Doublet Group distance statistics: 54640

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 3, 3, 2, 1, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.001, 0.010, 0.019, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.004, 0.015, 0.025, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C6	A	0, -0.002, 0.020, 0.042, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.020 std_dev=0.022
N1	A	0, -0.005, 0.017, 0.040, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.017 std_dev=0.022
C1'	A	0, 0.001, 0.024, 0.047, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.024 std_dev=0.023
O2	A	0, 0.016, 0.042, 0.068, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.042 std_dev=0.026
N4	A	0, 0.015, 0.055, 0.096, 0.149 max_d=0.149 avg_d=0.055 std_dev=0.040
C2'	A	0, 0.026, 0.091, 0.156, 0.227 max_d=0.227 avg_d=0.091 std_dev=0.065
O4'	A	0, 0.054, 0.129, 0.204, 0.233 max_d=0.233 avg_d=0.129 std_dev=0.075
O2'	A	0, 0.076, 0.155, 0.234, 0.310 max_d=0.310 avg_d=0.155 std_dev=0.079
C4'	A	0, 0.062, 0.147, 0.233, 0.309 max_d=0.309 avg_d=0.147 std_dev=0.086
C3'	A	0, 0.051, 0.143, 0.235, 0.339 max_d=0.339 avg_d=0.143 std_dev=0.092
O2	B	0, 0.135, 0.260, 0.385, 0.441 max_d=0.441 avg_d=0.260 std_dev=0.125
O3'	A	0, 0.074, 0.213, 0.352, 0.503 max_d=0.503 avg_d=0.213 std_dev=0.139
OP2	B	0, 0.216, 0.390, 0.563, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.390 std_dev=0.173
C5'	A	0, 0.091, 0.265, 0.440, 0.585 max_d=0.585 avg_d=0.265 std_dev=0.175
C2	B	0, 0.133, 0.317, 0.501, 0.628 max_d=0.628 avg_d=0.317 std_dev=0.184
P	B	0, 0.157, 0.346, 0.535, 0.616 max_d=0.616 avg_d=0.346 std_dev=0.189
O5'	B	0, 0.170, 0.365, 0.561, 0.784 max_d=0.784 avg_d=0.365 std_dev=0.196
P	A	0, 0.112, 0.313, 0.513, 0.654 max_d=0.654 avg_d=0.313 std_dev=0.200
C2'	B	0, 0.216, 0.426, 0.637, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.426 std_dev=0.211
C3'	B	0, 0.132, 0.343, 0.555, 0.718 max_d=0.718 avg_d=0.343 std_dev=0.211
O3'	B	0, 0.130, 0.348, 0.566, 0.735 max_d=0.735 avg_d=0.348 std_dev=0.218
N3	B	0, 0.183, 0.403, 0.624, 0.716 max_d=0.716 avg_d=0.403 std_dev=0.221
C4'	B	0, 0.172, 0.398, 0.623, 0.774 max_d=0.774 avg_d=0.398 std_dev=0.225
C5'	B	0, 0.154, 0.383, 0.612, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.383 std_dev=0.229
O4'	B	0, 0.192, 0.432, 0.672, 0.808 max_d=0.808 avg_d=0.432 std_dev=0.240
C1'	B	0, 0.193, 0.437, 0.680, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.437 std_dev=0.243
N1	B	0, 0.143, 0.389, 0.635, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.389 std_dev=0.246
OP1	B	0, 0.183, 0.447, 0.710, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.447 std_dev=0.263
O2'	B	0, 0.371, 0.647, 0.922, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.647 std_dev=0.276
OP2	A	0, 0.135, 0.411, 0.687, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.411 std_dev=0.276
C4	B	0, 0.230, 0.528, 0.826, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.528 std_dev=0.298
C6	B	0, 0.184, 0.495, 0.806, 1.000 max_d=1.000 avg_d=0.495 std_dev=0.311
O4	B	0, 0.288, 0.617, 0.945, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.617 std_dev=0.329
C5	B	0, 0.225, 0.560, 0.895, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.560 std_dev=0.335
