Doublet Group distance statistics: 54634

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 4, 16, 23, 18, 7, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.021, 0.029, 0.037, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.029 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.024, 0.038, 0.052, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.038 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.043, 0.060, 0.077, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.060 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.040, 0.058, 0.075, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.058 std_dev=0.018
C6	A	0, 0.037, 0.055, 0.073, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.055 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.041, 0.059, 0.077, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.059 std_dev=0.018
O2	A	0, 0.107, 0.155, 0.204, 0.261 max_d=0.261 avg_d=0.155 std_dev=0.049
N4	A	0, 0.118, 0.178, 0.237, 0.305 max_d=0.305 avg_d=0.178 std_dev=0.059
C2'	A	0, 0.172, 0.260, 0.349, 0.617 max_d=0.617 avg_d=0.260 std_dev=0.088
O2'	A	0, 0.286, 0.380, 0.474, 0.630 max_d=0.630 avg_d=0.380 std_dev=0.094
O4'	A	0, 0.060, 0.159, 0.259, 0.648 max_d=0.648 avg_d=0.159 std_dev=0.099
P	B	0, 0.207, 0.327, 0.446, 0.604 max_d=0.604 avg_d=0.327 std_dev=0.119
OP2	B	0, 0.251, 0.383, 0.516, 0.662 max_d=0.662 avg_d=0.383 std_dev=0.132
O5'	B	0, 0.228, 0.372, 0.517, 0.655 max_d=0.655 avg_d=0.372 std_dev=0.145
OP1	B	0, 0.271, 0.437, 0.604, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.437 std_dev=0.167
C6	B	0, 0.115, 0.287, 0.458, 0.862 max_d=0.862 avg_d=0.287 std_dev=0.171
C3'	A	0, 0.185, 0.362, 0.539, 1.236 max_d=1.236 avg_d=0.362 std_dev=0.177
C4'	A	0, 0.132, 0.317, 0.503, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.317 std_dev=0.185
C5'	B	0, 0.162, 0.353, 0.544, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.353 std_dev=0.191
C5	B	0, 0.117, 0.317, 0.517, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.317 std_dev=0.200
O4'	B	0, 0.101, 0.327, 0.553, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.327 std_dev=0.226
C4'	B	0, 0.113, 0.345, 0.577, 1.347 max_d=1.347 avg_d=0.345 std_dev=0.232
O3'	A	0, 0.231, 0.467, 0.704, 1.653 max_d=1.653 avg_d=0.467 std_dev=0.236
C3'	B	0, 0.120, 0.356, 0.592, 1.425 max_d=1.425 avg_d=0.356 std_dev=0.236
N1	B	0, 0.078, 0.314, 0.551, 1.365 max_d=1.365 avg_d=0.314 std_dev=0.236
O5'	A	0, 0.127, 0.372, 0.617, 1.624 max_d=1.624 avg_d=0.372 std_dev=0.245
C1'	B	0, 0.083, 0.342, 0.601, 1.531 max_d=1.531 avg_d=0.342 std_dev=0.259
C4	B	0, 0.099, 0.360, 0.621, 1.292 max_d=1.292 avg_d=0.360 std_dev=0.261
C5'	A	0, 0.151, 0.422, 0.693, 1.806 max_d=1.806 avg_d=0.422 std_dev=0.271
C2'	B	0, 0.092, 0.368, 0.645, 1.665 max_d=1.665 avg_d=0.368 std_dev=0.277
O4	B	0, 0.137, 0.453, 0.768, 1.481 max_d=1.481 avg_d=0.453 std_dev=0.316
N3	B	0, 0.099, 0.427, 0.755, 1.802 max_d=1.802 avg_d=0.427 std_dev=0.328
O3'	B	0, 0.101, 0.437, 0.772, 2.002 max_d=2.002 avg_d=0.437 std_dev=0.335
C2	B	0, 0.074, 0.415, 0.755, 1.920 max_d=1.920 avg_d=0.415 std_dev=0.341
P	A	0, 0.112, 0.456, 0.800, 2.112 max_d=2.112 avg_d=0.456 std_dev=0.344
OP2	A	0, 0.154, 0.521, 0.889, 2.190 max_d=2.190 avg_d=0.521 std_dev=0.368
O2'	B	0, 0.071, 0.442, 0.813, 2.225 max_d=2.225 avg_d=0.442 std_dev=0.371
