Doublet Group distance statistics: 54667

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C5	A	0, -0.001, 0.009, 0.018, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.009 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.004, 0.018, 0.032, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.018 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.005, 0.019, 0.034, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.019 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.004, 0.021, 0.038, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.004, 0.024, 0.045, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.024 std_dev=0.021
C2'	A	0, 0.005, 0.033, 0.061, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.033 std_dev=0.028
O2	A	0, 0.014, 0.050, 0.086, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.050 std_dev=0.036
N4	A	0, 0.009, 0.065, 0.121, 0.138 max_d=0.138 avg_d=0.065 std_dev=0.056
O2'	A	0, 0.022, 0.096, 0.169, 0.178 max_d=0.178 avg_d=0.096 std_dev=0.073
O4'	A	0, -0.009, 0.092, 0.193, 0.232 max_d=0.232 avg_d=0.092 std_dev=0.101
C3'	A	0, 0.010, 0.136, 0.263, 0.305 max_d=0.305 avg_d=0.136 std_dev=0.127
C4'	A	0, -0.003, 0.167, 0.338, 0.401 max_d=0.401 avg_d=0.167 std_dev=0.170
O3'	A	0, 0.025, 0.224, 0.424, 0.485 max_d=0.485 avg_d=0.224 std_dev=0.199
OP1	B	0, 0.082, 0.323, 0.563, 0.577 max_d=0.577 avg_d=0.323 std_dev=0.241
C5'	A	0, -0.030, 0.233, 0.496, 0.601 max_d=0.601 avg_d=0.233 std_dev=0.263
O5'	A	0, 0.113, 0.395, 0.678, 0.645 max_d=0.645 avg_d=0.395 std_dev=0.283
OP2	A	0, 0.081, 0.378, 0.674, 0.724 max_d=0.724 avg_d=0.378 std_dev=0.297
P	A	0, -0.083, 0.348, 0.778, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.348 std_dev=0.430
P	B	0, -0.049, 0.402, 0.853, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.402 std_dev=0.451
O5'	B	0, 0.124, 0.584, 1.044, 1.124 max_d=1.124 avg_d=0.584 std_dev=0.460
OP1	A	0, 0.085, 0.640, 1.195, 1.353 max_d=1.353 avg_d=0.640 std_dev=0.555
OP2	B	0, 0.187, 0.743, 1.299, 1.339 max_d=1.339 avg_d=0.743 std_dev=0.556
C4'	B	0, 0.128, 0.740, 1.352, 1.498 max_d=1.498 avg_d=0.740 std_dev=0.612
O4'	B	0, 0.188, 0.824, 1.460, 1.549 max_d=1.549 avg_d=0.824 std_dev=0.636
C5'	B	0, 0.248, 0.886, 1.524, 1.475 max_d=1.475 avg_d=0.886 std_dev=0.638
C6	B	0, 0.011, 0.721, 1.431, 1.687 max_d=1.687 avg_d=0.721 std_dev=0.710
C3'	B	0, 0.028, 0.741, 1.454, 1.703 max_d=1.703 avg_d=0.741 std_dev=0.713
O3'	B	0, 0.072, 0.799, 1.525, 1.758 max_d=1.758 avg_d=0.799 std_dev=0.727
C5	B	0, -0.038, 0.721, 1.480, 1.770 max_d=1.770 avg_d=0.721 std_dev=0.759
N1	B	0, 0.014, 0.780, 1.545, 1.820 max_d=1.820 avg_d=0.780 std_dev=0.765
C1'	B	0, 0.066, 0.834, 1.601, 1.853 max_d=1.853 avg_d=0.834 std_dev=0.768
C2	B	0, 0.021, 0.856, 1.691, 1.989 max_d=1.989 avg_d=0.856 std_dev=0.835
C4	B	0, -0.075, 0.775, 1.626, 1.959 max_d=1.959 avg_d=0.775 std_dev=0.850
O2	B	0, 0.086, 0.950, 1.813, 2.090 max_d=2.090 avg_d=0.950 std_dev=0.864
N3	B	0, -0.012, 0.856, 1.725, 2.047 max_d=2.047 avg_d=0.856 std_dev=0.868
O4	B	0, -0.118, 0.767, 1.652, 2.007 max_d=2.007 avg_d=0.767 std_dev=0.885
C2'	B	0, -0.137, 0.748, 1.633, 1.991 max_d=1.991 avg_d=0.748 std_dev=0.885
O2'	B	0, -0.213, 0.814, 1.842, 2.264 max_d=2.264 avg_d=0.814 std_dev=1.028

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.08	0.14	0.09	0.04
