Doublet Group distance statistics: 54661

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.006, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.012 std_dev=0.008
O2	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.008, 0.021, 0.033, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.007, 0.023, 0.039, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.023 std_dev=0.016
N4	A	0, 0.005, 0.021, 0.038, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.021 std_dev=0.017
O4'	A	0, 0.080, 0.258, 0.437, 0.484 max_d=0.484 avg_d=0.258 std_dev=0.178
C2'	A	0, 0.064, 0.249, 0.434, 0.511 max_d=0.511 avg_d=0.249 std_dev=0.185
C4'	A	0, 0.090, 0.313, 0.535, 0.622 max_d=0.622 avg_d=0.313 std_dev=0.223
O2'	A	0, 0.126, 0.392, 0.659, 0.747 max_d=0.747 avg_d=0.392 std_dev=0.266
C3'	A	0, 0.119, 0.410, 0.700, 0.801 max_d=0.801 avg_d=0.410 std_dev=0.290
OP1	B	0, 0.167, 0.511, 0.855, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.511 std_dev=0.344
O3'	A	0, 0.238, 0.671, 1.104, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.671 std_dev=0.433
C5'	A	0, 0.194, 0.632, 1.070, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.632 std_dev=0.438
P	B	0, 0.144, 0.603, 1.062, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.603 std_dev=0.459
OP2	B	0, 0.333, 0.826, 1.319, 1.303 max_d=1.303 avg_d=0.826 std_dev=0.493
O5'	A	0, 0.280, 0.879, 1.477, 1.616 max_d=1.616 avg_d=0.879 std_dev=0.599
O5'	B	0, 0.383, 1.012, 1.642, 1.663 max_d=1.663 avg_d=1.012 std_dev=0.630
C5'	B	0, 0.489, 1.258, 2.026, 1.941 max_d=1.941 avg_d=1.258 std_dev=0.768
OP2	A	0, 0.446, 1.251, 2.055, 1.958 max_d=1.958 avg_d=1.251 std_dev=0.804
C3'	B	0, 0.502, 1.391, 2.279, 2.221 max_d=2.221 avg_d=1.391 std_dev=0.888
P	A	0, 0.469, 1.361, 2.254, 2.205 max_d=2.205 avg_d=1.361 std_dev=0.892
C4'	B	0, 0.567, 1.507, 2.448, 2.302 max_d=2.302 avg_d=1.507 std_dev=0.940
O3'	B	0, 0.545, 1.572, 2.599, 2.498 max_d=2.498 avg_d=1.572 std_dev=1.027
O4'	B	0, 0.705, 1.837, 2.970, 2.793 max_d=2.793 avg_d=1.837 std_dev=1.133
C2'	B	0, 0.675, 1.814, 2.953, 2.835 max_d=2.835 avg_d=1.814 std_dev=1.139
C6	B	0, 0.759, 1.901, 3.043, 3.048 max_d=3.048 avg_d=1.901 std_dev=1.142
C5	B	0, 0.789, 2.003, 3.216, 3.248 max_d=3.248 avg_d=2.003 std_dev=1.214
OP1	A	0, 0.601, 1.851, 3.101, 3.140 max_d=3.140 avg_d=1.851 std_dev=1.250
C1'	B	0, 0.799, 2.089, 3.379, 3.191 max_d=3.191 avg_d=2.089 std_dev=1.290
N1	B	0, 0.890, 2.255, 3.621, 3.362 max_d=3.362 avg_d=2.255 std_dev=1.366
O2'	B	0, 0.860, 2.329, 3.797, 3.630 max_d=3.630 avg_d=2.329 std_dev=1.468
C4	B	0, 1.034, 2.526, 4.018, 3.804 max_d=3.804 avg_d=2.526 std_dev=1.492
O4	B	0, 1.111, 2.697, 4.283, 4.049 max_d=4.049 avg_d=2.697 std_dev=1.586
C2	B	0, 1.044, 2.848, 4.651, 4.791 max_d=4.791 avg_d=2.848 std_dev=1.804
N3	B	0, 1.131, 2.950, 4.769, 4.744 max_d=4.744 avg_d=2.950 std_dev=1.819
O2	B	0, 1.049, 3.291, 5.533, 6.159 max_d=6.159 avg_d=3.291 std_dev=2.242

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.18	0.16	0.13	0.09
C2	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.03	0.03	0.22	0.09	0.10	0.06
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.06	0.02	0.08	0.02	0.08	0.03	0.03	0.06	0.07	0.00	0.01	0.01	0.03	0.14	0.16	0.06
