Doublet Group distance statistics: 54647

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 3, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.011, 0.017, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.011 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.006, 0.014, 0.021, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.005, 0.013, 0.020, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.004, 0.014, 0.023, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.009, 0.021, 0.033, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.021 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.006, 0.018, 0.029, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.012
N4	A	0, 0.005, 0.023, 0.041, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.023 std_dev=0.018
O2	A	0, 0.005, 0.050, 0.095, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.050 std_dev=0.045
P	B	0, 0.135, 0.297, 0.459, 0.489 max_d=0.489 avg_d=0.297 std_dev=0.162
C5'	B	0, 0.161, 0.325, 0.489, 0.487 max_d=0.487 avg_d=0.325 std_dev=0.164
C4'	B	0, 0.132, 0.330, 0.528, 0.602 max_d=0.602 avg_d=0.330 std_dev=0.198
O5'	B	0, 0.154, 0.357, 0.560, 0.578 max_d=0.578 avg_d=0.357 std_dev=0.203
O2'	A	0, -0.048, 0.175, 0.398, 0.707 max_d=0.707 avg_d=0.175 std_dev=0.223
OP1	B	0, 0.159, 0.393, 0.627, 0.727 max_d=0.727 avg_d=0.393 std_dev=0.234
O4'	B	0, 0.121, 0.369, 0.617, 0.708 max_d=0.708 avg_d=0.369 std_dev=0.248
C2'	A	0, -0.092, 0.164, 0.421, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.164 std_dev=0.256
OP2	B	0, 0.208, 0.469, 0.731, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.469 std_dev=0.262
O4'	A	0, -0.074, 0.189, 0.452, 0.815 max_d=0.815 avg_d=0.189 std_dev=0.263
C3'	B	0, 0.056, 0.343, 0.629, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.343 std_dev=0.286
O3'	B	0, 0.003, 0.348, 0.693, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.348 std_dev=0.345
C1'	B	0, 0.089, 0.439, 0.789, 1.050 max_d=1.050 avg_d=0.439 std_dev=0.350
C6	B	0, 0.159, 0.511, 0.863, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.511 std_dev=0.352
OP2	A	0, -0.002, 0.351, 0.705, 1.173 max_d=1.173 avg_d=0.351 std_dev=0.353
C5	B	0, 0.189, 0.546, 0.904, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.546 std_dev=0.357
OP1	A	0, -0.022, 0.347, 0.717, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.347 std_dev=0.369
P	A	0, -0.046, 0.332, 0.710, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.332 std_dev=0.378
C2'	B	0, 0.077, 0.457, 0.837, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.457 std_dev=0.380
N1	B	0, 0.077, 0.467, 0.858, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.467 std_dev=0.390
C4'	A	0, -0.133, 0.270, 0.672, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.270 std_dev=0.402
C3'	A	0, -0.142, 0.277, 0.696, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.277 std_dev=0.419
C4	B	0, 0.103, 0.552, 1.000, 1.508 max_d=1.508 avg_d=0.552 std_dev=0.449
O2'	B	0, 0.117, 0.578, 1.040, 1.332 max_d=1.332 avg_d=0.578 std_dev=0.461
O4	B	0, 0.115, 0.605, 1.094, 1.669 max_d=1.669 avg_d=0.605 std_dev=0.490
C2	B	0, -0.027, 0.479, 0.984, 1.583 max_d=1.583 avg_d=0.479 std_dev=0.505
N3	B	0, -0.014, 0.519, 1.052, 1.711 max_d=1.711 avg_d=0.519 std_dev=0.533
O2	B	0, -0.073, 0.498, 1.069, 1.782 max_d=1.782 avg_d=0.498 std_dev=0.571
O5'	A	0, -0.197, 0.398, 0.994, 1.839 max_d=1.839 avg_d=0.398 std_dev=0.595
