_dev=5.012
C6	B	0, 0.000, 5.201, 10.403, 10.403 max_d=10.403 avg_d=5.201 std_dev=5.201
N1	B	0, 0.000, 5.728, 11.456, 11.456 max_d=11.456 avg_d=5.728 std_dev=5.728
N6	B	0, 0.000, 6.095, 12.189, 12.189 max_d=12.189 avg_d=6.095 std_dev=6.095

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.11	0.00	0.11	0.02	0.13	0.10	0.12
C2	0.01	0.00	0.07	0.18	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.22	0.11	0.01	0.23	0.01	0.62	0.14	0.43
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.10	0.02	0.04	0.04	0.10	0.07	0.04	0.01	0.00	0.03	0.01	0.14	0.01	0.02	0.30	0.20
C3'	0.02	0.18	0.01	0.00	0.15	0.00	0.17	0.02	0.19	0.11	0.19	0.18	0.16	0.14	0.11	0.02	0.00	0.01	0.26	0.20	0.11	0.54	0.29
C4	0.00	0.00	0.03	0.15	0.00	0.02	0.01	0.11	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.16	0.07	0.01	0.19	0.01	0.57	0.06	0.36
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.03	0.07	0.05	0.03	0.00	0.21	0.00	0.00	0.01	0.01	0.33	0.23	0.06
C5	0.01	0.01	0.00	0.17	0.01	0.00	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.10	0.01	0.18	0.01	0.76	0.03	0.41
C5'	0.06	0.09	0.10	0.02	0.11	0.00	0.15	0.00	0.14	0.18	0.12	0.06	0.08	0.18	0.12	0.10	0.15	0.02	0.00	0.15	0.31	0.35	0.02
C6	0.01	0.01	0.02	0.19	0.01	0.02	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.14	0.02	0.20	0.00	0.86	0.01	0.48
C8	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.04	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.03	0.02	0.10	0.02	0.61	0.12	0.26
N1	0.01	0.00	0.04	0.19	0.00	0.03	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.22	0.14	0.01	0.22	0.00	0.77	0.08	0.48
N2	0.01	0.00	0.10	0.18	0.01	0.07	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.12	0.01	0.24	0.00	0.57	0.20	0.44
N3	0.00	0.00	0.07	0.16	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.19	0.07	0.00	0.21	0.01	0.50	0.15	0.37
N7	0.01	0.01	0.04	0.14	0.00	0.03	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.08	0.02	0.13	0.02	0.81	0.15	0.36
N9	0.00	0.01	0.01	0.11	0.00	0.00	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.01	0.01	0.15	0.02	0.43	0.03	0.26
O2'	0.01	0.22	0.00	0.02	0.16	0.21	0.17	0.10	0.20	0.08	0.22	0.21	0.19	0.12	0.09	0.00	0.04	0.13	0.23	0.20	0.01	0.44	0.25
O3'	0.11	0.11	0.03	0.00	0.07	0.00	0.10	0.15	0.14	0.03	0.14	0.12	0.07	0.08	0.01	0.04	0.00	0.13	0.22	0.16	0.25	0.67	0.24
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.13	0.13	0.00	0.04	0.03	0.00	0.05	0.02
O5'	0.11	0.23	0.14	0.26	0.19	0.01	0.18	0.00	0.20	0.10	0.22	0.24	0.21	0.13	0.15	0.23	0.22	0.04	0.00	0.20	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.15	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.20	0.16	0.03	0.20	0.00	0.98	0.05	0.51