OP1	A	0, 0.143, 0.502, 0.860, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.502 std_dev=0.359
O5'	A	0, 0.055, 0.422, 0.790, 1.347 max_d=1.347 avg_d=0.422 std_dev=0.367

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.18	0.17	0.28	0.02
C2	0.02	0.00	0.05	0.06	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.06	0.01	0.27	0.07	0.24	0.06
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.09	0.00	0.01	0.01	0.05	0.18	0.22	0.04
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.02	0.06	0.03	0.05	0.05	0.09	0.01	0.00	0.01	0.06	0.22	0.19	0.05
C4	0.02	0.00	0.03	0.05	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.05	0.30	0.13	0.28	0.09
C4'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.07	0.02	0.03	0.07	0.06	0.02	0.02	0.00	0.01	0.25	0.26	0.03
C5	0.03	0.01	0.04	0.06	0.01	0.08	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.07	0.07	0.33	0.12	0.34	0.10
C5'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.08	0.01	0.10	0.00	0.08	0.03	0.05	0.10	0.06	0.02	0.04	0.01	0.02	0.28	0.24	0.02
C6	0.04	0.01	0.05	0.06	0.01	0.07	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.06	0.06	0.33	0.08	0.33	0.08
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.27	0.08	0.28	0.04
N3	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.06	0.03	0.28	0.09	0.25	0.08
N4	0.02	0.01	0.02	0.05	0.00	0.07	0.02	0.10	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.06	0.28	0.21	0.27	0.11
O2	0.04	0.00	0.09	0.09	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.11	0.03	0.24	0.12	0.21	0.08
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.05	0.02	0.04	0.02	0.09	0.00	0.03	0.03	0.03	0.22	0.23	0.05
O3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.06	0.02	0.07	0.04	0.06	0.03	0.06	0.06	0.11	0.03	0.00	0.01	0.21	0.25	0.14	0.07
O4'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.06	0.02	0.03	0.06	0.03	0.03	0.01	0.00	0.18	0.21	0.31	0.03
O5'	0.18	0.27	0.05	0.06	0.30	0.01	0.33	0.02	0.33	0.27	0.28	0.28	0.24	0.03	0.21	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.17	0.07	0.18	0.22	0.13	0.25	0.12	0.28	0.08	0.08	0.09	0.21	0.12	0.22	0.25	0.21	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.28	0.24	0.22	0.19	0.28	0.26	0.34	0.24	0.33	0.28	0.25	0.27	0.21	0.23	0.14	0.31	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.02	0.06	0.04	0.05	0.09	0.03	0.10	0.02	0.08	0.04	0.08	0.11	0.08	0.05	0.07	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.07	0.09	0.03	0.10	0.06	0.08	0.16	0.06	0.05	0.10	0.06	0.13	0.05	0.13	0.08	0.09	0.09	0.14	0.09
C2	0.08	0.11	0.07	0.06	0.12	0.11	0.09	0.21	0.08	0.08	0.13	0.12	0.08	0.05	0.15	0.13	0.10	0.14	0.18	0.14
C2'	0.04	0.05	0.10	0.04	0.09	0.05	0.06	0.14	0.05	0.04	0.08	0.05	0.15	0.06	0.12	0.06	0.08	0.10	0.15	0.10
C3'	0.06	0.04	0.11	0.05	0.07	0.04	0.06	0.09	0.05	0.05	0.06	0.04	0.16	0.08	0.09	0.06	0.08	0.09	0.13	0.08
C4	0.09	0.12	0.07	0.06	0.12	0.11	0.09	0.20	0.08	0.09	0.13	0.14	0.07	0.06	0.14	0.12	0.09	0.14	0.16	0.14
C4'	0.07	0.05	0.12	0.07	0.06	0.05	0.06	0.07	0.06	0.06	0.06	0.08	0.19	0.10	0.08	0.06	0.12	0.08	0.12	0.08
C5	0.09	0.12	0.07	0.06	0.12	0.11	0.09	0.21	0.08	0.09	0.13	0.14	0.07	0.07	0.13	0.13	0.10	0.13	0.15	0.13
C5'	0.10	0.08	0.13	0.09	0.07	0.08	0.08	0.05	0.09	0.09	0.07	0.11	0.18	0.10	0.07	0.09	0.14	0.11	0.12	0.10
C6	0.09	0.11	0.07	0.06	0.12	0.11	0.10	0.21	0.08	0.09	0.13	0.13	0.07	0.06	0.14	0.13	0.10	0.12	0.15	0.12