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.08	0.02	0.02	0.04	0.06	0.01	0.00	0.02	0.08	0.14	0.15	0.07
C4	0.02	0.01	0.06	0.04	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.05	0.03	0.23	0.08	0.14	0.10
C4'	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.06	0.02	0.03	0.05	0.02	0.08	0.01	0.00	0.03	0.17	0.10	0.03
C5	0.02	0.01	0.08	0.07	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.09	0.04	0.23	0.10	0.17	0.12
C5'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.10	0.00	0.12	0.00	0.10	0.05	0.07	0.12	0.02	0.08	0.04	0.01	0.01	0.19	0.06	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.08	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.09	0.04	0.23	0.10	0.17	0.11
N1	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.22	0.11	0.13	0.08
N3	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.02	0.03	0.23	0.07	0.11	0.07
N4	0.02	0.00	0.06	0.04	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.05	0.03	0.23	0.10	0.15	0.11
O2	0.01	0.00	0.07	0.06	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.08	0.04	0.20	0.12	0.08	0.05
O2'	0.02	0.05	0.00	0.01	0.07	0.08	0.07	0.08	0.06	0.03	0.06	0.08	0.07	0.00	0.04	0.06	0.04	0.20	0.15	0.04
O3'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.01	0.09	0.04	0.09	0.02	0.02	0.05	0.08	0.04	0.00	0.01	0.20	0.20	0.13	0.09
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.03	0.04	0.06	0.01	0.00	0.24	0.22	0.15	0.13
O5'	0.18	0.22	0.03	0.08	0.23	0.03	0.23	0.01	0.23	0.22	0.23	0.23	0.20	0.04	0.20	0.24	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.16	0.09	0.14	0.14	0.08	0.17	0.10	0.19	0.10	0.11	0.07	0.10	0.12	0.20	0.20	0.22	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.10	0.16	0.15	0.14	0.10	0.17	0.06	0.17	0.13	0.11	0.15	0.08	0.15	0.13	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.06	0.06	0.07	0.10	0.03	0.12	0.01	0.11	0.08	0.07	0.11	0.05	0.04	0.09	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.24	0.09	0.11	0.26	0.13	0.46	0.19	0.39	0.10	0.15	0.54	0.21	0.24	0.30	0.09	0.16	0.29	0.17	0.14
C2	0.17	0.40	0.20	0.17	0.23	0.13	0.53	0.17	0.46	0.13	0.27	0.78	0.37	0.27	0.26	0.08	0.12	0.31	0.19	0.12
C2'	0.12	0.23	0.11	0.15	0.21	0.20	0.37	0.22	0.31	0.10	0.16	0.47	0.18	0.25	0.25	0.16	0.16	0.24	0.17	0.10
C3'	0.15	0.21	0.14	0.15	0.19	0.20	0.28	0.18	0.24	0.13	0.17	0.37	0.19	0.25	0.21	0.20	0.13	0.24	0.21	0.12
C4	0.16	0.40	0.24	0.19	0.21	0.11	0.54	0.14	0.49	0.14	0.29	0.76	0.39	0.27	0.23	0.05	0.09	0.30	0.22	0.11
C4'	0.18	0.21	0.21	0.16	0.26	0.18	0.34	0.18	0.30	0.19	0.20	0.33	0.25	0.23	0.28	0.21	0.17	0.32	0.24	0.20
C5	0.11	0.29	0.18	0.16	0.23	0.10	0.50	0.15	0.46	0.12	0.21	0.59	0.30	0.25	0.25	0.03	0.12	0.30	0.20	0.14
C5'	0.25	0.24	0.30	0.22	0.28	0.21	0.33	0.18	0.31	0.26	0.24	0.25	0.35	0.25	0.29	0.27	0.20	0.36	0.32	0.26
C6	0.09	0.25	0.13	0.12	0.25	0.11	0.48	0.17	0.44	0.12	0.17	0.53	0.25	0.25	0.28	0.05	0.15	0.29	0.18	0.14
N1	0.12	0.30	0.14	0.14	0.24	0.12	0.49	0.17	0.43	0.10	0.19	0.63	0.29	0.26	0.27	0.07	0.14	0.30	0.18	0.13
N3	0.19	0.44	0.25	0.19	0.22	0.12	0.55	0.15	0.49	0.16	0.32	0.84	0.42	0.28	0.25	0.08	0.09	0.30	0.21	0.11
N4	0.18	0.44	0.28	0.21	0.20	0.10	0.54	0.13	0.50	0.16	0.34	0.80	0.42	0.26	0.22	0.05	0.05	0.30	0.26	0.09
O2	0.18	0.43	0.21	0.17	0.24	0.13	0.54	0.17	0.46	0.14	0.29	0.83	0.38	0.28	0.27	0.10	0.12	0.31	0.19	0.13