OP1	A	0, 0.079, 0.533, 0.987, 2.723 max_d=2.723 avg_d=0.533 std_dev=0.454
O2	B	0, 0.051, 0.517, 0.983, 2.516 max_d=2.516 avg_d=0.517 std_dev=0.466

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.02	0.02	0.00	0.04	0.04	0.09	0.04
C2	0.03	0.00	0.07	0.09	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.10	0.02	0.09	0.10	0.17	0.11
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.08	0.08	0.10	0.00	0.02	0.01	0.05	0.07	0.12	0.05
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.11	0.01	0.08	0.02	0.06	0.05	0.11	0.12	0.10	0.02	0.01	0.01	0.05	0.08	0.11	0.06
C4	0.03	0.01	0.07	0.11	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.06	0.13	0.03	0.13	0.17	0.24	0.17
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.06	0.00	0.06	0.01	0.05	0.03	0.05	0.07	0.06	0.05	0.03	0.01	0.01	0.04	0.04	0.02
C5	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.10	0.04	0.13	0.17	0.22	0.17
C5'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.09	0.01	0.09	0.00	0.08	0.05	0.07	0.10	0.05	0.05	0.05	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.03	0.06	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.04	0.11	0.12	0.16	0.13
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.03	0.02	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.06	0.02	0.08	0.09	0.14	0.09
N3	0.03	0.00	0.08	0.11	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.12	0.02	0.12	0.14	0.22	0.14
N4	0.03	0.02	0.08	0.12	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.15	0.04	0.14	0.20	0.26	0.19
O2	0.04	0.01	0.10	0.10	0.02	0.06	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.09	0.12	0.04	0.08	0.08	0.16	0.09
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.06	0.05	0.03	0.05	0.02	0.03	0.07	0.07	0.09	0.00	0.05	0.04	0.05	0.08	0.10	0.05
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.13	0.03	0.10	0.05	0.07	0.06	0.12	0.15	0.12	0.05	0.00	0.02	0.06	0.12	0.14	0.08
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.02	0.04	0.04	0.04	0.02	0.00	0.04	0.05	0.06	0.05
O5'	0.04	0.09	0.05	0.05	0.13	0.01	0.13	0.01	0.11	0.08	0.12	0.14	0.08	0.05	0.06	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01
OP1	0.04	0.10	0.07	0.08	0.17	0.04	0.17	0.04	0.12	0.09	0.14	0.20	0.08	0.08	0.12	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.17	0.12	0.11	0.24	0.04	0.22	0.02	0.16	0.14	0.22	0.26	0.16	0.10	0.14	0.06	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.11	0.05	0.06	0.17	0.02	0.17	0.02	0.13	0.09	0.14	0.19	0.09	0.05	0.08	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.30	0.10	0.08	0.22	0.08	0.21	0.13	0.17	0.13	0.33	0.40	0.16	0.08	0.25	0.08	0.14	0.21	0.23	0.17
C2	0.11	0.25	0.13	0.07	0.16	0.07	0.12	0.11	0.11	0.11	0.29	0.32	0.16	0.08	0.21	0.07	0.13	0.18	0.20	0.16
C2'	0.10	0.30	0.10	0.05	0.22	0.06	0.19	0.12	0.16	0.13	0.33	0.41	0.17	0.05	0.25	0.07	0.13	0.22	0.22	0.17
C3'	0.11	0.30	0.12	0.04	0.21	0.05	0.17	0.12	0.15	0.13	0.32	0.41	0.19	0.04	0.24	0.07	0.12	0.23	0.23	0.17
C4	0.13	0.25	0.16	0.11	0.24	0.08	0.15	0.10	0.13	0.15	0.29	0.28	0.17	0.13	0.28	0.09	0.11	0.17	0.18	0.15
C4'	0.12	0.30	0.11	0.07	0.21	0.06	0.19	0.12	0.17	0.14	0.31	0.41	0.19	0.08	0.22	0.08	0.12	0.22	0.23	0.16
C5	0.15	0.27	0.19	0.14	0.23	0.09	0.12	0.10	0.11	0.17	0.30	0.31	0.19	0.15	0.25	0.10	0.09	0.18	0.20	0.14
C5'	0.15	0.29	0.16	0.06	0.20	0.05	0.15	0.09	0.14	0.16	0.29	0.39	0.23	0.06	0.20	0.10	0.09	0.19	0.21	0.13