N1	0.08	0.11	0.06	0.05	0.13	0.10	0.10	0.20	0.08	0.08	0.13	0.11	0.08	0.04	0.15	0.12	0.09	0.12	0.15	0.12
N3	0.08	0.11	0.07	0.06	0.12	0.12	0.09	0.21	0.08	0.08	0.13	0.13	0.07	0.06	0.14	0.13	0.10	0.15	0.18	0.14
N4	0.08	0.11	0.08	0.06	0.12	0.10	0.10	0.17	0.09	0.09	0.13	0.14	0.07	0.07	0.14	0.11	0.08	0.14	0.14	0.12
O2	0.09	0.11	0.07	0.07	0.13	0.12	0.10	0.22	0.08	0.08	0.13	0.11	0.09	0.07	0.15	0.13	0.10	0.15	0.19	0.15
O2'	0.06	0.06	0.13	0.06	0.09	0.04	0.07	0.12	0.06	0.05	0.08	0.07	0.20	0.09	0.12	0.05	0.09	0.08	0.14	0.09
O3'	0.08	0.04	0.12	0.07	0.06	0.05	0.06	0.07	0.06	0.06	0.05	0.05	0.19	0.10	0.08	0.06	0.08	0.10	0.14	0.09
O4'	0.05	0.05	0.10	0.05	0.08	0.05	0.07	0.12	0.05	0.05	0.07	0.06	0.16	0.07	0.10	0.07	0.12	0.08	0.13	0.09
O5'	0.19	0.31	0.12	0.17	0.32	0.20	0.27	0.30	0.23	0.24	0.33	0.32	0.07	0.01	0.34	0.24	0.25	0.28	0.30	0.30
OP1	0.02	0.09	0.08	0.02	0.11	0.15	0.07	0.22	0.04	0.05	0.12	0.11	0.09	0.02	0.12	0.10	0.24	0.32	0.34	0.29
OP2	0.16	0.25	0.17	0.16	0.27	0.09	0.26	0.10	0.23	0.23	0.27	0.26	0.08	0.02	0.28	0.14	0.14	0.16	0.17	0.15
P	0.02	0.06	0.02	0.01	0.06	0.03	0.04	0.06	0.03	0.03	0.07	0.07	0.03	0.00	0.07	0.03	0.08	0.12	0.14	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.08	0.07	0.05	0.05
C2	0.02	0.00	0.06	0.05	0.01	0.06	0.02	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.05	0.01	0.06	0.13	0.10	0.08	0.08
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.05	0.10	0.00	0.01	0.04	0.01	0.08	0.07	0.08	0.06
C3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.02	0.02	0.05	0.06	0.01	0.01	0.05	0.02	0.08	0.08	0.09	0.06
C4	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.03	0.15	0.14	0.07	0.09
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.06	0.09	0.04	0.02	0.05	0.00	0.01	0.04	0.03	0.02
C5	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.16	0.16	0.10	0.12
C5'	0.01	0.12	0.02	0.02	0.09	0.00	0.06	0.00	0.05	0.05	0.12	0.17	0.04	0.05	0.11	0.01	0.01	0.06	0.04	0.01
C6	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.15	0.15	0.09	0.11
N1	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.12	0.09	0.06	0.07
N3	0.02	0.00	0.05	0.05	0.01	0.06	0.02	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.05	0.01	0.06	0.14	0.12	0.08	0.09
O2	0.02	0.01	0.10	0.06	0.01	0.09	0.03	0.17	0.03	0.02	0.01	0.00	0.11	0.07	0.02	0.09	0.14	0.13	0.14	0.13
O2'	0.02	0.07	0.00	0.01	0.05	0.04	0.03	0.04	0.02	0.03	0.07	0.11	0.00	0.02	0.06	0.04	0.05	0.07	0.06	0.04
O3'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.02	0.03	0.05	0.02	0.02	0.05	0.07	0.02	0.00	0.05	0.02	0.04	0.08	0.09	0.06
O4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.05	0.00	0.04	0.15	0.15	0.08	0.10
O4'	0.00	0.06	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.06	0.09	0.04	0.02	0.04	0.00	0.06	0.06	0.05	0.04
O5'	0.08	0.13	0.08	0.08	0.15	0.01	0.16	0.01	0.15	0.12	0.14	0.14	0.05	0.04	0.15	0.06	0.00	0.03	0.01	0.00
OP1	0.07	0.10	0.07	0.08	0.14	0.04	0.16	0.06	0.15	0.09	0.12	0.13	0.07	0.08	0.15	0.06	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.05	0.08	0.08	0.09	0.07	0.03	0.10	0.04	0.09	0.06	0.08	0.14	0.06	0.09	0.08	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.08	0.06	0.06	0.09	0.02	0.12	0.01	0.11	0.07	0.09	0.13	0.04	0.06	0.10	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00