OP1	0.13	0.62	0.02	0.11	0.57	0.33	0.76	0.31	0.86	0.61	0.77	0.57	0.50	0.81	0.43	0.01	0.25	0.00	0.01	0.98	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.14	0.30	0.54	0.06	0.23	0.03	0.35	0.01	0.12	0.08	0.20	0.15	0.15	0.03	0.44	0.67	0.05	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.43	0.20	0.29	0.36	0.06	0.41	0.02	0.48	0.26	0.48	0.44	0.37	0.36	0.26	0.25	0.24	0.02	0.00	0.51	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	1.66	0.05	0.33	1.08	0.62	1.33	0.60	1.74	0.68	1.91	1.22	1.94	1.08	0.63	0.02	0.75	0.25	0.06	0.23	0.84	0.41
C2	0.11	1.16	0.04	0.26	0.81	0.48	0.93	0.38	1.16	0.49	1.26	0.92	1.22	0.74	0.48	0.02	0.62	0.18	0.16	0.03	0.86	0.49
C2'	0.23	2.06	0.12	0.38	1.37	0.71	1.69	0.72	2.19	0.89	2.38	1.52	2.44	1.38	0.82	0.02	0.89	0.24	0.01	0.36	0.70	0.30
C3'	0.34	2.16	0.26	0.23	1.50	0.58	1.88	0.57	2.40	1.09	2.53	1.61	2.70	1.61	0.96	0.12	0.76	0.13	0.20	0.14	0.94	0.53
C4	0.04	1.11	0.05	0.18	0.76	0.49	0.96	0.38	1.23	0.53	1.30	0.81	1.37	0.82	0.44	0.07	0.51	0.25	0.24	0.10	1.11	0.66
C4'	0.18	1.83	0.12	0.28	1.23	0.63	1.57	0.59	2.05	0.87	2.17	1.32	2.34	1.34	0.74	0.01	0.75	0.24	0.15	0.13	0.95	0.52
C5	0.08	0.57	0.04	0.01	0.43	0.36	0.64	0.17	0.80	0.40	0.77	0.37	0.94	0.61	0.25	0.14	0.21	0.29	0.43	0.43	1.45	0.94
C5'	0.05	1.44	0.03	0.36	0.95	0.76	1.33	0.67	1.77	0.70	1.83	0.97	2.09	1.16	0.52	0.21	0.78	0.45	0.11	0.06	1.03	0.56
C6	0.16	0.18	0.03	0.12	0.18	0.25	0.37	0.02	0.44	0.27	0.36	0.06	0.56	0.41	0.11	0.19	0.00	0.29	0.52	0.60	1.58	1.06
C8	0.04	0.86	0.05	0.07	0.60	0.45	0.86	0.29	1.10	0.51	1.10	0.57	1.29	0.79	0.35	0.11	0.34	0.30	0.36	0.32	1.39	0.87
N1	0.06	0.48	0.04	0.00	0.37	0.31	0.51	0.13	0.62	0.32	0.61	0.34	0.71	0.48	0.22	0.14	0.20	0.23	0.39	0.36	1.27	0.83
N2	0.26	1.50	0.03	0.44	1.03	0.53	1.08	0.50	1.33	0.53	1.52	1.27	1.34	0.79	0.62	0.09	0.91	0.10	0.02	0.31	0.48	0.21
N3	0.15	1.46	0.05	0.32	0.97	0.55	1.14	0.50	1.45	0.59	1.60	1.12	1.55	0.91	0.57	0.01	0.73	0.20	0.09	0.15	0.80	0.42
N7	0.12	0.47	0.05	0.05	0.37	0.35	0.61	0.14	0.76	0.40	0.69	0.27	0.93	0.61	0.22	0.15	0.14	0.31	0.48	0.55	1.60	1.05
N9	0.05	1.24	0.05	0.20	0.83	0.53	1.07	0.44	1.39	0.58	1.47	0.89	1.56	0.91	0.49	0.07	0.55	0.27	0.21	0.05	1.10	0.64
O2'	0.01	2.12	0.21	0.82	1.23	1.09	1.53	1.17	2.12	0.60	2.41	1.49	2.35	1.12	0.59	0.23	1.35	0.52	0.49	0.98	0.06	0.29
O3'	0.41	2.44	0.25	0.32	1.68	0.61	2.09	0.63	2.69	1.20	2.86	1.81	3.04	1.77	1.08	0.12	0.92	0.08	0.14	0.27	0.75	0.42
O4'	0.12	1.57	0.06	0.28	1.03	0.59	1.31	0.54	1.71	0.69	1.84	1.13	1.94	1.09	0.60	0.03	0.68	0.25	0.14	0.11	0.97	0.52
O5'	0.27	1.47	0.33	0.10	1.13	0.29	1.49	0.14	1.84	1.00	1.83	1.07	2.14	1.40	0.79	0.12	0.29	0.06	0.62	0.55	1.64	1.14
O6	0.30	0.36	0.02	0.30	0.17	0.11	0.02	0.18	0.00	0.12	0.17	0.41	0.13	0.18	0.11	0.25	0.30	0.32	0.68	0.91	1.89	1.30
OP1	0.71	1.71	0.85	0.68	1.48	0.23	1.86	0.40	2.15	1.46	2.07	1.37	2.45	1.83	1.21	0.60	0.29	0.39	1.19	1.18	2.36	1.78