C2	0.02	0.00	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.06	0.10	0.09	0.05
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.14	0.07	0.02
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.10	0.00	0.08	0.02	0.04	0.03	0.08	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.15	0.06	0.02
C4	0.00	0.01	0.02	0.10	0.00	0.08	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.03	0.11	0.21	0.16	0.14
C4'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.00	0.06	0.03	0.05	0.09	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.15	0.10	0.01
C5	0.01	0.01	0.02	0.08	0.00	0.09	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.04	0.11	0.15	0.14	0.10
C5'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.14	0.00	0.14	0.00	0.10	0.05	0.10	0.16	0.00	0.01	0.04	0.01	0.00	0.17	0.13	0.00
C6	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.11	0.07	0.10	0.03
N1	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.08	0.09	0.09	0.02
N3	0.01	0.00	0.02	0.08	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.08	0.01	0.08	0.17	0.13	0.11
N4	0.01	0.01	0.02	0.12	0.01	0.09	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.13	0.02	0.13	0.30	0.21	0.19
O2	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.03	0.05	0.10	0.07	0.03
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.04	0.03	0.08	0.00	0.04	0.00	0.02	0.15	0.07	0.01
O3'	0.02	0.04	0.02	0.01	0.10	0.03	0.08	0.04	0.04	0.02	0.08	0.13	0.01	0.04	0.00	0.02	0.11	0.15	0.04	0.05
O4'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.10	0.15	0.09	0.05
O5'	0.08	0.06	0.02	0.03	0.11	0.00	0.11	0.00	0.11	0.08	0.08	0.13	0.05	0.02	0.11	0.10	0.00	0.02	0.03	0.00
OP1	0.14	0.10	0.14	0.15	0.21	0.15	0.15	0.17	0.07	0.09	0.17	0.30	0.10	0.15	0.15	0.15	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.09	0.07	0.06	0.16	0.10	0.14	0.13	0.10	0.09	0.13	0.21	0.07	0.07	0.04	0.09	0.03	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.05	0.02	0.02	0.14	0.01	0.10	0.00	0.03	0.02	0.11	0.19	0.03	0.01	0.05	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.36	0.12	0.20	0.09	0.02	0.16	0.10	0.09	0.21	0.22	0.03	0.12	0.25	0.17	0.08	0.46	0.13	0.06	0.57	0.21
C2	0.27	0.09	0.10	0.02	0.12	0.11	0.09	0.10	0.12	0.15	0.09	0.10	0.12	0.21	0.19	0.40	0.04	0.10	0.38	0.08
C2'	0.32	0.09	0.15	0.05	0.05	0.12	0.09	0.07	0.19	0.19	0.04	0.09	0.20	0.20	0.11	0.44	0.10	0.09	0.51	0.15
C3'	0.27	0.07	0.10	0.07	0.07	0.06	0.09	0.11	0.17	0.16	0.07	0.06	0.15	0.25	0.14	0.39	0.07	0.14	0.48	0.10
C4	0.20	0.12	0.06	0.07	0.24	0.07	0.22	0.13	0.14	0.12	0.18	0.11	0.02	0.26	0.31	0.34	0.03	0.17	0.22	0.06
C4'	0.32	0.08	0.17	0.07	0.03	0.10	0.12	0.15	0.22	0.19	0.03	0.06	0.23	0.20	0.10	0.42	0.11	0.08	0.55	0.16
C5	0.23	0.09	0.08	0.04	0.19	0.06	0.16	0.03	0.11	0.12	0.14	0.10	0.08	0.22	0.26	0.36	0.05	0.13	0.41	0.07
C5'	0.25	0.04	0.10	0.10	0.05	0.06	0.10	0.26	0.18	0.14	0.07	0.03	0.17	0.25	0.12	0.34	0.07	0.13	0.49	0.10
C6	0.28	0.09	0.13	0.05	0.09	0.10	0.07	0.06	0.14	0.16	0.07	0.09	0.16	0.19	0.16	0.40	0.11	0.08	0.56	0.16
N1	0.30	0.09	0.15	0.05	0.08	0.12	0.06	0.07	0.15	0.17	0.05	0.10	0.18	0.19	0.15	0.42	0.10	0.07	0.51	0.15
N3	0.23	0.10	0.06	0.05	0.20	0.08	0.17	0.14	0.11	0.12	0.15	0.11	0.05	0.25	0.27	0.36	0.02	0.14	0.25	0.03