C6	0.16	0.31	0.19	0.11	0.22	0.08	0.12	0.10	0.11	0.17	0.33	0.36	0.20	0.11	0.23	0.10	0.10	0.19	0.21	0.15
N1	0.11	0.29	0.14	0.07	0.20	0.07	0.14	0.11	0.12	0.12	0.33	0.36	0.17	0.08	0.22	0.06	0.13	0.20	0.21	0.16
N3	0.13	0.25	0.15	0.09	0.21	0.08	0.13	0.11	0.13	0.14	0.29	0.29	0.17	0.10	0.26	0.09	0.12	0.17	0.18	0.15
N4	0.14	0.24	0.16	0.13	0.27	0.09	0.20	0.11	0.16	0.17	0.29	0.26	0.16	0.15	0.32	0.11	0.11	0.17	0.17	0.16
O2	0.11	0.23	0.13	0.08	0.14	0.08	0.14	0.12	0.12	0.10	0.27	0.32	0.17	0.08	0.19	0.08	0.13	0.18	0.19	0.15
O2'	0.13	0.31	0.10	0.08	0.25	0.09	0.22	0.13	0.19	0.16	0.34	0.43	0.16	0.08	0.28	0.10	0.13	0.21	0.22	0.17
O3'	0.12	0.30	0.12	0.06	0.21	0.06	0.18	0.13	0.15	0.14	0.32	0.41	0.20	0.06	0.24	0.08	0.13	0.24	0.24	0.17
O4'	0.10	0.31	0.09	0.10	0.22	0.09	0.21	0.15	0.18	0.14	0.32	0.42	0.16	0.11	0.22	0.08	0.16	0.23	0.24	0.19
O5'	0.12	0.26	0.15	0.05	0.18	0.05	0.12	0.12	0.12	0.14	0.27	0.33	0.19	0.02	0.20	0.07	0.10	0.22	0.21	0.14
OP1	0.07	0.18	0.10	0.02	0.14	0.05	0.09	0.11	0.09	0.08	0.19	0.24	0.14	0.02	0.16	0.03	0.09	0.22	0.23	0.13
OP2	0.06	0.20	0.06	0.05	0.21	0.15	0.15	0.25	0.12	0.11	0.24	0.23	0.05	0.02	0.25	0.12	0.15	0.30	0.27	0.20
P	0.04	0.18	0.08	0.01	0.14	0.06	0.09	0.13	0.08	0.08	0.20	0.23	0.10	0.00	0.17	0.03	0.09	0.21	0.21	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.06	0.09	0.06
C2	0.01	0.00	0.07	0.08	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.09	0.01	0.02	0.11	0.10	0.17	0.10
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.07	0.12	0.00	0.02	0.05	0.01	0.04	0.07	0.07	0.04
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.07	0.04	0.08	0.11	0.02	0.01	0.07	0.01	0.06	0.08	0.09	0.06
C4	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.08	0.00	0.02	0.16	0.17	0.24	0.17
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.05	0.02	0.03	0.04	0.04	0.02	0.05	0.00	0.01	0.07	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.03	0.18	0.18	0.24	0.17
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.10	0.00	0.11	0.00	0.09	0.05	0.07	0.04	0.04	0.03	0.10	0.01	0.01	0.08	0.04	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.03	0.16	0.13	0.19	0.13
N1	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.01	0.11	0.09	0.15	0.09
N3	0.01	0.00	0.07	0.08	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.10	0.01	0.02	0.14	0.14	0.21	0.14
O2	0.03	0.00	0.12	0.11	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.13	0.02	0.04	0.08	0.08	0.15	0.08
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.06	0.04	0.04	0.04	0.04	0.03	0.08	0.12	0.00	0.04	0.07	0.03	0.04	0.09	0.06	0.04
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.08	0.02	0.07	0.03	0.07	0.04	0.10	0.13	0.04	0.00	0.09	0.02	0.10	0.13	0.15	0.09
O4	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.09	0.00	0.02	0.18	0.20	0.27	0.19
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02	0.02	0.00	0.07	0.07	0.09	0.07
O5'	0.06	0.11	0.04	0.06	0.16	0.01	0.18	0.01	0.16	0.11	0.14	0.08	0.04	0.10	0.18	0.07	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.06	0.10	0.07	0.08	0.17	0.07	0.18	0.08	0.13	0.09	0.14	0.08	0.09	0.13	0.20	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.17	0.07	0.09	0.24	0.04	0.24	0.04	0.19	0.15	0.21	0.15	0.06	0.15	0.27	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.10	0.04	0.06	0.17	0.02	0.17	0.01	0.13	0.09	0.14	0.08	0.04	0.09	0.19	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00