O2'	0.08	0.16	0.09	0.10	0.28	0.15	0.44	0.19	0.37	0.12	0.12	0.38	0.16	0.19	0.33	0.12	0.16	0.24	0.17	0.11
O3'	0.16	0.19	0.16	0.15	0.19	0.19	0.25	0.15	0.21	0.15	0.17	0.28	0.22	0.23	0.21	0.21	0.10	0.23	0.23	0.12
O4'	0.09	0.20	0.10	0.10	0.26	0.13	0.42	0.19	0.36	0.12	0.15	0.44	0.18	0.21	0.29	0.11	0.19	0.30	0.19	0.17
O5'	0.11	0.14	0.24	0.17	0.23	0.07	0.28	0.15	0.26	0.17	0.17	0.15	0.27	0.01	0.25	0.04	0.20	0.44	0.34	0.31
OP1	0.26	0.18	0.09	0.09	0.29	0.31	0.39	0.26	0.40	0.27	0.21	0.22	0.08	0.00	0.29	0.41	0.23	0.26	0.35	0.23
OP2	0.06	0.09	0.01	0.01	0.08	0.10	0.08	0.06	0.07	0.06	0.09	0.13	0.03	0.01	0.09	0.12	0.04	0.27	0.27	0.17
P	0.08	0.10	0.03	0.01	0.06	0.12	0.07	0.07	0.07	0.07	0.08	0.16	0.09	0.00	0.06	0.17	0.04	0.29	0.29	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.05	0.02	0.00	0.04	0.17	0.35	0.17
C2	0.03	0.00	0.16	0.08	0.01	0.02	0.01	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.10	0.01	0.09	0.22	0.37	0.63	0.44
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.05	0.01	0.18	0.03	0.20	0.02	0.10	0.30	0.00	0.01	0.05	0.01	0.07	0.25	0.43	0.24
C3'	0.02	0.08	0.00	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.11	0.02	0.06	0.15	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.25	0.35	0.20
C4	0.02	0.01	0.05	0.03	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.06	0.00	0.04	0.19	0.27	0.42	0.29
C4'	0.02	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.07	0.01	0.02	0.08	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.09	0.21	0.08
C5	0.01	0.01	0.18	0.09	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.25	0.04	0.01	0.12	0.11	0.25	0.50	0.26
C5'	0.01	0.09	0.03	0.01	0.14	0.00	0.13	0.00	0.09	0.06	0.13	0.06	0.02	0.03	0.16	0.02	0.00	0.05	0.05	0.02
C6	0.01	0.00	0.20	0.11	0.01	0.07	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00	0.24	0.04	0.01	0.14	0.10	0.26	0.50	0.27
N1	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.06	0.01	0.01	0.10	0.20	0.39	0.22
N3	0.02	0.00	0.10	0.06	0.00	0.02	0.00	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.09	0.01	0.05	0.25	0.39	0.59	0.44
O2	0.06	0.00	0.30	0.15	0.00	0.08	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.38	0.15	0.00	0.18	0.26	0.49	0.85	0.57
O2'	0.01	0.16	0.00	0.01	0.13	0.02	0.25	0.02	0.24	0.06	0.08	0.38	0.00	0.04	0.13	0.01	0.08	0.30	0.49	0.27
O3'	0.05	0.10	0.01	0.01	0.06	0.01	0.04	0.03	0.04	0.06	0.09	0.15	0.04	0.00	0.06	0.04	0.00	0.26	0.36	0.20
O4	0.02	0.01	0.05	0.03	0.00	0.06	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.06	0.00	0.04	0.22	0.31	0.43	0.32
O4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.04	0.00	0.12	0.02	0.14	0.01	0.05	0.18	0.01	0.04	0.04	0.00	0.05	0.10	0.23	0.09
O5'	0.04	0.22	0.07	0.02	0.19	0.01	0.11	0.00	0.10	0.10	0.25	0.26	0.08	0.00	0.22	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.17	0.37	0.25	0.25	0.27	0.09	0.25	0.05	0.26	0.20	0.39	0.49	0.30	0.26	0.31	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.35	0.63	0.43	0.35	0.42	0.21	0.50	0.05	0.50	0.39	0.59	0.85	0.49	0.36	0.43	0.23	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.17	0.44	0.24	0.20	0.29	0.08	0.26	0.02	0.27	0.22	0.44	0.57	0.27	0.20	0.32	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00