O3'	A	0, -0.189, 0.439, 1.067, 1.945 max_d=1.945 avg_d=0.439 std_dev=0.628
C5'	A	0, -0.198, 0.443, 1.084, 1.964 max_d=1.964 avg_d=0.443 std_dev=0.641

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.06	0.00	0.01	0.00	0.02	0.19	0.22	0.03
C2	0.03	0.00	0.12	0.12	0.01	0.03	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.15	0.06	0.04	0.21	0.14	0.08
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.07	0.02	0.10	0.06	0.19	0.00	0.02	0.01	0.05	0.03	0.40	0.12
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.08	0.00	0.03	0.01	0.04	0.04	0.12	0.09	0.16	0.02	0.01	0.01	0.05	0.09	0.42	0.17
C4	0.03	0.01	0.05	0.08	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.03	0.11	0.03	0.06	0.23	0.09	0.12
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.03	0.04	0.05	0.07	0.02	0.00	0.01	0.07	0.20	0.03
C5	0.03	0.02	0.04	0.03	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.04	0.05	0.06	0.24	0.10	0.12
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.07	0.00	0.07	0.00	0.07	0.04	0.06	0.07	0.06	0.07	0.01	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.04	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.04	0.07	0.05	0.24	0.14	0.10
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.05	0.02	0.03	0.21	0.17	0.06
N3	0.03	0.01	0.10	0.12	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.16	0.05	0.05	0.22	0.11	0.10
N4	0.03	0.01	0.06	0.09	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.13	0.04	0.07	0.24	0.09	0.14
O2	0.06	0.01	0.19	0.16	0.01	0.05	0.02	0.06	0.03	0.03	0.01	0.02	0.00	0.15	0.21	0.09	0.05	0.21	0.15	0.08
O2'	0.00	0.07	0.00	0.02	0.03	0.07	0.04	0.07	0.05	0.02	0.06	0.04	0.15	0.00	0.03	0.04	0.02	0.08	0.38	0.08
O3'	0.01	0.15	0.02	0.01	0.11	0.02	0.04	0.01	0.04	0.05	0.16	0.13	0.21	0.03	0.00	0.02	0.05	0.23	0.50	0.25
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.05	0.04	0.09	0.04	0.02	0.00	0.03	0.26	0.10	0.11
O5'	0.02	0.04	0.05	0.05	0.06	0.01	0.06	0.00	0.05	0.03	0.05	0.07	0.05	0.02	0.05	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.19	0.21	0.03	0.09	0.23	0.07	0.24	0.04	0.24	0.21	0.22	0.24	0.21	0.08	0.23	0.26	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.22	0.14	0.40	0.42	0.09	0.20	0.10	0.05	0.14	0.17	0.11	0.09	0.15	0.38	0.50	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.03	0.08	0.12	0.17	0.12	0.03	0.12	0.01	0.10	0.06	0.10	0.14	0.08	0.08	0.25	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.18	0.22	0.16	0.20	0.09	0.23	0.02	0.25	0.22	0.17	0.15	0.22	0.15	0.18	0.14	0.04	0.08	0.17	0.06
C2	0.15	0.08	0.19	0.17	0.15	0.10	0.22	0.06	0.23	0.17	0.09	0.06	0.19	0.21	0.14	0.12	0.06	0.09	0.17	0.06
C2'	0.09	0.10	0.10	0.06	0.12	0.06	0.14	0.09	0.14	0.12	0.10	0.07	0.09	0.07	0.11	0.07	0.11	0.16	0.15	0.10
C3'	0.08	0.07	0.07	0.08	0.09	0.11	0.09	0.14	0.08	0.07	0.08	0.06	0.06	0.08	0.10	0.09	0.14	0.22	0.15	0.14
C4	0.17	0.13	0.19	0.20	0.20	0.15	0.26	0.12	0.27	0.19	0.16	0.16	0.21	0.24	0.20	0.15	0.08	0.10	0.17	0.10
C4'	0.06	0.07	0.10	0.04	0.07	0.04	0.06	0.11	0.06	0.06	0.07	0.08	0.14	0.06	0.09	0.05	0.11	0.21	0.13	0.12
C5	0.19	0.14	0.22	0.22	0.21	0.14	0.27	0.08	0.28	0.22	0.15	0.10	0.22	0.24	0.20	0.16	0.04	0.09	0.16	0.08
C5'	0.09	0.15	0.05	0.08	0.21	0.11	0.18	0.17	0.14	0.12	0.20	0.14	0.10	0.03	0.24	0.12	0.17	0.30	0.15	0.19
C6	0.20	0.16	0.24	0.21	0.21	0.12	0.27	0.02	0.28	0.23	0.16	0.08	0.23	0.22	0.20	0.16	0.04	0.07	0.16	0.06
N1	0.18	0.13	0.22	0.18	0.18	0.10	0.24	0.03	0.25	0.20	0.12	0.05	0.21	0.20	0.16	0.14	0.04	0.08	0.17	0.06