OP2	0.19	1.24	0.28	0.12	1.02	0.26	1.46	0.02	1.79	1.04	1.68	0.87	2.16	1.45	0.74	0.01	0.28	0.09	0.78	0.88	1.86	1.39
P	0.55	1.61	0.63	0.45	1.37	0.06	1.77	0.26	2.09	1.34	2.01	1.25	2.42	1.74	1.08	0.37	0.03	0.25	1.05	1.07	2.13	1.63

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.09	0.00	0.15	0.14	0.24	0.21
C2	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.24	0.14	0.00	0.19	0.31	0.03	0.25
C2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.12	0.04	0.02	0.05	0.04	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.32	0.27	0.65	0.50
C3'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.00	0.12	0.02	0.10	0.18	0.05	0.01	0.13	0.17	0.10	0.02	0.00	0.01	0.10	0.01	0.60	0.30
C4	0.00	0.00	0.03	0.07	0.00	0.01	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.18	0.04	0.00	0.17	0.29	0.04	0.20
C4'	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.15	0.02	0.00	0.01	0.07	0.37	0.09
C5	0.00	0.00	0.03	0.12	0.00	0.01	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.05	0.01	0.16	0.35	0.26	0.15
C5'	0.08	0.10	0.12	0.02	0.11	0.00	0.13	0.00	0.12	0.14	0.12	0.10	0.12	0.14	0.11	0.04	0.12	0.02	0.00	0.09	0.27	0.01
C6	0.00	0.00	0.04	0.10	0.00	0.01	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.22	0.02	0.00	0.16	0.38	0.28	0.16
C8	0.01	0.00	0.02	0.18	0.00	0.02	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.14	0.02	0.12	0.30	0.31	0.09
N1	0.01	0.00	0.05	0.05	0.01	0.00	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.25	0.07	0.00	0.18	0.36	0.13	0.22
N3	0.00	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.22	0.15	0.01	0.19	0.27	0.11	0.25
N6	0.00	0.00	0.04	0.13	0.00	0.02	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.21	0.07	0.00	0.14	0.41	0.44	0.12
N7	0.01	0.00	0.03	0.17	0.01	0.02	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.15	0.02	0.12	0.36	0.45	0.08
N9	0.00	0.00	0.02	0.10	0.00	0.01	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.02	0.01	0.16	0.24	0.02	0.17
O2'	0.01	0.24	0.00	0.02	0.18	0.15	0.18	0.04	0.22	0.09	0.25	0.22	0.21	0.13	0.10	0.00	0.05	0.09	0.23	0.14	0.74	0.46
O3'	0.09	0.14	0.01	0.00	0.04	0.02	0.05	0.12	0.02	0.14	0.07	0.15	0.07	0.15	0.02	0.05	0.00	0.06	0.04	0.26	0.61	0.16
O4'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.09	0.06	0.00	0.00	0.02	0.09	0.01
O5'	0.15	0.19	0.32	0.10	0.17	0.01	0.16	0.00	0.16	0.12	0.18	0.19	0.14	0.12	0.16	0.23	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.14	0.31	0.27	0.01	0.29	0.07	0.35	0.09	0.38	0.30	0.36	0.27	0.41	0.36	0.24	0.14	0.26	0.02	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.24	0.03	0.65	0.60	0.04	0.37	0.26	0.27	0.28	0.31	0.13	0.11	0.44	0.45	0.02	0.74	0.61	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.21	0.25	0.50	0.30	0.20	0.09	0.15	0.01	0.16	0.09	0.22	0.25	0.12	0.08	0.17	0.46	0.16	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00