N4	0.18	0.18	0.11	0.13	0.33	0.09	0.33	0.20	0.22	0.16	0.25	0.15	0.08	0.31	0.39	0.30	0.11	0.22	0.15	0.18
O2	0.29	0.09	0.11	0.02	0.10	0.12	0.07	0.12	0.13	0.16	0.07	0.11	0.14	0.21	0.17	0.42	0.04	0.09	0.38	0.09
O2'	0.36	0.11	0.20	0.08	0.03	0.16	0.11	0.09	0.22	0.22	0.02	0.10	0.26	0.17	0.09	0.47	0.13	0.07	0.54	0.19
O3'	0.27	0.06	0.09	0.08	0.08	0.05	0.09	0.13	0.17	0.15	0.09	0.06	0.15	0.27	0.15	0.39	0.07	0.14	0.44	0.08
O4'	0.37	0.13	0.23	0.10	0.03	0.16	0.15	0.12	0.25	0.24	0.03	0.12	0.29	0.16	0.05	0.47	0.16	0.06	0.62	0.24
O5'	0.38	0.19	0.23	0.06	0.14	0.14	0.25	0.07	0.33	0.29	0.13	0.17	0.27	0.12	0.10	0.50	0.25	0.05	0.60	0.23
OP1	0.08	0.11	0.09	0.26	0.14	0.15	0.04	0.36	0.06	0.03	0.18	0.15	0.03	0.43	0.22	0.22	0.06	0.24	0.24	0.07
OP2	0.08	0.13	0.06	0.22	0.18	0.17	0.09	0.40	0.07	0.07	0.19	0.15	0.02	0.35	0.24	0.16	0.03	0.24	0.33	0.05
P	0.22	0.05	0.08	0.11	0.05	0.05	0.14	0.27	0.19	0.15	0.06	0.04	0.13	0.25	0.10	0.33	0.13	0.13	0.43	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.03	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.01	0.01	0.20	0.34	0.02	0.23
C2	0.01	0.00	0.11	0.03	0.01	0.11	0.01	0.35	0.01	0.00	0.00	0.01	0.17	0.02	0.02	0.04	0.17	0.14	0.06	0.09
C2'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.03	0.00	0.10	0.05	0.11	0.01	0.06	0.21	0.01	0.01	0.04	0.03	0.07	0.18	0.26	0.02
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.23	0.01	0.33	0.01	0.31	0.13	0.11	0.11	0.02	0.01	0.25	0.03	0.04	0.08	0.42	0.12
C4	0.01	0.01	0.03	0.23	0.00	0.25	0.01	0.56	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.26	0.00	0.02	0.10	0.15	0.10	0.13
C4'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.25	0.00	0.30	0.01	0.29	0.16	0.17	0.02	0.05	0.02	0.25	0.00	0.02	0.23	0.19	0.04
C5	0.02	0.01	0.10	0.33	0.01	0.30	0.00	0.62	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.39	0.02	0.05	0.12	0.16	0.10	0.14
C5'	0.12	0.35	0.05	0.01	0.56	0.01	0.62	0.00	0.55	0.36	0.46	0.25	0.04	0.08	0.58	0.03	0.01	0.31	0.16	0.01
C6	0.03	0.01	0.11	0.31	0.01	0.29	0.00	0.55	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.34	0.01	0.06	0.10	0.10	0.05	0.08
N1	0.01	0.00	0.01	0.13	0.00	0.16	0.00	0.36	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.11	0.00	0.01	0.15	0.18	0.04	0.12
N3	0.00	0.00	0.06	0.11	0.01	0.17	0.00	0.46	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.09	0.02	0.03	0.13	0.08	0.09	0.08
O2	0.02	0.01	0.21	0.11	0.02	0.02	0.01	0.25	0.01	0.01	0.01	0.00	0.28	0.20	0.03	0.08	0.21	0.19	0.06	0.12
O2'	0.06	0.17	0.01	0.02	0.04	0.05	0.05	0.04	0.07	0.06	0.12	0.28	0.00	0.03	0.03	0.06	0.02	0.19	0.27	0.04
O3'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.26	0.02	0.39	0.08	0.34	0.11	0.09	0.20	0.03	0.00	0.30	0.01	0.26	0.12	0.68	0.34
O4	0.01	0.02	0.04	0.25	0.00	0.25	0.02	0.58	0.01	0.00	0.02	0.03	0.03	0.30	0.00	0.03	0.10	0.23	0.12	0.18
O4'	0.01	0.04	0.03	0.03	0.02	0.00	0.05	0.03	0.06	0.01	0.03	0.08	0.06	0.01	0.03	0.00	0.28	0.50	0.22	0.39
O5'	0.20	0.17	0.07	0.04	0.10	0.02	0.12	0.01	0.10	0.15	0.13	0.21	0.02	0.26	0.10	0.28	0.00	0.07	0.07	0.00
OP1	0.34	0.14	0.18	0.08	0.15	0.23	0.16	0.31	0.10	0.18	0.08	0.19	0.19	0.12	0.23	0.50	0.07	0.00	0.00	0.01
OP2	0.02	0.06	0.26	0.42	0.10	0.19	0.10	0.16	0.05	0.04	0.09	0.06	0.27	0.68	0.12	0.22	0.07	0.00	0.00	0.01
P	0.23	0.09	0.02	0.12	0.13	0.04	0.14	0.01	0.08	0.12	0.08	0.12	0.04	0.34	0.18	0.39	0.00	0.01	0.01	0.00