N3	0.14	0.10	0.18	0.17	0.17	0.12	0.23	0.09	0.24	0.16	0.13	0.15	0.19	0.22	0.17	0.13	0.08	0.10	0.17	0.08
N4	0.19	0.18	0.20	0.21	0.24	0.18	0.29	0.18	0.30	0.21	0.21	0.23	0.22	0.25	0.25	0.19	0.14	0.13	0.19	0.14
O2	0.14	0.07	0.19	0.16	0.13	0.10	0.20	0.05	0.22	0.16	0.08	0.05	0.19	0.20	0.12	0.11	0.06	0.10	0.18	0.07
O2'	0.14	0.20	0.16	0.08	0.21	0.03	0.21	0.06	0.21	0.19	0.20	0.19	0.15	0.06	0.21	0.09	0.09	0.12	0.16	0.07
O3'	0.13	0.11	0.13	0.14	0.14	0.15	0.14	0.16	0.13	0.12	0.13	0.09	0.12	0.13	0.15	0.14	0.15	0.25	0.15	0.15
O4'	0.20	0.16	0.25	0.18	0.13	0.11	0.17	0.05	0.20	0.20	0.12	0.15	0.28	0.20	0.11	0.14	0.06	0.10	0.15	0.07
O5'	0.14	0.19	0.09	0.14	0.23	0.16	0.20	0.21	0.16	0.16	0.22	0.18	0.06	0.00	0.25	0.17	0.20	0.30	0.19	0.21
OP1	0.14	0.28	0.14	0.08	0.17	0.08	0.12	0.05	0.12	0.18	0.24	0.38	0.15	0.01	0.16	0.12	0.06	0.19	0.10	0.11
OP2	0.16	0.17	0.17	0.04	0.13	0.03	0.14	0.07	0.16	0.16	0.14	0.18	0.29	0.01	0.11	0.09	0.04	0.20	0.04	0.06
P	0.06	0.11	0.07	0.01	0.07	0.01	0.04	0.06	0.05	0.07	0.09	0.15	0.14	0.00	0.07	0.02	0.04	0.19	0.03	0.05

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.24	0.09	0.08
C2	0.01	0.00	0.07	0.06	0.01	0.08	0.02	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.06	0.02	0.09	0.18	0.39	0.15	0.20
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.11	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.24	0.06	0.08
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.04	0.04	0.06	0.08	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01	0.19	0.03	0.05
C4	0.02	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.05	0.00	0.02	0.04	0.24	0.08	0.07
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.08	0.02	0.06	0.17	0.04	0.01	0.03	0.00	0.01	0.17	0.04	0.06
C5	0.03	0.02	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.02	0.09	0.11	0.13	0.21	0.15
C5'	0.01	0.16	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.10	0.03	0.14	0.30	0.04	0.02	0.07	0.01	0.00	0.08	0.05	0.01
C6	0.03	0.00	0.01	0.04	0.02	0.08	0.01	0.10	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.02	0.02	0.10	0.12	0.14	0.20	0.17
N1	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.03	0.26	0.08	0.08
N3	0.01	0.00	0.05	0.06	0.01	0.06	0.01	0.14	0.02	0.02	0.00	0.01	0.08	0.06	0.02	0.05	0.15	0.35	0.11	0.17
O2	0.03	0.01	0.11	0.08	0.02	0.17	0.02	0.30	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.09	0.03	0.17	0.32	0.48	0.29	0.34
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.05	0.04	0.05	0.04	0.05	0.03	0.08	0.15	0.00	0.02	0.05	0.03	0.05	0.28	0.13	0.13
O3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.06	0.09	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.17	0.02	0.05
O4	0.02	0.02	0.02	0.05	0.00	0.03	0.02	0.07	0.02	0.01	0.02	0.03	0.05	0.05	0.00	0.02	0.05	0.24	0.08	0.07
O4'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.02	0.00	0.09	0.01	0.10	0.01	0.05	0.17	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.23	0.08	0.08
O5'	0.02	0.18	0.02	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.12	0.03	0.15	0.32	0.05	0.01	0.05	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.24	0.39	0.24	0.19	0.24	0.17	0.13	0.08	0.14	0.26	0.35	0.48	0.28	0.17	0.24	0.23	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.15	0.06	0.03	0.08	0.04	0.21	0.05	0.20	0.08	0.11	0.29	0.13	0.02	0.08	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.20	0.08	0.05	0.07	0.06	0.15	0.01	0.17	0.08	0.17	0.34	0.13	0.05	0.07	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00